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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9385#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1311 fasta sequence
[TAAACAACTACCATCTGTTGTTACACCACCACCTCTGCTAGATGCCAATTATAACAATAATAATAATAGAAACTATCCTGTAATGAACCATCGTTATGTACAACCTCCAAGTAATAATCTATTAGGATCAGATTCAGTTTCTGGAAATAGTATGTCTAATGTGTTAATGCCGCCAGTGCCTGCATCACCACCAGCACAATCAGCCCAAATGATTACAAACTTTGGGCATAACATTGGTGGATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACACCCACTCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGACCACTTCTACCGACATTACCACAAAAACAGCATCAATCATCAATGATGACACCAGGTTGGAATGATCCACCTATCTTAACAACTGATAAACCACGCCAAACAACCGTTTCACACAACCCTTATTATAATCCTATGGAATTTGTTAATTCACCTTTACCTCAACCGAATAATTCCGTATCACCGTCGAATTTTCCTCAACCAATGACGGAACTATACACAACTTCAAATCCTCCTTTACCACCAGGATATCCTGTTACTGGATTAAACGTATGTCAACCTGCACCACCACCACCACCACCAGTTCAAAATTCTATCCCACCTATAAATGCTGATATAATTCATCCTCAGCAGCCCTTGCCACCGTTGCCGACCCATGTTCAACAGCAATCATCATCATCACTCATGAGACCGCCAATTCAACAGCCATCGTATTCACAAGTACAAGGAGTGCCTCACCAACAAGAACAGTACCCAAATTATTTCCAGCCATCGGTTGAACAAACTTCTCAGTTTTCCAATATATCGTCATCACTACCACCTATGTCGTCAGTCGTTCCACCGAACCCTTACTCTCAATTTAATATTTGGCCTGCAGCTCAACCTTTGTCTAATACTGTAAAATCTGGGATTATCAATCAAACTATTGTTGAAAATGCCATATCATCAAATTCTTTCAGTTCTTCAAATAATGACCATAATGATGCACAGTCACTACATAATTTGGATTCTACAAGTTTAAACACCGATCCCAATAATATTAATAATTATTCATTGCCGACGGAATTCCAACCCATACAAAAAGTGTTATTTGACTTAATTCAAAATTGTCGTAAAGTTGGTGACACACATAATCGTCAAACATTAACGGATGATGAACATCGTCTGAATCAATTCTTTATGAATATATCTAATGGTCAATTACAATCAAATACTACATCAATGGAATATTTACATCACTG]
[+] EMBL CD160391 [TAAACAACTACCATCTGTTGTTACACCACCACCTCTGCTAGATGCCAATTATAACAATAATAATAATAGAAACTATCCTGTAATGAACCATCGTTATGTACAACCTCCAAGTAATAATCTATTAGGATCAGATTCAGTTTCTGGAAATAGTATGTCTAATGTGTTAATGCCGCCAGTGCCTGCATCACCACCAGCACAATCAGCCCAAATGATTACAAACTTTGGGCATAACATTGGTGGATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACANCCACTCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGAACACTTCTACCGA ]
[+] EMBL CD160102 [TAAACAACTACCATCTGTTGTTACACCACCACCTCTGCTAGATGCCAATTATAACAATAATAATAATAGAAACTATCCTGTAATGAACCATCGTTATGTACAACCTCCAAGTAATAATCTATTAGGATCAGATTCAGTTTCTGGAAATAGTATGTCTAATGTGTTAATGCCGCCAGTGCCTGCATCACCACCAGCACAATCAGCCCAAATGATTACAAACTTTGGGCATAACATTGGTGGATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACANCCACTCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGACCACTTCTAACGACATTAGCACAAAAACAGCATCCAT ]
