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Schistosoma mansoni
cluster # 9412 cluster # 9412       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9412#0 length = 978 sequences # 9  

consensusID : consensus_9412#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 978
fasta sequence
                              [TCCTCCNAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGTTGATTTCTGATCCCCCCCGTTCCGAAAAGGTGGTCCTGTCCATGAATATGAAACATTTCAGAAAATTTTAAGCTTATCTTATACATTTGCCCCAAATTTTGATCCGATTGCAAAAGATTTAGTGGAAAAACTACTTGTAATTAGTCCCAGTGAACGCCTTGGTAGTCCTTCCTGTGGTGGGTCCATATCTGTTCGTCAACATATGTTTTTCTCTGAAATTAAATGGGATATCTTGCCGTACCAAGAACCTCCTTTACTAGTTCCAAACTTGGAACCAATTGCTCCTGAGGGTTGGGATAATCTGCCAGTTGGTTTTAACGAAGCAGAGAAATATCACTTGTCGCGTGAACTCGGTTTGTCTCCCTCTCAAATAACTGAAGATGATCGTATTCGTTTATTAAATGCACAAGGAAAACATAATCCTTTCAATCGTTTCGTTCGCGGTCGTTTAATTTTAAAACAAGGTATATTGTTTAAGCGTCGAGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGTTTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTA-TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAGACTTTAATCAGTTTTGTACAGTCAGAATTTACGT]

[+] EMBL CD082607             [TCCTCCNAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGTTGATTTCTGATCCCCCCCGTTCCGAAAAGGTGGTCCTGTCCATGAATATGAAACATTTCAGAAAATTTTAAGCTTATCTTATACATTTGCCCCAAATTTTGATCCGATTGCAAAAGATTTAGTGGAAAAACTACTTGTAATTAGTCCCAGTGAACGCCTTGGTAGTCCTTCCTGTGGTGGGTCCATATCTGTTCGTCAACATATGTTTTTCTCTGAAATTAAATGGGATATCTTGCCGTACCAAGAACCTCCTTTACTAGTTCCAAACTTGGAACCAATTGCTCCTGAGGGTTGGGATAATCTGCCAGTTGGTTTTAACGAAGCAGAGAAATATCACTTGTCGCGTGAACTCGGTTTGTCTCCCTCTCAAATAACTGAAGATGATCGTATTCGTTTATTAAATGCACAAGGAAAACATAATCCTTTCAATCGTTTCGTTCGCGGTCGTTTAATTTTAAAACAAGGTATATTGTTTAAGCGTCGAGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGTTTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTA TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCANATAAAACATATTATTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL AI067234             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAACGAAGCAGAGAAATATCACTTGTCGCGTGAACTCGGTTTGTCTCCCTCTCAAATAACTGAAGATGATCGTATTCGTTTATTAAATGCACAAGGAAAACATAATCCTTTCAATCGTTTCGTTCGCGGTCGTTTAATTTTAAAACAAGGTATATTGTTTAAGCGTCGAGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGTTTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTA TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAGACTTTA                            ]
[-] EMBL CD076201             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCAAATAACTGAAGATGATCGTATTCGTTTATTAAATGCACAAGGAAAACATAATCCTTTCAATCGTTTCGTTCGCGGTCGTTTAATTTTAAAACAAGGTATATTGTTTAAGCGTCGAGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGTTTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTA TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAGACTTTAATCAGTTTTGTACAGTCAGAATTTACGT]
[-] EMBL AI067203             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACAAGGAAAACATAATCCTTTCAATCGTTTCGTTCGCGGTCGTTTAATTTTAAAACAAGGTATATTGTTTAAGCGTCGAGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGTTTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTA TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAGACTTTA                            ]
[-] EMBL AI067830             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGTTTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTA TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAG                                  ]
[-] EMBL AI067326             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CGGAAGGACCCC TCTGTTTTATTATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAAT                                                                 ]
[-] EMBL AI067306             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     CTTNTA TATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAG                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL AI068184             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATGACACTTAAAGGAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTATCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAGACTTTA                            ]
[-] EMBL AI067016             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGGTAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAAGTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACGACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAAATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAG                                  ]


>consensus_9412#0 TCCTCCNAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGTTGATTTCTGATCCCCCCCGTTCCGAAAAG GTGGTCCTGTCCATGAATATGAAACATTTCAGAAAATTTTAAGCTTATCTTATACATTTG CCCCAAATTTTGATCCGATTGCAAAAGATTTAGTGGAAAAACTACTTGTAATTAGTCCCA GTGAACGCCTTGGTAGTCCTTCCTGTGGTGGGTCCATATCTGTTCGTCAACATATGTTTT TCTCTGAAATTAAATGGGATATCTTGCCGTACCAAGAACCTCCTTTACTAGTTCCAAACT TGGAACCAATTGCTCCTGAGGGTTGGGATAATCTGCCAGTTGGTTTTAACGAAGCAGAGA AATATCACTTGTCGCGTGAACTCGGTTTGTCTCCCTCTCAAATAACTGAAGATGATCGTA TTCGTTTATTAAATGCACAAGGAAAACATAATCCTTTCAATCGTTTCGTTCGCGGTCGTT TAATTTTAAAACAAGGTATATTGTTTAAGCGTCGAGGATTATTCGCAAGAAAGCGGATGT TTTTACTAACGGAAGGACCCCATCTCTTTTATATCGATGTTGAAAATATGACACTTAAAG GAGAAGTTGGATGGTCCGATTCGTTAACTGTTGAATTGAGAAGTAACAAATTATTTTTTA TCCATGTTCCAAATAAAACATATTATTTAGAAGACCCTTCTGGTCATGCTGACGATTGGG TAAAACAAATAACATCCGTCAAATCGCGATATTTTAAAGATACTCAAACTTTATGTTCAA GTGATCCGAGTACTTCGATCCACTTAGGCATTTAATTCCATGAAACTCTTTAGACAAACG ACTTATTTTTCTATTCAGTTAGGAATGTGGAAATAAAAAATTGTTTATTTTGTGTTAAAA ATCGTTTTAAAATGTGTACACTAAATTGTTATTTAGTGTTACAGACTTTAATCAGTTTTG TACAGTCAGAATTTACGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)