These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9365#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 760 fasta sequence [CGAAAGCCTGACATCAATAACTTATGTCAGTTTATGGTGGTCTTGGAAACCTAGCAACTTGAATTCTTTTAAAATAATACGAAACAAATTCGTCTGGAAAAACTTATTGATTTTAAAACCTTGTGCCTGGTCACCAATAAAATCGAAATTCATGTCACCGATCTGTTGTATATTTATGTACATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAATGATAAGAAGGCCCCACGAGTTTGGAATTCCGGTATCCAAACTTTGGAAACGGAATGTTGCCGTGTTCATTGTTTCGAAACCCATACCGGTGTTAAGTTCTTA] [+] EMBL CD083849 [CGAAAGCCTGACATCAATAACTTATGTCAGTTTATGGTGGTCTTGGAAACCTAGCAACTTGAATTCTTTTAAAATAATACGAAACAAATTCGTCTGGAAAAACTTATTGATTTTAAAACCTTGTGCCTGGTCACCAATAAAATCGAAATTCATGTCACCGATCTGTTGTATATTTATGTACATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGG ] [+] EMBL AI975195 [ TGACATCAATAACTTATGTCAGTTTATGGTGGTCTTGGAAACCTAGCAACTTGAATTCTTTTAAAATAATACGAAACAAATTCGTCTGGAAAAACTTATTGATTTTAAAACCTTGTGCCTGGTCACCAATAAAATCGAAATTCATGTCACCGATCTGTTGTATATTTATGTACATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAGTACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAA ] [+] EMBL AI068088 [ ACATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATG ] [+] EMBL AI068262 [ TTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAA ] [+] EMBL AI067409 [ TTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGACAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAATCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAGAAGTTTTTTCACATAATGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGTAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGC ] [+] EMBL AI067649 [ TTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTA ] [+] EMBL AI067121 [ TTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCA ] [-] EMBL CD192543 [ AACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAATGATAAGAAGGCCCCACGAGTTTGGAATTCCGGTATCCAAACTTTGGAAACGGAATGTTGCCGTGTTCATTGTTTCGAAACCCATACCGGTGTTAAGTTCTTA] [-] EMBL CD192535 [ AACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAATGATAAGAAGGCCCCACGAGTTTGGAATTCCGGTATCCAAACTTTGGAAACGGAATGTTGCCGTGTTCATTGTTTCGAAACCCATACCGGTGTTAAGTTCTTA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||