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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9375#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 524 fasta sequence
[GCGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA-TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT-GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTATTATTTTA]
[+] EMBL CD185500 [GCGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCT ]
[+] EMBL CD131582 [GCGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGAAATTGTTA TTTTTTTTTCGTATGGCTGATCTCCTACATATTATGAGTACCACAACTATCACCACCTAGTACTAAAATGTTTCTATAAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCT ]
[+] EMBL CD131658 [ CGCGACATCTATCTGGAATTCTCTTTCAATACATTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCGCTACGT ]
[+] EMBL CD192715 [ ATCTGGAATTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTATTTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGNTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTA ]
[+] EMBL CD192374 [ TTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATT AAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTA ]
[+] EMBL CD134818 [ TTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTTGGGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTA ]
[+] EMBL CD192468 [ TTCTCTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATCGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGNTATCTATTCTCTNTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTA ]
[-] EMBL CD192298 [ TCTTTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTATTTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGTTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATGTATGAGCATAGTAGAGAAACACTATTGACATTGTTATCTATTCTCTTTACATTCTATTATGAATCATATTGTTTCTTCTCTTTCATGTCAGTTATTATTTTA]
[+] EMBL CD156006 [ CTTTCAATACTTTAAATAGTTTAAGTAAAGAAAAACATTTTGTAATCATTTATGCTTGTGATTGTTA TTTTTTTTTCGAATGGCTGATCTCGTACATACTATTAGTATCACGACTATCAACACCTAGTACTAGAATGTTTCTATGAAAATTGATAATCTCTTCATATTTTATATGATGTTTTTTTTGTGGTTTCGATAGGTCCAATCAAATGTTCCGTCTTTATTGCCAATCTATTACCTTATAATTGATTTTTCCCTACGTTTTATTAAAAAAAAAATCGATCACTATATTCCATGCTCACATTTATATCTTGATTGTCTT GGGGGGGGGAAAGAACAAACAAAATATTGGCATTCCATTATTGTTGATAAGGTGGAGCGTTATGGAAGCGTTTAATG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||