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Schistosoma mansoni
cluster # 9254 cluster # 9254       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9254#0 length = 1634 sequences # 9  

consensusID : consensus_9254#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1634
fasta sequence
                              [TTCCAGCACGTTGGTGTATCTGTTATTGACAATTTGATTAGAGGAGAATATATTTATGAAAATAGCTGTCTGAAATGCGGTTTCACATCCCGGTTACCTTCAAAGTTTTTAGAACTATCCTTGAAAGTTTCTTCAAAGTCACTTCCAGATTGTATACGGGATTATTTAAAGGAAGAACAATTAGTTGGTGATAATCGATATGCTTGTTCACAGTGTGGTTGCAAACGAGATGGTATTAGAAGAGCCTATATAACACGTGCTCCGCCATTGTTATGCATCCAGTTGCTTAGATTCACTTACGATTCAAACACTGGTCAACGTAAAAAGTATAAAGCTTCTATTCGTCTACCTGATCTTCTTGAGTTAACAAGAGTTGTTGAAAATCCAAAAAGTGATAAACATCTGAATTGTGAGCATTCTGTGGAATGTTTGAGTGTAGATTCAGATCCATGTTATCGTGCATATCGTCTCTGCGGTGTACTTTTACATATTGGCAACCAACCAACATCAGGACATTATATAGCTGTTCTTAGAGATTCTTACAAAAGAACCAATTTATCTGATGATAAAAACACAGAATTAAGTACTGAAGATGATCCTCTTTTAAAATTGGGTGAATGTTGGAGTGTTTGCAATGATATAGATGTCTTCAATGTACCGTCAAATCAATTTAAATTGGCAAAAATTAACGGATCAGCTAAATCATTGCAAACCTATTTAACCACTACTGAAACAACAGATTCATCAATAAACCTTACTAAATCTGATCAACCTTCTGAAAAGTGTTCTAGTCGTAGATCAGCTAAAAAACGTCGTCATGATACTTCCTCAAATGATCTTAGTTTCACTGACCTCGATGAAAGTAGAGATTATACAG-CTCCTAAGTGTATATCACAGGACGATTTATGGCATAGTTCAACTAATGCGTATATGGTATTTTATGAATCGGTGGATAATTGTAATTTGGATGAAGATATTGCAGTTCCTAGTGACTTACGCAAAACTATTGAAGAAGTAAATTTAACTGAACAACAAAAGCTTAT-ATCTGAACAACAAAATAAAGTAAATCATAAAAATCAGTTACTTGAAATACTATCCAACCTGAAATTACCTGATCCTATCAATTTATCACCAAATAATCATACTTTGATATCAATGAATTCTCTTGATGATGTATCTTTGGTATCAACATCTTGGTTACGTGATTGCCTTAATAATCCATTGTTATTAAGAGATGTCTGTTCAACTGATGCTCAAATAAAATCGCTTTCAAAACTCAAAGACTACATATTTCCTTCTTCTTTACCAAATCAATCCTCTTATGCCTTACGTACATGTTCACATGGCCGTGTTCCTATTGATCTTGCTGCAGGTTCATACAGGGCTGTTTCTACCAAAGGTCTTAAGAAGCTTA-TTGACATTCTCTTCTCAAAATCATTTGATGCCATTCAATCCGAAGATGCTAGGTTTGATCAATTTCAACCATGTCGAAAGTGTATTACATTAAATATCGCATTAATAAAAGTTGAAAATGCAATTAAAGAATTATCTAAGGAATTGGATTATTTCATANAATATAATCATTTGTCTTCCTCATATTATAAACGTCTTCAAAGTGAAAAGACAGACTCAAT]

