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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9347#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1153 fasta sequence
[CGCTTGTGAGGTAAACGCCTAATCCCTTAATTCACACCATCCACCTGCTTCTCATTCACGATTCTTAGTTTCATCCGCTCTGACTGTAATCTTTGACGTATATTTCAAATAAGTGGATTTCATTTCAATCAGTCAGACATTTTGGCCAACTTTAAATCGTCACCTACTATGAATCATACCAGGGCTTTACACTTTGTCTTCAAGGTGGCCAATCGTAATGAAACAATTGATTTTTACAAACGGATTCTTGGAATGAAGGTGTTACGACATGAAGAATTTACTGAAGGTTGTAAGGCTTCATGTAACGGACCATATGATGGGAAGTGGAGCAAAACCATGATAGGTTATGGACCTGAGGATAATCATTTTGTCGTTGAGTTGACTTATAATTATGGGATTGGTGCTTATCAACTTGGTAATGATTTTCA-GTATATTCGTATTCATAATAAGGATGCATATTCAAGAATTATCGGTGGATTATGGCCTATCACATTGAAAGAGTCAGATTCAGTAAAAGTGGAAGCTCCTGGTGGATATGCATTTTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGG-TCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATATCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCAAGTAGTCAATTACCAATTTTACAAAAAACGATGGATTCACAAAATGAAACGATTCTTACTCGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGATCCAGATGGTCATGAAATCTGTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTGGATCCACAAGCGGATAATTTATTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGGTTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATAAAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCTTGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCGTGTATGGAATGTTTGTTTTTTCTACTTTTTTTTCTAAATAATATACA]
[+] EMBL CD080382 [CGCTTGTGAGGTAAACGCCTAATCCCTTAATTCACACCATCCACCTGCTTCTCATTCACGATTCTTAGTTTCATCCGCTCTGACTGTAATCTTTGACGTATATTTCAAATAAGTGGATTTCATTTCAATCAGTCAGACATTTTGGCCAACTTTAAATCGTCACCTACTATGAATCATACCAGGGCTTTACACTTTGTCTTCAAGGTGGCCAATCGTAATGAAACAATTGATTTTTACAAACGGATTCTTGGAATGAAGGTGTTACGACATGAAGAATTTACTGAAGGTTGTAAGGCTTCATGTAACGGACCATATGATGGGAAGTGGAGCAAAACCATGATAGGTTATGGACCTGAGGATAATCATTTTGTCGTTGAGTTGACTTATAATTATGGGATTGGTGCTTATCAACTTGGTAATGATTTTCA GTATATTCGTATTCATAATAAGGATGCATATTCAAGAATTATCGGTGGATTATGGCCTATCACATTGAAAGAGTCAGATTCAGTAAAAGTGGAAGCTCCTGGTGGATATGCATTTTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGG TCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGgt ]
[+] EMBL CD081236 [ gcttgtgagGCTCTGACTGT ATCTTTGACGT TATTT AAATAAGTGGATTTCATTTCAATCAGTCAGACATTTTGGCCAACTTTAAATCGTCACCTACTATGAATCATACCAGGGCTTTACACTTTGTCTTCAAGGTGGCCAATCGTAATGAAACAATTGATTTTTACAAACGGATTCTTGGAATGAAGGTGTTACGACATGAAGAATTTACTGAAGGTTGTAAGGCTTCATGTAACGGACCATATGATGGGAAGTGGAGCAAAACCATGATAGGTTATGGACCTGAGGATAATCATTTTGTCGTTGAGTTGACTTATAATTATGGGATTGGTGCTTATCAACTTGGTAATGATTTTCA GTATATTCGTATTCATAATAAGGATGCATATTCAAGAATTATCGGTGGATTATGGCCTATCACATTGAAAGAGTCAGATTCAGTAAAAGTGGAAGCTCCTGGTGGATATGCATTTTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGG TCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATATCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCAAGTAGTCAATTACCAATT ]
[+] EMBL CD159548 [ CAGTTAAACATTTTGACCGACTTTAAATCGTCACCTCCTATGAATCATACCAGGGCTTTACACTTTGTCTTCAAAGTGGCCAATCGTAATGAAACAATTGATTTTTACAAACGGATTCTTGGAATGAAGGTGTTACGACATGAAGAATTTACTGAAGGTTGTAAGGCTTCATGTAACGGACCATATGATGGGAAGTGGAGCAAAACCATGATAGGTTATGGACCTGAGGATAATCATTTTGTCGTTGAGTTGACTTATAATTATGGGATTGGTGCTTATCAACTTGGTAATGATTTTCAGGTGTGTTTTTATTgt ]
[-] EMBL CD159570 [ AGTTAAACATTTTGACCGACTTTAAATCGTCACCTCCTATGAATCACACCAGGGCTTTACACTTTGTCTTCAAAGTGGCCAATCGTAATGAAACAATTGATTTTTACAAACGGATTCTTGGAATGAAGGTGTTACGACATGAAGAATTTACTGAAGGTTGTAAGGCTTCATGTAACGGACCATATGATGGGAAGTGGAGCAAAACCATGATAGGTTATGGACCTGAGGATAATCATTTTGTCGTTGAGTTGACTTATAATTATGGGATTGGTGCTTATCAACTTGGTAATGATTTTCAGGTGTGTTTTTATTgcc ]
