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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9399#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 909 fasta sequence
[GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC-TACTTGAAACATCT-GGAAGTTTCTTTGATCAGGGTAAAAAGCGACGAAAATTAAATATATCCCTTATATACTTTCAGCGTTACTACTGGTTCAAGCGTTCTCTTCCTATATGGGTGCAGTCGAAAAACGACGCCGAGTTATCATCAGCCAAATCAGTAGGTGAAACGAAGACAGATCTCAATACTGGTGAACTAACGTCTTCGATTGAAGAGCCTGCTGTAAATCATTCTGAAGATTCATTGATACCTAATAATCCTGAATCATCAGTTGATATCTCTGGTCCTAATTCAGATACTCAAACTCATTTACCTATGTTTATTCCTGTGCGTTTTCCTGTTGCAGTAGAGCAACAATATTTTGAAACCTTACAACAGTTCCGTGGTAATGTTGGTCGAGCGAAAAATTTCGCAGAAGC]
[+] EMBL CD199933 [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGCTTACTTG AACATCTGGGAAG TTCTTTGATCAG ]
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[+] EMBL CD199964 [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCGAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGCGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCCCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGAAGTTTCTTTGATCAG ]
[+] EMBL CD199814 [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGCCCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCTGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGAAGTTTCTTTGATCAG ]
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[+] EMBL CD200018 [GATTGCCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGCATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGGAGTTTCTTTGATCAG ]
[+] EMBL CD199810 [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGTTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGCATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGAAGTTTCTTTGATCAG ]
[+] EMBL CD199825 [GATTGTCGAACCTGTGAAGTTGACACCTCAAATGATGTTTATACGTCATATTTTGTTAACGAAATTGGACCGAACTACCGTTAATACAACTTTACGGCTAATTCGAAAAATGGATTGGAATGATCAAGAACTTGTCGAATTTACGTGCACCCTTTTCACTAGGGCGTGGGATGTTCGTTATACGAATATAAACTGTCTAGCCAGTGTGTTATCTGGGCTAGCTACTTATCATTCGGACTTTGCCATGGCTGTTGTCGACAATGTCATCGAAGATATCCGTGTGGGAATGGAGCTCAACCTTCCCAGTTTGAATCAGCGTCGAATTGTAATGGTCAAATACCTTGGTTTGTTGTATAACTATTGTCTGGTGGATTCTCCAGTGATATTTAAAACACTTTACTCTCTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGTATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGAAGTTTC ]
[+] EMBL CD124778 [ CTTCTCACATTCGGTGTTAGCTTGGATCTTGATTTCCCAAGCATTATTGATCCACCGGATTCATTATTTCGAATTACATTAATTTGCACGC TACTTGAAACATCT GGAAGTTTCTTTGATCAGGGTAAAAAGCGACGAAAATTAAATATATCCCTTATATACTTTCAGCGTTACTACTGGTTCAAGCGTTCTCTTCCTATATGGGTGCAGTCGAAAAACGACGCCGAGTTATCATCAGCCAAATCAGTAGGTGAAACGAAGACAGATCTCAATACTGGTGAACTAACGTCTTCGATTGAAGAGCCTGCTGTAAATCATTCTGAAGATTCATTGATACCTAATAATCCTGAATCATCAGTTGATATCTCTGGTCCTAATTCAGATACTCAAACTCATTTACCTATGTTTATTCCTGTGCGTTTTCCTGTTGCAGTAGAGCAACAATATTTTGAAACCTTACAACAGTTCCGTGGTAATGTTGGTCGAGCGAAAAATTTCGCAGAAGC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||