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Schistosoma mansoni
cluster # 9356 cluster # 9356       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9356#0 length = 621 sequences # 9  

consensusID : consensus_9356#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 621
fasta sequence
                              [ACGCTACCGGGATTACATGTTTTCCTGCACTGACTTAACTACTACACAGTCGAGTTGGGTTTTGTGAAACGACAATAAGGTCTTTAAAAGCTGCCCAAGATTCCTTGATATTCGAACTCTCATCATATTAAAGTGGCGTTGTTCAAGATTACGTGTCGCTTTATGGGACAAGAATATCTTTACTTACTTCCAACTGTCCTATTTAGTTAATTTATCCGATTGTAATTAAGTAGAACTAGGGGTTGTGTTTATAGTTTGTTGATTGTAATTGGCCTTTACAACAAATTGGTTTCTTTGTATGAATTAGCCAATCGAGATTACTGTTATATAAAACTATCATCCTTTTGTTTGTAAGACAAGAGACTTCCGTTTGCTTAAAAAGTACCTTATTTACTGTCAATTAGATGAACTCAGTTCCACCTATG-TCAACTATCAACGGAAGTTAGACGAACTATGTTTGTATCGCGGTTAACATTTGTATCAAAGACAGTGCCCAAAATTATTCGTCTATGTAGCAAGAAATTTGCG-TACAAAATAAATACA-AAAGAACAACAACGCTATAAAACATTATTTTCCGGAACCTGNGAATCAGTTTCTCATCAGCCTTTTCCAAATGCAGAA]

[+] EMBL AI067301             [ACGCTACCGGGATTACATGTTTTCCTGCACTGACTTAACTACTACACAGTCGAGTTGGGTTTTGTGAAACGACAATAAGGTCTTTAAAAGCTGCCCAAGATTCCTTGATATTCGAACTCTCATCATATTAAAGTGGCGTTGTTCAAGATTACGTGTCGCTTTATGGGACAAGAATATCTTTACTTACTTCCAACTGTCCTATTTAGTTAATTTATCCGATTGTAATTAAGTAGAACTAGGGGTTGTGTTTATAGTTTGTTGATTGTAATTGGCCTTTACAACAAATTGGTTTCTTTGTATGAATTAGCCAATCGAGATTACTGTTATATAAAACTATCATCCTTTTGTTTGTAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI068200             [      CCGGGATTACATGTTTTCCTGCACTGACTTAACTACTACACAGTCGAGTTGGGTTTTGTGAAACGACAATAAGGTCTTTAAAAGCTGCCCAAGATTCCTTGATATTCGAACTCTCATCATATTAAAGTGGCGTTGTTCAAGATTACGTGTCGCTTTATGGGACAAGAATATCTTTACTTACTTCCAACTGTCCTATTTAGTTAATTTATCCGATTGTAATTAAGTAGAACTAGGGGTTGTGTTTATAGTTTGTTGATTGTAATTGGCCTTTACAACAAATTGGTTTCTTTGTATGAATTAGCCAATCGAGATTACTGTTATATAAAACTATCATCCTTTTGTTTGTAAGACAAGAGACTTCCGTTTGCTTAAAAAGTACCTTATTTACTGTCAATTAGATGAACTCAGTTCCACCTATG TCAACTATCAACGGAAGTTAGACGAACTATGTTTGTATCGCGGTTAACATTTGTATCAAAGACAGTGCCCAAAATTATTCGTCTATGTAGCAAGAAATTTGCG TACAAAATAAATACA AAAGAACAACAACGCTATAAAACATTATTTTCCGGAACCTGNGAATCAGTTTCTCATCAGCCTTTTCCAAATGCAG  ]
