These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9329#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 591 fasta sequence [GGTATCATTGAAGTCATTATTACCACAATAAAACGACAGCCGCTACACGACTTTCGTTGATATTAAAAACTAGAATAAAGAAAACATGTAATAAACCAACAGGTGAGAAATACAAGCCACAATGTAGGCTTCAAAATAGACTTACAGAACCTTC-TAAAGAAAAAATGACAATAATTGTACGTTTCAAAACATGAAAATGGAATCATTGTTGCTAAAACATGACTTATTCTTCTGGAGCTTTAAAGAAAGACAAAAATGAAACGCCTTATAATGCAAAAGTTAGACAGTGATGAATAAAAAAAGATTAAACTCTGAGATTTTGGTACATAATTGTATTGTCAATAGGACCAAAGAAATAATCGGCAATTAATGCAGAAAAACGGAATGGATAAGGAAAGTAATCACTTATTAAGACATCCTATAAGGAGCCAAAAAAACAACGGAACAAATGCATGACCATTAAAAGAATGTTGAGAACTATGAAAACGGCCTGAGCCTGAAGTATGAGCAATCCGAGACCACAACACTAAGGTAAGTGGTTGTGAAAACAGCTAATTGTCATGTAAAGAAATTTATGAAAGGCACGTGTGT] [+] EMBL AI068322 [GGTATCATTGAAGTCATTATTACCACAATAAAACGACAGCCGCTACACGACTTTCGTTGATATTAAAAACTAGAATAAAGAAAACATGTAATAAACCAACAGGTGAGAAATACAAGCCACAATGTAGGCTTCAAAATAGACTTACAGAACCTTC TAAAGAAAAAATGACAATAATTGTACGTTTCAAAACATGAAAATGGAATCATTGTTGCTAAAACATGACTTATTCTTCTGGAGCTTTAAAGAAAGACAAAAATGAAACGCCTTATAATGCAAAAGTTAGACAGTGATGAATAAAAAAAGATTAAACTCTGAGATTTTGGTACATAATTGTATTGTCAATAGGACCAAAGAAATAATCGGCAATTAATGCAGAAAAACGGAATGGATAAGGAAAGTAATCACTTATTAAGACATCCTATAAGGAGC ] [+] EMBL CD136805 [ CAGAACCTTC TAAAGAAAAAATGACAATAATTGTACGTTTCAAAACATGAAAATGGAATCATTGTTGCTAAAACATGACTTATTCTTCTGGAGCTTTAAAGAAAGACAAAAATGAAACGCCTTATAATGCAAAAGTTAGACAGTGATGAATAAAAAAAGATTAAACTCTGAGATTTTGGTACATAATTGTATTGTCAATAGGACCAAAGAAATAATCGGCAATTAATGCAGAAAAACGGAATGGATAAGGAAAGTAATCACTTATTAAGACATCCTATAAGGAGCCAAAAAAACAACGGAACAAATGCATGACCATTAAAAGAATGTTGAGAACTATGAAAACGGCCTGAGCCTGAAGTATGAGCAATCCGAGACCACAACACTAAGGTAAGTGGTTGTGAAAACAGCTAATTGTCATG ] [+] EMBL CD136747 [ CAGAACCTTC TAAAGAAAAAATGACAATAATTGTACGTTTCAAAACATGAAAATGGAATCATTGTTGCTAAAACATGACTTATTCTTCTGGAGCTTTAAGGAAAGCCAAAAATGAAACGCCTTATAATGCAAAAGTTAGACAGTGATGAATAAAAAAAGATTAAACTCTGAGATTTTGGTACATAATTGTATTGTCAATAGGACCAAAGAAATAATCGGCAATTAATGCAGAAAAACGGAATGGATAAGGAAAGTAATCACTTATTAAGACATCCTATAAGGAGCCAAAAAAACAACGGAACAAATGCATGACCATTAAAAGAATGTTGAGAACTATGAAAACGGCCTGAGCCTGAAGTATGAGCAATCCGAGACCACAACACTAAGGTAAGTGGTTGTGAAAACAGCTAATTGTCATG ] [-] EMBL CD137309 [ AGAACC TC