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Schistosoma mansoni
cluster # 9332 cluster # 9332       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9332#0 length = 1565 sequences # 9  

consensusID : consensus_9332#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1565
fasta sequence
                              [GAAAAAATACGATTGAAGGTAATCTTAATAGTAAAACAAATGGTTCATGGAAATGTCATCTTATTCCCGGTGGTCATATTGATGTGATTATGGATTTGACTGTATCCACATGTGGTCAATGGATTGCAAGTGGTTCTAAAGACCAATCTATTTGTTTATGGCATTTAATAGAATCAGAAGACTCAACATCGTCATCATTACATAAATCTTCTAAAAATGTTCCTGTCAAATTGGATCTTATTACTCAAATTCACAAGGCACATGCTGCACATATCAGTTCTGTTTGTTTCGATAGATTGACAACACATCTTATATCTAGCTCAGAAGATGGAATTTTAAAAGTTTGGAATGTTCAATGTAATAACTTAGATAAACCAGATACTGTGTTATCGGAATTAAACACAATTCATGGAGCCCATTGTGGAGTAATTAATTCAATTGATGTTTCTGTTGATAATCGTCTTGTTGCTACTGCTTCACGCGATAAAACTGTTAAGATATGGGAATTCAAAAAACAAAGTTTACATTGTCAAGGGGTTCTTCAGGGTCACCGTAGAGGTGTTTGGTCTGTTTGTTTTTCAAGATTTGAGAAAATTGTACTTACTGCTTCGGGTGATGGAGACGTGAGATTATGGAATTTGAAAGATTTCTCATGTATCCGTACATTGGAAGGCCATGATCAACCAGTGTATAAAGCAGTTTTTCTTTCTCACGATAAACAGATATTATCATGCGATCAGAAAGGATTAATACGATTATGGAATATATCTAAGCCACCTAAAAATAATCAGGAAAAAGGAGAGAATATTGTTAAACCATCATCTGAAGAAAATTCATCTTTAGTTTATGAAGCACACGATGGAAGAATATGGTCATTAGCTATTTGCCCAGATGAATCTGGTTTTTTCACTGGTGGTGAAGATGAAACTTTGTGTTATTTTGAAGATATTACAGAGATATTGCTGAATGAGACATCACAACAGCAAGAGGAATATATTCAAACACAACAAGAATTGGATAATCTTGTACACAAACAAATGTATGCCGATGCTGTTCATTTGGCTGTCAAATTGGATCAGCCCAAGCGAACACTAGACATACTACAAGAACTTTTGACTCAAGATCTTGTCAAAGAGACTTGCAAAAATAATCAAAATATGAAATATCCTACTCAAGCTGGAAACTTATTATCAGTACTTGATGATTTTGTAAAGAAAAGTCACAATGAAAATCTTAATGATTCACTTAGTCTAAGTCAAAGACTTTTATCTTATGCTATCAATTGGAATACAAGAACTAGAACATCAATGATAAGTCAATTCGTGTTGAATTGGATACTAACACGTTGGACACCAGAAGAATTAATTGAATGGCCAAATTTCAATCAAGCGATACAATATCTCCTTCCATATACAACTCGTCATTATCAACGTATATGTAGATTAGAAGAACAACTAGCAATTTTAAATTACATTTCTGAGGTGACTGATGAACATTTAATTCCTACTGACACTTTTGATGAACCGATGGAGTTGGACAATCATCAAAATAATGTATCGTTTAAT]

[+] EMBL CD120287             [GAAAAAATACGATTGAAGGTAATCTTAATAGTAAAACAAATGGTTCATGGAAATGTCATCTTATTCCCGGTGGTCATATTGATGTGATTATGGATTTGACTGTATCCACATGTGGTCAATGGATTGCAAGTGGTTCTAAAGACCAATCTATTTGTTTATGGCATTTAATAGAATCAGAAGACTCAACATCGTCATCATTACATAAATCTTCTAAAAATGTTCCTGTCAAATTGGATCTTATTACTCAAATTCACAAGGCACATGCTGCACATATCAGTTCTGTTTGTTTCGATAGATTGACAACACATCTTATATCTAGCTCAGAAGATGGAATTTTAAAAGTTTGGAATGTTCAATGTAATAACTTAGAT AACCAGATACTGTGTTATCGGAATTNAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD120413             [GAAAAAATACGATTGAAGGTAATCTTAATAGTAAAACAAATGGTTCATGGAAATGTCATCTTATTCCCGGTGGTCATATTGATGTGATTATGGATTTGACTGTATCCACATGTGGTCAATGGATTGCAAGTGGTTCTAAAGACCAATCTATTTGTTTATGGCATTTAATAGAATCAGAAGACTCAACATCGTCATCATTACATAAATCTTCTAAAAATGTTCCTGTCAAATTGGATCTTATTACTCAAATTCACAAGGCACATGCTGCACATATCAGTTCTGTTTGTTTCGATAGATTGACAACACATCTTATATCTAGCTCAGAAGATGGAATTTTAAAAGTTTGGAATGTTCAATGTAATAACTTAGATAAACCAGATACTGTGTTATCGGAATTANACACAATTCATGGAGCCCATTGTGGAGTAATTAATTCAATTGATGTTTCTGTTGATAATCGTCTTGTTGCTACTGCTTCACGCGATAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD152481             [                                                                                                                                                   CTATTTGTTTATGGCATTTAATAGAATCAGAAGACTCAACATCGTCATCATTACATAAATCTTCTAAAAATGTTCCTGTCAAATTGGATCTTATTACTCAAATTCACAAGGCACATGCTGCACATATCAGTTCTGTTTGTTTCGATAGATTGACAACACATCTTATATCTAGCTCAGAAGATGGAATTTTAAAAGTTTGGAATGTTCAATGTAATAACTTAGATAAACCAGATACTGTGTTATCGGAATTAAACACAATTCATGGAGCCCATTGTGGAGTAATTAATTCAATTGATGTTTCTGTTGATAATCGTCTTGTTGCTACTGCTTCACGCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD112402             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATTCAATTGATGTTTCTGTTGATAATCGTCTTGTTGCTACTGCTTCACGCGATAAAACTGTTAAGATATGGGAATTCAAAAAACAAAGTTTACATTGTCAAGGGGTTCTTCAGGGTCACCGTAGAGGTGTTTGGTCTGTTTGTTTTTCAAGATTTGAGAAAATTGTACTTACTGCTTCGGGTGATGGAGACGTGAGATTATGGAATTTGAAAGATTTCTCATGTATCCGTACATTGGAAGGCCATGATCAACCAGTGTATAAAGCAGTTTTTCTTTCTCACGATAAACAGATATTATCATGCGATCAGAAAGGATTAATACGATTATGGAATATATCTAAGCCACCTAAAAATAATCAGGAAAAAGGAGAGAATATTGTTAAACCATCATCTGAAGAAAATTCATCTTTAGTTTATGAAGCACACGATGGAAGAATATGGTCATTAGCTATTTGCCCAGATGAATCTGGTTTTTTCACTGGTGGTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD160967             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                GAGAATATTGTTAAACCATCATCTGAAGAAAATTCATCTTTAGTTTATGAAGCACACGATGGAAGAATATGGTCATTAGCTATTTGCCCAGATGAATCTGGTTTTTTCACTGGTGGTGAAGATGAAACTTTGTGTTATTTTGAAGATATTACAGAGATATTGCTGAATGAGACATCACAACAGCAAGAGGAATATATTCAAACACAACAAGAATTGGATAATCTTGTACACAAACAAATGTATGCCGATGCTGTTCATTTGGCTGTCAAATTGGATCAGCCCAAGCGAACACTAGACATACTACAAGAACTTTTGACTCAAGATCTTGTCAAAGAGACTTGCAAAAATAATCAAAATATGAAATATCCTACTCAAGCTGGAAACTTATTATCAGTACTTGATGATTTTGTAAAGAAAAGTCACAATGAAAATCTTAATGATTCACTTAGTCTAAGTCAAAGACTTTTATCTTATGCTATCAATTGGAATACAAGAACTAGAACATCAATGATAAGTCAATTCGTGTTGAATTGGATACTAACACGTTGG                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD122882             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATACTACAAGAACTTTTGACTCAAGATCTTGTCAAAGAGACTTGCAAAAATAATCAAAATATGAAATATCCTACTCAAGCTGGAAACTTATTATCAGTACTTGATGATTTTGTAAAGAAAAGTCACAATGAAAATCTTAATGATTCACTTAGTCTAAGTCAAAGACTTTTATCTTATGCTATCAATTGGAATACAAGAACTAGAACATCAATGATAAGTCAATTCGTGTTGAATTGGATACTAACACGTTGGACACCAGAAGAATTAATTGAATGGCCAAATTTCAATCAAGCGATACAATATCTCC                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD123061             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATACTACAAGAACTTTTGACTCAAGATCTTGTCAAAGAGACTTGCAAAAATAATCAAAATATGAAATATCCTACTCAAGCTGGAAACTTATTATCAGTACTTGATGATTTTGTAAAGAAAAGTCACAATGAAAATCTTAATGATTCACTTAGTCTAAGTCAAAGACTTTTATCTTATGCTATCAATTGGAATACAAGAACTAGAACATCAATGATAAGTCAATTCGTGTTGAATTGGATACTAACACGTTGGACACCAGAAGAATTAATTGAATGGCCAAATTTCAATCAAGCGATACAATATCTCC                