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Schistosoma mansoni
cluster # 9381 cluster # 9381       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9381#0 length = 1500 sequences # 9  

consensusID : consensus_9381#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1500
fasta sequence
                              [TCATCGTAAACTGCTCACGATAACGTTCGTGCTGGTGGGCCTACAGGCTATGCTATGAGACTCTGTTCTGGAAATATCTCGTGTTTGTGTGGCTAATCTTCTATAAGTATAAAATATTCTATTTGGAACTATCAGATACTTATTTCTCTCCACCATCCGTTGGATGGGCTAATGTTCGATGAGGCTGCTGTGCACGTTATTGGAGGAGGCATCGGAGGAACAGTTGGAGCAGTTTTAACTTGTCCACTAGAAGTTGTCAAAGTTCGCCTACAATCTTCAAAAGGAATTGTACTTTCCTCATCTTCATTCAAGCATAACTCCGTCGCAGATTATAACCACAGTCATCGTTTATCGCGTATACGATGCATGTTATATGGTTTAAAACAAGCTGATCCTAAACATGTTCAAAAATCCAGTCCCAATCACAAGTCGGTGATTTCTTCGTGTATTAATTTGTCGAACCCCAAATACCCCAACATTCCCACTACACCTACCGATTTCCCAAAAGCCAAGCCTCATGGACTTCGGCGATCTCTTATTCTTCGTTCGTTAATTGACATTTTTCGTTATGAAGGACCCAAAGCTCTATTTAAAGGTCTTGTCCCTACTCTTGTTGGAGTGATGCCAACACGAGGTATATACTTTTGTGCATATCATAATGGACAGTTGTTCTTTGAAAAATATTTCCAGCCTGGTTCTTCATTTGTCTATTTATGTGCTGCTGGAATTGGAAGCATAACCGCTTCTTCCTTAACCAATCCTATTTGGTTTGTAAAAACAAGGCTTCAATTAGATTCACGGCCAGGTCATACACCTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGGAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGATATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGAAGGTTTAAGTGGCCTTTATCGTGGTATGGCAACTCATTATATTCGTCAAGTACCTAATTCTTGTATTATGATTGGAACTTATGAATTCGTTGTCTTTCTACTACAATCTTGGGATTT-ACTANAGACATCANGGNATAGNAGGGNATTGCTTTTATTCTCCTACTAATTAAAATCTTA-TTTCTTTCCCCATTCTCTATTTGTAC-GGAAAAATAATT-TTAGAGTG-AAAATAAATTTG]

[-] EMBL CD200705             [TCATCGTAAACTGCTCACGATAACGTTCGTGCTGGTGGGCCTACAGGCTATGCTATGAGACTCTGTTCTGGAAATATCTCGTGTTTGTGTGGCTAATCTTCTATAAGTATAAAATATTCTATTTGGAACTATCAGATACTTATTTCTCTCCACCATCCGTTGGATGGGCTAATGTTCGATGAGGCTGCTGTGCACGTTATTGGAGGAGGCATCGGAGGAACAGTTGGAGCAGTTTTAACTTGTCCACTAGAAGTTGTCAAAGTTCGCCTACAATCTTCAAAAGGAATTGTACTTTCCTCATCTTCATTCAAGCATAACTCCGTCGCAGATTATAACCACAGTCATCGTTTATCGCGTATACGATGCATGTTATATGGTTTAAAACAAGCTGATCCTAAACAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BG930249             [                                      gtCTACAGGTTATGTTATGAGACTCTGTTCTGG AATATCTCGTGTTTGTGTGGCTAATCTTCTATAAGTATAAAATATTCTATTTGGAACTATCAGATACTTATTTCTCTCCACCATCCGTTGGATGGGCTAATGTTCGA CAGGCTGCTGTGCACGTTATTGGAGGAGGCATCGGAGGAACAGTTGGAGCAGTTTTAACTTGTCCACTAGAAGTTGTCAAAGTTCGCCTACAATCTTCAAAAGGAATTGTACTTTCCTCATCTTCATTCAAGCATAACTCCGTCGCAGATTATAACCACAGTCATCGTTTATCGCGTATACGATGCATGTTATATGGTTTAAAACAAGCTGATCCTAAACATGTTCAAAAATCCAGTCCCAATCACAAGTCGGTGATTTCTTCGTGTATTAATTTGTCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD183363             [                                                                                GTGTTTGTGTGGCTAATCTTCTATAAGTATAAAATATTCTATTTGGAACTATCAGATACTTATTTCTCTCCACCATCCGTTGGATGGGCTAATGTTCGATGAGGCTGCTGTGCACGTTATTGGAGGAGGCATCGGAGGAACAGTTGGAGCAGTTTTAACTTGTCCACTAGAAGTTGTCAAAGTTCGCCTACAATCTTCAAAAGGAATTGTACTTTCCTCATCTTCATTCAAGCATAACTCCGTCGCAGATTATAACCACAGTCATCGTTTATCGCGCATACGATGCATGTTATATGGTTTAAAACAAGCTGATCCTAAACATGTTCAAAAATCCAGTCCCAATCACAAGTCGGTGATTTCTTCGTGTATTAATTTGTCGAACCCCAAATACCCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD096803             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCTGATCCTAAACATATTCAAAAATCCAGTCCCAATCACAAGTCGGTGATTTCTTCGTGTATTAATTTGTCGAACCCCTCAGGCCTCAACATTCCCACTACACCTACCGATTTCCCAAAAGCCAAGCCTCATGGACTTCGGCGATCTCTTATTCTTCGTTCGTTAATTGACATTTTTCGTTATGAAGGACCCAAAGCTCTATTTAAAGGTCTTGTCCCTACTCTTGTTGGAGTGATGCCAACACGAGGTATATACTTTTGTGCATATCATAATGGACAGTTGTTCTTTGAAAAATATTTCCAGCCTGGTTCTTCATTTGTCTATTTATGTGCTGCTGGAATTGGAAGCATAACCGCTTCTTCCTTAACCAATCCTATTTGGTTTGTAAAAACAAGGCTTCAATTAGATTCACGGCCAGGTCATACACCTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD079331             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGTTCTTTGAAAAATATTTCCAGCCTGGTTCTTCATTTGTCTATTTATGTGCTGCTGGAATTGGAAGCATAACCGCTTCTTCCTTAACCAATCCTATTTGGTTTGTAAAAACAAGGCTTCAATTAGATTCACGGCCAGGTCATACACCTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGGAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGATATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCANAGAGGAAGGTTTAAGTGGCCTTTATCGTGGTATGGCAACTCATTATATTCGTCAAGTACCTAATTCTTGTATTATGATTGGAACTTATGAATTCGTTGTCTTTCTACTACAATCTTGGGATTT ACTANAGACATCANGGNATAGNAGGGNATTGCTTTTATTCTCCTACTAATTAAAATCTTA TTTCTTTCCCCATTCTCTATTTGTAC GGAAAAATAATT TTAGAGTG AAAATAAATTT ]
[-] EMBL CD097280             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGAAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGGTATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGA                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD097410             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGGAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGATATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGA                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD097281             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CTATTACGGTTTCACAAGTTATACGTAACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGAAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGGTATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTTCTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTAGTACCCTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGA                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD073608             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TACCAC TGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTTGGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTTTGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAACAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGTTCAAGTGGTGGAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGATATGATCTTGTGTATGATTGCTAGTGCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGTTTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCAAAGAGGAAGGTTTAAGTGGCCTTTATCGTGGTATGGCAACTCATTATATTCGTCAAGTACCTAATTCTTGTATTATGATTGGAACTTATGAATTCGTTGTCTTTCTACTACAATCTTGGGATTTAACTAAAGACATCAAGGTATAGTAGTGTATTGCTTTTATTCTTCTACTAATTAAAATCTTATTTTCTTTCCCATTTCTCTATTTGTACAGAAAAAATAATTATTAGAGTGAAAAATAAATTTG]


