Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9253 cluster # 9253       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9253#0 length = 1489 sequences # 9  

consensusID : consensus_9253#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1489
fasta sequence
                              [ATCTTGGCTCGAGGCACACGTTTAGATAAAGAAATCAAAGCTGTCCTATCATTTGCTGTCGTCGGCAGTAATTGTGTTATCGATTTGGATGGTAGTCGTCGAGCTCGTGGTAGACAATATCCGTGGGGGTTAGTTGAAGTAGAGAATAGTCGTCATTGTGATTTTACAAAGCTGCGTATATTTCTGCTAAAGACACATATGCAGGATTTAAAAGATATGACATTGGATGTGCATTATGAAAATTATAGAGCGAAATATATTACTGAACGGATGTCTAAACGTCAAAGCGATCGTCGTGAAGGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCTATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAACTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGAAACGTAATACCAATGTTGTACCGAACCCATCAGTTAGTTTAAATAATGGTACAGGTAATGCTCAATCTTCTCCAATTCCTGTAACTGGTCAACAAGCGTCTTGAATACAAAAAGCATATAGGCTGGCTAGGATTCAAAATCCCGTTATCACACTTGTTTATGTCTTATTATTTTGCTTAACATTCAGTCGATGAGGTCGCAATATAGTCAATATAATGTGCNTACNNAT-ATTATTNTATCGTTTATACTTGCANAACTATNTCTTCTTTCTTTCCTTAAATCTATACAACATTGTCTAATTAATTGTTTGTGTCTACTTATGTTTATTCAATTACCGGTTTCATATAATCTTGTTTTAATGAANAAGTAGACAGAAATTCTACTTCCTTTTTTT-AAAAATGAACTTATTATGTTGCACATTCTTAGTTTTTCAATTATGTTCGCATTTCGTTAAAAATAAAGGTAGAAGGAACTGTTAATTTTCTCTTTGACTGATGGTGTATTGTTTTTTCTTTCTCAGTTTTTGTAGGTCAACATAAATTTCTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTAATTAATCATGAATGTGCATTTTATCTTACCTTTATAACATTAAACCAAACCAATCGATTACTTTCTTTTCATTTTATTAATCTAGTCTATCTTATTCATAATTTTTTATTACTTTATGGGTACACCAATTTC-TGTTACATTTTGTCTACTAAAAATTATATTATCTGATGTGAAAAAACTCTACATTTTTGTTTTCGTACGCATTTTCATACTTTTTGTTAAATTTTGTCTTTTCACTTCATTTTATTATTTCGTCTATTTAACTTAAAAAAATGAGGTGAATAAACCATGCTTATCAGTATCCTAAAATATTGTGTTCATTCATTTTTGTTTTTTGTCTTAAGTAGGTTTTTTTCTCTTTATGTACTTAGCTGCTTATATTTGACGGTTTCGTGTAAAATATATGTTATGTACGCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGT]

[+] EMBL CD080695             [ATCTTGGCTCGAGGCACACGTTTAGATAAAGAAATCAAAGCTGTCCTATCATTTGCTGTCGTCGGCAGTAATTGTGTTATCGATTTGGATGGTAGTCGTCGAGCTCGTGGTAGACAATATCCGTGGGGGTTAGTTGAAGTAGAGAATAGTCGTCATTGTGATTTTACAAAGCTGCGTATATTTCTGCTAAAGACACATATGCAGGATTTAAAAGATATGACATTGGATGTGCATTATGAAAATTATAGAGCGAAATATATTACTGAACGGATGTCTAAACGTCAAAGCGATCGTCGTGAAGGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCTATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAACTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGAAACGTAATACCAATGTTGTACCGAACCCATCAGTTAGTTTAAATAATGGTACAGGTAATGCTCAATCTTCTCCAATTCCTGTAACTGGTCAACAAGCGTCTTGAATACAAAAAGCATATAGGCTGGCTAGGATTCAAAATCCCGTTATCACACTTGTTTATGTCTTATTATTTTGCTTAACATTCAGTCGATGAGGTCGCAATATAGTCAATATAATGTGCNTACNNAT ATTATTNTATCGTTTATACTTGCANAACTATNTCTTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL BG931010             [                                                                                                                                 tcAGTTGAAGTAGAGAATAGTCGTCATTGTGATTTTACAAAGCTGCGTATATTTCTGCTAAAGACGCATATGCAGGATTTAAAAGATATGACATTGGATGTGCATTATGAAAATTATAGAGCGAAATATATTACTGAACGGATGTCTAAACGTCAAAGCGATCGTCGTGAAGGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCTATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAACTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGAAACGTAATACCAATGTTGTACCGAt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD125950             [                                                                                                                                                             GTGATTTTACAAAGCTGCGTATA TTCTGCTAAAGACACATATGCAGGATTTAAAAGATATGACATTGGATGTGCATTATGAAAATTATGGCGCGAAATATATTACTGAACGGATGTCTAAACGTCAAAGCGATCGTCGTGAAGGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCTATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAACTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGAAACGTAATACCAATGTTGTACCGAACCCATCAGTTAGTTTAAATAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD145589             [                                                                                                                                                                  TTTACAAAGCTGCGTATATTTCTGCTAAAGACACATATGCAGGATTTAAAAGATATGACATTGGATGTGCATTATGAAAATTATAGAGCGAAATATATTACTGAACGGATGTCTAAACGTCAAAGCGATCGTCGTGAAGGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCTATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAACTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGGAACGTAATACCAATGTTGTACCGAACCCATCAGTTAGTTTAAATAATGGTACAGGTAATGCTCAATCTTCTCCAATTCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD081830             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CGTGAAGGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCTATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAACTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGAAACGTAATACCAATGTTGTACCGAACCCATCAGTTAGTTTAAATAATGGTACAGGTAATGCTCAATCTTCTCCAATTCCTGTAACTGGTCAACAAGCGTCTTGAATACAAAAAGCATATAGGCTGGCTAGGATTCAAAATCCCGTTATCACACTTGTTTATGTCTTATTATTTTGCTTAACATTCAGTCGATGAGGTCGCAATATAGTCAATATAATGTGC TAACAATAATTATTTTATCGTTTATACTTGCAAAACTATTTCTTCTTTCTTTCCTTAAATCTATACAACATTGTCTAATTAATTGTTTGTGTCTACTTATGTTTATTCAATTACCGGTTTCATATAATCTTGTTTTAATGAANAAGTAGACAGAAATTCTACTTCCTTTNTTT AAAAATGAACTTATTATGTTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD076979             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTTTGTGTCTACTTATGTTTATTCAATTACCGGTTTCATATAATCTTGTTTTAATGAAAAAGTAGACAGAAATTCTACTTCCTTTTTTTAAAAAATGAACTTATTATGTTGCACATTCTTAGTTTTTCAATTATGTTCGCATTTCGTTAAAAATAAAGGTAGAAGGAACTGTTAATTTTCTCTTTGACTGATGGTGTATTGTTTTTTCTTTCTCAGTTTTTGTAGGTCAACATAAATTTCTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTAATTAATCATGAATGTGCATTTTATCTTACCTTTATAACATTAAACCAAACCAATCGATTACTTTCTTTTCATTTTATTAATCTAGTCTATCTTATTCATAATTTTTTATTACTTTATGGGTACACCAATTTCNTGTTACATTTTGTCTACTAAAAATTATATTATCTGATGTGAAAAAACTCTACATTTTTGTTTTCGTACGCATTTTCATACTTTTTGTTAAATTTTGTCTTTTCACTTCATTTTATTATTTCGTCTATTTAACTTAAAAAAATGAGGTGAATAAACCATGCTTAT                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD075552             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    CAGAAATTCTACTTCCTTTTTTA AANAATGAACTTATTATGTTGCACATTCTTAGTTTTTCAATTATGTTCGCATTTCGTTAAAAATAAAGGTAGAAGGAACTGTTAATTTTCTCTTTGACTGATGGTGTATTGTTTTTTCTTTCTCAGTTTTTGTAGGTCAACATAAATTTCTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTAATTAATCATGAATGTGCATTTTATCTTACCTTTATAACATTAAACCAAACCAATCGATTACTTTCTTTTCATTTTATTAATCTAGTCTATCTTATTCATAATTTTTTATTACTTTATGGGTACACCAATTTC TGTTACATTTTGTCTACTAAAAATTATATTATCTGATGTGAAAAAACTCTACATTTTTGTTTTCGTACGCATTTTCATACTTTTTGTTAAATTTTGTCTTTTCACTTCATTTTATTATTTCGTCTATTTAACTTAAAAAAATGAGGTGAATAAACCATGCTTATCAGTATCCTAAAATATTGTGTTCATTCATTTTTGTTTTTTGTCTTAAGTAGGTTTTTTTCTCTTTATGTACTTAGCTGCTTATATTTGACGGTTTCGTGTAAAATATATGTTA                                                                  ]
