cluster # 9331

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Schistosoma mansoni
cluster # 9331 cluster # 9331 Sequences # 9 consensus # 4

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consensus_9331#0 length = 1009 sequences # 6
consensus_9331#1 length = 758 sequences # 1

consensus_9331#2 length = 706 sequences # 1
consensus_9331#3 length = 525 sequences # 1

consensusID : consensus_9331#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 1009
fasta sequence

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[+] EMBL AI975404             [TTTGTACGGTGCTCGATAGAACTGAAGGTTTATTTTACAACAACGACAACAGAGAAAAATTAAAAAAAAATCAGGCCAGTAATATCATCGAACGAATTTTCACACGAAATATAAAATGGCTTCCGTTTCTAAGATTATCTATTTAATTTCTATACTTGTTGCAATCGCATGTATTATTGTATCGATTGCCACTAATCCAACATGGAATGATAGTACAAATAATTCCTTGTGGAGAGCAAATGGAGGACTTAGTATAGCCGGACTGATTTTGTTAGTAATAGCAGCTATCCTTGCAATTGTTTTGATTTGCAGAGATTATTCCAGAAGAATAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTGTAGCCTTGATATGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTATGGTCAACAAATTAATTGGCAAGCATGGTTATTATCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD074468             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CAGAAGAATAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGATATGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTATGGTCAACAAATTAATTGGCAAGCATGGTTATTATCAGCTATGTGGGTAACGTTTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGTTGATGATTATTAGATTGCAAGTATTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTAAATAAAGCAAATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTTTACTCGTTTATTCGGATACCCTATTTGTTTATTTATTTTTCTTACATAGTTCTATAAATTAACTCTCTGATTTACTGTAAAGTTCATTTCACTTTATCCGATAATTTCTAACTTGTTTAAATACTGTCTCACTTATTTTGATTATTCTTGAAACTTATCCTCAAAAAAAGGAAAGATATGAATGTCTAGGTATCGACTACTTATCCTGAGATTGGTAATATTCTTTTTATTGTTTAAAAACAAATTAATTTCATTGTTATTACTATAATAATAATTTTTACTAAGATGGTTTGTAGTATCAGCATATACTGTTTTTTAATATGTGCCGCTTATATTTGTTAGGTTTTTATGTAATCAGTATTTCTTATTGAATAAATAGAAATATACTTCCTTTCAAAAATG]
[-] EMBL CD074288             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGATATGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTATGGTCAACAAATTAATTGGCAAGCATGGTTATTATCAGCTATGTGGGTAACGTTTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGTTGATGATTATTAGATTGCAAGTATTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTAAATAAAGCAAATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTTTACTCGTTTATTCGGATACCCTATTTGTTTATTTATTTTTCTTACATAGTTCTATAAATTAACTCTCTGATTTACTGTAAAGTTCATTTCACTTTATCCGATAATTTCTAACTTGTTTAAATACTGTCTCACTTATTTTGATTATTCTTGAAACTTATCCTCAAAAAAAGGAAAGATATGAATGTCTAGGTATCGACTACTTATCCTGAGATTGGTAATATTCTTTTTATTGTTTAAAAACAAATTAATTTCATTGTTATTACTATAATAATAATTTTTACTAAGATGGTTTGTAGTATCAGCATATACTGTTTTTTAATATGTGCCGCTTATATTTGTTAGGTTTTTATGTAATCAGTATTTCTTATTGAATAAATAGAAATATACTTCCTTT        ]
[+] EMBL CD137085             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCTATTTATGGTCAACAAATTAATTGGCAAGCATGGTTATTATCAGCTATGTGGGTAACGTTTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGTTGATGATTATTAGATTGCAAGTATTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTGAATAAAGCAAATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTTTACTCGTTTATTCGGATACCCTATTTGTTTATTTATTTTTCTTACATAGTTCTATAAATTAACTTTCTGATTTACTGTAAAGTTCATTTCACTTTATCCGATAATTTCTAACTTGTTTAAATACTGTCTCACTTATTTTGATTATTCTTGANACTTATCCTCAAAA                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD137153             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCTATTTATGGTCAACAAATTAATTGGCAAGCATGGTTATTATCAGCTATGTGGGTAACGTTTATTCGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGTTGATGATTATTAGATTGCAAGTATTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTAAATAAAGCAAATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTTTACTCGTTTATTCGGATACCCTATTTGTTTATTTATTTTTCTCACATAGTTCTATAAATTAACTCTCTGATTTACTGTAAAGTTCATTTCACTTTATCCGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD137308             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GCAAGTATTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTAAATAAAGCAAATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTTTACTCGTTTATTCGGATACCCTATTTGTTTATTTATTTTTCTTACATAGTTCTATAAATTAACTCTCTGATTTACTGTAAAGCTCATTTCACTTTATCCGATAATTTCTAACTTGTTTAAATACTGTCTCACTTATTTTGATTATTCTTGAAACTTATCCTCAAAAA                                                                                                                                                                                                                                           ]