[+] EMBL CD153358             [TTCCAGCACGTTGGTGTATCTGTTATTGACAATTTGATTAGAGGAGAATATATTTATGAAAATAGCTGTCTGAAATGCGGTTTCACATCCCGGTTACCTTCAAAGTTTTTAGAACTATCCTTGAAAGTTTCTTCAAAGTCACTTCCAGATTGTATACGGGATTATTTAAAGGAAGAACAATTAGTTGGTGATAATCGATATGCTTGTTCACAGTGTGGTTGCAAACGAGATGGTATTAGAAGAGCCTATATAACACGTGCTCCGCCATTGTTATGCATCCAGTTGCTTAGATTCACTTACGATTCAAACACTGGTCAACGTAAAAAGTATAAAGCTTCTATTCGTCTACCTGATCTTCTTGAGTTAACAAGAGTTGTTGAAAATCCAAAAAGTGATAAACATCTGAATTGTGAGCATTCTGTGGAATGTTTGAGTGTAGATTCAGATCCATGTTATCGTGCATATCGTCTCTGCGGTGTACTTTTACATATTGGCAACCAACCAACATCAGGACATTATATAGCTGTTCTTAGAGATTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD094585             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TCTCTGCGGTGTACTTTTACATATTGGCAACCAACCAACATCAGGACATTATATAGCTGTTCTTAGAGATTCTTACAAAAGAACCAATTTATCTGATGATAAAAACACAGAATTAAGTACTGAAGATGATCCTCTTTTAAAATTGGGTGAATGTTGGAGTGTTTGCAATGATATAGATGTCTTCAATGTACCGTCAAATCAATTTAAATTGGCAAAAATTAACGGATCAGCTAAATCATTGCAAACCTATTTAACCACTACTGAAACAACAGATTCATCAATAAACCTTACTAAATCTGATCAACCTTCTGAAAAGTGTTCTAGTCGTAGATCAGCTAAAAAACGTCGTCATGATACTTCCTCAAGTGATCTTAGTTTCACTGACCTCGATGAAAGTAGAGATTATACAG CTCCTAAGTGTATATCACAGGACGATTTATGGCATAGTTCAACTAATGCGTATATGGTATTTTATGAATCGGTGGATAATTGTAATTTGGATGAAGATATTGCAGTTCCTAGTGACTTACGCAAAACTATTGAAGAAGTAAATTTAACTGAACAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD065076             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTATATAGCTGTTCTTAGAGATTCTTACAAAAGAACCAATTTATCTGATGATAAAAACACAGAATTAAGTACTGAAGATGATCCTCTTTTAAAATTGGGTGAATGTTGGAGTGTTTGCAATGATATAGATGTCTTCAATGTACCGTCAAATCAATTTAAATTGGCAAAAATTAACGGATCAGCTAAATCATTGCAAACCTATTTAACCACTACTGAAACAACAGATTCATCAATAAACCTTACTAAATCTGATCAACCTTCTGAAAAGTGTTCTAGTCGTAGATCAGCTAAAAAACGTCGTCATGATACTTCCTCAAATGATCTTAGTTTCACTGACCTCGATGAAAGTAGAGATTATACAGCCTCCTAAGTGTATATCACAGGACGATTTATGGCATAGTTCAACTAATGCGAATATGGTATTTTATGAATCGGCGGATAATTGTCATTTGCATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD167005             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTATATAGCTGTTCTTAGAGATTCTTACAAAAGAACCAATTTATCTGATGATAAAAACACAGAATTAAGTACTGAAGATGATCCTCTTTTAAAATTGGGTGAATGTTGGAGTGTTTGCAATGATATAGATGTCTTCAATGTACCGTCAAATCAATTTAAATTGGCAAAAATTAACGGATCAGCTAAATCATTGCAAACCTATTTAACCACTACTGAAACAACAGATTCATCAATAAACCTTACTAAATCTGATCAACCTTCTGAAAAGTGTTCTAGTCGTAGATCAGCTAAAAAACGTCGTCATGATACTTCCTCAAATGATCTTAGTTTCACTGACCTCGATGAAAGTAGAGATTATACAG CTCCTAAGTGTATATCACAGGACGATTTATGGCATAGTTCAACTAATGCGTATATGGTATTTTATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD129412             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            