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD119250             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCAAGATCTTGTCAAAGAGACTTGCAAAAATAATCAAGATATGAAATATCCTACTCAAGCTGGAAACTTATTATCAGTACTTGATGATTTTGTAAAGAAAAGTCACAATGAAAATCTTAATGATTCACTTAGTCTAAGTCAAAGACTTTTATCTTATGCTATCAATTGGAATGCAAGAACTAGAACATCAATGATAAGTCAATTCGTGTTGAATTGGATACTAACACGTTGGACACCAGAAGAATTAATTGAATGGCCAAATTTCAATCAAGCGATACAATATCTCCTTCCATATACAACTCGTCATTATCAACGTATATGTAGATTAGAAGAACAACTAGCAATTTTAAATTACATTTCTGAGGTGACTGATGAACATTTAATTCCTACTGACACTTTTGATGAACCGATGGAGTTGGACAATCATCAAAATAATGTATCGTTTAAT]
[-] EMBL CD119020             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAAAATATG AATATCCTACTCAAGCTGGAAACTTATTATCAGTACTTGATGATTTTGTAAAGAAAAGTCACAATGAAAATCTTAATGATTCACTTAGTCTAAGTCAAAGACTTTTATCTTATGCTATCAATTGGAATACAAGAACTAGAACATCAATGATAAGTCAATTCGTGTTGAATTGGATACTAACACGTTGGACACCAGAAGAATTAATTGAATGGCCAAATTTCAATCAAGCGATACAATATCTCCTTCCATATACAACTCGTCATAATCAACGTATATGTAGATTAGAAGAACAACTAGCAATTTTAAATTACATTTCTGAGGTGACTGATGAACATTTAATTCCTACTGACACTTTTGATGAACCGATGGAGTTGGACAATCATCAAAATAATGTATCGTTTAAT]


>consensus_9332#0 GAAAAAATACGATTGAAGGTAATCTTAATAGTAAAACAAATGGTTCATGGAAATGTCATC TTATTCCCGGTGGTCATATTGATGTGATTATGGATTTGACTGTATCCACATGTGGTCAAT GGATTGCAAGTGGTTCTAAAGACCAATCTATTTGTTTATGGCATTTAATAGAATCAGAAG ACTCAACATCGTCATCATTACATAAATCTTCTAAAAATGTTCCTGTCAAATTGGATCTTA TTACTCAAATTCACAAGGCACATGCTGCACATATCAGTTCTGTTTGTTTCGATAGATTGA CAACACATCTTATATCTAGCTCAGAAGATGGAATTTTAAAAGTTTGGAATGTTCAATGTA ATAACTTAGATAAACCAGATACTGTGTTATCGGAATTAAACACAATTCATGGAGCCCATT GTGGAGTAATTAATTCAATTGATGTTTCTGTTGATAATCGTCTTGTTGCTACTGCTTCAC GCGATAAAACTGTTAAGATATGGGAATTCAAAAAACAAAGTTTACATTGTCAAGGGGTTC TTCAGGGTCACCGTAGAGGTGTTTGGTCTGTTTGTTTTTCAAGATTTGAGAAAATTGTAC TTACTGCTTCGGGTGATGGAGACGTGAGATTATGGAATTTGAAAGATTTCTCATGTATCC GTACATTGGAAGGCCATGATCAACCAGTGTATAAAGCAGTTTTTCTTTCTCACGATAAAC AGATATTATCATGCGATCAGAAAGGATTAATACGATTATGGAATATATCTAAGCCACCTA AAAATAATCAGGAAAAAGGAGAGAATATTGTTAAACCATCATCTGAAGAAAATTCATCTT TAGTTTATGAAGCACACGATGGAAGAATATGGTCATTAGCTATTTGCCCAGATGAATCTG GTTTTTTCACTGGTGGTGAAGATGAAACTTTGTGTTATTTTGAAGATATTACAGAGATAT TGCTGAATGAGACATCACAACAGCAAGAGGAATATATTCAAACACAACAAGAATTGGATA ATCTTGTACACAAACAAATGTATGCCGATGCTGTTCATTTGGCTGTCAAATTGGATCAGC CCAAGCGAACACTAGACATACTACAAGAACTTTTGACTCAAGATCTTGTCAAAGAGACTT GCAAAAATAATCAAAATATGAAATATCCTACTCAAGCTGGAAACTTATTATCAGTACTTG ATGATTTTGTAAAGAAAAGTCACAATGAAAATCTTAATGATTCACTTAGTCTAAGTCAAA GACTTTTATCTTATGCTATCAATTGGAATACAAGAACTAGAACATCAATGATAAGTCAAT TCGTGTTGAATTGGATACTAACACGTTGGACACCAGAAGAATTAATTGAATGGCCAAATT TCAATCAAGCGATACAATATCTCCTTCCATATACAACTCGTCATTATCAACGTATATGTA GATTAGAAGAACAACTAGCAATTTTAAATTACATTTCTGAGGTGACTGATGAACATTTAA TTCCTACTGACACTTTTGATGAACCGATGGAGTTGGACAATCATCAAAATAATGTATCGT TTAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)