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Schistosoma mansoni
cluster # 9357 cluster # 9357       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9357#0 length = 1593 sequences # 9  

consensusID : consensus_9357#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1593
fasta sequence
                              [CTTGTTTAACCGACGGTAATCACTATACTCATATGGAAATCGACCCTGCCACAATTTTAGGTGTCGTTGCTGGTTTGATTCCTTATCCGGACCACAATCAATCTCCCCGAAATACTTATCAATGTGCTATGGGTAAGCAAGCTATCGGCACTGTTGCGCTTAATCAGCAAATCCGTTTTGATACACTTCAATGTCAAATGGTCTACCCTCAAAAACCCCTTGTTCAGTCAAAGACTATTCAAATGATGCATTTTGATGAGCTTCCTGCTGGTCAAAATGCAGTTGTGGCAATAATGTCTTATTCTGGGTATGACGTTGAGGATGCGTTGGTTATTAACCAAGCATCAACTGATCGAGGTTTCGCTCGTGCTTGTGTTTATCGTCGGTCTGGTGTTCATCTCANAATGCATGAGAATGCAGTTTACGATCGCTTAATGGGCCCTAGCGTAAAGCGAGAANCCGGGGTTCTTCGTCGTGGAGATGAGGTGCTTCAGGCGGATGGAGTTGCTTACATTGGTGCTTGTGTTAACGACCGTCAAATCCTTATCAATAAAGAAATGCCTGTTGTTAGTTCAAGTGCTGTATTGGATAATGCGGGATCGCTTAGTTTGAATGTGAATACACCTGAAAATGCGACAGAATTCAAGCGTTGTCCTGTAGACTACAAAGGAATAGAGCCGTCCTATGTAGAAAAAGTTATGTTTTCCACATCAGAAGGCAACCAGGCAGTAGTAAAGATATTATTGCGCCAAACTAGAAGACCCGAAGTTGGAGATAAGTTTTCCAGCCGCCATGGTCAAAAAGGGGTCGTTGGACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGCCTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATCCTCATGGATTTCCCAGCAGGATGACGGTGGGTAAATTGTTAGAAGTCTTGGGTAGCAAAGCCGGGGCTATCGAAGGGAAAATTCGAGACGGTTCAGCTTTTTCTGGGGATCCTGCTGAAGTCCTTTCACAAGTACTTATTGATCATGGGTATCATTATCTTGGTAAGGAGATTTTGTATTCTGGCGTCACTGGAGCCCCACTTGAAGCATTTATTTACTTTGGTCCTGTTTATTACCAGCGACTTAAGCATATGGTTATGGATAAAGTACATGCTCGCTCACGCGGTCCCGTCACAGCATTGACTCGGCAGCCGACGGAGGGTCGTAGTAGAGAAGGANGTTTACGAGTTGGAGAAATGGAACGAGACTGTTTTATTGCTTATGGTACTTCACAGTTACTATTAGAACGTCTTCTGCTTTCCAGCGATGCCTATGATGCATGCGTATGTGAAAAATGTGGTTTGTTAGCTACGTCACCTAACTGGTGTCAGTATTGTCGAAGTAGTCGACAAGTTGTTTCTGTTCGTATGCCATATGCCTGCAAGCTGCTTTTCCAAGAACTAATGTGCATGAGGATTCTGCCGCGCCTTCGTTTAAGGGCTGCTTATCATAGCAGTATACACACTAAATCTAAGTGATTCATTTTGTATATTCAAATTAATTGTTGTTGATAACTCTGCCATATAATTCTCATGAATTTGTATAAAATTG]

[+] EMBL CD092517             [CTTGTTTAACCGACGGTAATCACTATACTCATATGGAAATCGACCCTGCCACAATTTTAGGTGTCGTTGCTGGTTTGATTCCTTATCCGGACCACAATCAATCTCCCCGAAATACTTATCAATGTGCTATGGGTAAGCAAGCTATCGGCACTGTTGCGCTTAATCAGCAAATCCGTTTTGATACACTTCAATGTCAAATGGTCTACCCTCAAAAACCCCTTGTTCAGTCAAAGACTATTCAAATGATGCATTTTGATGAGCTTCCTGCTGGTCAAAATGCAGTTGTGGCAATAATGTCTTATTCTGGGTATGACGTTGAGGATGCGTTGGTTATTAACCAAGCATCAACTGATCGAGGTTTCGCTCGTGCTTGTGTTTATCGTCGGTCTGGTGTTCATCTCANAATGCATGAGAATGCAGTTTACGATCGCTTAATGGGCCCTAGCGTAAAGCGAGAAN                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD180457             [        