cluster # 9420

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9420 cluster # 9420 Sequences # 9 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9420#0 length = 724 sequences # 9
consensusID : consensus_9420#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 724
fasta sequence
                              [CAGGCCANAATTTGGCACGAGG-------CCGATGAAGCCAGCAGCAATGAAAAAATTCAGCACCAGTCATTCTTCTCCACTACCACCCAGTGACCCAGGAGCTCCTAAAAGATCAGTACCTGGACCAACTTCCCCTTGGCATTTTTTCGATCTCTTGTTGTTTTCGACTCTTCGACGACCGATGTTTATTGATCCGGCCATTAAAGCTGGAGTATATCTTTGCCTAGCTGCCGGTGTATCCCTTGTCTTCGACTTTGTGAGAGCTCCTCCGACTTACTTTTCTAATAAGCAAAATCCGTTCAATAGGTATTTCGTGAAATTGGGGTGGGCTTGGACATGTGGTTGCCTTGCAGCCTTTATAATCGTTTCTTCCTTTGTATATACGGCTGGTAATATTAAGCTTATGCGCGGGCATATTTTACGCTTGGTCGTTGGCTCTGGTTGCTGGTATACTGTTACTGGACTTATCAACTTAATTCACGATTGGTCTGGTCACTGTCATCCAGTATCGGTTACCTTGCCTAATGGACTCC-GTCCTAATCAACGAATATCATGTCACCGAGCTGGAGGTGTTTGGCTAGGATTTGATATATCGGGTCACTGCTTCCTGTTAATCATGTCCAATTTATGGATTATTGAAGAACTAAGTTGTATGCAACACTGGAACAAACTCTCTGAAATTCTGCAGCTGAATAAGAAGCACGAACCANACCAATCTACTAATACCAGT]

[+] EMBL CD080842             [CAGGCCANAATTTGGCACGAGG       CCGCTGAAGCCAGCAGCAATGAAAAAATTCAGCACCAGTCATTCTTCTCCACTACCACCCAGTGACCCAGGAGCTCCTAAAAGATCAGTACCTGGACCAACTTCCCCTTGGCATTTTTTCGATCTCTTGTTGTTTTCGACTCTTCGACGACCGATGTTTATTGATCCGGCCATTAAAGCTGGAGTATATCTTTGCCTAGCTGCCGGTGTATCCCTTGTCTTCGACTTTGTGAGAGCTCCTCCGACTTACTTTTCTAATAAGCAAAATCCGTTCAATAGGTATTTCGTGAAATTGGGGTGGGCTTGGACATGTGGTTGCCTTGCAGCCTTTATAATCGTTTCTTCCTTTGTATATACGGCTGGTAATATTAAGCTTATGCGCGGGCATATTTTACGCTTGGTCGTTGGCTCTGGTTGCTGGTATACTGTTACTGGACTTATCAACTTAATTCACGATTGGTCTGGTCACTGTCATCCAGTATCGGTTACCTTGCCTAATGGACTCC GTCCTAATCAACGAATATCATGTCACCGAGCTGGAGGTGTTTGGCTAGGATTTGATATATCGGGTCACTGCTTCCTGTTAATCATGTCCAATTTATGGATTATTGAAGAACTAAGTTGTATGCAACACTGGAACAAACTCTCTGAAATTCTGCAGCTGAATAAGAAGCACGAACCANACCAATCTACTAATACCAGT]
[+] EMBL CD083280             [gnaGCCAAGATTCGGCACGAGGCAATTTCCCGATGAAGCCAGCAGCAATGAAAAAATTCAGCACCAGTCATTCTTCTCCACTACCACCCAGTGACCCAGGAGCTCCTAAAAGATCAGTACCTGGACCAACTTCCCCTTGGCATTTTTTCGATCTCTTGTTGTTTTCGACTCTTCGACGACCGATGTTTATTGATCCGGCCATTAAAGCTGGAGTATATCTTTGCCTAGCTGCCGGTGTATCCCTTGTCTTCGACTTTGTGAGAGCTCCTCCGACTTACTTTTCTAATAAGCAAAATCCGTTCAATAGGTATTTCGTGAAATTGGGGTGGGCTTGGACATGTGGTTGCCTTGCAGCCTTTATAATCGTTTCTTCCTTTGTATATACGGCTGGTAATATTAAGCTTATGCGCGGGCATATTTTACGCTTGGTCGTTGGCTCTGGTTGCTGGTATACTGTTACTGGACTTATCAACTTAATTCACGATTGGTCTGGTCACTGTCATCCAGTATCGGTTACCTTGCCTAATGGACTCC GTCCTAATCAACGAATATCATGTCACCGAGCTGGAGGTGTTTGGCTAGGATTTGATATATCGGGTCACTGCTTCCTGTTAATCATGT                                                                                                              ]
