|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9365#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 760 fasta sequence
[CGAAAGCCTGACATCAATAACTTATGTCAGTTTATGGTGGTCTTGGAAACCTAGCAACTTGAATTCTTTTAAAATAATACGAAACAAATTCGTCTGGAAAAACTTATTGATTTTAAAACCTTGTGCCTGGTCACCAATAAAATCGAAATTCATGTCACCGATCTGTTGTATATTTATGTACATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAATGATAAGAAGGCCCCACGAGTTTGGAATTCCGGTATCCAAACTTTGGAAACGGAATGTTGCCGTGTTCATTGTTTCGAAACCCATACCGGTGTTAAGTTCTTA]
[+] EMBL CD083849 [CGAAAGCCTGACATCAATAACTTATGTCAGTTTATGGTGGTCTTGGAAACCTAGCAACTTGAATTCTTTTAAAATAATACGAAACAAATTCGTCTGGAAAAACTTATTGATTTTAAAACCTTGTGCCTGGTCACCAATAAAATCGAAATTCATGTCACCGATCTGTTGTATATTTATGTACATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGG ]
[+] EMBL AI975195 [ TGACATCAATAACTTATGTCAGTTTATGGTGGTCTTGGAAACCTAGCAACTTGAATTCTTTTAAAATAATACGAAACAAATTCGTCTGGAAAAACTTATTGATTTTAAAACCTTGTGCCTGGTCACCAATAAAATCGAAATTCATGTCACCGATCTGTTGTATATTTATGTACATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAGTACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAA ]
[+] EMBL AI068088 [ ACATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATG ]
[+] EMBL AI068262 [ TTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAA ]
[+] EMBL AI067409 [ TTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGACAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAATCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAGAAGTTTTTTCACATAATGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGTAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGC ]
[+] EMBL AI067649 [ TTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTA ]
[+] EMBL AI067121 [ TTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCA ]
[-] EMBL CD192543 [ AACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAATGATAAGAAGGCCCCACGAGTTTGGAATTCCGGTATCCAAACTTTGGAAACGGAATGTTGCCGTGTTCATTGTTTCGAAACCCATACCGGTGTTAAGTTCTTA]
[-] EMBL CD192535 [ AACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAATGATAAGAAGGCCCCACGAGTTTGGAATTCCGGTATCCAAACTTTGGAAACGGAATGTTGCCGTGTTCATTGTTTCGAAACCCATACCGGTGTTAAGTTCTTA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||