[-] EMBL CD114095 [ TAATAATAATAGGGGCTATCCTGTAATGAACCATCGTTATGTACAACCTCCAAGTAATAATCTATTAGGATCAGATTCAGTTTCTGGAAATAGTATGTCTAATGTGTTAANGCCGCCAGTGCTTGCATCACCACCAGCACAATCAGCCCAAATGATTACAAACTTTGGGCATAACATTGGTGGATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACACCCACTCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGACCACTTCTACCGACATTACCACAAAAACAGCATCAATCATCAATGATGACACCAGGTTGGAATGATCCACCTATCTTAACAACTGATAAACCACGCCAAACAACCGTTTCACACAACCCTTATTATAATCCTATGGAATTTGTTAATTCACATTTACCTCAACCGAATAATTCCGTATCACCGTCGAATTTTCCTCAACCAATGACGGAACTATACACAACTTCAAATCCTCCTTTACCACCAGGATATCCTGTTACTGGA ]
[+] EMBL CD133304 [ CACAATCAGCCCAAATGATTACAAACTTTGGGCATAACATTGGTGGATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACACCCACTCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGACCACTTCTACCGACATTACCACAAAAACAGCATCAATCATCAATGATGACACCAGGTTGGAATGATCCACCTATCTTAACAACTGATAAACCACGCCAAACAACCGTTTCACACAACCCTTATTATAATCCTATGGAATTTGTTAATTCACCTTTACCTCAACCGAATAATTCCGTATCACCGTCGAATTTTCCTCAACCAATGACGGAACTATACACAACTTCAAATCC ]
[+] EMBL AI976664 [ TGGTGGATCAATGCCTCCTAGTTTTCAATCATTAAACACTATGCCTTATGGTATGCCAACACCCACTCCCCAATTCAATGTTCAACAGCAGCAAGAACACAATCAACAACAAATGCGACCACTTCTACCGACATTACCACAAAAACAGCATCAATCATCAATGATGACACCAGGTTGGAATGATCCACCTATCTTAACAACTGATAAACCACGCCAAACAACCGTTTCACACAACCCTTATTATAATCCTATGGAATTTGTTAATTCACCTTTACCTCAACCGAATAATTCCGTATCACCGTCGAATTTTCCTCAACCAATGACGGAACTATACACAACTTCAAATCCTCCTTTACCACCAGGATATCCTGTTACTGGATTAAACGTATGTCAACCTGCACCACCACCACCACCACCAGTTCAAAATTCTATCCCACCTATAAATGCTGATATAATTCATCCTCAGCAGCCCTTGCCACCGTTGCCGACCCATGTTCAACAGCAATCATCATCATCACTCATGAGACCGCCAATTCAACAGCCATCGGATTCACAAGT ]
[-] EMBL CD147907 [ AAAATTCTATCCCACCTATAAATGCTGATATAATTCATCCTCAGCAGCCCTTGCCACCGTTGCCGACCCATGTTCAACAGCAATCATTATCATCACTCATGAGACCGCCAATTCAACAGCCATCGTATTCACAAGTACAAGGAGTGCCTCACCAACAAGAACAGTACCCAAATTATTTCCAGCCATCGGTTGAACAAACTTCTCAGTTTTCCAATATATCGTCATCACTACCACCTATGTCGTCAGTCGTTCCACCGAACCCTTACTCTCAA ]
[+] EMBL CD193563 [ CAGCCCTTGCCACCGTTGCCGACCCATGTTCAACAGCAATCATCATCATCACTCATGAGACCGCCAATTCAACAGCCATCGTATTCACAAGTACAAGGAGTGCCTCACCAACAAGAACAGTACCCAAATTATCTCCAGCCATCGGTTGAACAAACTTCTCAGTTTTCCAATATATCGTCATCAC ]
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[+] EMBL AI975429 [ CAACCTTTGCATAATACTGTTAAATCTGGGATTATCAATCAAACTATTGTTGAAAATGCCATATCATCAAATTCTTTCAGCTCTTCAAATAATGACCATAATGATGCACACACACTACATAATTTGGATTCTACAAGTTTAAACACCGATCCCAATAATATTAATAATTATTCATTGCCGACGGAATCACAACCCATACAAAAAGTGTTATTTGACTCAATTCAAAATTGACGTAAAGCTGGTGACACACATAATCGTCAAACATTAACGGATGATGAACATCGTCTGAATCAATTCTTTATGAATATATCTAATGGTCAATTACAATCAAATACTACATCAATGGAATATTTACATCACTG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||