>consensus_9381#0 TCATCGTAAACTGCTCACGATAACGTTCGTGCTGGTGGGCCTACAGGCTATGCTATGAGA CTCTGTTCTGGAAATATCTCGTGTTTGTGTGGCTAATCTTCTATAAGTATAAAATATTCT ATTTGGAACTATCAGATACTTATTTCTCTCCACCATCCGTTGGATGGGCTAATGTTCGAT GAGGCTGCTGTGCACGTTATTGGAGGAGGCATCGGAGGAACAGTTGGAGCAGTTTTAACT TGTCCACTAGAAGTTGTCAAAGTTCGCCTACAATCTTCAAAAGGAATTGTACTTTCCTCA TCTTCATTCAAGCATAACTCCGTCGCAGATTATAACCACAGTCATCGTTTATCGCGTATA CGATGCATGTTATATGGTTTAAAACAAGCTGATCCTAAACATGTTCAAAAATCCAGTCCC AATCACAAGTCGGTGATTTCTTCGTGTATTAATTTGTCGAACCCCAAATACCCCAACATT CCCACTACACCTACCGATTTCCCAAAAGCCAAGCCTCATGGACTTCGGCGATCTCTTATT CTTCGTTCGTTAATTGACATTTTTCGTTATGAAGGACCCAAAGCTCTATTTAAAGGTCTT GTCCCTACTCTTGTTGGAGTGATGCCAACACGAGGTATATACTTTTGTGCATATCATAAT GGACAGTTGTTCTTTGAAAAATATTTCCAGCCTGGTTCTTCATTTGTCTATTTATGTGCT GCTGGAATTGGAAGCATAACCGCTTCTTCCTTAACCAATCCTATTTGGTTTGTAAAAACA AGGCTTCAATTAGATTCACGGCCAGGTCATACACCTATTACGGTTTCACAAGTTATACGT AACACTTGGAAACAAGATGGATTACGTGGCTTCTACCGAGGTGTAAGTGCATCGTATTTT GGTTCTCTAGAAACAGCTTTAAATTTCGTTGTATATGAAAATTTTAAATCAGAACTACTT TGGAGAGAGCATAAACGTAAACGTCAATTAACACTTAATAGTCCTGTTCCAATATCGGAA CAATCTGTTTACAGTAGTGATAATGATTATCTGCCTCAAAAAGCATCGGATTTTCGTGGT TCAAGTGGTGGAAGTAAATTGTCTGCTTCAAAAGATATGATCTTGTGTATGATTGCTAGT GCTTGTTCTAAAGCAATCGCTATTACTGCTCTATATCCTCATGAAGTAGCTCGAACTCGT TTACGTGAAGAAACTGGACAATATCGAGGATTTTTTCGTACACTTCATTTAGTTGGCAAA GAGGAAGGTTTAAGTGGCCTTTATCGTGGTATGGCAACTCATTATATTCGTCAAGTACCT AATTCTTGTATTATGATTGGAACTTATGAATTCGTTGTCTTTCTACTACAATCTTGGGAT TTACTANAGACATCANGGNATAGNAGGGNATTGCTTTTATTCTCCTACTAATTAAAATCT TATTTCTTTCCCCATTCTCTATTTGTACGGAAAAATAATTTTAGAGTGAAAATAAATTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)