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consensusID : consensus_9338#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 1059 fasta sequence
[CGGGCCATTATTCGGCACGCAGGTTAATCGATTCCGCATAAAATACTACTTTTCTGTCAATAATTCATACGTTGCCAAAAAGATCGGGCTGATCCTGTTCCCGTTTGCTCATACAAAATGGGGTGTAAATTATGATCCTGTGGGACCGGTTCCTCCAGGAGATGATATAAATGCTCCTGATTTGTATATTCCTCTGATGGCTTCCATCACATACATACTTCTGAGTGGTGTTATATTTGGATTTCAAGGTCGTTTTTCACCTGAGTACCTTGGGATTTTATCCAGTGAAGCTTTTGGCTGGTATTTGCTTGAAGTTTTATTATCTCTTTTTGCAATGTACATCCTCAATATTCAGAACAATATTTCTTATTTAGATATAGTTGCTTATTGTGGTTATAAATTTGTCAGCATGATAGTTGTA-TTGATTAGTTATATTGGTTTGGATCGACCAGGCTATTATTTTAGTTTACTGTATACTAGTTTAGCATTGGCATTTTTCCTCATAAGAAGCCTCAAACTCAAAATTCTTCCACATGTTGAAGCATATCCATCTGAGTGTAATAAACGCCGATTATATTTACTACTTCTGATTGCCTTCATTCAACCATTAATGATGTGGTGGTTGACACGTCGTGTTATCCTGTAGGGATTGTAAACCGTGTTGTTTTTTCCTTTGTGGTTTTTATCATCACAATCTGATATAAAAAAAGTAAAAATTGTCTAAATAACATCCTTTGCTTCCTAATTTGTGTATAAACAAGGTTAAACAATTTCCACCTTTTTTATCAGTCACATTCTCTTTTTTTTAAGTATTCAAATATCCGCTTATTCATAGAAAGATTTTTCACCGACGAATTGTCATTACCTGTCTAATGTAAAAGTGTTAAGGATTGTAAAAGATT-GTTTTTGGGAGTTTTAGTCGTGCAATTGTATGTCTTCACTTTCTAACATATGCTTGTATTCAATGTTTCCAGCTATTTATCCATCAATATAAGATAATTATTTA-TATTTATATGTACCTTGTTTTAGAT-CTATTA-TNTATTC-ATAA-TTACTAAGGTA]
[+] EMBL CD081569 [CGGGCCATTATTCGGCACGCAGGTTAATCGATTCCGCATAAAATACTACTTTTCTGTCAATAATTCATACGTTGCCAAAAAGATCGGGCTGATCCTGTTCCCGTTTGCTCATACAAAATGGGGTGTAAATTATGATCCTGTGGGACCGGTTCCTCCAGGAGATGATATAAATGCTCCTGATTTGTATATTCCTCTGATGGCTTCCATCACATACATACTTCTGAGTGGTGTTATATTTGGATTTCAAGGTCGTTTTTCACCTGAGTACCTTGGGATTTTATCCAGTGAAGCTTTTGGCTGGTATTTGCTTGAAGTTTTATTATCTCTTTTTGCAATGTACATCCTCAATATTCAGAACAATATTTCTTATTTAGATATAGTTGCTTATTGTGGTTATAAATTTGTCAGCATGATAGTTGTA CTGATTAGTTATATTGGTTTGGATCGACCAGGCTATTATTTTAGTTTACTGTATACTAGTTTAGCATTGGCATTTTTCCTCATAAGAAGCCTCAAACTCAAAATTCTTCCACATGTTGAAGCATATCCATCTGAGTGTAATAAACGCCGATTATATTTACTACTTCTGATTGCCTTCATTCAACCATTAATGATGTGGTGGTTGACACGTCGTGTTATCCTGTAGGGATTGTAAACCGTGTTGTTTTTTCCTTTGTGGTTTTTATCATCACAATCTGATATAAAAAAAGTAAAAATTGTCTAAATAACATCCTTTGCTTCCTAATTTGTGTATAAACAAGGTTAAACAATTTCCACCTTTTTTATCAGTCACATTCTCTTTTTTTTAAGTATTCAAATATCCGCTTATTCATAGAAAGATTTTTCACCGACGAATTGTCATTACCTGTCTAATGTAAAAGTGTTAACGATTGTAAAAGATTCGTTTTGGGGAG TTTAGTCGTGCAATTG ATGTCTT ACTTTCT ACATATGCCTGTATTC ATGGTTTCAGCT TTTATCCAT AATATAAGAT ANTATTCA TATTTATATGTACCTTGTTTTAGAT CTATTA TNTATTC ATAA TTACTAAG ]
