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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9332#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1565 fasta sequence
[GAAAAAATACGATTGAAGGTAATCTTAATAGTAAAACAAATGGTTCATGGAAATGTCATCTTATTCCCGGTGGTCATATTGATGTGATTATGGATTTGACTGTATCCACATGTGGTCAATGGATTGCAAGTGGTTCTAAAGACCAATCTATTTGTTTATGGCATTTAATAGAATCAGAAGACTCAACATCGTCATCATTACATAAATCTTCTAAAAATGTTCCTGTCAAATTGGATCTTATTACTCAAATTCACAAGGCACATGCTGCACATATCAGTTCTGTTTGTTTCGATAGATTGACAACACATCTTATATCTAGCTCAGAAGATGGAATTTTAAAAGTTTGGAATGTTCAATGTAATAACTTAGATAAACCAGATACTGTGTTATCGGAATTAAACACAATTCATGGAGCCCATTGTGGAGTAATTAATTCAATTGATGTTTCTGTTGATAATCGTCTTGTTGCTACTGCTTCACGCGATAAAACTGTTAAGATATGGGAATTCAAAAAACAAAGTTTACATTGTCAAGGGGTTCTTCAGGGTCACCGTAGAGGTGTTTGGTCTGTTTGTTTTTCAAGATTTGAGAAAATTGTACTTACTGCTTCGGGTGATGGAGACGTGAGATTATGGAATTTGAAAGATTTCTCATGTATCCGTACATTGGAAGGCCATGATCAACCAGTGTATAAAGCAGTTTTTCTTTCTCACGATAAACAGATATTATCATGCGATCAGAAAGGATTAATACGATTATGGAATATATCTAAGCCACCTAAAAATAATCAGGAAAAAGGAGAGAATATTGTTAAACCATCATCTGAAGAAAATTCATCTTTAGTTTATGAAGCACACGATGGAAGAATATGGTCATTAGCTATTTGCCCAGATGAATCTGGTTTTTTCACTGGTGGTGAAGATGAAACTTTGTGTTATTTTGAAGATATTACAGAGATATTGCTGAATGAGACATCACAACAGCAAGAGGAATATATTCAAACACAACAAGAATTGGATAATCTTGTACACAAACAAATGTATGCCGATGCTGTTCATTTGGCTGTCAAATTGGATCAGCCCAAGCGAACACTAGACATACTACAAGAACTTTTGACTCAAGATCTTGTCAAAGAGACTTGCAAAAATAATCAAAATATGAAATATCCTACTCAAGCTGGAAACTTATTATCAGTACTTGATGATTTTGTAAAGAAAAGTCACAATGAAAATCTTAATGATTCACTTAGTCTAAGTCAAAGACTTTTATCTTATGCTATCAATTGGAATACAAGAACTAGAACATCAATGATAAGTCAATTCGTGTTGAATTGGATACTAACACGTTGGACACCAGAAGAATTAATTGAATGGCCAAATTTCAATCAAGCGATACAATATCTCCTTCCATATACAACTCGTCATTATCAACGTATATGTAGATTAGAAGAACAACTAGCAATTTTAAATTACATTTCTGAGGTGACTGATGAACATTTAATTCCTACTGACACTTTTGATGAACCGATGGAGTTGGACAATCATCAAAATAATGTATCGTTTAAT]
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[+] EMBL CD120413 [GAAAAAATACGATTGAAGGTAATCTTAATAGTAAAACAAATGGTTCATGGAAATGTCATCTTATTCCCGGTGGTCATATTGATGTGATTATGGATTTGACTGTATCCACATGTGGTCAATGGATTGCAAGTGGTTCTAAAGACCAATCTATTTGTTTATGGCATTTAATAGAATCAGAAGACTCAACATCGTCATCATTACATAAATCTTCTAAAAATGTTCCTGTCAAATTGGATCTTATTACTCAAATTCACAAGGCACATGCTGCACATATCAGTTCTGTTTGTTTCGATAGATTGACAACACATCTTATATCTAGCTCAGAAGATGGAATTTTAAAAGTTTGGAATGTTCAATGTAATAACTTAGATAAACCAGATACTGTGTTATCGGAATTANACACAATTCATGGAGCCCATTGTGGAGTAATTAATTCAATTGATGTTTCTGTTGATAATCGTCTTGTTGCTACTGCTTCACGCGATAAA ]
[-] EMBL CD152481 [ CTATTTGTTTATGGCATTTAATAGAATCAGAAGACTCAACATCGTCATCATTACATAAATCTTCTAAAAATGTTCCTGTCAAATTGGATCTTATTACTCAAATTCACAAGGCACATGCTGCACATATCAGTTCTGTTTGTTTCGATAGATTGACAACACATCTTATATCTAGCTCAGAAGATGGAATTTTAAAAGTTTGGAATGTTCAATGTAATAACTTAGATAAACCAGATACTGTGTTATCGGAATTAAACACAATTCATGGAGCCCATTGTGGAGTAATTAATTCAATTGATGTTTCTGTTGATAATCGTCTTGTTGCTACTGCTTCACGCGA ]
