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Schistosoma mansoni
cluster # 936 cluster # 936       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_936#0 length = 1028 sequences # 2  

consensusID : consensus_936#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1028
fasta sequence
                              [AAGTTTATAAAAAATCAAGTAGTTTTACACGTAGACAATTATTTTTATCCTTGGTCTTTGTTTATCAAATCAGTCACTATTGTTTGTAATTCTCTTTTAAAAGTTATAGATGAAAATTTCTCATCAACTCGTTCACACCCTGCCTTCCCCAAACGATCTGCAAGCTCTGGATCATTGACAAATCTGAAATAAACAATTAGTTTTTTTATAGAGCGTAGTGAATTTGAATAAAACGGAAAGGTATTATTTAGTGCTAAAATAATTAAAGTTTGATTTGATGAAGCCCATAAAGTCGATTTGCGAATGATTGTCAGTTGTTCTGAAGTTTATCGTAGTTCTTGAATTGTATTATCATCCTCCAAACCACAAAATTACATAAAATTTGTTTTTGAGTTAAAACGCTCTATACGAAATTACAATAGCTATTTAGGTGCTTAACTTGACAACTTAAAGTGTAGTCAAAGCCGTAGACCATTTAGAAAGCTGGGCGAATTTGGTGGAATGGGGACTAACAAAGTTGATACAATAGTTTACTTGACTTTAACAAGTATGCACTGGGCGTCTAATATCCAGCTATTAATCGGAANAATGACTAGTGTGATAGTCAACAGACATGAATTAAAGCCACTGGGAGCACAAGGTAATATATAGGACATCAGTCACAGACTTGTATACTCAGCTCTGAACTTCCTGAGAGCTAATGATATTAATCGGGTACCCAAAATAAGGTAGAACGACCGGAATTTTAACGTAGGTATTAAGATGTAGAACATAAACATATCTTTGAAGCATTAGTGTATAACTATGTGGGGAACTCTGGGGTTGAGCGTAGACATCTCAGGTGGTCACGACATGTACACTGACCAGGATAAGAATAGGTTGTAAAAATGTAAAGAGAAGCGTACTTGCTAAGGTAGTTGGCCATAGTTTGTGGAAGTTGGTTTATTGGGTGCACTGTACATAGAAATCCTGTAGAACCATGCAAAACAGTTTCTTTAGGACCACCAGAATCCAATGCAATGACCCTC]

[+] EMBL CD075596             [AAGTTTATAAAAAATCAAGTAGTTTTACACGTAGACAATTATTTTTATCCTTGGTCTTTGTTTATCAAATCAGTCACTATTGTTTGTAATTCTCTTTTAAAAGTTATAGATGAAAATTTCTCATCAACTCGTTCACACCCTGCCTTCCCCAAACGATCTGCAAGCTCTGGATCATTGACAAATCTGAAATAAACAATTAGTTTTTTTATAGAGCGTAGTGAATTTGAATAAAACGGAAAGGTATTATTTAGTGCTAAAATAATTAAAGTTTGATTTGATGAAGCCCATAAAGTCGATTTGCGAATGATTGTCAGTTGTTCTGAAGTTTATCGTAGTTCTTGAATTGTATTATCATCCTCCAAACCACAAAATTACATAAAATTTGTTTTTGAGTTAAAACGCTCTATACGAAATTACAATAGCTATTTAGGTGCTTAACTTGACAACTTAAAGTGTAGTCAAAGCCGTAGACCATTTAGAAAGCTGGGCGAATTTGGTGGAATGGGGACTAACAAAGTTGATACAATAGTTTACTTGACTTTAACAAGTATGCACTGGGCGTCTAATATCCAGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD081892             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATTTGGTGGAATGGGGACTAACANAGTTGATACAATAGTTTACTTGACTTTAACAAGTATGCACTGGGCGTCTAATATCCAGCTATTAATCGGAANAATGACTAGTGTGATAGTCAACAGACATGAATTAAAGCCACTGGGAGCACAAGGTAATATATAGGACATCAGTCACAGACTTGTATACTCAGCTCTGAACTTCCTGAGAGCTAATGATATTAATCGGGTACCCAAAATAAGGTAGAACGACCGGAATTTTAACGTAGGTATTAAGATGTAGAACATAAACATATCTTTGAAGCATTAGTGTATAACTATGTGGGGAACTCTGGGGTTGAGCGTAGACATCTCAGGTGGTCACGACATGTACACTGACCAGGATAAGAATAGGTTGTAAAAATGTAAAGAGAAGCGTACTTGCTAAGGTAGTTGGCCATAGTTTGTGGAAGTTGGTTTATTGGGTGCACTGTACATAGAAATCCTGTAGAACCATGCAAAACAGTTTCTTTAGGACCACCAGAATCCAATGCAATGACCCTC]


>consensus_936#0 AAGTTTATAAAAAATCAAGTAGTTTTACACGTAGACAATTATTTTTATCCTTGGTCTTTG TTTATCAAATCAGTCACTATTGTTTGTAATTCTCTTTTAAAAGTTATAGATGAAAATTTC TCATCAACTCGTTCACACCCTGCCTTCCCCAAACGATCTGCAAGCTCTGGATCATTGACA AATCTGAAATAAACAATTAGTTTTTTTATAGAGCGTAGTGAATTTGAATAAAACGGAAAG GTATTATTTAGTGCTAAAATAATTAAAGTTTGATTTGATGAAGCCCATAAAGTCGATTTG CGAATGATTGTCAGTTGTTCTGAAGTTTATCGTAGTTCTTGAATTGTATTATCATCCTCC AAACCACAAAATTACATAAAATTTGTTTTTGAGTTAAAACGCTCTATACGAAATTACAAT AGCTATTTAGGTGCTTAACTTGACAACTTAAAGTGTAGTCAAAGCCGTAGACCATTTAGA AAGCTGGGCGAATTTGGTGGAATGGGGACTAACAAAGTTGATACAATAGTTTACTTGACT TTAACAAGTATGCACTGGGCGTCTAATATCCAGCTATTAATCGGAANAATGACTAGTGTG ATAGTCAACAGACATGAATTAAAGCCACTGGGAGCACAAGGTAATATATAGGACATCAGT CACAGACTTGTATACTCAGCTCTGAACTTCCTGAGAGCTAATGATATTAATCGGGTACCC AAAATAAGGTAGAACGACCGGAATTTTAACGTAGGTATTAAGATGTAGAACATAAACATA TCTTTGAAGCATTAGTGTATAACTATGTGGGGAACTCTGGGGTTGAGCGTAGACATCTCA GGTGGTCACGACATGTACACTGACCAGGATAAGAATAGGTTGTAAAAATGTAAAGAGAAG CGTACTTGCTAAGGTAGTTGGCCATAGTTTGTGGAAGTTGGTTTATTGGGTGCACTGTAC ATAGAAATCCTGTAGAACCATGCAAAACAGTTTCTTTAGGACCACCAGAATCCAATGCAA TGACCCTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)