Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9294 cluster # 9294       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9294#0 length = 1573 sequences # 9  

consensusID : consensus_9294#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1573
fasta sequence
                              [TTCTTATGACTGAGTACAAGTTAGTTGTTGTTGGAGCTGGTGGAGTTGGCAAAAGTGCTCTTACTATCCAGCTCATTCAGAATCATTTTGTTGAGGAATATGACCCAACGATAGAGGACTCTTATAGAAAACAGATGGTCATTGATGGAGAAATATGCTTGTTAGATATCTTAGATACTGCTGGTCAAGAGGAATACAGTGCAATGCGCGATCAGTATATGCGTACTGGAGAGGGGTTTTTATGCGTATTTGCCGTAAACAACTCCAAGAGCTACGATGATATAAATCAATATCGAGAGCAGATCAAAAGAGTCAAAGATGCTGACGAAGTTCCTATGGTTCTTGTTGGAAACAAAGTTGATCTCACAAATCGCAGTGTTTGTACAGAGGAGGCAAAATCTTTAGCCCACTCGTATAATATCCCTTATGTTGAGACTTCCGCCAAGACCAGACAAGGTGTGGAAGATGCGTTTCATAAACTTGTCCGGGAGATCAGAAAATCTAAAGAGAAGAAGGGGAAAGATCGTAAAAAGCGCAAACGAAAATGTTGTATACAATGAATTAACCACTATATTATATTGGGCGCCAGTGGGCTTTATTAAAAAACTGGAATTTAATTTCAAAGCGTCTCAATGATGATTATAATAGCTGTATTTGTGAACTGGCCTTCGTCACTATCCGGTCTTCATAAACTTTTCATCTGATTTAGCATAATTCCACATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACGTATGCGAACATACGAATGTTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTCTCCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAATTTTAGATATCATTCTAGGTATGCTTTCTGCAACTTTTCCACTTTCTTTTCAAATTAATCGCGTTCTGTACATGTATTCATCGCGCGACTAATCTCCTTTTTTGTCAGCCTCCTATTTGTTTTGATTCAATCTGCTGTACACAATATGTAGTAAAAATAACAATGGCATTTTTGCACACGTACAAACTTTGTGACTTTATTGTTTCCGTTTACGGGTATTATTTTTATTGACACCAATATTGTTATGATTGTTTAATCTCTGAGTGTACATATATCGATTCTTTCTTTACTTTATTTGTCATCTTGTTTTATGCAATATATGATTATGGAAAATTGGATATAATGATTATTTTGAGCTATGTATTAGAAAAATATAAAACCGTTAGTTTGACAGGTTGAGATAGATTCAATCTGTCTTTTTTTGTCAAGGTCACCATCTTTATGTTCGTACAAATTGAATGGATATCGAGCCTGACAAAACATCAGTTGGACGTTTCTGTTTATCTGTCAATCAGTATTTCCATATTGTTTGTTTCTCAACCTGTCATCCTTAAATCCAAAATCGTATATATTTTCTTGAATTGAAAGTTGCACTAGTAAATATAAATTTGTCGGTTCGGTATAATAAATGCTTTTTATTGGTTTCATACACATGCTGATTGTATATTGTTAAATATAATAATTACAGTTAAAAAAA]

[+] EMBL SM53177              [TTCTTATGACTGAGTACAAGTTAGTTGTTGTTGGAGCTGGTGGAGTTGGCAAAAGTGCTCTTACTATCCAGCTCATTCAGAATCATTTTGTTGAGGAATATGACCCAACGATAGAGGACTCTTATAGAAAACAGATGGTCATTGATGGAGAAATATGCTTGTTAGATATCTTAGATACTGCTGGTCAAGAGGAATACAGTGCAATGCGCGATCAGTATATGCGTACTGGAGAGGGGTTTTTATGCGTATTTGCCGTAAACAACTCCAAGAGCTACGATGATATAAATCAATATCGAGAGCAGATCAAAAGAGTCAAAGATGCTGACGAAGTTCCTATGGTTCTTGTTGGAAACAAAGTTGATCTCACAAATCGCAGTGTTTGTACAGAGGAGGCAAAATCTTTAGCCCACTCGTATAATATCCCGTATGTTGAGACTTCCGCCAAGACCAGACAAGGTGTGGAAGATGCGTTTCATAAACTTGTCCGGGAGATCAGAAAATCTAAAGAGAAGAAGGGGAAAGATCGTAAAAAGCGCAAACGAAAATGTTGTATACAATGAATTAACCACTATATTATATTGGGCGCCAGTGGGCTTTATTAAAAAACTGGAATTTAATTTCAAAGCGTCTCAATGATGATTATAATAGCTATATTTGTGAACTGGCCTTCGTCACTATCCGGTCTTCATAAACTTTTCATCTGATTTAGCATAATTCCACATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACGTATGCGAACATACGAATGTTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTCTCCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAATTTTAGATATCATTCTAGGTATGCTTTCTGCAACTTTTCCACTTTCTTTTCAAATTAATCGCGTTCTGTACATGTATTCATCGCGCGACTAATCTCCTTTTTTGTCAGCCTCCTATTTGTTTTGATTCAATCTGCTGTACACAATATGTAGTAAAAATAACAATGGCATTTTTGCACACGTACAAACTTTGTGACTTTATTGTTTCCGTTTACGGGTATTATTTTTATTGACACCAATATTGTTATGATTGTTTAATCTCTGAGTGTACATATATCGATTCTTTCTTTACTTTATTTGTCATCTTGTTTTATGCAATATATGATTATGGAAAATTGGATATAATGATTATTTTGAGCTATGTATTAGAAAAATATAAAACCGTTAGTTTGACAGGTTGAGATAGATTCAATCTGTCTTTTTTTGTCAAGGTCACCATCTTTATGTTCGTACAAATTGAATGGATATCGAGCCTGACAAAACATCAGTTGGACGTTTCTGTTTATCTGTCAATCAGTATTTCCATATTGTTTGTTTCTCAACCTGTCATCCTTAAATCCAAAATCGTATATATTTTCTTGAATTGAAAGTTGCACTAGTAAATATAAATTTGTCGGTTCGGTATAATAAATGCTTTTTATTGGTTTCATACACATGCTGATTGTATATTGTTAAATATAATAATTACAGTTAAAAAAA]
[+] EMBL CD188423             [                                                    AAGCGCTCTTACTATCCAGCTTATTCAGAATCATTTTGTTGAGGAATATGACCCAACGATAGAGGACTCTTGTAGAAAACAGATGGTCATTGATGGAGAAATATGCTTGTTAGATATCTTAGATACTGCTGGTCAAGAGGAATACAGTGCAATGCGCGATCAGTATATGCGTACTGGAGAGGGGTTTTTATGCGTATTTGCCGTAAACAACTCCAAGAGCTACGATGATATAAATCAATATCGAGAGCAGATCAAAAGAGTCAAAGATGCTGACGAAGTTCCTATGGTTCTTGTTGGAAACAAAGTTGATCTCACAAATCGCAGTGTTTGTACAGAGGAGGCAAAATCTTTAGCCCACTCGTATAATATCCCTTATGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL SM11479              [                                                                                                                   GGACTCTTATAGAAAACAGATGGTCATTGATGGAGAAATATGCTTGTTAGATATCTTAGATACTGCTGGTCAAGAGGAATACAGTGCAATGCGCGATCAGTATATGCGTACTGGAGAGGGGTTTTTATGCGTATTTGCCGTAAACAACTCCAAGAGCTACGATGATATAAATCAATATCGAGAGCAGATCAAAAGAGTCAAAGATGCTGACGAAGTTCCTATGGTTCTTGTTGGAAACAAAGTTGATCTCACAAATCGCAGTGTTTGTACAGAGGAGGCAAAATCTTTAGCCCACTCGTATAATATCCCTTATGTTGAGACTTCCGCCAAGACCAGACAAGGTGTGGAAGATGCGTTTCATAAACTTGTCCGGGAGATCAGAAAATCTAAAGAGAAGAAGGGGAAAGATCGTAAAAAGCGCAAACGAAAATGTTGTATACAATGAATTAACCACTATATTATATTGGGCGCCAGTGGGCTTTATTAAAAAACTGGAATTTAATTTCAAAGCGTCTCAATGATGATTATAATAGCTGTATTTGTGAACTGGCCTTCGTCACTATCCGGTCTTCATAAACTTTTCATCTGATTTAGCATAATTCCACATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACGTATGCGAACATACGAATGTTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTCTCCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAATTTTAGATATCATTCTAGGTATGCTTTCTGCAACTTTTCCACTTTCTTTTCAAATTAATCGCGTTCTGTACATGTATTCATCGCGCGACTAATCTCCTTTTTTGTCAGCCTCCTATTTGTTTTGATTCAATCTGCTGTACACAATATGTAGTAAAAATAACAATGGCATTTTTGCACACGTACAAACTTTGTGACTTTATTGTTTCCGTTTACGGGTATTATTTTTATTGACACTAATATTGTTATGATTGTTTAATCTCTGAGTGTACATATATCGATTCTTTCTTTACTTTATTTGTCATCTTGTTTTATGCAATATATGATTATGGAAAATTGGATATAATGATTATTTTGAGCTATGTATTAGAAAAATATAAAACCGTTAGTTTGACAGGTTGAGATAGATTCAATCTGTCTTTTTTTGTCAAGGTCACCATCTTTATGTTCGTACAAATTGAATGGATATCGAGCCTGACAAAACATCAGTTGGACGTTTCTGTTTATCTGTCAATCAGTATTTCCATATTGTTTGTTTCTCAACCTGTCATCCTTAAATCCAAAATCGTATATATTTTCTTGAATTGAAAGTTGCACTAGTAAATATAAATTTG                                                                                      ]
[-] EMBL CD198514             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCGTATAATATCCCTTATGTTGAGACTTCCGCCAAGACCAGACAAGGTGTGGAAGATGCGTTTCATAAACTTGTCCGGGAGATCAGAAAATCTAAAGAGAAGAAGGGGAAAGATCGTAAAAAGCGCAAACGAAAATGTTGTATACAATGAATTAACCACTATATTATATTGGGCGCCAGTGGGCTTTATTAAAAAACTGGAATTTAATTTCAAAGCGTCTCAATGATGATTATAATAGCTGTATTTGTGAACTGGCCTTCGTCACTATCCGGTCTTCATAAACTTTTCATCTGATTTAGCATAATTCCACATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACGTATGCGAACATACGAATGTTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTCTCCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI618821             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTCGTCACTATCCGGTCTTCATAAACTTTTCATCTGATTTAGCATAATTCCACATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACGTATGCGAACATACGAATGTTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTCTCCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAATTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD137212             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCTGATTTAGCATAATTCCACATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACGTATGCGAACATACGAATGCTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTCTCCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAATTTTAGATATCATTCTAGGTATGCTTTCTGCAACTTTTCCACTTTCTTTTCAAATTAATCGCGTTCTGTACATGTATTCATCGCGCGACTAATCTCCTTTTTTGTCAGCCTCCTATTTGTTTTGATTCAATCTGCTGTACACAATATGTAGTAAAAATAACAATGGCATTTTTGCACACGTACAAACTTTGTGACTTTATTGTTTCCGTTTACGGGTATTATTTTTATTGACACCAATATTGTTATGATTGTTTAATCTCTGAGTGTACATATATCGATTCTTTCTTTACTTTATTTGNCATCTTGgt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD139983             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCATAATTCCACATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACGTATGCGAACATACGAATGTTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTCACCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAATTTTAGATATCATTCTAGGTATGCTTTCTGCAACTTTTCCACTTTCTTTTCAAA