[+] EMBL AI067937             [      CCGGGATTACATGTTTTCCTGCACTGACTTAACTACTACACAGTCGAGTTGGGTTTTGTGAAACGACAATAAGGTCTTTAAAAGCTGCCCAAGATTCCTTGATATTCGAACTCTCATCATATTAAAGTGGCGTTGTTCAAGATTACGTGTCGCTTTATGGGACAAGAATATCTTTACTTACTTCCAACTGTCCTATTTAGTTAATTTATCCGATTGTAATTAAGTAGAACTAGGGGTTGTGTTTATAGTTTGTTGATTGTAATTGGCCTTTACAACAAATTGGTTTCCTTGCATGAATTAGCCACTCGAGATTACTGTTATATAGAACTATCATCCTTTTGTTTGTAATACAAGAGACTTCCGTTTGCTTAAAAAGTACCTTATTTACTGTCAATTAGATGAACTCAGTTCCACCTATGCTCAACTATCAACGGAAGTTAGACGAACTATGTTTGTATCGCGGATAACATTTGTATCAAAGACAGTGCCCAAAATTACTCGTCTATGTCGCACGAAATTTGCG TACAATCTATCTACACAATGAACAACAACGCTAATAAACATTAGTTTCCGGAACCTGGGAAT                                ]
[+] EMBL AI067266             [      CCGGGATTACATGTTTTCCTGCACTGACTTAACTACTACACAGTCGAGTTGGGTTTTGTGAAACGACAATAAGGTCTTTAAAAGCTGCCCAAGATTCCTTGATATTCGAACTCTCATCATATTAAAGTGGCGTTGTTCAAGATTACGTGTCGCTTTATGGGACAAGAATATCTTTACTTACTTCCAACTGTCCTATTTAGTTAATTTATCCGATTGTAATTAAGTAGAACTAGGGGTTGTGTTTATAGTTTGTTGATTGTAATTGGCCTTTACAACAAATTGGTTTCTTTGTATGAATTAGCCAATCGAGATTACTGTTATATAAAACTATCATCCTTTTGTTTGTAAGACAAGAGACTTCCGTTTGCTTAAAAAGTACCTTATTTACTGTCAATTAGATGAACTCAGTTCCACCTATG TCAACTATCAACGGAAGTTAGACGAACTATGTTTGTATCGCGGTTAACATTTGTATCAAAGACAGTGCCCAAAATTATTCGTCTATGTAGCAAGAAATTTGCGTTAC AAATAAATACA AAAGAACAACAACGCTATAAA                                                         ]
[+] EMBL AI067718             [      CCGGGATTACATGTTTTCCTGCACTGACTTAACTACTACACAGTCGAGTTGGGTTTTGTGAAACGACAATAAGGTCTTTAAAAGCTGCCCAAGATTCCTTGATATTCGAACTCTCATCATATTAAAGTGGCGTTGTTCAAGATTACGTGTCGCTTTATGGGACAAGAATATCTTTACTTACTTCCAACTGTCCTATTTAGTTAATTTATCCGATTGTAATTAAGTAGAACTAGGGGTTGTGTTTATAGTTTGTTGATTGTAATTGGCCTTTACAACAAATTGGTTTCTTTGTATGAATTAGCCAATCGAGATTACTGTTATATAAAACTATCATCCTTTTGTTTGTAAGACAAGAGACTTCCGTTTGCTTAAAAAGTACCTTATTTACTGTCAATTAGATGAACTCAGTTCCACCTATG TCAACTATCAACGGAAGTTAGACGAACTATGTTTGTATCGCGGTTAACATTTG                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL AI068047             [      CCGGGATTACATGTTTTCCTGCACTGACTTAACTACTACACAGTCGAGTTGGGTTTTGTGAAACGACAATAAGGTCTTTAAAAGCTGCCCAAGATTCCTTGATATTCGAACTCTCATCATATTAAAGTGGCGTTGTTCAAGATTACGTGTCGCTTTATGGGACAAGAATATCTTTACTTACTTCCAACTGTCCTATTTAGTTAATTTATCCGATTGTAATTAAGTAGAACTAGGGGTTGTGTTTATAGTTTGTTGATTGTAATTGGCCTTTACAACAAATTGGTTTCTTTGTATGAATTAGCCAATCGAGATTACTGTTATATAAAACTATCATCCTTTTGTTTGTAAGACAAGAGACTTCCGTTTGCTTAAAAAGTACCTTATTTACTGTCAATTAGATGAACTCAGTTCCACCTATG TCAACTATCAACGGAAGTTAGACGAA                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI068298             [      