>consensus_9331#0
TTTGTACGGTGCTCGATAGAACTGAAGGTTTATTTTACAACAACGACAACAGAGAAAAAT
TAAAAAAAAATCAGGCCAGTAATATCATCGAACGAATTTTCACACGAAATATAAAATGGC
TTCCGTTTCTAAGATTATCTATTTAATTTCTATACTTGTTGCAATCGCATGTATTATTGT
ATCGATTGCCACTAATCCAACATGGAATGATAGTACAAATAATTCCTTGTGGAGAGCAAA
TGGAGGACTTAGTATAGCCGGACTGATTTTGTTAGTAATAGCAGCTATCCTTGCAATTGT
TTTGATTTGCAGAGATTATTCCAGAAGAATAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTT
AGCCTTGATATGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTATGGTCAACAAATTAATTGGCAAGC
ATGGTTATTATCAGCTATGTGGGTAACGTTTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTT
ATTGGTTGATGATTATTAGATTGCAAGTATTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATA
AAACAACACAATATTATTTAAATAAAGCAAATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTA
AATATTTTACTCGTTTATTCGGATACCCTATTTGTTTATTTATTTTTCTTACATAGTTCT
ATAAATTAACTCTCTGATTTACTGTAAAGTTCATTTCACTTTATCCGATAATTTCTAACT
TGTTTAAATACTGTCTCACTTATTTTGATTATTCTTGAAACTTATCCTCAAAAAAAGGAA
AGATATGAATGTCTAGGTATCGACTACTTATCCTGAGATTGGTAATATTCTTTTTATTGT
TTAAAAACAAATTAATTTCATTGTTATTACTATAATAATAATTTTTACTAAGATGGTTTG
TAGTATCAGCATATACTGTTTTTTAATATGTGCCGCTTATATTTGTTAGGTTTTTATGTA
ATCAGTATTTCTTATTGAATAAATAGAAATATACTTCCTTTCAAAAATG

consensusID : consensus_9331#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 758
fasta sequence

                              [TTAAAGATCATTTTGATCGTTAAAAATCTACTACTTTTTTACGGTGCTCGATAGAACTGAAGGTTTATTTTACAACAACGACAACAGAGAAAGTAAACCTCTTGGTGAACTACGAGTAAATTAATTACAGAATTAAAAAAAAATCAGGCCAGTAATNNNNNCGAACGAATTTTCACACGAAATATAAAATGGCTTCCGTTTCTAAGATTATCTATTTAATTTCTATACTTGTTGCAATCGCATGTATTATTGTATCGATTGCCACTAATCCAACATGGAATGATAGTACAAATAATTCCTTGTGGAGAGNNNNNNNNNNNNNNNNATAGCCGGACTGATTTTGTTAGTAATAGCAGCTATCCTTGCAATTGTTTTGATTTGCAGAGATTATTCCAGAAGAATAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGATATGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTATGGCAGCTATGTGGGTAACGTTTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGTTGATGATTATTAGATTGCAAGTATTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTAAATAAAGCANATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTNTAACATAGTTCTATAAATTAACTCTCTGATTTACTGGTAAGNTCATTTCACTTTATCCCGATATTTCTAACTTGGTTAAATACTGGCTCACTTNATTTTGATATNNCTGAA]