ACCGACGGTAATCACTATACTCATATGGAAATCGACCCTGCCACAATTTTAGGTGTCGTTGCTGGTTTGATTCCTTATCCGGACCACAATCAATCTCCCCGAAATACTTATCAATGTGCTATGGGTAAGCAAGCTATCGGCACTGTTGCGCTTAATCAGCAAATCCGTTTTGATACACTTCAATGTCAAATGGTCTACCCTCAAAAACCCCTTGTTCAGTCAAAGACTATTCAAATGATGCATTTTGATGAGCTTCCTGCTGGTCAAAATGCAGTTGTGGCAATAATGTCTTATTCTGGGTATGACGTTGAGGATGCGTTAGTTATTAACCAAGCATCAATTGATCGAGGTTTCGCTCGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD092513             [                ggATCACTATACTCATATGGAAATCGACCCTGCCACAATTTTAAGTGTCGGTGCTGGGTTGATTGCTTATCCGGACCACAATCAATCTGCCCGAAATACTTATCAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BF936982             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CGCTCGTGCTTGTGTTTATCGTCGGTCTGGTGTTCATCTCAAAATGCATGAAAATGCAGTTTACGATCGCTTAATGGGCCCTAGCATAGAGCGAGAAACCGGGGTTCTTCGTCGTGGAGATGAGGTGCTTCAGGCGGATGGAGTTGCTTACATTGGTGCTTGTGTTAACGACCGTCAAATCCTTATCAATAAAGAAATGCCTGTTGTTAGTTCAAGTGCTGTATTGGATAATGCGGGATCGCTTAGTTTGAATGTGAATACACCTGAAAATGCGACAGAATTCAAGCGTTGTCCTGTAGACTACAAAGGAATAGAGCCGTCCTATGTAGAAAAAGTTATGTTTTCCACATCAGAAGGCAACCAGGCAGTAGTAAAGATATTATTGCGCCAAACTAGAAGACCCGAAGTTGGAGATAAGTTTTCCAGCCGCCATGGTCAAAAAGGGGTCGTTGGACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGCCTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD082449             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gCCTGAAAATGCGACAGAATTCAAGCGTTGTCCTGTAGACTACAAAGGAATAGAGCCGTCCTATGTAGAAAAAGTTATGTTTTCCACATCAGAAGGCAACCAGGCAGTAGTAAAGATATTATTGCGCCAAACTAGAAGACCCGAAGTTGGAGATAAGTTTTCCAGCCGCCATGGTCAAAAAGGGGTCGTTGGACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGCCTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATCCTCATGGATTTCCCAGCAGGATGACGGTGGGTAAATTGTTAGAAGTCTTGGGTAGCAAAGCCGGGGCTATCGAAGGGAAAATTCGAGACGGTTCAGCTTTTTCTGGGGATCCTGCTGAAGTCCTTTCACAAGTACTTATTGATCATGGGTATCATTATCTTGGTAAGGAGATTTTGTATTCTGGCGTCACTGGAGCCCCACTTGAAGCATTTATTTACTTTGGTCCTGTTTATTACCAGCGACTTAAGCATATGGTTATGGATAAAGTACATGCTCGCTCACGCGGTCCCGTCACAGCATTGACTCGGCAGCCGACGGAGGGTCGTAGTAGAGAAGGAN                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL BG930542             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGCCGCCATGGTCAAAAAGGGGTCGTTGGACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGCCTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATCCTCATGGATTTCCCAGCAGGATGACGGTGGGTAAATTGTTAGAAGTCTTGGGTAGCAAAGCCGGGGCTATCGAAGGGAAAATTCGAGACGGTTCAGCTTTTTCTGGGGATCCTGCTGAAGTCCTTTCACAAGTACTTATTGATCATGGGTATCATTATCTTGGTAAGGAGATTTTGTATTCTGGCGTCACTGGAGCCCCACTTGAAGCATTTATTTACTTTGGTCCTGTTTATTACCAGCGACTTAAGCATATGGTTATGGATAAAGTACATGCTCGCTCACGCGGTCCCGTCACAGCATTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD152782             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGCCTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATCCTCATGGATTTCCCAGCAGGATGACGGTGGGTAAATTGTTAGAAGTCTTGGGTAGCAAAGCCGGGGCTATCGAAGGGAAAATTCGAGACGGTTCAGCTTTTTCTGGGGATCCTGCTGAAGTCCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD152787             