cluster # 9380

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Schistosoma mansoni
cluster # 9380 cluster # 9380 Sequences # 9 consensus # 2

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consensus_9380#0 length = 741 sequences # 8

consensus_9380#1 length = 596 sequences # 1

consensusID : consensus_9380#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 741
fasta sequence

                              [GAGCCATATTCGGCCGAGGGTGAAATACGTGGTACCGCTCATGTTGTAATGCTGTTCGCCGATGTTTTAGTTTATTTTTTCACACTATTCATTGGTGTTTCTGCTAACGACACAAAATCTTGTGCTGTTGCGGGATTCACTTCGTTACTCAAATGCTCTTCATGTTCAGAGTTAAAGAAGTTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGTGAAGATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGCTCCTGATCTTTAGAACGCTATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATCGGAAGAGTATGACTAATCTGAAAGTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAATTCGCATGCTCAATGAGAAACGACAAGTGCAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACAATATTAGAGTTTGTTAATGAACGCATCACTAAGCAATAAGGTTGTCAACAGCTTTTCATGTGCACTTGTGACTTGTATGATGATGCATGAACTAAATCTCATATGTGAGGT-GTTCTGTATTTGATGTTTAGTCCAGAGTGCTATTGATTAGTCTGTATTTGTTTATACT-GTTTCTCCACCTTTTTGTAAACCATTTTTATTGTTTGTATTCAAACTTGGTGCAACAAATAATTTTTATGTCATGCGCTTGTATAAAGTAATATTAATTTTCAAAAGTGCAAT]

[+] EMBL CD081514             [GAGCCATATTCGGCCGAGGGTGAAATACGTGGTACCGCTCATGTTGTAATGCTGTTCGCCGATGTTTTAGTTTATTTTTTCACACTATTCATTGGTGTTTCTGCTAACGACACAAAATCTTGTGCTGTTGCGGGATTCACTTCGTTACTCAAATGCTCTTCATGTTCAGAGTTAAAGAAGTTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGTGAAGATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGCTCCTGATCTTTAGAACGCTATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATCGGAAGAGTATGACTAATCTGAAAGTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAATTCGCATGCTCAATGAGAAACGACAAGTGCAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACANTATTAGAGTTTGTTAATGAACGCATCACTAAGCAATAAGGTTGTCAACAGCTTTTCATGTGCACTTGTGACTNGTATGATGATGCATGAACTANATCTCATATGTGAGGTGGGTCTGTA TTGATGTTTAGTCCAGAGTGCTATNGATTAGNCTGTATTTGTTTATACTGGGTTCT CA CTTTTTGT AACCA TTNTATTGTTNG ATTC AACTTGGTGC ACAAATTA TTTTATGTCATGCGC TGGAT AAGGAA ATTAATTTTC AAAGTGgc  ]
[-] EMBL CD155712             [          gactttgaGGTGAAATACGTGGTACCGCTCATGTTGTAATGCTGTTCGCCGATGTTTTAGTTTATTTTTTCACACTATTCATTGGTGTTTCTGCTAACGACACAAAATCTTGTGCTGTTGCGGGATTCACTTCGTTACTCAAATGCTCTTCATGTTCAGAGTTAAGGAAGTTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGTGAAGATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD093360             [                                                                                             GGTGTTTCTGCTAACGACACAAAATCTTGTGCTGTTGCGGGATTCACTTCGTTACTCAAACGCTCTTCATGTTCAGAGTTAAAGAAGTTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGTGAAGATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGCTCCTGATCTTTAGAACGCTATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATCGGAAGAGTATGACTAATCTGAAAGTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAACTCGCATGCTCAATGAGAAACGACAAGTGCAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACAATATTAGAGTTTGTTAATGAACGCATCACTAAGCAATAAGGTTGTCAACAGCTTTTCATGTGCACTTGTGACTTGTATGATGATGCATGAACTAAATCTCATATGTGAGGT GTTCTGTATTTGATGTTTAGTCCAGAGTGCTATTGATTAGTCTG        TATACT GTTTCTCCACCTTTTTGTAAACCAT                                                                                        ]
[-] EMBL CD075337             [                                                                                                                                         CACTTCGTTACTCAAATGCTCTTCATGTTCAGAGTTAAAGAAGTTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGTGAAGATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGCTCCTGATCTTTAGAACGCTATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATCGGAAGAGTATGACTAATCTGAAAGTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAATTCGCATGCTCAATGAGAAACGACAAGTGCAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACAATATTAGAGTTTGTTAATGAACGCATCACTAAGCAATAAGGTTGTCAACAGCTTTTCATGTGCACTTGTGACTTGTATGATGATGCATGAACTAAATCTCATATGTGAGGT GTTCTGTATTTGATGTTTAGTCCAGAGTGCTATTGATTAGTCTGTATTTGTTTATACT GTTTCTCCACCTTTTTGTAAACCATTTTTATTGTTTGTATTCAAACTTGGTGCAACAAATAATTTTTATGTCATGCGCTTGTATAAAGTAATATTAATTTTCAAAAGTGCAAT]
[+] EMBL CD145515             [                                                                                                                                           CTTCGTTACTCAAATGCTCTTCATGTTCAGAGTTAAAGAAGCTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGTGAAGATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGCTCCTGATCTTTAGAACGCTATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATCGGAAGAGTATGACTAATCTGAAAGTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAATTCGCATGCTCAATGAGAAACGACAAGTGCAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACAATATTAGAGTTTGTTAATGAACGCATCACTAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD145399             [                                                                                                                                            TTCGTTACTCAAATGCTCTTCATGTTCAGAGTTAAAGAAGTTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGTGAAAATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGCTCCTGATCTTTAGAACGCTATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATCGGAAGAGTATGACTAATCTGAAAGTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAATTCGCATGCTCAATGAGAAACGACAAGTGCAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACAATATTAGAGTTTGTTAATGAACGCATCACTAAGCAA                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD073438             [                                                                                                                                                                                                                        TGTTGTGAAGATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGCTCCTGATCTTTAGAACGCTATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATC GAAGAGTATGACTAATCTGAAAGTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAATTCGCATGCTCAATGAGAAACGACAAGTGCAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACAATATTAGAGTTTGTTAATGAACGCATCACTAAGCAATAAGGTTGTCAACAGCTTTTCATGTGCACTTGTGACTTGTATGATGATGCATGAACTAAATCTCATATGTGAGGT GTTCTGTATTTGATGTTTAGTCCAGAGTGCTATTGATTAGTCTGTATTTGTTTATACT GTTTCTCCACCTTTTTGTAAACCATTTTTATTGTTTGTATTCAAACTTGGTGCAACAAATAATTTTTATGTCATGCGCTTGTATAAAGTAATATTAATTTTCAAAAGTGCAAT]
[-] EMBL CD077138             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AATATTAGAGTTTGTTAATGCACGCATCACTAAGCAATAAGGTTGTCACCAGCTTTTCATGTGCACTTGTGACTTGTATGATGATGCATGAACTAAATCTCATATGTGAGGT GTTCTGTATTTGATGTTTAGTCCAGAGTGCTATTGATTAGTCTGTATTTGTTTATACT GTTTCTCCACCTTTTTGTAAACCATTTTTATTGTTTGTATTCAAACTTGGTGCAACAAATAATTTTTATGTCACGCGCTTGTATAAAGTAATATTAATTTT            ]