[-] EMBL BF936757             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTCTACTTCCTTTTTTTAAAAAATGAACTTATTATGTTGCACATTCTTAGTTTTTCAATTATGTTCGCATTTCGTTAAAAATAAAGGTAGAAGGAACTGTTAATTTTCTCTTTGACTGATGGTGTATTGTTTTTTCTTTCTCAGTTTTTGTAGGTCAACATAAATTTCTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTAATTAATCATGAATGTGCATTTTATCTTACCTTTATAACATTAAACCAAACCAATCGATTACTTTCTTTTCATTTTATTAATCTAGTCTATCTTATTCATAATTTTTTATTACTTTATGGGTACACCAATTTC TGTTACATTTTGTCTACTAAAAATTATATTATCTGATGTGAAAAAACTCTACATTTTTGTTTTCGTACGCATTTTCATACTTTTTGTTAAATTTTGTCTTTTCACTTCATTTTATTATTTCGTCTATTTAACTTAAAAAAATGAGGTGAATAAACCATGCTTATCAGTATCCTAAAATATTGTGTTCATTCATTTTTGTTTTTTGTCTTAAGTAGGTTTTTTTCTCTTTATGTACTTAGCTGCTTATATTTGACGGTTTCGTGTAAAATATATGTTATGTACGCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGT]
[-] EMBL AI975053             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATAAATTTCTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTAATTAATCATGAATGTGCATTTTATCTTACCTTTATAACATTAAACCAAACCAATCGATTACTTTCTTTTCATTTTATTAATCTAGTCTATCTTATTCATAATTTTTTATTACTTTATGGGTACACCAATTTC TGTTACATTTTGTCTACTAAAAATTATATTATCTGATGTGAAAAAACTCTACATTTTTGTTTTCGTACGCATTTTCATACTTTTTGTTAAATTTTGTCTTTTCACTTCATTTTATTATTTCGTCTATTTAACTTAAAAAAATGAGGTGAATAAACCATGCTTATCAGTATCCTAAAATATTGTGTTCATTCATTTTTGTTTTTTGTCTTAAGTAGGTTTTTTTCTCTTTATGTACTTAGCTGCTTATATTTGACGGTTTCGTGTAAAATATATGTTATGTACGCGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGT]


>consensus_9253#0 ATCTTGGCTCGAGGCACACGTTTAGATAAAGAAATCAAAGCTGTCCTATCATTTGCTGTC GTCGGCAGTAATTGTGTTATCGATTTGGATGGTAGTCGTCGAGCTCGTGGTAGACAATAT CCGTGGGGGTTAGTTGAAGTAGAGAATAGTCGTCATTGTGATTTTACAAAGCTGCGTATA TTTCTGCTAAAGACACATATGCAGGATTTAAAAGATATGACATTGGATGTGCATTATGAA AATTATAGAGCGAAATATATTACTGAACGGATGTCTAAACGTCAAAGCGATCGTCGTGAA GGTGTTAATACTGGAGCATTGGCAAGATTAGAAAAAGAGGGTGGAACTGGCTTTGAGGCT ATTGTTGATCAAGATAGTTTACTAAAACAAAAAGAGGAAGAGCTTCAGAGAATGCAACAA CTAATGAGTAAAATGCAAGAACAGTTGAAACGTAATACCAATGTTGTACCGAACCCATCA GTTAGTTTAAATAATGGTACAGGTAATGCTCAATCTTCTCCAATTCCTGTAACTGGTCAA CAAGCGTCTTGAATACAAAAAGCATATAGGCTGGCTAGGATTCAAAATCCCGTTATCACA CTTGTTTATGTCTTATTATTTTGCTTAACATTCAGTCGATGAGGTCGCAATATAGTCAAT ATAATGTGCNTACNNATATTATTNTATCGTTTATACTTGCANAACTATNTCTTCTTTCTT TCCTTAAATCTATACAACATTGTCTAATTAATTGTTTGTGTCTACTTATGTTTATTCAAT TACCGGTTTCATATAATCTTGTTTTAATGAANAAGTAGACAGAAATTCTACTTCCTTTTT TTAAAAATGAACTTATTATGTTGCACATTCTTAGTTTTTCAATTATGTTCGCATTTCGTT AAAAATAAAGGTAGAAGGAACTGTTAATTTTCTCTTTGACTGATGGTGTATTGTTTTTTC TTTCTCAGTTTTTGTAGGTCAACATAAATTTCTTGCTTTTTTTTTCTTTTACTAATTAAT CATGAATGTGCATTTTATCTTACCTTTATAACATTAAACCAAACCAATCGATTACTTTCT TTTCATTTTATTAATCTAGTCTATCTTATTCATAATTTTTTATTACTTTATGGGTACACC AATTTCTGTTACATTTTGTCTACTAAAAATTATATTATCTGATGTGAAAAAACTCTACAT TTTTGTTTTCGTACGCATTTTCATACTTTTTGTTAAATTTTGTCTTTTCACTTCATTTTA TTATTTCGTCTATTTAACTTAAAAAAATGAGGTGAATAAACCATGCTTATCAGTATCCTA AAATATTGTGTTCATTCATTTTTGTTTTTTGTCTTAAGTAGGTTTTTTTCTCTTTATGTA CTTAGCTGCTTATATTTGACGGTTTCGTGTAAAATATATGTTATGTACGCGTAAAAAAAA AAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)