[-] EMBL CD073935 [ TCTCTTTTTGCAATGTACATCCTCAATATTCAGAACAATATTTCTTATTTAGATATAGTTGCTTATTGTGGTTATAAATTTGTCAGCATGATAGTTGTA TTGATTAGTTATATTGGTTTGGATCGACCAGGCTATTATTTTAGTTTACTGTATACTAGTTTAGCATTGGCATTTTTCCTCATAAGAAGCCTCAAACTCAAAATTCTTCCACATGTTGAAGCATATCCATCTGAGTGTAATAAACGCCGATTATATTTACTACTTCTGATTGCCTTCATTCAACCATTAATGATGTGGTGGTTGACACGTCGTGTTATCCTGTAGGGATTGTAAACCGTGTTGTTTTTTCCTTTGTGGTGTTTATCATCACAATCTGATATAAAAAAAGTAAAAATTGTCTAAATAACATCCTTTGCTTCCTAATTTGTGTATAAACAAGGTTAAACAATTTCCACCTTTTTTATCAGTCACATTCTCTTTTTTTTAAGTATTCAAATATCCGCTTATTCATAGAAAGATTTTTCACCGACGAATTGTCATTACCTGTCTAATGTAAAAGTGTTAAGGATTGTAAAAGATT GTTTTTGGGAGTTTTAGTCGTGCAATTGTATGTCTTCACTTTCTAACATATGCTTGTATTCAATGTTTCCAGCTATTTATCCATCAATATAAGATAATTATTT ]
[-] EMBL CD076531 [ GTGGTTATAAATTGNTCAGCATGATAG TGTATTTGATTAGTTATATTGGTTTGGATCGACCAGGCTATTATTTTAGTTTACTGTATACTAGTTTAGCATTGGCATTTTTCCTCATAAGAAGCCTCAAACTCAAAATTCTTCCACATGTTGAAGCATATCCATCTGAGTGTAATAAACGCCGATTATATTTACTACTTCTGATTGCCTTCATTCAACCATTAATGATGTGGTGGTTGACACGTCGTGTTATCCTGTAGGGATTGTAAACCGTGTTGTTTTTTCCTTTGTGGTGTTTATCATCACAATCTGATATAAAAAAAGTAAAAATTGTCTAAATAACATCCTTTGCTTCCTAATTTGTGTATAAACAAGGTTAAACAATTTCCACCTTTTTTATCAGTCACATTCTCTTTTTTTTAAGTATTCAAATATCCGCTTATTCATAGAAAGATTTTTCACCGACGAATTGTCATTACCTGTCTAATGTAAAAGTGTTAAGGATTGTAAAAGATT GTTTTTGGGAGTTTTAGTCGTGCAATTGTATGTCTTCACTTTCTAACATATGCTTGTATTCAATGTTTCCAGCTATTTATCCATCAATATAAGATAATTATTT ]
[-] EMBL CD075395 [ ATTTTTCCTCATAAGAAGCCTCAAACTCAAAATTCTTCCACATGTTGAAGCATATCCATCTGAGTGTAATAAACGCCGATTATATTTACTACTTCTGATTGCCTTCATTCAACCATTAATGATGTGGTGGTTGACACGTCGTGTTATCCTGTAGGGATTGTAAACCGTGTTGTTTTTTCCTTTGTGGTTTTTATCATCCCAATCTGATATAAAAAAAGTAAAAATTGTCTAAATAACATCCTTTGCTTCCTAATTTGTGTATAAACAAGGTTAAACAATTTCCCCCTTTTTTATCAGTCACATTCTCTTTTTTTTAAGTATTCAAATATCCGCTTATTCATAGAAAGATTTTTCACCGACGAATTGTCATTACCTGTCTAATGTAAAAGTGTTAAGGATTGTAAAAGATT GTTTTTGGGAGTTTTAGTCGTGCAATTGTATGTCTTCACTTTCTAACATATGCTTGTATTCAATGTTTCCAGCTATTTATCCATCAATATAAGATAATTATTTATTATTTATATGTACTTTGTTTTAGATCCTATTATTTTATTCAATAATTTACTAAAGTA]
