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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9253#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1489 fasta sequence
[ATCTTGGCTCGAGGCACACGTTTAGATAAAGAAATCAAAGCTGTCCTATCATTTGCTGTCGTCGGCAGTAATTGTGTTATCGATTTGGATGGTAGTCGTCGAGCTCGTGGTAGACAATATCCGTGGGGGTTAGTTGAAGTAGAGAATAGTCGTCATTGTGATTTTACAAAGCTGCGTATATTTCTGCTAAAGACACATATGCAGGATTTAAAAGATATGACATTGGATGTGCATTATGAAAATTATAGAGCGAAATATATTACTGAACGGATGTCTAAACGTCAAAGCGATCGTCGTGAAGGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCTATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAACTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGAAACGTAATACCAATGTTGTACCGAACCCATCAGTTAGTTTAAATAATGGTACAGGTAATGCTCAATCTTCTCCAATTCCTGTAACTGGTCAACAAGCGTCTTGAATACAAAAAGCATATAGGCTGGCTAGGATTCAAAATCCCGTTATCACACTTGTTTATGTCTTATTATTTTGCTTAACATTCAGTCGATGAGGTCGCAATATAGTCAATATAATGTGCNTACNNAT-ATTATTNTATCGTTTATACTTGCANAACTATNTCTTCTTTCTTTCCTTAAATCTATACAACATTGTCTAATTAATTGTTTGTGTCTACTTATGTTTATTCAATTACCGGTTTCATATAATCTTGTTTTAATGAANAAGTAGACAGAAATTCTACTTCCTTTTTTT-AAAAATGAACTTATTATGTTGCACATTCTTAGTTTTTCAATTATGTTCGCATTTCGTTAAAAATAAAGGTAGAAGGAACTGTTAATTTTCTCTTTGACTGATGGTGTATTGTTTTTTCTTTCTCAGTTTTTGTAGGTCAACATAAATTTCTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTAATTAATCATGAATGTGCATTTTATCTTACCTTTATAACATTAAACCAAACCAATCGATTACTTTCTTTTCATTTTATTAATCTAGTCTATCTTATTCATAATTTTTTATTACTTTATGGGTACACCAATTTC-TGTTACATTTTGTCTACTAAAAATTATATTATCTGATGTGAAAAAACTCTACATTTTTGTTTTCGTACGCATTTTCATACTTTTTGTTAAATTTTGTCTTTTCACTTCATTTTATTATTTCGTCTATTTAACTTAAAAAAATGAGGTGAATAAACCATGCTTATCAGTATCCTAAAATATTGTGTTCATTCATTTTTGTTTTTTGTCTTAAGTAGGTTTTTTTCTCTTTATGTACTTAGCTGCTTATATTTGACGGTTTCGTGTAAAATATATGTTATGTACGCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGT]
[+] EMBL CD080695 [ATCTTGGCTCGAGGCACACGTTTAGATAAAGAAATCAAAGCTGTCCTATCATTTGCTGTCGTCGGCAGTAATTGTGTTATCGATTTGGATGGTAGTCGTCGAGCTCGTGGTAGACAATATCCGTGGGGGTTAGTTGAAGTAGAGAATAGTCGTCATTGTGATTTTACAAAGCTGCGTATATTTCTGCTAAAGACACATATGCAGGATTTAAAAGATATGACATTGGATGTGCATTATGAAAATTATAGAGCGAAATATATTACTGAACGGATGTCTAAACGTCAAAGCGATCGTCGTGAAGGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCTATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAACTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGAAACGTAATACCAATGTTGTACCGAACCCATCAGTTAGTTTAAATAATGGTACAGGTAATGCTCAATCTTCTCCAATTCCTGTAACTGGTCAACAAGCGTCTTGAATACAAAAAGCATATAGGCTGGCTAGGATTCAAAATCCCGTTATCACACTTGTTTATGTCTTATTATTTTGCTTAACATTCAGTCGATGAGGTCGCAATATAGTCAATATAATGTGCNTACNNAT ATTATTNTATCGTTTATACTTGCANAACTATNTCTTCT ]
[-] EMBL BG931010 [ tcAGTTGAAGTAGAGAATAGTCGTCATTGTGATTTTACAAAGCTGCGTATATTTCTGCTAAAGACGCATATGCAGGATTTAAAAGATATGACATTGGATGTGCATTATGAAAATTATAGAGCGAAATATATTACTGAACGGATGTCTAAACGTCAAAGCGATCGTCGTGAAGGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCTATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAACTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGAAACGTAATACCAATGTTGTACCGAt ]
[-] EMBL CD125950 [ GTGATTTTACAAAGCTGCGTATA TTCTGCTAAAGACACATATGCAGGATTTAAAAGATATGACATTGGATGTGCATTATGAAAATTATGGCGCGAAATATATTACTGAACGGATGTCTAAACGTCAAAGCGATCGTCGTGAAGGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCTATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAACTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGAAACGTAATACCAATGTTGTACCGAACCCATCAGTTAGTTTAAATAATG ]