TAATCGCngtc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD140047             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCATAATTCCACATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACGTATGCGAACATACGAATGTTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTCTCCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAATTTTAGATATCATTCTAGGTATGCTTTCTGCAACTTTTCCACTTTCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD140048             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTGTCAAGGTCACCATCTTTATGTTCGTACAAATTGAATGGATATCGAGCCTGACAAAACATCAGTTGGACGTTTCTGTTTATCTGTCAATCAGTATTTCCATATTGTTTGTTTCTCAACCTGTCATCCTTAAATCCAAAATCGTATATATT                                                                                                                            ]


>consensus_9294#0 TTCTTATGACTGAGTACAAGTTAGTTGTTGTTGGAGCTGGTGGAGTTGGCAAAAGTGCTC TTACTATCCAGCTCATTCAGAATCATTTTGTTGAGGAATATGACCCAACGATAGAGGACT CTTATAGAAAACAGATGGTCATTGATGGAGAAATATGCTTGTTAGATATCTTAGATACTG CTGGTCAAGAGGAATACAGTGCAATGCGCGATCAGTATATGCGTACTGGAGAGGGGTTTT TATGCGTATTTGCCGTAAACAACTCCAAGAGCTACGATGATATAAATCAATATCGAGAGC AGATCAAAAGAGTCAAAGATGCTGACGAAGTTCCTATGGTTCTTGTTGGAAACAAAGTTG ATCTCACAAATCGCAGTGTTTGTACAGAGGAGGCAAAATCTTTAGCCCACTCGTATAATA TCCCTTATGTTGAGACTTCCGCCAAGACCAGACAAGGTGTGGAAGATGCGTTTCATAAAC TTGTCCGGGAGATCAGAAAATCTAAAGAGAAGAAGGGGAAAGATCGTAAAAAGCGCAAAC GAAAATGTTGTATACAATGAATTAACCACTATATTATATTGGGCGCCAGTGGGCTTTATT AAAAAACTGGAATTTAATTTCAAAGCGTCTCAATGATGATTATAATAGCTGTATTTGTGA ACTGGCCTTCGTCACTATCCGGTCTTCATAAACTTTTCATCTGATTTAGCATAATTCCAC ATCTGCTCTAGCAGTTTTACTAAAAAGTTACTTTGAATAATTGTTTTGTTCGTACATACG TATGCGAACATACGAATGTTTTAAAATTTAACTTGTTTGAACTTTTGTATGAGTTTTGTC TCCCTTTCGATTTATATATATGGTAAAACAATGCAATTTTAGATATCATTCTAGGTATGC TTTCTGCAACTTTTCCACTTTCTTTTCAAATTAATCGCGTTCTGTACATGTATTCATCGC GCGACTAATCTCCTTTTTTGTCAGCCTCCTATTTGTTTTGATTCAATCTGCTGTACACAA TATGTAGTAAAAATAACAATGGCATTTTTGCACACGTACAAACTTTGTGACTTTATTGTT TCCGTTTACGGGTATTATTTTTATTGACACCAATATTGTTATGATTGTTTAATCTCTGAG TGTACATATATCGATTCTTTCTTTACTTTATTTGTCATCTTGTTTTATGCAATATATGAT TATGGAAAATTGGATATAATGATTATTTTGAGCTATGTATTAGAAAAATATAAAACCGTT AGTTTGACAGGTTGAGATAGATTCAATCTGTCTTTTTTTGTCAAGGTCACCATCTTTATG TTCGTACAAATTGAATGGATATCGAGCCTGACAAAACATCAGTTGGACGTTTCTGTTTAT CTGTCAATCAGTATTTCCATATTGTTTGTTTCTCAACCTGTCATCCTTAAATCCAAAATC GTATATATTTTCTTGAATTGAAAGTTGCACTAGTAAATATAAATTTGTCGGTTCGGTATA ATAAATGCTTTTTATTGGTTTCATACACATGCTGATTGTATATTGTTAAATATAATAATT ACAGTTAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)