[+] EMBL CD080965             [TTAAAGATCATTTTGATCGTTAAAAATCTACTACTTTTTTACGGTGCTCGATAGAACTGAAGGTTTATTTTACAACAACGACAACAGAGAAAGTAAACCTCTTGGTGAACTACGAGTAAATTAATTACAGAATTAAAAAAAAATCAGGCCAGTAATNNNNNCGAACGAATTTTCACACGAAATATAAAATGGCTTCCGTTTCTAAGATTATCTATTTAATTTCTATACTTGTTGCAATCGCATGTATTATTGTATCGATTGCCACTAATCCAACATGGAATGATAGTACAAATAATTCCTTGTGGAGAGNNNNNNNNNNNNNNNNATAGCCGGACTGATTTTGTTAGTAATAGCAGCTATCCTTGCAATTGTTTTGATTTGCAGAGATTATTCCAGAAGAATAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGATATGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTATGGCAGCTATGTGGGTAACGTTTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGTTGATGATTATTAGATTGCAAGTATTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTAAATAAAGCANATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTNTAACATAGTTCTATAAATTAACTCTCTGATTTACTGGTAAGNTCATTTCACTTTATCCCGATATTTCTAACTTGGTTAAATACTGGCTCACTTNATTTTGATATNNCTGAA]




>consensus_9331#1
TTAAAGATCATTTTGATCGTTAAAAATCTACTACTTTTTTACGGTGCTCGATAGAACTGA
AGGTTTATTTTACAACAACGACAACAGAGAAAGTAAACCTCTTGGTGAACTACGAGTAAA
TTAATTACAGAATTAAAAAAAAATCAGGCCAGTAATNNNNNCGAACGAATTTTCACACGA
AATATAAAATGGCTTCCGTTTCTAAGATTATCTATTTAATTTCTATACTTGTTGCAATCG
CATGTATTATTGTATCGATTGCCACTAATCCAACATGGAATGATAGTACAAATAATTCCT
TGTGGAGAGNNNNNNNNNNNNNNNNATAGCCGGACTGATTTTGTTAGTAATAGCAGCTAT
CCTTGCAATTGTTTTGATTTGCAGAGATTATTCCAGAAGAATAGTGATCGCAATACTTGT
TTTATTAATTTTAGCCTTGATATGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTATGGCAGCTATGT
GGGTAACGTTTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGTTGATGATTATTAGA
TTGCAAGTATTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTA
AATAAAGCANATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTNTAACATAGTTCTA
TAAATTAACTCTCTGATTTACTGGTAAGNTCATTTCACTTTATCCCGATATTTCTAACTT
GGTTAAATACTGGCTCACTTNATTTTGATATNNCTGAA

consensusID : consensus_9331#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 706
fasta sequence

                              [CTCGNAGGCCAANAATTCGGCACGAGGATTTTGATCGTTAAAAATCTACTACTTTTTTACGGTGCTCGATAGAACTGAAGGTTTATTTTACAACAACGACAACAGAGAAAGTAAACCTCTTGGTGAACTACGATAATATCATCGAACGAATTTTCACACGAAATATAAAATGGCTTCCGTTTCTAAGATTATCTATTTAATTTCTATACTTGTTGCAATCGCATGTATTATTGTATCGATTGCCACTAATCCAACATGGAATGATAGTACAAATAATTCCTTGTGGAGAGCAAATGGAGGACTTAGTATAGCCGGACTGATTTTGTTAGTAATAGCAGCTATCCTTGCAATTGTTTTGATTTGCAGAGATTATTCCAGAAGAATAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGATATGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTATGGTCAACAAATTAATTGGCAAGCATGGTTATTATCAGCTATGTGGGTAACGTTTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGTTGATGATTATTAGATTGCAAGTATTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTAAATAAAGCAAATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTNTACTCGTTTATTCGGATACCCTATTTGTTTATTTATTNTTCTTAC]

[+] EMBL CD080372             [CTCGNAGGCCAANAATTCGGCACGAGGATTTTGATCGTTAAAAATCTACTACTTTTTTACGGTGCTCGATAGAACTGAAGGTTTATTTTACAACAACGACAACAGAGAAAGTAAACCTCTTGGTGAACTACGATAATATCATCGAACGAATTTTCACACGAAATATAAAATGGCTTCCGTTTCTAAGATTATCTATTTAATTTCTATACTTGTTGCAATCGCATGTATTATTGTATCGATTGCCACTAATCCAACATGGAATGATAGTACAAATAATTCCTTGTGGAGAGCAAATGGAGGACTTAGTATAGCCGGACTGATTTTGTTAGTAATAGCAGCTATCCTTGCAATTGTTTTGATTTGCAGAGATTATTCCAGAAGAATAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGATATGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTATGGTCAACAAATTAATTGGCAAGCATGGTTATTATCAGCTATGTGGGTAACGTTTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGTTGATGATTATTAGATTGCAAGTATTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTAAATAAAGCAAATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTNTACTCGTTTATTCGGATACCCTATTTGTTTATTTATTNTTCTTAC]




