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Schistosoma mansoni
cluster # 925 cluster # 925       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_925#0 length = 905 sequences # 2  

consensusID : consensus_925#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 905
fasta sequence
                              [CGAGGCCANAATTCGGCACGAGGTCTGCGTATCCTTCTGCCTGATCGTGAAAATATTCGTCGAGTACGTAGTGTAGACATGGCCCCAGAGATGCAAGATAAATCAAGAAAGTTAACGAAATCAAATATTTCTAAATGTGAAATTGTAGATGTTCTTTTAGAAGATGCTACAATTACATCAACACATGATAATCATCCTGTATCAATACTTCGTGATGTAATCATGTCATGTTCATAAATAATCTAATCAAGACAAAAAAAAAGCCATGTTTAACCTTTTTGAAAATCAATCTGCTTTTTTAACAATTAATGACTTAAAACATTTTTCTTCTCTCCTCGTACTATAATAATATTCATTGCTTATCTTTCAATTTGACAATGACATGATGATCACAATTTTGATTTCGATTATGTTGTAATCATGAACTGCATTTTTTTTTAATGCTGGGTAGTCATTATTCGATTGGTTACTGATGATATTGTTCGATTGATCGTTTATATTCGTATAATAATAATAATAATAATAACCATACATACATTCATTAGTAATATTATTATTATTATTATTATTATTAATAGTTTTTAATTATGCTACTTATTAGTGTTATTCATCGACATACATTTGCATTTCTAATCATACTTATTCATTTCATTATTTCTTTAATGGNATTTTTTTTGTTTTAAAATAGTCACTCACTCACTCACTCATATATATACCTTAATCATTCATGGTAAACATTAATGATGATTATTATTGTTGTTTTAATCAAGTACAATAACAAATTTAATTCATAATTGTGTATTAGTAATTGACTACTGATATTATCACATTATAAGTAGTAGCATAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATCATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]

[+] EMBL CD082577             [CGAGGCCANAATTCGGCACGAGGTCTGCGTATCCTTCTGCCTGATCGTGAAAATATTCGTCGAGTACGTAGTGTAGACATGGCCCCAGAGATGCAAGATAAATCAAGAAAGTTAACGAAATCAAATATTTCTAAATGTGAAATTGTAGATGTTCTTTTAGAAGATGCTACAATTACATCAACACATGATAATCATCCTGTATCAATACTTCGTGATGTAATCATGTCATGTTCATAAATAATCTAATCAAGACAAAAAAAAAGCCATGTTTAACCTTTTTGAAAATCAATCTGCTTTTTTAACAATTAATGACTTAAAACATTTTTCTTCTCTCCTCGTACTATAATAATATTCATTGCTTATCTTTCAATTTGACAATGACATGATGATCACAATTTTGATTTCGATTATGTTGTAATCATGAACTGCATTTTTTTTTAATGCTGGGTAGTCATTATTCGATTGGTTACTGATGATATTGTTCGATTGATCGTTTATATTCGTATAATAATAATAATAATAATAACCATACATACATTCATTAGTAATATTATTATTATTATTATTATTATTAATAGTTTTTAATTATGCTACTTATTAGTGTTATTCATCGACATACATTTGCATTTCTAATCATACTTATTCATTTCATTATTTCTTTAATGGNATT                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL AI977069             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGATCACAATTTTGATTTCGATTATGTTGTAATCATGAACTGCATTTTTTTTTAATGCTGGGTAGTCATTATTCGATTGGTTACTGATGATATTGTTCGATTGATCGTTTATATTCGTATAATAATAATAATAATAATAACCATACATACATTCATTAGTAA   TATTATTATTATTATTATTATTAATAGTTTTTAATTATGCTACTTATTAGTGTTATTCATCGACATACATTTGCATTTCTAATCATACTTATTCATTTCATTATTTCTTTAATGGTATTTTTTTTGTTTTAAAATAGTCACTCACTCACTCACTCATATATATACCTTAATCATTCATGGTAAACATTAATGATGATTATTATTGTTGTTTTAATCAAGTACAATAACAAATTTAATTCATAATTGTGTATTAGTAATTGACTACTGATATTATCACATTATAAGTAGTAGCATAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATCATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]


>consensus_925#0 CGAGGCCANAATTCGGCACGAGGTCTGCGTATCCTTCTGCCTGATCGTGAAAATATTCGT CGAGTACGTAGTGTAGACATGGCCCCAGAGATGCAAGATAAATCAAGAAAGTTAACGAAA TCAAATATTTCTAAATGTGAAATTGTAGATGTTCTTTTAGAAGATGCTACAATTACATCA ACACATGATAATCATCCTGTATCAATACTTCGTGATGTAATCATGTCATGTTCATAAATA ATCTAATCAAGACAAAAAAAAAGCCATGTTTAACCTTTTTGAAAATCAATCTGCTTTTTT AACAATTAATGACTTAAAACATTTTTCTTCTCTCCTCGTACTATAATAATATTCATTGCT TATCTTTCAATTTGACAATGACATGATGATCACAATTTTGATTTCGATTATGTTGTAATC ATGAACTGCATTTTTTTTTAATGCTGGGTAGTCATTATTCGATTGGTTACTGATGATATT GTTCGATTGATCGTTTATATTCGTATAATAATAATAATAATAATAACCATACATACATTC ATTAGTAATATTATTATTATTATTATTATTATTAATAGTTTTTAATTATGCTACTTATTA GTGTTATTCATCGACATACATTTGCATTTCTAATCATACTTATTCATTTCATTATTTCTT TAATGGNATTTTTTTTGTTTTAAAATAGTCACTCACTCACTCACTCATATATATACCTTA ATCATTCATGGTAAACATTAATGATGATTATTATTGTTGTTTTAATCAAGTACAATAACA AATTTAATTCATAATTGTGTATTAGTAATTGACTACTGATATTATCACATTATAAGTAGT AGCATAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATCATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACT GCGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)