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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9357#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1593 fasta sequence
[CTTGTTTAACCGACGGTAATCACTATACTCATATGGAAATCGACCCTGCCACAATTTTAGGTGTCGTTGCTGGTTTGATTCCTTATCCGGACCACAATCAATCTCCCCGAAATACTTATCAATGTGCTATGGGTAAGCAAGCTATCGGCACTGTTGCGCTTAATCAGCAAATCCGTTTTGATACACTTCAATGTCAAATGGTCTACCCTCAAAAACCCCTTGTTCAGTCAAAGACTATTCAAATGATGCATTTTGATGAGCTTCCTGCTGGTCAAAATGCAGTTGTGGCAATAATGTCTTATTCTGGGTATGACGTTGAGGATGCGTTGGTTATTAACCAAGCATCAACTGATCGAGGTTTCGCTCGTGCTTGTGTTTATCGTCGGTCTGGTGTTCATCTCANAATGCATGAGAATGCAGTTTACGATCGCTTAATGGGCCCTAGCGTAAAGCGAGAANCCGGGGTTCTTCGTCGTGGAGATGAGGTGCTTCAGGCGGATGGAGTTGCTTACATTGGTGCTTGTGTTAACGACCGTCAAATCCTTATCAATAAAGAAATGCCTGTTGTTAGTTCAAGTGCTGTATTGGATAATGCGGGATCGCTTAGTTTGAATGTGAATACACCTGAAAATGCGACAGAATTCAAGCGTTGTCCTGTAGACTACAAAGGAATAGAGCCGTCCTATGTAGAAAAAGTTATGTTTTCCACATCAGAAGGCAACCAGGCAGTAGTAAAGATATTATTGCGCCAAACTAGAAGACCCGAAGTTGGAGATAAGTTTTCCAGCCGCCATGGTCAAAAAGGGGTCGTTGGACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGCCTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATCCTCATGGATTTCCCAGCAGGATGACGGTGGGTAAATTGTTAGAAGTCTTGGGTAGCAAAGCCGGGGCTATCGAAGGGAAAATTCGAGACGGTTCAGCTTTTTCTGGGGATCCTGCTGAAGTCCTTTCACAAGTACTTATTGATCATGGGTATCATTATCTTGGTAAGGAGATTTTGTATTCTGGCGTCACTGGAGCCCCACTTGAAGCATTTATTTACTTTGGTCCTGTTTATTACCAGCGACTTAAGCATATGGTTATGGATAAAGTACATGCTCGCTCACGCGGTCCCGTCACAGCATTGACTCGGCAGCCGACGGAGGGTCGTAGTAGAGAAGGANGTTTACGAGTTGGAGAAATGGAACGAGACTGTTTTATTGCTTATGGTACTTCACAGTTACTATTAGAACGTCTTCTGCTTTCCAGCGATGCCTATGATGCATGCGTATGTGAAAAATGTGGTTTGTTAGCTACGTCACCTAACTGGTGTCAGTATTGTCGAAGTAGTCGACAAGTTGTTTCTGTTCGTATGCCATATGCCTGCAAGCTGCTTTTCCAAGAACTAATGTGCATGAGGATTCTGCCGCGCCTTCGTTTAAGGGCTGCTTATCATAGCAGTATACACACTAAATCTAAGTGATTCATTTTGTATATTCAAATTAATTGTTGTTGATAACTCTGCCATATAATTCTCATGAATTTGTATAAAATTG]
[+] EMBL CD092517 [CTTGTTTAACCGACGGTAATCACTATACTCATATGGAAATCGACCCTGCCACAATTTTAGGTGTCGTTGCTGGTTTGATTCCTTATCCGGACCACAATCAATCTCCCCGAAATACTTATCAATGTGCTATGGGTAAGCAAGCTATCGGCACTGTTGCGCTTAATCAGCAAATCCGTTTTGATACACTTCAATGTCAAATGGTCTACCCTCAAAAACCCCTTGTTCAGTCAAAGACTATTCAAATGATGCATTTTGATGAGCTTCCTGCTGGTCAAAATGCAGTTGTGGCAATAATGTCTTATTCTGGGTATGACGTTGAGGATGCGTTGGTTATTAACCAAGCATCAACTGATCGAGGTTTCGCTCGTGCTTGTGTTTATCGTCGGTCTGGTGTTCATCTCANAATGCATGAGAATGCAGTTTACGATCGCTTAATGGGCCCTAGCGTAAAGCGAGAAN ]
[-] EMBL CD180457 [ ACCGACGGTAATCACTATACTCATATGGAAATCGACCCTGCCACAATTTTAGGTGTCGTTGCTGGTTTGATTCCTTATCCGGACCACAATCAATCTCCCCGAAATACTTATCAATGTGCTATGGGTAAGCAAGCTATCGGCACTGTTGCGCTTAATCAGCAAATCCGTTTTGATACACTTCAATGTCAAATGGTCTACCCTCAAAAACCCCTTGTTCAGTCAAAGACTATTCAAATGATGCATTTTGATGAGCTTCCTGCTGGTCAAAATGCAGTTGTGGCAATAATGTCTTATTCTGGGTATGACGTTGAGGATGCGTTAGTTATTAACCAAGCATCAATTGATCGAGGTTTCGCTCGTGC ]
[+] EMBL CD092513 [ ggATCACTATACTCATATGGAAATCGACCCTGCCACAATTTTAAGTGTCGGTGCTGGGTTGATTGCTTATCCGGACCACAATCAATCTGCCCGAAATACTTATCAAT ]