>consensus_9331#2
CTCGNAGGCCAANAATTCGGCACGAGGATTTTGATCGTTAAAAATCTACTACTTTTTTAC
GGTGCTCGATAGAACTGAAGGTTTATTTTACAACAACGACAACAGAGAAAGTAAACCTCT
TGGTGAACTACGATAATATCATCGAACGAATTTTCACACGAAATATAAAATGGCTTCCGT
TTCTAAGATTATCTATTTAATTTCTATACTTGTTGCAATCGCATGTATTATTGTATCGAT
TGCCACTAATCCAACATGGAATGATAGTACAAATAATTCCTTGTGGAGAGCAAATGGAGG
ACTTAGTATAGCCGGACTGATTTTGTTAGTAATAGCAGCTATCCTTGCAATTGTTTTGAT
TTGCAGAGATTATTCCAGAAGAATAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTT
GATATGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTATGGTCAACAAATTAATTGGCAAGCATGGTT
ATTATCAGCTATGTGGGTAACGTTTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGT
TGATGATTATTAGATTGCAAGTATTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAA
CACAATATTATTTAAATAAAGCAAATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATT
NTACTCGTTTATTCGGATACCCTATTTGTTTATTTATTNTTCTTAC

consensusID : consensus_9331#3
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 525
fasta sequence

                              [GGACTTAGTAAGCCGGACTATTTGTTAGTAATAGCAGCTATCCTGCAATGTTTTGATTTGCAGAGATTATCCAGAAGAATAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGACACGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTACGGTCAACAAATTAATTGGCCAGCATGGTTATTATCAGCTATGTGGGTGACGTTTATTTGTATTCCTATCGCAATAATATTATTAGTGGCTCATGATTACTAGAATGCAAGTAATGCTATCAGTTCACATGGTTTCCCTACATAAGGCAACGCAATACTATTTAAATAGAGCAAATGATTATATCCATTCACACATCAAACTTAAATATTTAAGTCGTCAATTCGGAGTACCCTATATGTTTAGCAATGTATCTTACATAGCTCAATAAATAAACTCTCCGAGTTACTGTAAAGTTCACTTCACGTTAACGGATAATTTAAAACTTGATTAAATACTGTCTCACTTATTATGATTAATCGTTAAAATGATCCTCAAACA]

[-] EMBL CD137180             [GGACTTAGTAAGCCGGACTATTTGTTAGTAATAGCAGCTATCCTGCAATGTTTTGATTTGCAGAGATTATCCAGAAGAATAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGACACGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTACGGTCAACAAATTAATTGGCCAGCATGGTTATTATCAGCTATGTGGGTGACGTTTATTTGTATTCCTATCGCAATAATATTATTAGTGGCTCATGATTACTAGAATGCAAGTAATGCTATCAGTTCACATGGTTTCCCTACATAAGGCAACGCAATACTATTTAAATAGAGCAAATGATTATATCCATTCACACATCAAACTTAAATATTTAAGTCGTCAATTCGGAGTACCCTATATGTTTAGCAATGTATCTTACATAGCTCAATAAATAAACTCTCCGAGTTACTGTAAAGTTCACTTCACGTTAACGGATAATTTAAAACTTGATTAAATACTGTCTCACTTATTATGATTAATCGTTAAAATGATCCTCAAACA]




>consensus_9331#3
GGACTTAGTAAGCCGGACTATTTGTTAGTAATAGCAGCTATCCTGCAATGTTTTGATTTG
CAGAGATTATCCAGAAGAATAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGACA
CGCTTCATAGTTGCTTTGGCTATTTACGGTCAACAAATTAATTGGCCAGCATGGTTATTA
TCAGCTATGTGGGTGACGTTTATTTGTATTCCTATCGCAATAATATTATTAGTGGCTCAT
GATTACTAGAATGCAAGTAATGCTATCAGTTCACATGGTTTCCCTACATAAGGCAACGCA
ATACTATTTAAATAGAGCAAATGATTATATCCATTCACACATCAAACTTAAATATTTAAG
TCGTCAATTCGGAGTACCCTATATGTTTAGCAATGTATCTTACATAGCTCAATAAATAAA
CTCTCCGAGTTACTGTAAAGTTCACTTCACGTTAACGGATAATTTAAAACTTGATTAAAT
ACTGTCTCACTTATTATGATTAATCGTTAAAATGATCCTCAAACA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9331#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9331#3      ------------------------------------------------------------
consensus_9331#1      ------------------TTAAAGATCATTTTGATCGTTAAAAATCTACTACTTTTTTAC 42
consensus_9331#2      CTCGNAGGCCAANAATTCGGCACGAGGATTTTGATCGTTAAAAATCTACTACTTTTTTAC 60
                                                                                  