aatccGGACGATTTATGGCATAGTT AACTAATGCGTATATGGTATTTTATGAATCGGGGGATAATTGTAATTTGGATGAACATATTGCAGTTCCTAGTGACTTACGCAAAACTATTGAAGAAGTAAACTTAACTGAACAACAAAAGCTTAT ATCTGAACAACAAAATAAAGTAAATCATAAAAATCAGTTACTTGAAATACTATCCAACCTGAAATTACCTGATCCTATCAATTTATGACCAAATAATCATACTTTGATATCAATGAATTCTCTTGATGATGTATCTTTGGCATCAACATATTGGTTACGTGATTGCCTTAATAATCCATTGTTATTAAGAGATGTCTGCTCAACTGATGCTCAAATAAAATCGCTTTCAAAACTCAAAGACTACATATTTCCTTCTTCTTTACCAAATCAATCCTCTTATGCCTTACGTACATGTTCACATGGCCGTGTTCCTATTGATCTTGCTGCAGGTTCATACAGGGCTGCTATTACCAAAGGTCTTA                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD129409             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GCATAGTTCAACTAATGCGTATATGGTATTTTATGAATCGGTGGATAATTGTAATTTGGATGAAGATATTGCAGTTCCTAGTGACTTACGCAAAACTATTGAAGAAGTAAACTTAACTGAACAACAAAAGCTTAT ATCTGAACAACAAAATAAAGTAAATCATAAAAATCAGTTACTTGAAATACTATCCAACCTGAAATTACCTGATCCTATCAATTTATCACCAAATAATCATACTTTGATATCAATGAATTCTCTTGATGATGTATCTTTGGTATCAACATCTTGGTTACGTGATTGCCTTAATAATCCATTGTTATTAAGAGATGTCTGTTCAACTGATGCTCAAATAAAATCGCTTTCAAAACTCAAAGACTACATATTTCCTTCTTCTTTACCAAATCAATCCTCTTATGCCTTACGTACATGTTCACATGGCCGTGTTCCTATTGATCTTGCTGCAGGTTCATACAGGGCTGTTTCTACCAAAGGTCTTAAGAAGCTTA TTGACATTCTCTTCTCAAAATCATTTGATGCCATTCAATCCGAAGATGCTAGGTTTGATCAATTTCAACCATGTCGAAAGTGTATTACATTAAATATCGCATTAATAAAAGTTGAAAATGCAATTAAAGAATTATCTAAGGAATTGGATTATTTCATANAATATAATCATTTGTCTTCCTCATATT                                  ]
[+] EMBL CD126867             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AACTATTGAAGAAGTAAATTTAACTGAACAACAAAAGCTTAT ATCTGAACAACAAAATAAAGTAAATCATAAAAATCAGTTACTTGAAATACTATCCAACCTGAAATTACCTGATCCTATCAATTTATCACCAAATAATCATACTTTGATATCAATGAATTCTCTTGATGATGTATCTTTGGTATCAACATCTTGGTTACGTGATTGCCTTAATAATCCATTGTTATTAAGAGATGTCTGTTTAACTGATGCTCAAATAAAATCGCTTTCAAAACTCAAAGACTACATATTTCCTTCTTCTTTACCAAATCAATCCTCTTATGCCTTACGTACATGTTCACATGGCCGTGTTCCTATTGATCTTGCTGCAGGTTCATACAGGGCTGTTTCTACCAAAGGTCTTAAGAAGCTTATTTGACATTCT                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD126885             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACAAAAGCTTATAATCTGAACAACAAAATAAAGTAAATCATAAAAATCAGTTACTTGAAATACTATCCAACCTGAAATTACCTGATCCTATCAATTTATCACCAAATAATCATACTTTGATATCAATGAATTCTCTTGATGATGTATCTTTGGTATCAACATCTTGGTTACGTGATTGCCTTAATAATCCATTGTTATTAAGAGATGTCTATTTAACTGATGCTCAAATAAAATCGCTTTCAAAACTCAAAGACTACATATTTCCTTCTTCTTTACCAAATCAATCCCCTTATGCCTTACGTACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD066669             