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Schistosoma mansoni
cluster # 9397 cluster # 9397       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9397#0 length = 1584 sequences # 9  

consensusID : consensus_9397#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1584
fasta sequence
                              [CGATTCTNCCGCTACATCNGCATGTTTGTACGATATGGNGGNATGAGATTTCCGATGATATGAGTCCNTTACCCAGTANTAGTCCACTGCCACAACACATGTTTGCAGGTGCATGTGCAGGTATAATGGAACATATGNTCATGTATCCTGTCGACTGTGTTAAAACTCGAATGCAGTGTCTGAGGCCTGTTGGTAGTTCTAATTACCCAGGTTTACTAACTGGTCTGTATCGTCTAATCCTTCA-GGAAGGAGTATCAGGTTCGCTAAAAGGTAGTGGTGCAGTGATCTGGGGTGCTGGTCCGGCACATGCCGCTTACTTTGGATGCTATGAAAAAATGAAGTCAACCCTAGCTATAGCCCCCATAGGATCGACCCATATAAATCATATGATAGCTGGGACTTGTGCAACTTTACTACACGATGCTATTATGACTCCTGCAGATGCTGTGAAGCAACGTCTGCAACTTTACAATAGTCCTTACCACAACACTTTTGATTGTCTCCGTCGAGTGTGTTTAACAGAAGGACTCGGTGTATTGTACAGAGCTTATTTTACACAGTTATCCATGAATATACCTTATCAGACAATTCATTTTGTTTGTTATGAGCATGCTCAGAGTTTAATAAATCCAAATCGTCAGTATCTACCATGGACTCATGTTGTATCCGGAGGTATAGCTGGTTGTTTTGCCGCTGCTTTCACAAACCCGTTAGATGTTTGTAAAACTCTACTAAATACACAGGATCGGTGTGTTCAAAAGAATATATGTTTTGGTCACTTCACACAGTCATCTAAACCTGAATTCCGAGGGTTGTTTGGCACAGCGATGTATGTATACCAAATGACTGGTTTAAGAGGATTCACTAGAGGTATAAGTGCTCGAATCCTAACAGCTGTTCCAGGCACTGCTTTATCCTGGTCAGTTTATGAATATTTTAAATGGCGGTTAAAAGCACCAACAAAACCTTTAGGATCTGATTTTGGCGAGACTAGTGGTGGTAACAGTGTTCATAATATTGAAATTTTACCCATGGAAAAATTGTGTGTAACTGCCAGTTCCAAATGGATTCCTGATTCCACTGATTTGACATACACAACAACAGTTAATACTACAAATGGACGATCAAATGTACAGGAGAACACTAGATAAGTCAAAGTATTACTATTACTGTGAAGTAGTAGTGCTACATAAGAAATGTTTAAAATTCTCCATGCTTTATCCATCCGCTTCCTGTGATGATGATCAAGTGTCCACACAGTGGATCAGTTTGTTCACCGNCGATAACACTAGTTTATAGCGATGATTGTTTAGTTTACATAAATTTCCCCGCTTACCATGCACANAACTTTGTATAAAGAAATGATTATTTTCTACATCATCCTACCTGTATAANTAAAACATTGCTTTAATC-TTTCTTTCCTCTATCTTACCGGTCAGACTGC-TTTAATCCATGTGTACAAA-TACATTTACTTTTANTCACTTTC-TTCCATTTTCGCG-C-ATGGGTTTGGTTTG-GGTGGTTCCT-CCCAAGGGGGGTT-A-AAAAATAACCATT-TGTTGATG-GAAAATT-TTGCTAAA-ATAAATAGAT]

[-] EMBL CD146727             [CGATTCTNCCGCTACATCNGCATGTTTGTACGATATGGNGGNATGAGATTTCCGATGATATGAGTCCNTTACCCAGTANTAGTCCACTGCCACAACACATGTTTGCAGGTGCATGTGCAGGTATAATGGAACATATGNTCATGTATCCTGTCGACTGTGTTAAAACTCGAATGCAGTGTCTGAGGCCTGTTGGTAGTTCTAATTACCCAGGTTTACTAACTGGTCTGTATCGTCTAATCCTTCA