consensus_9331#0      -------------------------------TTTGTACGGTGCTCGATAGAACTGAAGGT 29
consensus_9331#3      ------------------------------------------------------------
consensus_9331#1      GGTGCTCGATAGAACTGAAGGTTTATTTTACAACAACGACAACAGAGAAAGTAAACCTCT 102
consensus_9331#2      GGTGCTCGATAGAACTGAAGGTTTATTTTACAACAACGACAACAGAGAAAGTAAACCTCT 120
                                                                                  

consensus_9331#0      TTATTTTACAACAACGACAACAGAGAAAAATTAAAAAAAAATCAGGCCAGTAATATCATC 89
consensus_9331#3      ------------------------------------------------------------
consensus_9331#1      TGGTGAACTACGAGTAAATTAATTACAGAATTAAAAAAAAATCAGGCCAGTAATNNNNNC 162
consensus_9331#2      TGGTGAACTACGA-------------------------------------TAATATCATC 143
                                                                                  

consensus_9331#0      GAACGAATTTTCACACGAAATATAAAATGGCTTCCGTTTCTAAGATTATCTATTTAATTT 149
consensus_9331#3      ------------------------------------------------------------
consensus_9331#1      GAACGAATTTTCACACGAAATATAAAATGGCTTCCGTTTCTAAGATTATCTATTTAATTT 222
consensus_9331#2      GAACGAATTTTCACACGAAATATAAAATGGCTTCCGTTTCTAAGATTATCTATTTAATTT 203
                                                                                  

consensus_9331#0      CTATACTTGTTGCAATCGCATGTATTATTGTATCGATTGCCACTAATCCAACATGGAATG 209
consensus_9331#3      ------------------------------------------------------------
consensus_9331#1      CTATACTTGTTGCAATCGCATGTATTATTGTATCGATTGCCACTAATCCAACATGGAATG 282
consensus_9331#2      CTATACTTGTTGCAATCGCATGTATTATTGTATCGATTGCCACTAATCCAACATGGAATG 263
                                                                                  

consensus_9331#0      ATAGTACAAATAATTCCTTGTGGAGAGCAAATGGAGGACTTAGTATAGCCGGACTGATTT 269
consensus_9331#3      -----------------------------------GGACTTAGTA-AGCCGGACTA--TT 22
consensus_9331#1      ATAGTACAAATAATTCCTTGTGGAGAGNNNNNNNNNNNNNNNN-ATAGCCGGACTGATTT 341
consensus_9331#2      ATAGTACAAATAATTCCTTGTGGAGAGCAAATGGAGGACTTAGTATAGCCGGACTGATTT 323
                                                                  * *********   **

consensus_9331#0      TGTTAGTAATAGCAGCTATCCTTGCAATTGTTTTGATTTGCAGAGATTATTCCAGAAGAA 329
consensus_9331#3      TGTTAGTAATAGCAGCTATCCT-GCAAT-GTTTTGATTTGCAGAGATTAT-CCAGAAGAA 79
consensus_9331#1      TGTTAGTAATAGCAGCTATCCTTGCAATTGTTTTGATTTGCAGAGATTATTCCAGAAGAA 401
consensus_9331#2      TGTTAGTAATAGCAGCTATCCTTGCAATTGTTTTGATTTGCAGAGATTATTCCAGAAGAA 383
                      ********************** ***** ********************* *********

consensus_9331#0      TAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGATATGCTTCATAGTTGCTTTGG 389
consensus_9331#3      TAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGACACGCTTCATAGTTGCTTTGG 139
consensus_9331#1      TAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGATATGCTTCATAGTTGCTTTGG 461
consensus_9331#2      TAGTGATCGCAATACTTGTTTTATTAATTTTAGCCTTGATATGCTTCATAGTTGCTTTGG 443
                      *************************************** * ******************