TAAAGAAAAAATGACAATAATTGTACGTTTCAAAACATGAAAATGGAATCATTGTTGCTAAAACATGACTTATTCTTCTGGAGCTTTAAAGAAAGACAAAAATGAAACGCCTTATAATGCAANAGTTAGACAGTGATGAATAAAAAAAGATTAAACTCTGAGATTTTGGTACATAATTGTATTGTCAATAGGACCAAAGAAATAATCGGCAATTAATGCAGAAAAACGGAATGGATAAGGAAAGTAATCACTTATTAAGACATCCTATAAGGAGCCAAAAAAACAACGGAACAAATGCATGACCATTAAAAGAATGTTGAGAACTATGAAAACGGCCTGAGCCTGAAGTATGAGCAATCCGAGACCACAACACTAAGGTAAGTGGTTGTGAAAACAGCTAATTGTCATGT ] [+] EMBL CD136916 [ ngCCTTCATTAAGAAAAAATGACAATAATTGTACGTTTCAAAACATGAAAATGGAATCATTGTTGCTAAAACATGACTTATTCTTCTGGAGCTTTAAAGAAAGACAAAAATGAAACGCCTTATAATGCAAAAGTTAGACAGTGATGAATAAAAAAAGATTAAACTCTGAGATTTTGGTACATAATTGTATTGTCAATAGGACCAAAGAAATAATCGGCAATTAATGCAGAAAAACGGAATGGATAAGGAAAGTAATCACTTATTAAGACATCCTATAAGGAGCCAAAAAAACAACGGAACAAATGCATGACCATTAAAAGAATGTTGAGAACTATGAAAACGGCCTGAGCCTGAAGTATGAGCAATCCGAGACCACAACACTAAGGTAAGTGGTTGTGAAAACAGCTAATTGTCATG ] [-] EMBL CD137004 [ ACAATAATTGTACGTTTCAAAACATGAAAATGGAATCATTGTTGCTAAAACATGACTTATTCTTCTGGAGCTTTAAAGAAAGACAAAAATGAAACGCCTTATAATGCAAAAGTTAGACAGTGATGAATAAAAAAAGATTAAACTCTGAGATTTTGGTACATAATTGTATTGTCAATAGGACCAAAGAAATAATCGGCAATTAATGCAGAAAAACGGAATGGATAAGGAAAGTAATCACTTATTAAGACATCCTATAAGGAGCCAAAAAAACAACGGAACAAATGCATGACCATTAAGAGAATGTTGAGAACTATGAAAACGGCCTGAGCCTGAAGTATGAGCAATCCGAGACCACAACACTAAGGTAAGTGGTTGTGAAAACAGCTAATTGTCATGT ] [-] EMBL CD137170 [ ACAATAATTGTACGTTTCAAAACATGAAAATGGAATCATTGTTGCTAAAACATGACTTATTCTTCTGGAGCTTTAAAGAAAGACAAAAATGAAACGCCTTATAATGCAAAAGTTAGACAGTGATGAATAAAAAAAGATTAAACTCTGAGATTTTGGTACATAATTGTATTGTCAATAGGACCAAAGAAATAATCGGCAATTAATGCAGAAAAACGGAATGGATAAGGAAAGTAATCACTTATTAAGACATCCTATAAGGAGCCAAAAAAACAACGGAACAAATGCATGACCATTAAAAGAATGTTGAGAACTATGAAAACGGCCTGAGCCTGAAGTATGAGCAATCCGAGACCACAACACTAAGGTAAGTGGTTGTGAAAACAGCTAATTGTCATGT ] [+] EMBL CD136955 [ ACAATAATTGTACGTTTCAAAACATGAAAATGGAATCATTGTCGCTAAAACATGACTTATTCTTCTGGAGCTTTAAAGAAAGACAAAAATGAAACGCCTTATAATGCAAAAGTTAGACAGTGATGAATAAAAAAAGATTAAACTCTGAGATTTTGGTACATAATTGTATTGTCAATAGGACCAAAGAAATAATCGGCAATTAATGCAGAAAAACGGAATGGATAAGGAAAGTAATCACTTATTAAGACATCCTATAAGGAGCCAAAAAAACAACGGAACAAATGCATGACCATTAAAAGAATGTTGAGAACTATGAAAACGGCCTGAGCCTGAAGTATGAGCAATCCGAGACCACAACACTAAGGTAAGTGGTTGTGAAAACAGCTAATTGTCATG ] [-] EMBL CD142380 [ GTAATCACTTATTAAGACAGCCTATAAGGAGCCAGAAAAACAACGGAACAAATGCATGACCATTAAAAGAATGTTGAGAACTATGAAAACGGCCTGAGCCTGAAGTATGAGCAATCCGAGACCACAACACTAAGGTAAGTGGTTGTGAAAACAGCTAATTGTCATGTAAAGAAATTTATGAAAGGCACGTGTGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||