consensusID : consensus_9338#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 709 fasta sequence
[TATCATAATCCCGGATACCCTCCAAACTACCCAGAAACTCCTTATTATGCCAACTTCCAGCCAAACAGTCAGGAATATATTCCTGCTGCACCACGTACAAATGGTAATACTGGGATGTCATTTATCCAAAATCAGTTTATTCCCGATTTGGCTGTCCGTTATGGGTCAGCTATGTTTGATGAAGGTGCAAACTTTGTCCATAAGAATGTTGACCAATATGTTAATCGATTCCGCATAAAATACTACTTTTCTGTCAATAATTCATACGTTGCCAAAAAGATCGGGCTGATCCTGTTCCCGTTTGCTCATACAAAATGGGGTGTAAATTATGATCCTGTGGGACCGGTTCCTCCAGGAGATGATATAAATGCTCCTGATTTGTATATTCCTCTGATGGCTTCCATCACATACATACTTCTGAGTGGTGTTATATTTGGA-TTTCAAGGTCGTTTTTCACCTGAGTACCTTGGGATTTTATCCAGTGAAGCTTTTGGCTGGTTATTGCTTGAAGTTTTATTATCTCTTTTTGCAATGTACATCCTCAATATTCAGAACAATATTTCTTATTTAGATATAGTTGCTTATTGTGGTTATAAATTTGTCAGCATGATAGTTGTATTGATTAGTTATATTGGTTTGGATCGACCAGGCTATTATTTTAGTTTACTGTATACTAGTTTAGCATTGGCATTNTTCCTCATAAGAAGCC]
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[+] EMBL CD079675 [ gaggCCCGGATACCCTCCAAACTACCCAGAAACTCCTTATTATGCCAACTTCCAGCCAAACAGTCAGGAATATATTCCTGCTGCACCACGTACAAATGGTAATACTGGGATGTCATTTATCCAAAATCAGTTTATTCCCGATTTGGCTGTCCGTTATGGGTCAGCTATGTTTGATGAAGGTGCAAACTTTGTCCATAAGAATGTTGACCAATATGTTAATCGATTCCGCATAAAATACTACTTTTCTGTCAATAATTCATACGTTGCCAAAAAGATCGGGCTGATCCTGTTCCCGTTTGCTCATACAAAATGGGGTGTAAATTATGATCCTGTGGGACCGGTTCCTCCAGGAGATGATATAAATGCTCCTGATTTGTATATTCCTCTGATGGCTTCCATCACATACATACTTCTGAGTGGTGTTATATTTGGA TTTCAAGGTCGTTTTTCACCTGAGTACCTTGGGATTTTATCCAGTGAAGCTTTTGGCTGGTTATTGCTTGAAGTTTTATTATCTCTTTTTGCAATGTACATCCTCAATATTCAGAACAATATTTCTTATTTAGATATAGTTGCTTATTGTGGTTATAAATTTGTCAGCATGATAGTTGTATTGATTAGTTATATTGGTTTGGATCGACCAGGCTATTATTTTAGTTTACTGTATACTAGTTTAGCATTGGCATTNTTCCTCATAAGAAGCC]
[+] EMBL CD189082 [ ATTCCTGCTGCACCACGTACAAATGGTAATACTGGGATGTCATTTATCCAAAATCAGTTTATTCCCGATTTGGCTGTCCGTTATGGGTCAGCTATGTTTGATGAAGGTGCAAACTTTGTCCATAAGAATGTTGACCAATATGTTAATCGATTCCGCATAAAATACTACTTTTCTGTCAATAATTCATACGTTGCCAAAAAGATCGGGCTGATCCTGTTCCCGTTTGCTCATACAAAATGGGGTGTAAATTATGATCCTGTGGGACCGGTTCCTCCAGGAGATGATATAAATGCTCCTGATTTGTATATTCCTCTGATGGCTTCCATCACATACATACTTCTGAGTGGTGTTATATTTGGA TTTCAAGGTCGTTTTTCACCTGAGTACCTTGGGATTTTATCCAGTGAAGCTTTTGGCTGGTTATTGCTTGAAGTTTTATTATCTCTTTTTGC ATGTACATCCTCAATATTCAGAAACATATTTCTTATNTAGATATAGNTGCTTATTGTGGNTATAAATTTGTCAGCATGATAGTTGTATTGATTAGTTATATTGG ]
