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Schistosoma mansoni
cluster # 9365 cluster # 9365       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9365#0 length = 760 sequences # 9  

consensusID : consensus_9365#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 760
fasta sequence
                              [CGAAAGCCTGACATCAATAACTTATGTCAGTTTATGGTGGTCTTGGAAACCTAGCAACTTGAATTCTTTTAAAATAATACGAAACAAATTCGTCTGGAAAAACTTATTGATTTTAAAACCTTGTGCCTGGTCACCAATAAAATCGAAATTCATGTCACCGATCTGTTGTATATTTATGTACATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAATGATAAGAAGGCCCCACGAGTTTGGAATTCCGGTATCCAAACTTTGGAAACGGAATGTTGCCGTGTTCATTGTTTCGAAACCCATACCGGTGTTAAGTTCTTA]

[+] EMBL CD083849             [CGAAAGCCTGACATCAATAACTTATGTCAGTTTATGGTGGTCTTGGAAACCTAGCAACTTGAATTCTTTTAAAATAATACGAAACAAATTCGTCTGGAAAAACTTATTGATTTTAAAACCTTGTGCCTGGTCACCAATAAAATCGAAATTCATGTCACCGATCTGTTGTATATTTATGTACATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI975195             [        TGACATCAATAACTTATGTCAGTTTATGGTGGTCTTGGAAACCTAGCAACTTGAATTCTTTTAAAATAATACGAAACAAATTCGTCTGGAAAAACTTATTGATTTTAAAACCTTGTGCCTGGTCACCAATAAAATCGAAATTCATGTCACCGATCTGTTGTATATTTATGTACATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAGTACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAA                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI068088             [                                                                                                                                                                                   ACATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATG                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI068262             [                                                                                                                                                                                         TTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAA                                                                                                       ]
[+] EMBL AI067409             [                                                                                                                                                                                         TTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGACAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAATCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAGAAGTTTTTTCACATAATGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGTAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGC                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI067649             [                                                                                                                                                                                         TTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTA                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL AI067121             [                                                                                                                                                                                         TTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAATGAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCATTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAAAGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTACACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCA                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD192543             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAATGATAAGAAGGCCCCACGAGTTTGGAATTCCGGTATCCAAACTTTGGAAACGGAATGTTGCCGTGTTCATTGTTTCGAAACCCATACCGGTGTTAAGTTCTTA]
[-] EMBL CD192535             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACAGGGATATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACCTCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAATGGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAATGATAAGAAGGCCCCACGAGTTTGGAATTCCGGTATCCAAACTTTGGAAACGGAATGTTGCCGTGTTCATTGTTTCGAAACCCATACCGGTGTTAAGTTCTTA]


>consensus_9365#0 CGAAAGCCTGACATCAATAACTTATGTCAGTTTATGGTGGTCTTGGAAACCTAGCAACTT GAATTCTTTTAAAATAATACGAAACAAATTCGTCTGGAAAAACTTATTGATTTTAAAACC TTGTGCCTGGTCACCAATAAAATCGAAATTCATGTCACCGATCTGTTGTATATTTATGTA CATGCTTCCTTCCTTGTCGTACTTGATTTTTTAAGTCTGAATTAAAATTAGCACGAAAAT GAGTGTATACGGCCTTTACGTGATTAGTGAATCTGGTTCACTACAATTTTACTATGACCA TTCTGACGTTAACGTCGAAGTTGAAAAGAAATACGATTTCCCACTCCCGTTCCATTTCAA AGCTGTGGATGGCCGTATTGTTGTGGATTTTGGTGCATGTGACGATGTAAAAATAGGGTA CACTGTAATATCTGTTGACGGCATTACAGCTAAAGGGACATCTCTGGAAGACAACAGGGA TATTTTAAAAGTTTTTTCAGATAAAGACAACTTTCCACTGACTATCAAACTTGGAAGACC TCGACTACGTCCAAACGACCGAATTCACCTTGCTAGTATGTTCCATCCGTTACACTCAAT GGCTCGACTTCTTTCCCCGATTCCGGATTCCAGCTTCAGCTTTGTTTCTCCGGCTAATGA TAAGAAGGCCCCACGAGTTTGGAATTCCGGTATCCAAACTTTGGAAACGGAATGTTGCCG TGTTCATTGTTTCGAAACCCATACCGGTGTTAAGTTCTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)