>consensus_9380#0
GAGCCATATTCGGCCGAGGGTGAAATACGTGGTACCGCTCATGTTGTAATGCTGTTCGCC
GATGTTTTAGTTTATTTTTTCACACTATTCATTGGTGTTTCTGCTAACGACACAAAATCT
TGTGCTGTTGCGGGATTCACTTCGTTACTCAAATGCTCTTCATGTTCAGAGTTAAAGAAG
TTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGTGAAGATGAAAATGTATCT
GGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGCTCCTGATCTTTAGAACGC
TATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATCGGAAGAGTATGACTAATCTGAAA
GTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAATTCGCATGCTCAATGAGAAACGACAAGTG
CAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACAATATTAGAGTTTGTTAATGAA
CGCATCACTAAGCAATAAGGTTGTCAACAGCTTTTCATGTGCACTTGTGACTTGTATGAT
GATGCATGAACTAAATCTCATATGTGAGGTGTTCTGTATTTGATGTTTAGTCCAGAGTGC
TATTGATTAGTCTGTATTTGTTTATACTGTTTCTCCACCTTTTTGTAAACCATTTTTATT
GTTTGTATTCAAACTTGGTGCAACAAATAATTTTTATGTCATGCGCTTGTATAAAGTAAT
ATTAATTTTCAAAAGTGCAAT

consensusID : consensus_9380#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 596
fasta sequence

                              [GTACCGCTCATGTTGTAATGCTGTTCGCCGATGTTTTAGTTTATTTTTTCACACTATTCGTAAGGATAATTAGCTTTTGGGTACACTGAAATCTAATTTAATCGCAGATTGGTGTTTCTGCTAACGACACAAAATCTTGTGCTGTTGCGGGATTCACTTCGTTACTCAAATGCTCTTCATGTTCAGAGTTAAAGAAGTTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGTGAAGATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGCTCCTGATCTTTAGAACGCTATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATCGAAGAGTATGACTAATCTGAAAGTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAATTCGCATGCTCAATGAGAAACGACAAGTGCAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACAATATTAGAGTTTGTTAATGAACGCATCACTAAGCAATAAGGTTGTCAACAGCTTTTCATGTGCACTTGTGACTTGTATGATGATGCATGAACTAAATCTCATATGTGAGGTGTTCTGTATT]

