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Schistosoma mansoni
cluster # 9398 cluster # 9398       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9398#0 length = 1288 sequences # 9  

consensusID : consensus_9398#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1288
fasta sequence
                              [TGCAATTGACATGTTGGGGGTGGCGGTGGTAAAGAAAACTGCTGTTGTTGTGATTGTTGTATCGACTGTTGTTGTTGTGGATGAAATTGATTAGAAGCAGGTGTTTGGTTAGCCACTAACTGTTGTTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGAGCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATATTGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTGTTGTACTGTTGGTTTGTTGTATGCTTGACCACTTGGATTTAATTGATTTATTTGTTGAGTATTAGTATTAGAAAAATTTGACTGAGCAACATGATTCGCTTCAGAGCCGTAATTTGGTGCCATAGATTGTGTCATTAGCATTGGAGATTGACTGGCTGTCATCACTGCCATAGAGACAGATTCCCCAAAAACCGGATTCGTTTGGTAATTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAAT-CCA-TTACATCAGCATTACTCAACATCAGATGATGCCCCCCACCACCACCATTCAATAAAGTACCAGTTGCTGACGGGGAGTTAAATTGTTTTGAACGTAACATACTTGAACTACCACGAAAACCATTTGGATCATCACATATTTCTTTGCCACCAATGTAATACCATAGATTTGTTGAAAATAATTTACTATCCGTATGAGTTAGAATGCATAGCATGATGACGGCGACGACAAGCCCAAATCAGAATAACCAAAAACAACACTGGTATTAATAAACCTAAGATCAAAGCACCAACAAATGTCAATCCAAAGTATTGTGCCCAACTCCATTGACTTGGCAATGGTGCAGATGCTTTCTCCAAAGCACTACATGGTTCAGTATAAGAAGTAATATTATCAACACAGATTCTAGCATCCGGATAGCCAGCAGGAATCGTACCTTCTAATATCAGCTTGTAATCTTTTGAAGAGAAACCCAATGATGATTTAGATAGAATATCCACATAT]

[+] EMBL CD144927             [TGCAATTGACATGTTGGGGGTGGCGGTGGTAAAGAAAACTGCTGTTGTTGTGATTGTTGTATCGACTGTTGTTGTTGTGGATGAAATTGATTAGAAGCAGGTGTTTGGTTAGCCACTAACTGTTGTTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGAGCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATATTGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTGTTGTACTGTTGGTTTGTTGTATGCTTGACCACTTGGATTTAATTGATTTATTTGTTGAGTATTAGTATTAGAAAAATTTGACTGAGCAACATGATTCGCTTCAGAGCCGTAATTTGGTGCCATAGATTGTGTCATTAGCATTGGAGATTGACTGGCTGTCATCACTGCCATAGAGACAGATTCCCCAAAAAACGGATTCGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD132302             [                                                                             TGGATGAAATTGATTAGAAGCAGGTGTTTGGTTAGCCACTAACTGTTGTTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGAGCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATATTGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTGTTGTACCGTTGGTTTGTTGTATGCTTGACCACTTGGATTTAATTGATTTATTTGTTGAGTATTAGTATTAGAAAAATTTGACTGAGCAACATGATTCGCTTCAGAGCCGTAATTTGGTGCCATAGATAGTGTCATTAGCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD183820             [                                                                                                                             TTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGAGCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATATTGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD112573             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGGAGATTGACTGGCCGTCATCACTGCTATAGAGACAGATTCCCCAAAAACCGGATTCGTTTGGTAATTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD197666             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTGACTGGCTGTCATCACTGCCATAGAGACAGATTCCCCAAAAACNGGATTCGTTTGGTAATTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCTTTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAAT CCA TTACATCAGCATTACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD187105             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGATTCCCCAAAAACCGGATTCGTTTGGTAATTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCATAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAAT CCA TTACATCAGCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD128328             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAAT CCACTTACATCAGCATTACTCAACATCAGATGATGCCCCCCACCACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD112588             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tgtaaaGACTGTGGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATCTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD183484             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATCAGGTAAATGCCA TTACATCAGCATTACTCAACATCAGATGATGCCCACCACCACCACCATTCAATAAAGTACCAGTTGCTGACGGGGAGTTAAATTGTTTTGAACGTAACATACTTGAACTACCACGAAAACCATTTGGATCATCACATATTTCTTTGCCACCAATGTAATACCATAGATTTGTTGAAAATAATTTACTATCCGTATGAGTTAGAATGCATAGCATGATGACGGCGACGACAAGCCCAAATCAGAATAACCAAAAACAACACTGGTATTAATAAACCTAAGATCAAAGCACCAACAAATGTCAATCCAAAGTATTGTGCCCAACTCCATTGACTTGGCAATGGTGCAGATGCTTTCTCCAAAGCACTACATGGTTCAGTATAAGAAGTAATATTATCAACACAGATTCTAGCATCCGGATAGCCAGCAGGAATCGTACCTTCTAATATCAGCTTGTAATCTTTTGAAGAGAAACCCAATGATGATTTAGATAGAATATCCACATAT]


>consensus_9398#0 TGCAATTGACATGTTGGGGGTGGCGGTGGTAAAGAAAACTGCTGTTGTTGTGATTGTTGT ATCGACTGTTGTTGTTGTGGATGAAATTGATTAGAAGCAGGTGTTTGGTTAGCCACTAAC TGTTGTTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGA GCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATAT TGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTGTTGTACTGTTGGTTTGTTGTATGCTTGA CCACTTGGATTTAATTGATTTATTTGTTGAGTATTAGTATTAGAAAAATTTGACTGAGCA ACATGATTCGCTTCAGAGCCGTAATTTGGTGCCATAGATTGTGTCATTAGCATTGGAGAT TGACTGGCTGTCATCACTGCCATAGAGACAGATTCCCCAAAAACCGGATTCGTTTGGTAA TTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACT AACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTC AGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGA TAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAA GTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAA TCCATTACATCAGCATTACTCAACATCAGATGATGCCCCCCACCACCACCATTCAATAAA GTACCAGTTGCTGACGGGGAGTTAAATTGTTTTGAACGTAACATACTTGAACTACCACGA AAACCATTTGGATCATCACATATTTCTTTGCCACCAATGTAATACCATAGATTTGTTGAA AATAATTTACTATCCGTATGAGTTAGAATGCATAGCATGATGACGGCGACGACAAGCCCA AATCAGAATAACCAAAAACAACACTGGTATTAATAAACCTAAGATCAAAGCACCAACAAA TGTCAATCCAAAGTATTGTGCCCAACTCCATTGACTTGGCAATGGTGCAGATGCTTTCTC CAAAGCACTACATGGTTCAGTATAAGAAGTAATATTATCAACACAGATTCTAGCATCCGG ATAGCCAGCAGGAATCGTACCTTCTAATATCAGCTTGTAATCTTTTGAAGAGAAACCCAA TGATGATTTAGATAGAATATCCACATAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)