GGAAGGAGTATCAGGTTCGCTAAAAGGTAGTGGTGCAGTGATCTGGGGTGCTGGTCCGGCACATGCCGCTTACTTTGGATGCTATGAAAAAATGAAGTCAACCCTAGCTATAGCCCCCATAGGATCGACCCATATAAATCATATGATAGCTGGGACTTGTGCAACTTTACTACACGATGCTATTATGACTCCTGCAGATGCTGTGAAGCAACGTCTGCAACTTTACAATAGTCCTTACCACAACACTTTTGATTGTCTCCGTCGAGTGTGTTTAACAGAAGGACTCGGTGTATTGTACAGAGCTTATTTTACACAGTTATCCATGAATATACCTTATCAGACAATTCATTTTGTTTGTTATGAGCATGCTCAGAGTTTAATAAATCCAAATCGTCAGTATCTACCATGGACTCATGTTGTATCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD067243             [                                                         tTATGAGTCC TTACCCAGTACTAGTCCACTGCCACAACACATGTTTGCAGGTGCATGTGCAGGTATAATGGAACATATTGTCATGTATCCTGTCGACTGTGTTAAAACTCGAATGCAGTGTCTGAGGCCTGTTGGTAGTTCTAATTACCCAGGTTTACTAACTGGTCTGTATCGTCTAATCCTTCA GGAAGGAGTATCAGGTTCGCTAAAAGGTAGTGGTGCAGTGATCTGGGGTGCTGGTCCGGCACATGCCGCTTACTTTGGATGCTATGAAAAAAAGAAGTCAACCCTAGCTATAGCCCCCATAGGATCGACCCATATAAATCATATGATAGCTGGGACTTGTGCAACTTTACTACACGATGCTATTATGACTCCTGCAGATGCTGTGAAGCAACGTCTGCAACTTTACAATAGTCCTTACCACAACACTTTTGATTGTCTCCGGCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD166105             [                                                                                                                                                                                                                              GTCTGTATCGTCT ATNCCTCAGGGAAGGAGTATCAGGTTCGCTAAAAGGTAGTGGTGCAGTGATCTGGGGTGCTGGTCCGGCACATGCCGCTTACTNTGGATGCTATGAAAAAATGAAGTCAACCCTAGCTATAGCCCCCATAGGATCGACCCATATAAATCATATGATAGCTGGGACTTGTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD146995             [                                                                                                                                                                                                                               TCTGTATCGTCTAATCCTTCA GGAAGGAGTATCAGGTTCGCTAAAAGGTAGTGGTGCAGTGATCTGGGGTGCTGGTCCGGCACATGCCGCTTACTTTGGATGCTATGAAAAAATGAAGTCAACCCTAGCTATAGCCCCCATAGGATCGACCCATATAAATCATATGATAGCTGGGACTTGTGCAACTTTACTACACGATGCTATTATGACTCCTGCAGATGCTGTGAAGCAACGTCCGCAACTTTACAATAGTCCTTACCACAACACTTTTGATTGTCTCCGTCGAGTGTGTTTAACAGAAGGACTCGGTGTATTGTACAGAGCTTATTTTACACAGTTATCCATGAATATACCTTATCAGACAATTCATTTTGTTTGTTATGAGCATGCTCAGAGTTTAATAAATCCAAATCGTCAGTATCTACCATGGACTCATGTTGTATCCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD078591             