[+] EMBL CD080471             [                     c       CCGATGAAGCCAGCAGCAATGAAAAAATTCAGCACCAGTCATTCTTCTCCACTACCACCCAGTGACCCAGGAGCTCCTAAAAGATCAGTACCTGGACCAACTTCCCCTTGGCATTTTTTCGATCTCTTGTTGTTTTCGACTCTTCGACGACCGATGTTTATTGATCCGGCCATTAAAGCTGGAGTATATCTTTGCCTAGCTGCCGGTGTATCCCTTGTCTTCGACTTTGTGAGAGCTCCTCCGACTTACTTTTCTAATAAGCAAAATCCGTTCAATAGGTATTTCGTGAAATTGGGGTGGGCTTGGACATGTGGTTGCCTTGCAGCCTTTATAATCGTTTCTTCCTTTGTATATACGGCTGGTAATATTAAGCTTATGCGCGGGCATATTTTACGCTTGGTCGTTGGCTCTGGTTGCTGGTATACTGTTACTGGACTTATCAACTTAATTCACGATTGGTCTGGTCACTGTCATCCAGTATCGGTTACCTTGCCTAATGGACTCC GTCCTAATCAACGAATATCATGTCACCGAGCTGGAGGTGTTTGGCTAGGATTTGATATATCGGGTCACTGCTTCCTGTTAATCATGTCCAATTTATGGATTATTGAAGAACTAAGTTGTATGCAACACTGGAACANACTCTCTGAAATTCTGCA                                           ]
[+] EMBL CD154835             [                                                                                    CACCCAGTGACCCAGGAGCTCCTAAAAGATCAGTACCTGGACCAACTTCCCCTTGGCATTTTTTCGATCTCTTGTTGTTTTCGACTCTTCGACGACCGATGTTTATTGATCCGGCCATTAAAGCTGGAGTATATCTTTGCCTAGCTGCCGGTGTATCCCTTGTCTTCGACTTTGTGAGAGCTCCTCCGACTTACTTTTCTAATAAGCAAAATCCGTTCAATAGGTATTTCGTGAAATTGGGGTGGGCTTGGACATGTGGTTGCCTTGCAGCCTTTATAATCGTTTCTTCCTTTGTATATACGGCTGGTAATATTAAGCTTATGCGCGGGCATATTTTACGCTTGGTCGTTGGCTCTGGTTGCTGGTATACTGTTACTGGACTTATCAACTTAATTCACGATTGGTCTGGTCACTGTCATCCAGTATCGGTTACCTTGCCTAATGGACTCC GTCCTAATCAACGAATATCATGTCACCGAGCTGGAGGTGTTTGGCTAGGATTTGATATATCGGGTCACTGCTTCCTGTTAATCATGTCCAATTTATGGATTATTGAAGAACTAA                                                                                   ]
[-] EMBL CD097576             [                                                                                                     GCTCCTAAAAGATCAGTACCTGGACCAACTTCCCCTTGGCATTTTTTCGATCTCTTGTTGTTTTCGACTCTTCGACGACCGATGTTTATTGATCCGGCCATTAAAGCTGGAGTATATCTTTGCCTAGCTGCCGGTGTATCCCTTGTCTTCGACTTTGTGAGAGCTCCTCCGACTTACTTTTCTAATAAGCAAAATCCGTTCAATAGGTATTTCGTGAAATTGGGGTGGGCTTGGACATGTGGTTGCCTTGCAGCCTTTATAATCGTTTCTTCCTTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD154629             [                                                                                                                                                                                      