[+] EMBL BF936982 [ CGCTCGTGCTTGTGTTTATCGTCGGTCTGGTGTTCATCTCAAAATGCATGAAAATGCAGTTTACGATCGCTTAATGGGCCCTAGCATAGAGCGAGAAACCGGGGTTCTTCGTCGTGGAGATGAGGTGCTTCAGGCGGATGGAGTTGCTTACATTGGTGCTTGTGTTAACGACCGTCAAATCCTTATCAATAAAGAAATGCCTGTTGTTAGTTCAAGTGCTGTATTGGATAATGCGGGATCGCTTAGTTTGAATGTGAATACACCTGAAAATGCGACAGAATTCAAGCGTTGTCCTGTAGACTACAAAGGAATAGAGCCGTCCTATGTAGAAAAAGTTATGTTTTCCACATCAGAAGGCAACCAGGCAGTAGTAAAGATATTATTGCGCCAAACTAGAAGACCCGAAGTTGGAGATAAGTTTTCCAGCCGCCATGGTCAAAAAGGGGTCGTTGGACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGCCTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATC ]
[+] EMBL CD082449 [ gCCTGAAAATGCGACAGAATTCAAGCGTTGTCCTGTAGACTACAAAGGAATAGAGCCGTCCTATGTAGAAAAAGTTATGTTTTCCACATCAGAAGGCAACCAGGCAGTAGTAAAGATATTATTGCGCCAAACTAGAAGACCCGAAGTTGGAGATAAGTTTTCCAGCCGCCATGGTCAAAAAGGGGTCGTTGGACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGCCTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATCCTCATGGATTTCCCAGCAGGATGACGGTGGGTAAATTGTTAGAAGTCTTGGGTAGCAAAGCCGGGGCTATCGAAGGGAAAATTCGAGACGGTTCAGCTTTTTCTGGGGATCCTGCTGAAGTCCTTTCACAAGTACTTATTGATCATGGGTATCATTATCTTGGTAAGGAGATTTTGTATTCTGGCGTCACTGGAGCCCCACTTGAAGCATTTATTTACTTTGGTCCTGTTTATTACCAGCGACTTAAGCATATGGTTATGGATAAAGTACATGCTCGCTCACGCGGTCCCGTCACAGCATTGACTCGGCAGCCGACGGAGGGTCGTAGTAGAGAAGGAN ]
[-] EMBL BG930542 [ AGCCGCCATGGTCAAAAAGGGGTCGTTGGACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGCCTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATCCTCATGGATTTCCCAGCAGGATGACGGTGGGTAAATTGTTAGAAGTCTTGGGTAGCAAAGCCGGGGCTATCGAAGGGAAAATTCGAGACGGTTCAGCTTTTTCTGGGGATCCTGCTGAAGTCCTTTCACAAGTACTTATTGATCATGGGTATCATTATCTTGGTAAGGAGATTTTGTATTCTGGCGTCACTGGAGCCCCACTTGAAGCATTTATTTACTTTGGTCCTGTTTATTACCAGCGACTTAAGCATATGGTTATGGATAAAGTACATGCTCGCTCACGCGGTCCCGTCACAGCATTGA ]
[-] EMBL CD152782 [ ACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGCCTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATCCTCATGGATTTCCCAGCAGGATGACGGTGGGTAAATTGTTAGAAGTCTTGGGTAGCAAAGCCGGGGCTATCGAAGGGAAAATTCGAGACGGTTCAGCTTTTTCTGGGGATCCTGCTGAAGTCCTT ]
[-] EMBL CD152787 [ ACTTATTGTTCGTCAAGAAGATTTGCCTTTTTCAACGAATGGTCTTACCCCTGACATCATAATGAATCTTCATGGATTTCCCAGCAGGATGACGGTGGGTAAATTGTTAGAAGTCTTGGGTAGCAAAGCCGGGGCTATCGAAGGGAAAATTCGAGACGGTTCAGCTTTTTCTGGGGATCCT ]
[-] EMBL CD076047 [ ctatTTGATCATGGGTATCATTATCTTGGTAAGGAGATTTTGTATTCTGGCGTCACTGGAGCCCCACTTGAAGCATTTATTTACTTTGGTCCTGTTTATTACCAGCGACTTAAGCATATGGTTATGGATAAAGTACATGCTCGCTCACGCGGTCCCGTCACAGCATTGACTCGGCAGCCGACGGAGGGTCGTAGTAGAGAAGGAGGTTTACGAGTTGGAGAAATGGAACGAGACTGTTTTATTGCTTATGGTACTTCACAGTTACTATTAGAACGTCTTCTGCTTTCCAGCGATGCCTATGATGCATGCGTATGTGAAAAATGTGGTTTGTTAGCTACGTCACCTAACTGGTGTCAGTATTGTCGAAGTAGTCGACAAGTTGTTTCTGTTCGTATGCCATATGCCTGCAAGCTGCTTTTCCAAGAACTAATGTGCATGAGGATTCTGCCGCGCCTTCGTTTAAGGGCTGCTTATCATAGCAGTATACACACTAAATCTAAGTGATTCATTTTGTATATTCAAATTAATTGTTGTTGATAACTCTGCCATATAATTCTCATGAATTTGTATAAAATTG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||