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGCTCAGAGTTTAATAAATCCAAATCGTCAGTATCTACCATGGACTCATGTTGTATCCGGAGGTATAGCTGGTTGTTTTGCCGCTGCTTTCACAAACCCGTTAGATGTTTGTAAAACTCTACTAAATACACAGGATCGGTGTGTTCAAAAGAATATATGTTTTGGTCACTTCACACAGTCATCTAAACCTGAATTCCGAGGGTTGTTTGGCACAGCGATGTATGTATACCAAATGACTGGTTTAAGAGGATTCACTAGAGGTATAAGTGCTCGAATCCTAACAGCTGTTCCAGGCACTGCTTTATCCTGGTCAGTTTATGAATATTTTAAATGGCGGTTAAAAGCACCAACAAAACCTTTAGGATCTGATTTTGGCGAGACTAGTGGTGGTAACAGTGTTCATAATATTGAAATTTTACCCATGGAAAAATTGTGTGTAACTGCCAGTTCCAAATGGATTCCTGATTCCACTGATTTGACATACACAACAACAGTTAATACTACAAATGGACGATCAAATGTACAGGAGAACACTAGATAAGTCAAAGTATTACTATTACTGTGAAGTAGTAGTGCTACATAAGAAATGTTTAAAATTCTCCATGCTTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD187242             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTTGTATCCGGAGGTATAGCTGGTTGTTTTGCCGCTGCTTTCACAAACCCGTTAGATGTTTGTAAAACTCTACTAAATACACAGGATCGGTGTGTTCAAAAGAATATATGTTTTGGTCACTTCACACAGTCATCTAAACCTGAATTCCGAGGGTTGTTTGGCACAGCGATGTATGTATACCAAATGACTGGTTTAAGAGGATTCACTAGAGGTATAAGTGCTCGAATCCTAACAGCTGTTCCAGGCACTGCTTTATCCTGGTCAGTTTATGAATATTTTAAATGGCGGTTAAAAGCACCAACAAAACCTTTAGGATCTGATTTTGGCGAGACTAGTGGTGGTAACAGTGTTCATAATATTGAAATTTTACCCATGGAAAAATTGTGTGTAACTGCCAGTTCCAAATGGATTCCTGATTCCACTGATTTGACATACACAACAACAGTTAATACTACAAATGGACGATCAAATGTACAGAAGc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD062445             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCGG GTG TCAAAAGAATATATGTTTTGGTCACTTCACACAGTCATCTAAACCTGAATTCCGAGGGTTGTTTGGCACAGCGATGTATGTATACCAAATGACTGGTTTAAGAGGATTCACTAGAGGTATAAGTGCTCGAATCCTAACAGCTGTTCCAGGCACTGCTTTATCCTGGTCAGTTTATGAATATTTTAAATGGCGGTTAAAAGCACCAACAAAACCTTTAGGATCTGATTTTGGCGAGACTAGTGGTGGTAACAGTGTTCATAATATTGAAATTTTACCCATGGAAAAATTGTGTGTAACTGCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD080216             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CTGAATTCCGAGGGTTGTTTGGCACAGCGATGTATGTATACCAAATGACTGGTTTAAGAGGATTCACTAGAGGTATAAGTGCTCGAATCCTAACAGCTGTTCCAGGCACTGCTTTATCCTGGTCAGTTTATGAATATTTTAAATGGCGGTTAAAAGCACCAACAAAACCTTTAGGATCTGATTTTGGCGAGACTAGTGGTGGTAACAGTGTTCATAATATTGAAATTTTACCCATGGAAAAATTGTGTGTAACTGCCAGTTCCAAATGGATTCCTGATTCCACTGATTTGACATACACAACAACAGTTAATACTACAAATGGACGATCAAATGTACAGGAGAACACTAGATAAGTCAAAGTATTACTATTGCTGTGAAGTAGTAGTGCTACATAAGAAATGTTTAAAATTCTCCATGCTTTATCCATCCGCTTCCTGTGATGATGATCAAGTGTCCACACAGTGGATCAGTTTGTTCACCGNCGATAACACTAGTTTATAGCGATGATTGTTTAGTTTACATAAATTTCCCCGCTTACCATGCACANAACTTTGTATAAAGAAATGATTATTTTCTACATCATCCTACCTGTATAANTAAAACATTGCTTTAATC TTTCTTTCCTCTATCTTACCGGTCAGACTGC TTTAATCCATGTGTACAAA TACATTTACTTTTANTCACTTTC TTCCATTTTCGCG C ATGGGTTTGGTTTG GGTGGTTCCT CCCAAGGGGGGTT A AAAAATAACCATT TGTTGATG GAAAATT TTGCTAAA ATA       ]