ATGTTTATTGATCCGGCCATTAAAGCTGGAGTATATCTTTGCCTAGCTGCCGGTGTATCCCTTGTCTTCGACTTTGTGAGAGCTCCTCCGACTTACTTTTCTAATAAGCAAAATCCGTTCAATAGGTATTTCGTGAAATTGGGGTGGGCTTGGACATGTGGTTGCCTTGCAGCCTTTATAATCGTTTCTTCCTTTGTATATACGGCTGGTAGTATTAAGCTTATGCGCGGGCATATTTTACGCTTGGTCGTTGGCTCTGGTTGCTGGTATACTGTTACTGGACTTATCAACTTAATTCACGATTGGTCTGGTCACTGTCATCCAGTATCGGTTACCTTGCCTAATGGACTCC GTCCTAATCAACGAATATCATGTCACCGAGCTGGAGGTGTTTGGCTAGGATTTGATATATCGGGTCACTGCTT                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD154392             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGCAGCCTTTATAATCGTTTCTTCCTTTGTATATACGGCTGGTAATATTAAGCTTATGCGCGGGCATATTTTACGCTTGGTCGTTGGCTCTGGTTGCTGGTATACTGTTACTGGACTTATCAACTTAATTCACGATTGGTCTGGTCACTGTCATCCAGTATCGGTTACCTTGCCTAATGGACTCC GTCCTAATCAACGAATATCATGTCACCGAGCTGGAGGTGTTTGGCTAGGATTTGATATATCGGGTCACTGCTTC                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD159118             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GCAGCCTTTATAGTCGTTTCTTCCTTTGTATATGCGGCTGGTAATATTAAGCTTATGCGCGGGCATATTTTACGCTTGGTCGTTGGCTCTGGTTGATGGTATGGTGTTACTGGTCTTATCAGTTTAATTCACGATTGGTCTGGTCACTGTCATCCAGTATCGGTTTCCTCGCGTAATGGACTCCTGTCTTAATCAACGAATATCATGTCTCCGAGCTGGAGGTGTTTGGATAGGATTTGATATATCGGGTCACTGTTTCCTGTTAATCATGTCCAATTTATGGATTATTGAAGAATTA                                                                                    ]
[-] EMBL CD199191             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CAACGAATATCATGTCACCGAGCTGGAGGTGTTTGGCTAGGATTTG  ATATCGGGTCACTGCTTCCTGTTAATCATGTACAATTTATGGATTATTGAAGACCTAAG                                                                                  ]




>consensus_9420#0
CAGGCCANAATTTGGCACGAGGCCGATGAAGCCAGCAGCAATGAAAAAATTCAGCACCAG
TCATTCTTCTCCACTACCACCCAGTGACCCAGGAGCTCCTAAAAGATCAGTACCTGGACC
AACTTCCCCTTGGCATTTTTTCGATCTCTTGTTGTTTTCGACTCTTCGACGACCGATGTT
TATTGATCCGGCCATTAAAGCTGGAGTATATCTTTGCCTAGCTGCCGGTGTATCCCTTGT
CTTCGACTTTGTGAGAGCTCCTCCGACTTACTTTTCTAATAAGCAAAATCCGTTCAATAG
GTATTTCGTGAAATTGGGGTGGGCTTGGACATGTGGTTGCCTTGCAGCCTTTATAATCGT
TTCTTCCTTTGTATATACGGCTGGTAATATTAAGCTTATGCGCGGGCATATTTTACGCTT
GGTCGTTGGCTCTGGTTGCTGGTATACTGTTACTGGACTTATCAACTTAATTCACGATTG
GTCTGGTCACTGTCATCCAGTATCGGTTACCTTGCCTAATGGACTCCGTCCTAATCAACG
AATATCATGTCACCGAGCTGGAGGTGTTTGGCTAGGATTTGATATATCGGGTCACTGCTT
CCTGTTAATCATGTCCAATTTATGGATTATTGAAGAACTAAGTTGTATGCAACACTGGAA
CAAACTCTCTGAAATTCTGCAGCTGAATAAGAAGCACGAACCANACCAATCTACTAATAC
CAGT
clustalw multiple alignements is not computed in this case