consensus_9331#0      CTATTTATGGTCAACAAATTAATTGGCAAGCATGGTTATTATCAGCTATGTGGGTAACGT 449
consensus_9331#3      CTATTTACGGTCAACAAATTAATTGGCCAGCATGGTTATTATCAGCTATGTGGGTGACGT 199
consensus_9331#1      CTATTTATGG--------------------------------CAGCTATGTGGGTAACGT 489
consensus_9331#2      CTATTTATGGTCAACAAATTAATTGGCAAGCATGGTTATTATCAGCTATGTGGGTAACGT 503
                      ******* **                                ************* ****

consensus_9331#0      TTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGTTGATGATTATTAGATTGCAAGTA 509
consensus_9331#3      TTATTTGTATTCCTATCGCAATAATATTATTAGTGGCTCATGATTACTAGAATGCAAGTA 259
consensus_9331#1      TTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGTTGATGATTATTAGATTGCAAGTA 549
consensus_9331#2      TTATTTGTATTCTTATCGCAATAATATTCTTATTGGTTGATGATTATTAGATTGCAAGTA 563
                      ************ *************** *** *** * ******* **** ********

consensus_9331#0      TTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTAAATAAAGCA 569
consensus_9331#3      ATGCTATCAGTTCACATGGTTTCCCTACATAAGGCAACGCAATACTATTTAAATAGAGCA 319
consensus_9331#1      TTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTAAATAAAGCA 609
consensus_9331#2      TTGTTAACAGTCTCAATGGTTTCCTTACATAAAACAACACAATATTATTTAAATAAAGCA 623
                       ** ** ****    ********* *******  **** ***** ********** ****

consensus_9331#0      AATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTTTACTCGTTTATTCGGA-TACCC 628
consensus_9331#3      AATGATTATATCCATTCACACATCAAACTTAAATATTTAAGTCGTCAATTCGGAGTACCC 379
consensus_9331#1      NATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTNTAA------------------- 650
consensus_9331#2      AATGATTATATCCATTCATACATTAAACTTAAATATTNTA-------------------- 663
                       ***************** **** *************  *                    

consensus_9331#0      TATTTGTTTATTTATTTTTCTTACATAGTTCTATAAATTAACTCTCTGATTTACTGTAAA 688
consensus_9331#3      TATATGTTTAGCAATGTATCTTACATAGCTCAATAAATAAACTCTCCGAGTTACTGTAAA 439
consensus_9331#1      -----------------------CATAGTTCTATAAATTAACTCTCTGATTTACTGGTAA 687
consensus_9331#2      ----------------------------CTCGTTTATTCGGATACCCTATTTGTTTATTT 695
                                                   **  * * *    *  *  * **  *     

consensus_9331#0      GTTCATTTCACTTTATCCGATAATTTCTAACTTGTTTAAATACTGTCTCACTTATTTTGA 748
consensus_9331#3      GTTCACTTCACGTTAACGGATAATTTAAAACTTGATTAAATACTGTCTCACTTATTATGA 499
consensus_9331#1      GNTCATTTCACTTTATCCCGATATTTCTAACTTGGTTAAATACTGGCTCACTTNATTTTG 747
consensus_9331#2      ATTNTTCTTAC------------------------------------------------- 706
                        *    * **                                                 

consensus_9331#0      TTATTCTTGAAACTTATCCTCAAAAAAAGGAAAGATATGAATGTCTAGGTATCGACTACT 808
consensus_9331#3      TTAATCGTTAAAATGATCCTCAAACA---------------------------------- 525
consensus_9331#1      ATATNNCTGAA------------------------------------------------- 758
consensus_9331#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9331#0      TATCCTGAGATTGGTAATATTCTTTTTATTGTTTAAAAACAAATTAATTTCATTGTTATT 868
consensus_9331#3      ------------------------------------------------------------
consensus_9331#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9331#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9331#0      ACTATAATAATAATTTTTACTAAGATGGTTTGTAGTATCAGCATATACTGTTTTTTAATA 928
consensus_9331#3      ------------------------------------------------------------
consensus_9331#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9331#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9331#0      TGTGCCGCTTATATTTGTTAGGTTTTTATGTAATCAGTATTTCTTATTGAATAAATAGAA 988
consensus_9331#3      ------------------------------------------------------------
consensus_9331#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9331#2      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9331#0      ATATACTTCCTTTCAAAAATG 1009
consensus_9331#3      ---------------------
consensus_9331#1      ---------------------
consensus_9331#2      ---------------------