[-] EMBL CD165528 [ GTTGACCAATATGTTAATCGATTCCGCATAAAATACTACTTTTCTGTCAATAATTCATACGTTGCCAAAAAGATCGGGCTGATCCTGTTCCCGTTTGCTCATACAAAATGGGGTGTAAATTATGATCCTGTGGGACCGGTTCCTCCAGGAGATGATATAAATGCTCCTGATTTGTATATTCCTCTGATGGCTTCCATCACATACATACTTCTGAGTGGTGTTATATTTGGA TTTCAAGGTCGTTTTTCACCTGAGTACCTTGGGATTTTATCCAGTGAAGCTTTTGGCTGGTTATTGCTTGAAGTTTTATTATCTCTTTTTGCAATGTACATCCTCAATATTCAGAACAATACTTCTTATTTAGATATAGTTGCTTATTGTGGTTATAAATTTGTCAGCATGATAGTTGTATTGATTAGTTATATTGGTTTGGATCGACCAGGCTATTATTTTAGTTTACTGTATACTAGTTTAGCATTGGCATT ]
[+] EMBL CD078146 [ CGTTGCCAAAAAGATCGGGCTGATCCTGTTCCCGTTTGCTCATACAAAATGGGGTGTAAATTATGATCCTGTGGGACCGGTTCCTCCAGGAGATGATATAAATGCTCCTGATTTGTATATTCCTCTGATGGCTTCCATCACATACATACTTCTGAGTGGTGTTATATTTGGATTTTCAAGGTCGTTTTTCACCT ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_9338#0 ------------------------------------------------------------
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consensus_9338#0 ------------------------------------------------------------
consensus_9338#1 CCAAACAGTCAGGAATATATTCCTGCTGCACCACGTACAAATGGTAATACTGGGATGTCA 120
consensus_9338#0 ------------------------------------------------------------
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* **** * * * * * *********************
consensus_9338#0 TACTACTTTTCTGTCAATAATTCATACGTTGCCAAAAAGATCGGGCTGATCCTGTTCCCG 103
consensus_9338#1 TACTACTTTTCTGTCAATAATTCATACGTTGCCAAAAAGATCGGGCTGATCCTGTTCCCG 300
************************************************************
consensus_9338#0 TTTGCTCATACAAAATGGGGTGTAAATTATGATCCTGTGGGACCGGTTCCTCCAGGAGAT 163
consensus_9338#1 TTTGCTCATACAAAATGGGGTGTAAATTATGATCCTGTGGGACCGGTTCCTCCAGGAGAT 360
************************************************************
consensus_9338#0 GATATAAATGCTCCTGATTTGTATATTCCTCTGATGGCTTCCATCACATACATACTTCTG 223
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************************************************************
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consensus_9338#1 --------------------------------------------------------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||