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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9381#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1500 fasta sequence
[TCATCGTAAACTGCTCACGATAACGTTCGTGCTGGTGGGCCTACAGGCTATGCTATGAGACTCTGTTCTGGAAATATCTCGTGTTTGTGTGGCTAATCTTCTATAAGTATAAAATATTCTATTTGGAACTATCAGATACTTATTTCTCTCCACCATCCGTTGGATGGGCTAATGTTCGATGAGGCTGCTGTGCACGTTATTGGAGGAGGCATCGGAGGAACAGTTGGAGCAGTTTTAACTTGTCCACTAGAAGTTGTCAAAGTTCGCCTACAATCTTCAAAAGGAATTGTACTTTCCTCATCTTCATTCAAGCATAACTCCGTCGCAGATTATAACCACAGTCATCGTTTATCGCGTATACGATGCATGTTATATGGTTTAAAACAAGCTGATCCTAAACATGTTCAAAAATCCAGTCCCAATCACAAGTCGGTGATTTCTTCGTGTATTAATTTGTCGAACCCCAAATACCCCAACATTCCCACTACACCTACCGATTTCCCAAAAGCCAAGCCTCATGGACTTCGGCGATCTCTTATTCTTCGTTCGTTAATTGACATTTTTCGTTATGAAGGACCCAAAGCTCTATTTAAAGGTCTTGTCCCTACTCTTGTTGGAGTGATGCCAACACGAGGTATATACTTTTGTGCATATCATAATGGACAGTTGTTCTTTGAAAAATATTTCCAGCCTGGTTCTTCATTTGTCTATTTATGTGCTGCTGGAATTGGAAGCATAACCGCTTCTTCCTTAACCAATCCTATTTGGTTTGTAAAAACAAGGCTTCAATTAGATTCACGGCCAGGTCATACACCTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGGAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGATATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGAAGGTTTAAGTGGCCTTTATCGTGGTATGGCAACTCATTATATTCGTCAAGTACCTAATTCTTGTATTATGATTGGAACTTATGAATTCGTTGTCTTTCTACTACAATCTTGGGATTT-ACTANAGACATCANGGNATAGNAGGGNATTGCTTTTATTCTCCTACTAATTAAAATCTTA-TTTCTTTCCCCATTCTCTATTTGTAC-GGAAAAATAATT-TTAGAGTG-AAAATAAATTTG]
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[+] EMBL BG930249 [ gtCTACAGGTTATGTTATGAGACTCTGTTCTGG AATATCTCGTGTTTGTGTGGCTAATCTTCTATAAGTATAAAATATTCTATTTGGAACTATCAGATACTTATTTCTCTCCACCATCCGTTGGATGGGCTAATGTTCGA CAGGCTGCTGTGCACGTTATTGGAGGAGGCATCGGAGGAACAGTTGGAGCAGTTTTAACTTGTCCACTAGAAGTTGTCAAAGTTCGCCTACAATCTTCAAAAGGAATTGTACTTTCCTCATCTTCATTCAAGCATAACTCCGTCGCAGATTATAACCACAGTCATCGTTTATCGCGTATACGATGCATGTTATATGGTTTAAAACAAGCTGATCCTAAACATGTTCAAAAATCCAGTCCCAATCACAAGTCGGTGATTTCTTCGTGTATTAATTTGTCGA ]
[+] EMBL CD183363 [ GTGTTTGTGTGGCTAATCTTCTATAAGTATAAAATATTCTATTTGGAACTATCAGATACTTATTTCTCTCCACCATCCGTTGGATGGGCTAATGTTCGATGAGGCTGCTGTGCACGTTATTGGAGGAGGCATCGGAGGAACAGTTGGAGCAGTTTTAACTTGTCCACTAGAAGTTGTCAAAGTTCGCCTACAATCTTCAAAAGGAATTGTACTTTCCTCATCTTCATTCAAGCATAACTCCGTCGCAGATTATAACCACAGTCATCGTTTATCGCGCATACGATGCATGTTATATGGTTTAAAACAAGCTGATCCTAAACATGTTCAAAAATCCAGTCCCAATCACAAGTCGGTGATTTCTTCGTGTATTAATTTGTCGAACCCCAAATACCCC ]
[+] EMBL CD096803 [ GCTGATCCTAAACATATTCAAAAATCCAGTCCCAATCACAAGTCGGTGATTTCTTCGTGTATTAATTTGTCGAACCCCTCAGGCCTCAACATTCCCACTACACCTACCGATTTCCCAAAAGCCAAGCCTCATGGACTTCGGCGATCTCTTATTCTTCGTTCGTTAATTGACATTTTTCGTTATGAAGGACCCAAAGCTCTATTTAAAGGTCTTGTCCCTACTCTTGTTGGAGTGATGCCAACACGAGGTATATACTTTTGTGCATATCATAATGGACAGTTGTTCTTTGAAAAATATTTCCAGCCTGGTTCTTCATTTGTCTATTTATGTGCTGCTGGAATTGGAAGCATAACCGCTTCTTCCTTAACCAATCCTATTTGGTTTGTAAAAACAAGGCTTCAATTAGATTCACGGCCAGGTCATACACCTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGAT ]
[+] EMBL CD079331 [ TGTTCTTTGAAAAATATTTCCAGCCTGGTTCTTCATTTGTCTATTTATGTGCTGCTGGAATTGGAAGCATAACCGCTTCTTCCTTAACCAATCCTATTTGGTTTGTAAAAACAAGGCTTCAATTAGATTCACGGCCAGGTCATACACCTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGGAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGATATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCANAGAGGAAGGTTTAAGTGGCCTTTATCGTGGTATGGCAACTCATTATATTCGTCAAGTACCTAATTCTTGTATTATGATTGGAACTTATGAATTCGTTGTCTTTCTACTACAATCTTGGGATTT ACTANAGACATCANGGNATAGNAGGGNATTGCTTTTATTCTCCTACTAATTAAAATCTTA TTTCTTTCCCCATTCTCTATTTGTAC GGAAAAATAATT TTAGAGTG AAAATAAATTT ]
[-] EMBL CD097280 [ CTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGAAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGGTATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGA ]
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[-] EMBL CD097281 [ CTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGAAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGGTATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTTCTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTAGTACCCTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGA ]
[-] EMBL CD073608 [ TACCAC TGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGGAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGATATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGAAGGTTTAAGTGGCCTTTATCGTGGTATGGCAACTCATTATATTCGTCAAGTACCTAATTCTTGTATTATGATTGGAACTTATGAATTCGTTGTCTTTCTACTACAATCTTGGGATTTAACTAAAGACATCAAGGTATAGTAGTGTATTGCTTTTATTCTTCTACTAATTAAAATCTTATTTTCTTTCCCATTTCTCTATTTGTACAGAAAAAATAATTATTAGAGTGAAAAATAAATTTG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||