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCACATGGCCGTGTTCCTATTGATCTTGCTGCAGGTTCATACAGGGCTGTTTCCACCAAAGGTCTTAAGAAGCTTA TTGACATTCTCTTCTCAAAATCATTTGATGCCATTCAATCCGAAGATGCTAGGTTTGATCAATTTCAACCATGTCGAAAGTGTATTACATTAAATATCGCATTAATAAAAGTTGAAAATGCAATTAAAGAATTATCTAAGGAATTGGATTATTTCATAAAATATAATCATTTGTCTTCCTCATATTATAAACGTCTTCAAAGTGAAAAGACAGACTCAAT]


>consensus_9254#0 TTCCAGCACGTTGGTGTATCTGTTATTGACAATTTGATTAGAGGAGAATATATTTATGAA AATAGCTGTCTGAAATGCGGTTTCACATCCCGGTTACCTTCAAAGTTTTTAGAACTATCC TTGAAAGTTTCTTCAAAGTCACTTCCAGATTGTATACGGGATTATTTAAAGGAAGAACAA TTAGTTGGTGATAATCGATATGCTTGTTCACAGTGTGGTTGCAAACGAGATGGTATTAGA AGAGCCTATATAACACGTGCTCCGCCATTGTTATGCATCCAGTTGCTTAGATTCACTTAC GATTCAAACACTGGTCAACGTAAAAAGTATAAAGCTTCTATTCGTCTACCTGATCTTCTT GAGTTAACAAGAGTTGTTGAAAATCCAAAAAGTGATAAACATCTGAATTGTGAGCATTCT GTGGAATGTTTGAGTGTAGATTCAGATCCATGTTATCGTGCATATCGTCTCTGCGGTGTA CTTTTACATATTGGCAACCAACCAACATCAGGACATTATATAGCTGTTCTTAGAGATTCT TACAAAAGAACCAATTTATCTGATGATAAAAACACAGAATTAAGTACTGAAGATGATCCT CTTTTAAAATTGGGTGAATGTTGGAGTGTTTGCAATGATATAGATGTCTTCAATGTACCG TCAAATCAATTTAAATTGGCAAAAATTAACGGATCAGCTAAATCATTGCAAACCTATTTA ACCACTACTGAAACAACAGATTCATCAATAAACCTTACTAAATCTGATCAACCTTCTGAA AAGTGTTCTAGTCGTAGATCAGCTAAAAAACGTCGTCATGATACTTCCTCAAATGATCTT AGTTTCACTGACCTCGATGAAAGTAGAGATTATACAGCTCCTAAGTGTATATCACAGGAC GATTTATGGCATAGTTCAACTAATGCGTATATGGTATTTTATGAATCGGTGGATAATTGT AATTTGGATGAAGATATTGCAGTTCCTAGTGACTTACGCAAAACTATTGAAGAAGTAAAT TTAACTGAACAACAAAAGCTTATATCTGAACAACAAAATAAAGTAAATCATAAAAATCAG TTACTTGAAATACTATCCAACCTGAAATTACCTGATCCTATCAATTTATCACCAAATAAT CATACTTTGATATCAATGAATTCTCTTGATGATGTATCTTTGGTATCAACATCTTGGTTA CGTGATTGCCTTAATAATCCATTGTTATTAAGAGATGTCTGTTCAACTGATGCTCAAATA AAATCGCTTTCAAAACTCAAAGACTACATATTTCCTTCTTCTTTACCAAATCAATCCTCT TATGCCTTACGTACATGTTCACATGGCCGTGTTCCTATTGATCTTGCTGCAGGTTCATAC AGGGCTGTTTCTACCAAAGGTCTTAAGAAGCTTATTGACATTCTCTTCTCAAAATCATTT GATGCCATTCAATCCGAAGATGCTAGGTTTGATCAATTTCAACCATGTCGAAAGTGTATT ACATTAAATATCGCATTAATAAAAGTTGAAAATGCAATTAAAGAATTATCTAAGGAATTG GATTATTTCATANAATATAATCATTTGTCTTCCTCATATTATAAACGTCTTCAAAGTGAA AAGACAGACTCAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)