These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9255#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1176 fasta sequence [CTCGCAGGCCGNAATTCGGCACGAGGAATTTTTCAGTTGACGTCCTAATCTATGGAAAGTCACCTCTTCTTATAAGCAAACACAGAAGTTGATTTGTATTTAGGATTTATATCTTCACATGAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTATGTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACAAAGTACATTCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGTTTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATGTATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGGTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATTCCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCCGACCCAATAATGAAACCTGTTGTTATATCCAATTGCACTGCCTTCCAGTGTCAGACTTAAAACATGTTTAGAATGAAACAAGAAATTCTATGTGATATATTAATCTGTTTTAAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATATTTACAGTGAATCAGTCTGTCGATTTTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCAAATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTTAGCTTGTGGGAGGTGTTTTTTTCCAATGCAAATGACATATACTACTGACTATGTTCCTCATTTCCTTGCTTTTTTGTGTTATTGTGTATAGCTAAAATTGTATCATCAAGCGCTTTTAGATGTCTTCCCAGATCATTGGTTTAAAGAGGTACTGATATTTAACCTGAAAATCTATTTAGTTCTGTAATCTTATAATTTCACTGAAGATTCGATGTGTCAATAAAATTTCCATTCATTTGGTTTATTGAGATCATTTAGGTTGACAATTCAATGCCGGTCGTTAAAAATATTTTTTCAACGTACAATCGCAAGATATTTTGTAAATAAACTGTCATTTATTAGATTTCCTCCCCACTTATATATCAAGATTAATCATTTTTACTATTATTCGATAAGTCAACATCTTGCATATT] [+] EMBL CD077985 [CTCGCAGGCCGNAATTCGGCACGAGGAATTTTTCAGTTGACGTCCTAATCTATGGAAAGTCACCTCTTCTTATAAGCAAACACAGAAGTTGATTTGTATTTAGGATTTATATCTTCACATGAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTATGTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACANAGTACt ] [-] EMBL CD178795 [ ATTTNTCAGTTGACGTCNTAATCTATGGANAGTCACCTCTTCTTATAAGCAAACACAGAAGTTGATTTGTATTTAGGATTTATATCTTCACATGAAATTATCCTTATAATTATTACTCTCAGTCAACTGTAACTCAGAATCTCATCCAATTATGTTTTGTGTTCATTTCACGCTTCTGTCACTATCAATATAGATAGATATGACAAAGTACATTCATTTTTACAACCAAATTATGGCTGACCGGTTGTTTTTTGTTATGATTATTATTTTTGTTTTCCTTCACGTCCATTTTCAGATTTAAAACAAAATACATTTTAAATTCTTTTGTACATGTATTTGATCAGTTTTGCATCTTTTGTTACCTTATGTATACTTGGGGTTTTTTTGTTCATCCTTATATTATTATGTGTTGAATTGTTAATGTTTTATGCGCTCTTTTGGTTCAGTTGGATTCCATTCAATCTTCATCGTCAAGTTATTGCTACTACAAGAGTATTATCTGTCACAACTGCCGACCCAATAATAAAACCTGTTGTTATATCCA ] [-] EMBL CD178784 [ 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EMBL CD066520 [ cAGTTTAATTTTCTCTCGCTTATATTTACAGTGAATCAGTCTGACGATTTTTAAAATTCTATTTTACTTATTAATGTTTCAAATCACATATATATTGGACATTTGCCTATTTAGCTTGTGGGAGGTGTTTTTTTCCAATGCAAATGACATATACTACTGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||