CCGGGATTACATGTTTTCCTGCACTGACTTAACTACTACACAGTCGAGTTGGGTTTTGTGAAACGACAATAAGGTCTTTAAAAGCTGCCCAAGATTCCTTGATATTCGAACTCTCATCATATTAAAGTGGCGTTGTTCAAGATTACGTGTCGCTTTATGGGACAAGAATATCTTTACTTACTTCCAACTGTCCTATTTAGTTAATTTATCCGATTGTAATTAAGTAGAACTAGGGGTTGTGTTTATAGTTTGTTGATTGTAATTGGCCTTTACAACAAATTGGTTTCTTTGTATGAATTAGCCAATCGAGATTACTGTTATATAAAACTATCATCCTTTTGTTTGTAAGACAAGAGACTTCCGTTTGCTTAAAAAGTA CTTATTTACTGTCAATTAGATGAACTCAGTTCCCACTATG TCAACTATCAACGGAAGTT                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI067260             [      CCGGGATTACATGTTTTCCTGCACTGACTTAACTACTACACAGTCGAGTTGGGTTTTGTGAAACGACAATAAGGTCTTTAAAAGCTGCCCAAGATTCCTTGATATTCGAACTCTCATCATATTAAAGTGGCGTTGTTCAAGATTACGTGTCGCTTTATGGGACAAGAATATCTTTACTTACTTCCAACTGTCCTATTTAGTTAATTTATCCGATTGTAATTAAGTAGAACTAGGGGTTGTGTTTATAGTTTGTTGATTGTAATTGGCCTTTACAACAAATTGGTTTCTTTGTATGAATTAGCCAATCGAGATTACTGTTATATAAAACTATCATCCTTTTGTTTGTAAGACAAGAGACTTCCGTTTGCTTAAAAAGTACCTTATTTACTGTCAATTAGATGAACTCAGTTCCACCTATG TCAACTATCAACGGAAGTTAGACGAACTATGTTTGTATCGCGGTTAACATTTGTATCAAAGACAGTGCCCAAAATTATTCGTCTATGTAGCAAGAAATTTGCG TACAAAATAAATACA AAAGAACAACAACGCTATAAAACATTATTTTCCGGAACCTGNGAATCAATTTCTCATCAGCCTTTTCCAAATGCAAAA]
[+] EMBL AI067671             [      CCGGGATTACATGTTTTCCTGCACTGACTTAACTACTACACAGTCGAGTTGGGTTTTGTGAAACGACAATAAGGTCTTTAAAAGCTGCCCAAGATTCCTTGATATTCGAACTCTCATCATATTAAAGTGGCGTTGTTCAAGATTACGTGTCGCTTTATGGGACAAGAATATCTTTACTTACTTCCAACTGTCCTATTTAGTTAATTTATCCGATTGTAATTAAGTAGAACTAGGGGTTGTGTTTATAGTTTGTTGATTGTAATTGGCCTTTACAACAAATTGGTTTCTTTGTATGAATTAGCCAATCGAGATTACTGTTATATAAAACTATCATCCTTTTGTTTGTAAGACAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                       ]


>consensus_9356#0 ACGCTACCGGGATTACATGTTTTCCTGCACTGACTTAACTACTACACAGTCGAGTTGGGT TTTGTGAAACGACAATAAGGTCTTTAAAAGCTGCCCAAGATTCCTTGATATTCGAACTCT CATCATATTAAAGTGGCGTTGTTCAAGATTACGTGTCGCTTTATGGGACAAGAATATCTT TACTTACTTCCAACTGTCCTATTTAGTTAATTTATCCGATTGTAATTAAGTAGAACTAGG GGTTGTGTTTATAGTTTGTTGATTGTAATTGGCCTTTACAACAAATTGGTTTCTTTGTAT GAATTAGCCAATCGAGATTACTGTTATATAAAACTATCATCCTTTTGTTTGTAAGACAAG AGACTTCCGTTTGCTTAAAAAGTACCTTATTTACTGTCAATTAGATGAACTCAGTTCCAC CTATGTCAACTATCAACGGAAGTTAGACGAACTATGTTTGTATCGCGGTTAACATTTGTA TCAAAGACAGTGCCCAAAATTATTCGTCTATGTAGCAAGAAATTTGCGTACAAAATAAAT ACAAAAGAACAACAACGCTATAAAACATTATTTTCCGGAACCTGNGAATCAGTTTCTCAT CAGCCTTTTCCAAATGCAGAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)