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGCCTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATCTTCATGGATTTCCCAGCAGGATGACGGTGGGTAAATTGTTAGAAGTCTTGGGTAGCAAAGCCGGGGCTATCGAAGGGAAAATTCGAGACGGTTCAGCTTTTTCTGGGGATCCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD076047             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctatTTGATCATGGGTATCATTATCTTGGTAAGGAGATTTTGTATTCTGGCGTCACTGGAGCCCCACTTGAAGCATTTATTTACTTTGGTCCTGTTTATTACCAGCGACTTAAGCATATGGTTATGGATAAAGTACATGCTCGCTCACGCGGTCCCGTCACAGCATTGACTCGGCAGCCGACGGAGGGTCGTAGTAGAGAAGGAGGTTTACGAGTTGGAGAAATGGAACGAGACTGTTTTATTGCTTATGGTACTTCACAGTTACTATTAGAACGTCTTCTGCTTTCCAGCGATGCCTATGATGCATGCGTATGTGAAAAATGTGGTTTGTTAGCTACGTCACCTAACTGGTGTCAGTATTGTCGAAGTAGTCGACAAGTTGTTTCTGTTCGTATGCCATATGCCTGCAAGCTGCTTTTCCAAGAACTAATGTGCATGAGGATTCTGCCGCGCCTTCGTTTAAGGGCTGCTTATCATAGCAGTATACACACTAAATCTAAGTGATTCATTTTGTATATTCAAATTAATTGTTGTTGATAACTCTGCCATATAATTCTCATGAATTTGTATAAAATTG]


>consensus_9357#0 CTTGTTTAACCGACGGTAATCACTATACTCATATGGAAATCGACCCTGCCACAATTTTAG GTGTCGTTGCTGGTTTGATTCCTTATCCGGACCACAATCAATCTCCCCGAAATACTTATC AATGTGCTATGGGTAAGCAAGCTATCGGCACTGTTGCGCTTAATCAGCAAATCCGTTTTG ATACACTTCAATGTCAAATGGTCTACCCTCAAAAACCCCTTGTTCAGTCAAAGACTATTC AAATGATGCATTTTGATGAGCTTCCTGCTGGTCAAAATGCAGTTGTGGCAATAATGTCTT ATTCTGGGTATGACGTTGAGGATGCGTTGGTTATTAACCAAGCATCAACTGATCGAGGTT TCGCTCGTGCTTGTGTTTATCGTCGGTCTGGTGTTCATCTCANAATGCATGAGAATGCAG TTTACGATCGCTTAATGGGCCCTAGCGTAAAGCGAGAANCCGGGGTTCTTCGTCGTGGAG ATGAGGTGCTTCAGGCGGATGGAGTTGCTTACATTGGTGCTTGTGTTAACGACCGTCAAA TCCTTATCAATAAAGAAATGCCTGTTGTTAGTTCAAGTGCTGTATTGGATAATGCGGGAT CGCTTAGTTTGAATGTGAATACACCTGAAAATGCGACAGAATTCAAGCGTTGTCCTGTAG ACTACAAAGGAATAGAGCCGTCCTATGTAGAAAAAGTTATGTTTTCCACATCAGAAGGCA ACCAGGCAGTAGTAAAGATATTATTGCGCCAAACTAGAAGACCCGAAGTTGGAGATAAGT TTTCCAGCCGCCATGGTCAAAAAGGGGTCGTTGGACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGC CTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATCCTCATGGATTTCCCAGCA GGATGACGGTGGGTAAATTGTTAGAAGTCTTGGGTAGCAAAGCCGGGGCTATCGAAGGGA AAATTCGAGACGGTTCAGCTTTTTCTGGGGATCCTGCTGAAGTCCTTTCACAAGTACTTA TTGATCATGGGTATCATTATCTTGGTAAGGAGATTTTGTATTCTGGCGTCACTGGAGCCC CACTTGAAGCATTTATTTACTTTGGTCCTGTTTATTACCAGCGACTTAAGCATATGGTTA TGGATAAAGTACATGCTCGCTCACGCGGTCCCGTCACAGCATTGACTCGGCAGCCGACGG AGGGTCGTAGTAGAGAAGGANGTTTACGAGTTGGAGAAATGGAACGAGACTGTTTTATTG CTTATGGTACTTCACAGTTACTATTAGAACGTCTTCTGCTTTCCAGCGATGCCTATGATG CATGCGTATGTGAAAAATGTGGTTTGTTAGCTACGTCACCTAACTGGTGTCAGTATTGTC GAAGTAGTCGACAAGTTGTTTCTGTTCGTATGCCATATGCCTGCAAGCTGCTTTTCCAAG AACTAATGTGCATGAGGATTCTGCCGCGCCTTCGTTTAAGGGCTGCTTATCATAGCAGTA TACACACTAAATCTAAGTGATTCATTTTGTATATTCAAATTAATTGTTGTTGATAACTCT GCCATATAATTCTCATGAATTTGTATAAAATTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)