[-] EMBL CD073056             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTCCTGATTCCACTGATTTGACATACACAACAACAGTTAATACTACAAATGGACGATCAAATGTACAGGAGAACACTAGATAAGTCAAAGTATTACTATTACTGTGAAGTAGTAGTGCTACATAAGAAATGTTTAAAATTCTCCATGCTTTATCCATCCGCTTCCTGTGATGATGATCAAGTGTCCACACAGTGGATCAGTTTGTTCACCGCCGATAACACTAGTTTATAGCGATGATTGTTTAGTTTACATAAATTTCCCCGCTTACCATGCACAAAACTTTGTATAAAGAAATGATTATTTTTTACATCATTTTACCTGTATAA TTAAACATTGCTTTTATCTTTTCTTTCCTCTATCTTACCGTTCAGACTGCTTTTAATCCATGTGTACAAATTACATTTACTTTTAGTCACTTTCTTTCCATTTTC CGTCTATTGGTTT GTTTGTGTTGTTTCCTCCCCAAGGGGGGTTCAGAGAAAT AGCATTATGTTGATGTGATTATTATTGCTAAATATAAATAGAT]


>consensus_9397#0 CGATTCTNCCGCTACATCNGCATGTTTGTACGATATGGNGGNATGAGATTTCCGATGATA TGAGTCCNTTACCCAGTANTAGTCCACTGCCACAACACATGTTTGCAGGTGCATGTGCAG GTATAATGGAACATATGNTCATGTATCCTGTCGACTGTGTTAAAACTCGAATGCAGTGTC TGAGGCCTGTTGGTAGTTCTAATTACCCAGGTTTACTAACTGGTCTGTATCGTCTAATCC TTCAGGAAGGAGTATCAGGTTCGCTAAAAGGTAGTGGTGCAGTGATCTGGGGTGCTGGTC CGGCACATGCCGCTTACTTTGGATGCTATGAAAAAATGAAGTCAACCCTAGCTATAGCCC CCATAGGATCGACCCATATAAATCATATGATAGCTGGGACTTGTGCAACTTTACTACACG ATGCTATTATGACTCCTGCAGATGCTGTGAAGCAACGTCTGCAACTTTACAATAGTCCTT ACCACAACACTTTTGATTGTCTCCGTCGAGTGTGTTTAACAGAAGGACTCGGTGTATTGT ACAGAGCTTATTTTACACAGTTATCCATGAATATACCTTATCAGACAATTCATTTTGTTT GTTATGAGCATGCTCAGAGTTTAATAAATCCAAATCGTCAGTATCTACCATGGACTCATG TTGTATCCGGAGGTATAGCTGGTTGTTTTGCCGCTGCTTTCACAAACCCGTTAGATGTTT GTAAAACTCTACTAAATACACAGGATCGGTGTGTTCAAAAGAATATATGTTTTGGTCACT TCACACAGTCATCTAAACCTGAATTCCGAGGGTTGTTTGGCACAGCGATGTATGTATACC AAATGACTGGTTTAAGAGGATTCACTAGAGGTATAAGTGCTCGAATCCTAACAGCTGTTC CAGGCACTGCTTTATCCTGGTCAGTTTATGAATATTTTAAATGGCGGTTAAAAGCACCAA CAAAACCTTTAGGATCTGATTTTGGCGAGACTAGTGGTGGTAACAGTGTTCATAATATTG AAATTTTACCCATGGAAAAATTGTGTGTAACTGCCAGTTCCAAATGGATTCCTGATTCCA CTGATTTGACATACACAACAACAGTTAATACTACAAATGGACGATCAAATGTACAGGAGA ACACTAGATAAGTCAAAGTATTACTATTACTGTGAAGTAGTAGTGCTACATAAGAAATGT TTAAAATTCTCCATGCTTTATCCATCCGCTTCCTGTGATGATGATCAAGTGTCCACACAG TGGATCAGTTTGTTCACCGNCGATAACACTAGTTTATAGCGATGATTGTTTAGTTTACAT AAATTTCCCCGCTTACCATGCACANAACTTTGTATAAAGAAATGATTATTTTCTACATCA TCCTACCTGTATAANTAAAACATTGCTTTAATCTTTCTTTCCTCTATCTTACCGGTCAGA CTGCTTTAATCCATGTGTACAAATACATTTACTTTTANTCACTTTCTTCCATTTTCGCGC ATGGGTTTGGTTTGGGTGGTTCCTCCCAAGGGGGGTTAAAAAATAACCATTTGTTGATGG AAAATTTTGCTAAAATAAATAGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)