These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9381#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1500 fasta sequence [TCATCGTAAACTGCTCACGATAACGTTCGTGCTGGTGGGCCTACAGGCTATGCTATGAGACTCTGTTCTGGAAATATCTCGTGTTTGTGTGGCTAATCTTCTATAAGTATAAAATATTCTATTTGGAACTATCAGATACTTATTTCTCTCCACCATCCGTTGGATGGGCTAATGTTCGATGAGGCTGCTGTGCACGTTATTGGAGGAGGCATCGGAGGAACAGTTGGAGCAGTTTTAACTTGTCCACTAGAAGTTGTCAAAGTTCGCCTACAATCTTCAAAAGGAATTGTACTTTCCTCATCTTCATTCAAGCATAACTCCGTCGCAGATTATAACCACAGTCATCGTTTATCGCGTATACGATGCATGTTATATGGTTTAAAACAAGCTGATCCTAAACATGTTCAAAAATCCAGTCCCAATCACAAGTCGGTGATTTCTTCGTGTATTAATTTGTCGAACCCCAAATACCCCAACATTCCCACTACACCTACCGATTTCCCAAAAGCCAAGCCTCATGGACTTCGGCGATCTCTTATTCTTCGTTCGTTAATTGACATTTTTCGTTATGAAGGACCCAAAGCTCTATTTAAAGGTCTTGTCCCTACTCTTGTTGGAGTGATGCCAACACGAGGTATATACTTTTGTGCATATCATAATGGACAGTTGTTCTTTGAAAAATATTTCCAGCCTGGTTCTTCATTTGTCTATTTATGTGCTGCTGGAATTGGAAGCATAACCGCTTCTTCCTTAACCAATCCTATTTGGTTTGTAAAAACAAGGCTTCAATTAGATTCACGGCCAGGTCATACACCTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGGAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGATATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGAAGGTTTAAGTGGCCTTTATCGTGGTATGGCAACTCATTATATTCGTCAAGTACCTAATTCTTGTATTATGATTGGAACTTATGAATTCGTTGTCTTTCTACTACAATCTTGGGATTT-ACTANAGACATCANGGNATAGNAGGGNATTGCTTTTATTCTCCTACTAATTAAAATCTTA-TTTCTTTCCCCATTCTCTATTTGTAC-GGAAAAATAATT-TTAGAGTG-AAAATAAATTTG] [-] EMBL CD200705 [TCATCGTAAACTGCTCACGATAACGTTCGTGCTGGTGGGCCTACAGGCTATGCTATGAGACTCTGTTCTGGAAATATCTCGTGTTTGTGTGGCTAATCTTCTATAAGTATAAAATATTCTATTTGGAACTATCAGATACTTATTTCTCTCCACCATCCGTTGGATGGGCTAATGTTCGATGAGGCTGCTGTGCACGTTATTGGAGGAGGCATCGGAGGAACAGTTGGAGCAGTTTTAACTTGTCCACTAGAAGTTGTCAAAGTTCGCCTACAATCTTCAAAAGGAATTGTACTTTCCTCATCTTCATTCAAGCATAACTCCGTCGCAGATTATAACCACAGTCATCGTTTATCGCGTATACGATGCATGTTATATGGTTTAAAACAAGCTGATCCTAAACAT ] [+] EMBL BG930249 [ gtCTACAGGTTATGTTATGAGACTCTGTTCTGG AATATCTCGTGTTTGTGTGGCTAATCTTCTATAAGTATAAAATATTCTATTTGGAACTATCAGATACTTATTTCTCTCCACCATCCGTTGGATGGGCTAATGTTCGA CAGGCTGCTGTGCACGTTATTGGAGGAGGCATCGGAGGAACAGTTGGAGCAGTTTTAACTTGTCCACTAGAAGTTGTCAAAGTTCGCCTACAATCTTCAAAAGGAATTGTACTTTCCTCATCTTCATTCAAGCATAACTCCGTCGCAGATTATAACCACAGTCATCGTTTATCGCGTATACGATGCATGTTATATGGTTTAAAACAAGCTGATCCTAAACATGTTCAAAAATCCAGTCCCAATCACAAGTCGGTGATTTCTTCGTGTATTAATTTGTCGA ] [+] EMBL CD183363 [ 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TGTTCTTTGAAAAATATTTCCAGCCTGGTTCTTCATTTGTCTATTTATGTGCTGCTGGAATTGGAAGCATAACCGCTTCTTCCTTAACCAATCCTATTTGGTTTGTAAAAACAAGGCTTCAATTAGATTCACGGCCAGGTCATACACCTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGGAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGATATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCANAGAGGAAGGTTTAAGTGGCCTTTATCGTGGTATGGCAACTCATTATATTCGTCAAGTACCTAATTCTTGTATTATGATTGGAACTTATGAATTCGTTGTCTTTCTACTACAATCTTGGGATTT ACTANAGACATCANGGNATAGNAGGGNATTGCTTTTATTCTCCTACTAATTAAAATCTTA TTTCTTTCCCCATTCTCTATTTGTAC GGAAAAATAATT TTAGAGTG AAAATAAATTT ] [-] EMBL CD097280 [ CTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGAAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGGTATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGA ] [-] EMBL CD097410 [ CTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGGAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGATATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGA ] [-] EMBL CD097281 [ 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TGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGGAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGATATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGAAGGTTTAAGTGGCCTTTATCGTGGTATGGCAACTCATTATATTCGTCAAGTACCTAATTCTTGTATTATGATTGGAACTTATGAATTCGTTGTCTTTCTACTACAATCTTGGGATTTAACTAAAGACATCAAGGTATAGTAGTGTATTGCTTTTATTCTTCTACTAATTAAAATCTTATTTTCTTTCCCATTTCTCTATTTGTACAGAAAAAATAATTATTAGAGTGAAAAATAAATTTG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||