[-] EMBL CD145589 [ TTTACAAAGCTGCGTATATTTCTGCTAAAGACACATATGCAGGATTTAAAAGATATGACATTGGATGTGCATTATGAAAATTATAGAGCGAAATATATTACTGAACGGATGTCTAAACGTCAAAGCGATCGTCGTGAAGGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCTATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAACTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGGAACGTAATACCAATGTTGTACCGAACCCATCAGTTAGTTTAAATAATGGTACAGGTAATGCTCAATCTTCTCCAATTCCT ]
[+] EMBL CD081830 [ CGTGAAGGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCTATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAACTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGAAACGTAATACCAATGTTGTACCGAACCCATCAGTTAGTTTAAATAATGGTACAGGTAATGCTCAATCTTCTCCAATTCCTGTAACTGGTCAACAAGCGTCTTGAATACAAAAAGCATATAGGCTGGCTAGGATTCAAAATCCCGTTATCACACTTGTTTATGTCTTATTATTTTGCTTAACATTCAGTCGATGAGGTCGCAATATAGTCAATATAATGTGC TAACAATAATTATTTTATCGTTTATACTTGCAAAACTATTTCTTCTTTCTTTCCTTAAATCTATACAACATTGTCTAATTAATTGTTTGTGTCTACTTATGTTTATTCAATTACCGGTTTCATATAATCTTGTTTTAATGAANAAGTAGACAGAAATTCTACTTCCTTTNTTT AAAAATGAACTTATTATGTTGC ]
[-] EMBL CD076979 [ GTTTGTGTCTACTTATGTTTATTCAATTACCGGTTTCATATAATCTTGTTTTAATGAAAAAGTAGACAGAAATTCTACTTCCTTTTTTTAAAAAATGAACTTATTATGTTGCACATTCTTAGTTTTTCAATTATGTTCGCATTTCGTTAAAAATAAAGGTAGAAGGAACTGTTAATTTTCTCTTTGACTGATGGTGTATTGTTTTTTCTTTCTCAGTTTTTGTAGGTCAACATAAATTTCTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTAATTAATCATGAATGTGCATTTTATCTTACCTTTATAACATTAAACCAAACCAATCGATTACTTTCTTTTCATTTTATTAATCTAGTCTATCTTATTCATAATTTTTTATTACTTTATGGGTACACCAATTTCNTGTTACATTTTGTCTACTAAAAATTATATTATCTGATGTGAAAAAACTCTACATTTTTGTTTTCGTACGCATTTTCATACTTTTTGTTAAATTTTGTCTTTTCACTTCATTTTATTATTTCGTCTATTTAACTTAAAAAAATGAGGTGAATAAACCATGCTTAT ]
[-] EMBL CD075552 [ CAGAAATTCTACTTCCTTTTTTA AANAATGAACTTATTATGTTGCACATTCTTAGTTTTTCAATTATGTTCGCATTTCGTTAAAAATAAAGGTAGAAGGAACTGTTAATTTTCTCTTTGACTGATGGTGTATTGTTTTTTCTTTCTCAGTTTTTGTAGGTCAACATAAATTTCTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTAATTAATCATGAATGTGCATTTTATCTTACCTTTATAACATTAAACCAAACCAATCGATTACTTTCTTTTCATTTTATTAATCTAGTCTATCTTATTCATAATTTTTTATTACTTTATGGGTACACCAATTTC TGTTACATTTTGTCTACTAAAAATTATATTATCTGATGTGAAAAAACTCTACATTTTTGTTTTCGTACGCATTTTCATACTTTTTGTTAAATTTTGTCTTTTCACTTCATTTTATTATTTCGTCTATTTAACTTAAAAAAATGAGGTGAATAAACCATGCTTATCAGTATCCTAAAATATTGTGTTCATTCATTTTTGTTTTTTGTCTTAAGTAGGTTTTTTTCTCTTTATGTACTTAGCTGCTTATATTTGACGGTTTCGTGTAAAATATATGTTA ]
[-] EMBL BF936757 [ ATTCTACTTCCTTTTTTTAAAAAATGAACTTATTATGTTGCACATTCTTAGTTTTTCAATTATGTTCGCATTTCGTTAAAAATAAAGGTAGAAGGAACTGTTAATTTTCTCTTTGACTGATGGTGTATTGTTTTTTCTTTCTCAGTTTTTGTAGGTCAACATAAATTTCTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTAATTAATCATGAATGTGCATTTTATCTTACCTTTATAACATTAAACCAAACCAATCGATTACTTTCTTTTCATTTTATTAATCTAGTCTATCTTATTCATAATTTTTTATTACTTTATGGGTACACCAATTTC TGTTACATTTTGTCTACTAAAAATTATATTATCTGATGTGAAAAAACTCTACATTTTTGTTTTCGTACGCATTTTCATACTTTTTGTTAAATTTTGTCTTTTCACTTCATTTTATTATTTCGTCTATTTAACTTAAAAAAATGAGGTGAATAAACCATGCTTATCAGTATCCTAAAATATTGTGTTCATTCATTTTTGTTTTTTGTCTTAAGTAGGTTTTTTTCTCTTTATGTACTTAGCTGCTTATATTTGACGGTTTCGTGTAAAATATATGTTATGTACGCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGT]
[-] EMBL AI975053 [ ATAAATTTCTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTAATTAATCATGAATGTGCATTTTATCTTACCTTTATAACATTAAACCAAACCAATCGATTACTTTCTTTTCATTTTATTAATCTAGTCTATCTTATTCATAATTTTTTATTACTTTATGGGTACACCAATTTC TGTTACATTTTGTCTACTAAAAATTATATTATCTGATGTGAAAAAACTCTACATTTTTGTTTTCGTACGCATTTTCATACTTTTTGTTAAATTTTGTCTTTTCACTTCATTTTATTATTTCGTCTATTTAACTTAAAAAAATGAGGTGAATAAACCATGCTTATCAGTATCCTAAAATATTGTGTTCATTCATTTTTGTTTTTTGTCTTAAGTAGGTTTTTTTCTCTTTATGTACTTAGCTGCTTATATTTGACGGTTTCGTGTAAAATATATGTTATGTACGCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||