[+] EMBL CD112402 [ ATTCAATTGATGTTTCTGTTGATAATCGTCTTGTTGCTACTGCTTCACGCGATAAAACTGTTAAGATATGGGAATTCAAAAAACAAAGTTTACATTGTCAAGGGGTTCTTCAGGGTCACCGTAGAGGTGTTTGGTCTGTTTGTTTTTCAAGATTTGAGAAAATTGTACTTACTGCTTCGGGTGATGGAGACGTGAGATTATGGAATTTGAAAGATTTCTCATGTATCCGTACATTGGAAGGCCATGATCAACCAGTGTATAAAGCAGTTTTTCTTTCTCACGATAAACAGATATTATCATGCGATCAGAAAGGATTAATACGATTATGGAATATATCTAAGCCACCTAAAAATAATCAGGAAAAAGGAGAGAATATTGTTAAACCATCATCTGAAGAAAATTCATCTTTAGTTTATGAAGCACACGATGGAAGAATATGGTCATTAGCTATTTGCCCAGATGAATCTGGTTTTTTCACTGGTGGTGAA ]
[+] EMBL CD160967 [ GAGAATATTGTTAAACCATCATCTGAAGAAAATTCATCTTTAGTTTATGAAGCACACGATGGAAGAATATGGTCATTAGCTATTTGCCCAGATGAATCTGGTTTTTTCACTGGTGGTGAAGATGAAACTTTGTGTTATTTTGAAGATATTACAGAGATATTGCTGAATGAGACATCACAACAGCAAGAGGAATATATTCAAACACAACAAGAATTGGATAATCTTGTACACAAACAAATGTATGCCGATGCTGTTCATTTGGCTGTCAAATTGGATCAGCCCAAGCGAACACTAGACATACTACAAGAACTTTTGACTCAAGATCTTGTCAAAGAGACTTGCAAAAATAATCAAAATATGAAATATCCTACTCAAGCTGGAAACTTATTATCAGTACTTGATGATTTTGTAAAGAAAAGTCACAATGAAAATCTTAATGATTCACTTAGTCTAAGTCAAAGACTTTTATCTTATGCTATCAATTGGAATACAAGAACTAGAACATCAATGATAAGTCAATTCGTGTTGAATTGGATACTAACACGTTGG ]
[-] EMBL CD122882 [ ATACTACAAGAACTTTTGACTCAAGATCTTGTCAAAGAGACTTGCAAAAATAATCAAAATATGAAATATCCTACTCAAGCTGGAAACTTATTATCAGTACTTGATGATTTTGTAAAGAAAAGTCACAATGAAAATCTTAATGATTCACTTAGTCTAAGTCAAAGACTTTTATCTTATGCTATCAATTGGAATACAAGAACTAGAACATCAATGATAAGTCAATTCGTGTTGAATTGGATACTAACACGTTGGACACCAGAAGAATTAATTGAATGGCCAAATTTCAATCAAGCGATACAATATCTCC ]
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[-] EMBL CD119250 [ TCAAGATCTTGTCAAAGAGACTTGCAAAAATAATCAAGATATGAAATATCCTACTCAAGCTGGAAACTTATTATCAGTACTTGATGATTTTGTAAAGAAAAGTCACAATGAAAATCTTAATGATTCACTTAGTCTAAGTCAAAGACTTTTATCTTATGCTATCAATTGGAATGCAAGAACTAGAACATCAATGATAAGTCAATTCGTGTTGAATTGGATACTAACACGTTGGACACCAGAAGAATTAATTGAATGGCCAAATTTCAATCAAGCGATACAATATCTCCTTCCATATACAACTCGTCATTATCAACGTATATGTAGATTAGAAGAACAACTAGCAATTTTAAATTACATTTCTGAGGTGACTGATGAACATTTAATTCCTACTGACACTTTTGATGAACCGATGGAGTTGGACAATCATCAAAATAATGTATCGTTTAAT]
[-] EMBL CD119020 [ CAAAATATG AATATCCTACTCAAGCTGGAAACTTATTATCAGTACTTGATGATTTTGTAAAGAAAAGTCACAATGAAAATCTTAATGATTCACTTAGTCTAAGTCAAAGACTTTTATCTTATGCTATCAATTGGAATACAAGAACTAGAACATCAATGATAAGTCAATTCGTGTTGAATTGGATACTAACACGTTGGACACCAGAAGAATTAATTGAATGGCCAAATTTCAATCAAGCGATACAATATCTCCTTCCATATACAACTCGTCATAATCAACGTATATGTAGATTAGAAGAACAACTAGCAATTTTAAATTACATTTCTGAGGTGACTGATGAACATTTAATTCCTACTGACACTTTTGATGAACCGATGGAGTTGGACAATCATCAAAATAATGTATCGTTTAAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||