[+] EMBL CD079244 [ CGGTGGATTATGGCCTATCACATTGAAAGAGTCAGATTCAGTAAAAGTGGAAGCTCCTGGTGGATATGCATTTTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGG TCTCATAAACTTGGTATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATTTCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCAAGTAGTCAATTACCAATTTTACAAAAAACGATGGATTCAAAAAATGAAACGATTCTTACTCGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGATCCAGATGGTCATGAAATCTTTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTGGATCCACAAGCGGATAGTTTACTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGGTTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATANAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCTTGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCATGTATGGAATGTTNGTTNTTTCTAC TTNTTTTCTAAAT ATATAC ]
[-] EMBL CD074478 [ ATCACA TGAAAGAGTCAGATTCAGTAAAAGTGGAAGCTCCTGGTGGATATGCATTTTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGG TCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATATCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCAAGTAGTCAATTACCAATTTTACAAAAAACGATGGATTCACAAAATGAAACGATTCTTACTCGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGATCCAGATGGTCATGAAATCTGTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTGGATCCACAAGCGGATAATTTATTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGGTTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATAAAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCTTGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCGTGTATGGAATGTTTGTTTTTTCTACTTTTTTTTCTAAATAATATACA]
[-] EMBL CD074297 [ TTGGGTGCACAACTGTGATAGTGATGGGGATCCAGTTCGAATGGTGGCTTTAGCTACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGATTATTGG TCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATATCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCAAGTAGTCAATTACCAATTTTACAAAAAACGATGGATTCACAAAATGAAACGATTCTTACTCGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGATCCAGATGGTCATGAAATCTGTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTGGATCCACAAGCGGATAATTTATTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGGTTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATAAAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCTTGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCGTGTATGGAATGTTTGTTTTTTCTACTTTTTTTTCTAAATAATATACA]
[-] EMBL CD075067 [ ACTTCAAATCTTAAACGATCCACTGA TATTGGTTCTCATAAACTTAATATGACACTTGTGTCATCTAGTTCAGATGAAGCAGTGTTTTGTTATTCACCAAATCAGTGTACTTTAAAACTAATATCCATTCAAAAACCTATTGATCATGCTAGCGCATTTGGTCGTATAGCTTTTGCATGCCCAAGTAGTCAATTACCAATTTTACAAAAAACGATGGATTCACAAAATGAAACGATTCTTACTCGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGATCCAGATGGTCATGAAATCTGTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTGGATCCACAAGCGGATAATTTATTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGGTTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATAAAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCTTGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCGTGTATGGAATGTTTGTTTTTTCTACTTTTTTTTCTAAATAATATACA]
[-] EMBL SMW746 [ GAAACGATTCTTACTCGTTTAGTCAGCTTGGATACTCCAGGAAAAGCTACTGTACAAGTGATTATTTTAGCTGATCCAGATGGTCATGAAATCTGTTTTGTTGGAGATGAAGCTTTTAGACAGTTGTCACAAGTGGATCCNCAACCGGATAATTTATTACAATCAGCTATAGCCTCAGATAAAAGTGATGAATGGTTCAATAAACATGGTGGCAAGACAACAAAATAAAACTATTGTTTTCAACTCATTGAATCTTGTGTGTATGGTATCATGAATTGTCGTGTATGGAATGTTTGTTTTTTCTACTTTTTTTTCTAAATAATATACA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||