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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9398#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1288 fasta sequence
[TGCAATTGACATGTTGGGGGTGGCGGTGGTAAAGAAAACTGCTGTTGTTGTGATTGTTGTATCGACTGTTGTTGTTGTGGATGAAATTGATTAGAAGCAGGTGTTTGGTTAGCCACTAACTGTTGTTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGAGCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATATTGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTGTTGTACTGTTGGTTTGTTGTATGCTTGACCACTTGGATTTAATTGATTTATTTGTTGAGTATTAGTATTAGAAAAATTTGACTGAGCAACATGATTCGCTTCAGAGCCGTAATTTGGTGCCATAGATTGTGTCATTAGCATTGGAGATTGACTGGCTGTCATCACTGCCATAGAGACAGATTCCCCAAAAACCGGATTCGTTTGGTAATTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAAT-CCA-TTACATCAGCATTACTCAACATCAGATGATGCCCCCCACCACCACCATTCAATAAAGTACCAGTTGCTGACGGGGAGTTAAATTGTTTTGAACGTAACATACTTGAACTACCACGAAAACCATTTGGATCATCACATATTTCTTTGCCACCAATGTAATACCATAGATTTGTTGAAAATAATTTACTATCCGTATGAGTTAGAATGCATAGCATGATGACGGCGACGACAAGCCCAAATCAGAATAACCAAAAACAACACTGGTATTAATAAACCTAAGATCAAAGCACCAACAAATGTCAATCCAAAGTATTGTGCCCAACTCCATTGACTTGGCAATGGTGCAGATGCTTTCTCCAAAGCACTACATGGTTCAGTATAAGAAGTAATATTATCAACACAGATTCTAGCATCCGGATAGCCAGCAGGAATCGTACCTTCTAATATCAGCTTGTAATCTTTTGAAGAGAAACCCAATGATGATTTAGATAGAATATCCACATAT]
[+] EMBL CD144927 [TGCAATTGACATGTTGGGGGTGGCGGTGGTAAAGAAAACTGCTGTTGTTGTGATTGTTGTATCGACTGTTGTTGTTGTGGATGAAATTGATTAGAAGCAGGTGTTTGGTTAGCCACTAACTGTTGTTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGAGCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATATTGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTGTTGTACTGTTGGTTTGTTGTATGCTTGACCACTTGGATTTAATTGATTTATTTGTTGAGTATTAGTATTAGAAAAATTTGACTGAGCAACATGATTCGCTTCAGAGCCGTAATTTGGTGCCATAGATTGTGTCATTAGCATTGGAGATTGACTGGCTGTCATCACTGCCATAGAGACAGATTCCCCAAAAAACGGATTCGTT ]
[+] EMBL CD132302 [ TGGATGAAATTGATTAGAAGCAGGTGTTTGGTTAGCCACTAACTGTTGTTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGAGCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATATTGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTGTTGTACCGTTGGTTTGTTGTATGCTTGACCACTTGGATTTAATTGATTTATTTGTTGAGTATTAGTATTAGAAAAATTTGACTGAGCAACATGATTCGCTTCAGAGCCGTAATTTGGTGCCATAGATAGTGTCATTAGCATT ]
[-] EMBL CD183820 [ TTGTTGTTGAGGTTGGTTCTGAAATTGAAAGTTAGACGGTTGTTGAAATGATTGAGCTATTTGTGGTTGTGGTTGAATTAAATTCGTTTGAGATTGTTGAGTCGGGGGAAAATATTGCGATTGTGCACGTGGTTGATGGTGCTGTTG ]
[-] EMBL CD112573 [ TGGAGATTGACTGGCCGTCATCACTGCTATAGAGACAGATTCCCCAAAAACCGGATTCGTTTGGTAATTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCA ]
[-] EMBL CD197666 [ ATTGACTGGCTGTCATCACTGCCATAGAGACAGATTCCCCAAAAACNGGATTCGTTTGGTAATTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCTTTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAAT CCA TTACATCAGCATTACT ]
[-] EMBL CD187105 [ AGATTCCCCAAAAACCGGATTCGTTTGGTAATTGTAAGCTTCATTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCATAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAAT CCA TTACATCAGCATT ]
[-] EMBL CD128328 [ TTTTGTTGTTGACTTTGTGACTGTTGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATTTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCCACTACACGTCCACCTGGTACAACTACATCAGGTAAAT CCACTTACATCAGCATTACTCAACATCAGATGATGCCCCCCACCACCA ]
[+] EMBL CD112588 [ tgtaaaGACTGTGGTTGAATAAGTTCATTTGACACTAACGGCATTGTATTTTGACCAGTGCGTGCAACAGTAGTAACATTTGTACCACAATTATTCAGTGAAACTGTCCCATTAACATTTGTTAGCATAACCTGATTATTTTGTGCATTTGACAGATAATCTGTGTTTGTATATCCAGCATTATTATGATTATGACGAAGTGTGTTGCCGCCTAAAGTATTTCCGGAATAATTAAAAGCC ]
[+] EMBL CD183484 [ ATCAGGTAAATGCCA TTACATCAGCATTACTCAACATCAGATGATGCCCACCACCACCACCATTCAATAAAGTACCAGTTGCTGACGGGGAGTTAAATTGTTTTGAACGTAACATACTTGAACTACCACGAAAACCATTTGGATCATCACATATTTCTTTGCCACCAATGTAATACCATAGATTTGTTGAAAATAATTTACTATCCGTATGAGTTAGAATGCATAGCATGATGACGGCGACGACAAGCCCAAATCAGAATAACCAAAAACAACACTGGTATTAATAAACCTAAGATCAAAGCACCAACAAATGTCAATCCAAAGTATTGTGCCCAACTCCATTGACTTGGCAATGGTGCAGATGCTTTCTCCAAAGCACTACATGGTTCAGTATAAGAAGTAATATTATCAACACAGATTCTAGCATCCGGATAGCCAGCAGGAATCGTACCTTCTAATATCAGCTTGTAATCTTTTGAAGAGAAACCCAATGATGATTTAGATAGAATATCCACATAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||