[+] EMBL CD078987             [GTACCGCTCATGTTGTAATGCTGTTCGCCGATGTTTTAGTTTATTTTTTCACACTATTCGTAAGGATAATTAGCTTTTGGGTACACTGAAATCTAATTTAATCGCAGATTGGTGTTTCTGCTAACGACACAAAATCTTGTGCTGTTGCGGGATTCACTTCGTTACTCAAATGCTCTTCATGTTCAGAGTTAAAGAAGTTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGTGAAGATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGCTCCTGATCTTTAGAACGCTATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATCGAAGAGTATGACTAATCTGAAAGTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAATTCGCATGCTCAATGAGAAACGACAAGTGCAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACAATATTAGAGTTTGTTAATGAACGCATCACTAAGCAATAAGGTTGTCAACAGCTTTTCATGTGCACTTGTGACTTGTATGATGATGCATGAACTAAATCTCATATGTGAGGTGTTCTGTATT]




>consensus_9380#1
GTACCGCTCATGTTGTAATGCTGTTCGCCGATGTTTTAGTTTATTTTTTCACACTATTCG
TAAGGATAATTAGCTTTTGGGTACACTGAAATCTAATTTAATCGCAGATTGGTGTTTCTG
CTAACGACACAAAATCTTGTGCTGTTGCGGGATTCACTTCGTTACTCAAATGCTCTTCAT
GTTCAGAGTTAAAGAAGTTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGTG
AAGATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGCT
CCTGATCTTTAGAACGCTATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATCGAAGAG
TATGACTAATCTGAAAGTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAATTCGCATGCTCAA
TGAGAAACGACAAGTGCAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACAATATT
AGAGTTTGTTAATGAACGCATCACTAAGCAATAAGGTTGTCAACAGCTTTTCATGTGCAC
TTGTGACTTGTATGATGATGCATGAACTAAATCTCATATGTGAGGTGTTCTGTATT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9380#0      ---------------GAGCCATATTCGGCCGAGGGTGAAATACGTGGTACCGCTCATGTT 45
consensus_9380#1      GTACCGCTCATGTTGTAATGCTGTTCG-CCGATGTTTTAGTTTATTTTTTCACACTATTC 59
                                      *    * **** **** * *  * *   *  *  * * *   * 

consensus_9380#0      GTAATGCTG-TTCGCCGATGTTTTAGTTTATTTTT--TCACACTATTCATTGGTGTTTCT 102
consensus_9380#1      GTAAGGATAATTAGCTTTTGGGTACACTGAAATCTAATTTAATCGCAGATTGGTGTTTCT 119
                      **** * *  ** **   **  *    * *  * *  *   *      ************

consensus_9380#0      GCTAACGACACAAAATCTTGTGCTGTTGCGGGATTCACTTCGTTACTCAAATGCTCTTCA 162
consensus_9380#1      GCTAACGACACAAAATCTTGTGCTGTTGCGGGATTCACTTCGTTACTCAAATGCTCTTCA 179
                      ************************************************************

consensus_9380#0      TGTTCAGAGTTAAAGAAGTTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGT 222
consensus_9380#1      TGTTCAGAGTTAAAGAAGTTCAAATTAGAAAAGATTGAAACATCTTGTTTTCAGTGTTGT 239
                      ************************************************************

consensus_9380#0      GAAGATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGC 282
consensus_9380#1      GAAGATGAAAATGTATCTGGAATTTCTAAGAAATATGCTTTTGCAGAACTAGTAACCTGC 299
                      ************************************************************

consensus_9380#0      TCCTGATCTTTAGAACGCTATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATCGGAAG 342
consensus_9380#1      TCCTGATCTTTAGAACGCTATCCTCAAGTACTTGCATTCATTGACAGCAAGGATCG-AAG 358
                      ******************************************************** ***

consensus_9380#0      AGTATGACTAATCTGAAAGTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAATTCGCATGCTC 402
consensus_9380#1      AGTATGACTAATCTGAAAGTGGTATACGAAAGAGGTCATAGACCTACAATTCGCATGCTC 418
                      ************************************************************

consensus_9380#0      AATGAGAAACGACAAGTGCAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACAATA 462
consensus_9380#1      AATGAGAAACGACAAGTGCAAGAAGAGATTCCTATCGACACTTGGGATAGCGATACAATA 478
                      ************************************************************

consensus_9380#0      TTAGAGTTTGTTAATGAACGCATCACTAAGCAATAAGGTTGTCAACAGCTTTTCATGTGC 522
consensus_9380#1      TTAGAGTTTGTTAATGAACGCATCACTAAGCAATAAGGTTGTCAACAGCTTTTCATGTGC 538
                      ************************************************************

consensus_9380#0      ACTTGTGACTTGTATGATGATGCATGAACTAAATCTCATATGTGAGGTGTTCTGTATTTG 582
consensus_9380#1      ACTTGTGACTTGTATGATGATGCATGAACTAAATCTCATATGTGAGGTGTTCTGTATT-- 596
                      **********************************************************  

consensus_9380#0      ATGTTTAGTCCAGAGTGCTATTGATTAGTCTGTATTTGTTTATACTGTTTCTCCACCTTT 642
consensus_9380#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9380#0      TTGTAAACCATTTTTATTGTTTGTATTCAAACTTGGTGCAACAAATAATTTTTATGTCAT 702
consensus_9380#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9380#0      GCGCTTGTATAAAGTAATATTAATTTTCAAAAGTGCAAT 741
consensus_9380#1      ---------------------------------------