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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9412#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 978 fasta sequence
[TCCTCCNAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGTTGATTTCTGATCCCCCCCGTTCCGAAAAGGTGGTCCTGTCCATGAATATGAAACATTTCAGAAAATTTTAAGCTTATCTTATACATTTGCCCCAAATTTTGATCCGATTGCAAAAGATTTAGTGGAAAAACTACTTGTAATTAGTCCCAGTGAACGCCTTGGTAGTCCTTCCTGTGGTGGGTCCATATCTGTTCGTCAACATATGTTTTTCTCTGAAATTAAATGGGATATCTTGCCGTACCAAGAACCTCCTTTACTAGTTCCAAACTTGGAACCAATTGCTCCTGAGGGTTGGGATAATCTGCCAGTTGGTTTTAACGAAGCAGAGAAATATCACTTGTCGCGTGAACTCGGTTTGTCTCCCTCTCAAATAACTGAAGATGATCGTATTCGTTTATTAAATGCACAAGGAAAACATAATCCTTTCAATCGTTTCGTTCGCGGTCGTTTAATTTTAAAACAAGGTATATTGTTTAAGCGTCGAGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGTTTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTA-TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAGACTTTAATCAGTTTTGTACAGTCAGAATTTACGT]
[+] EMBL CD082607 [TCCTCCNAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGTTGATTTCTGATCCCCCCCGTTCCGAAAAGGTGGTCCTGTCCATGAATATGAAACATTTCAGAAAATTTTAAGCTTATCTTATACATTTGCCCCAAATTTTGATCCGATTGCAAAAGATTTAGTGGAAAAACTACTTGTAATTAGTCCCAGTGAACGCCTTGGTAGTCCTTCCTGTGGTGGGTCCATATCTGTTCGTCAACATATGTTTTTCTCTGAAATTAAATGGGATATCTTGCCGTACCAAGAACCTCCTTTACTAGTTCCAAACTTGGAACCAATTGCTCCTGAGGGTTGGGATAATCTGCCAGTTGGTTTTAACGAAGCAGAGAAATATCACTTGTCGCGTGAACTCGGTTTGTCTCCCTCTCAAATAACTGAAGATGATCGTATTCGTTTATTAAATGCACAAGGAAAACATAATCCTTTCAATCGTTTCGTTCGCGGTCGTTTAATTTTAAAACAAGGTATATTGTTTAAGCGTCGAGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGTTTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTA TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCANATAAAACATATTATTTA ]
[-] EMBL AI067234 [ TTAACGAAGCAGAGAAATATCACTTGTCGCGTGAACTCGGTTTGTCTCCCTCTCAAATAACTGAAGATGATCGTATTCGTTTATTAAATGCACAAGGAAAACATAATCCTTTCAATCGTTTCGTTCGCGGTCGTTTAATTTTAAAACAAGGTATATTGTTTAAGCGTCGAGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGTTTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTA TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAGACTTTA ]
[-] EMBL CD076201 [ TCAAATAACTGAAGATGATCGTATTCGTTTATTAAATGCACAAGGAAAACATAATCCTTTCAATCGTTTCGTTCGCGGTCGTTTAATTTTAAAACAAGGTATATTGTTTAAGCGTCGAGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGTTTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTA TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAGACTTTAATCAGTTTTGTACAGTCAGAATTTACGT]
[-] EMBL AI067203 [ ACAAGGAAAACATAATCCTTTCAATCGTTTCGTTCGCGGTCGTTTAATTTTAAAACAAGGTATATTGTTTAAGCGTCGAGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGTTTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTA TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAGACTTTA ]
[-] EMBL AI067830 [ AGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGTTTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTA TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAG ]
[-] EMBL AI067326 [ CGGAAGGACCCC TCTGTTTTATTATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAAT ]
[-] EMBL AI067306 [ CTTNTA TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAG ]
[-] EMBL AI068184 [ ATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAGACTTTA ]
[-] EMBL AI067016 [ ATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||