cluster # 9425

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Schistosoma mansoni
cluster # 9425 cluster # 9425 Sequences # 9 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9425#0 length = 606 sequences # 9
consensusID : consensus_9425#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 606
fasta sequence
                              [GGGGAAGAGAAAGGCAAGGGAGGCCCGACTATGACATGGCATCAACCTTTGAAG-TCATTGACTGACCTGAGTAGTAGGCTCAGGCTACTTGGTTGGGGTTAGAGTCGTCTTAGCCAACGGTTGCAGA-TGTTAAGTCACATGGTTCAGAACCGTTCACAGTGACATAGGTGCATTCATTCTTTGTCTTCCCCTAGATACCCAGTTTCTAAATAATATCATAAAATATTTTCCACTAATTCATATTTGCCTTTCAAGCCATAACTTCTATGCTTAATCTTCTCTATTACCAACAACGCTGTTACTGCCTGTAGTACTTTGAGATTTCCCTTGATAATTTCATGTCGCTATATGTGACTACTTAAACCGATGCAGACATGTTCCAGTTTCTACGTTGTGTATAACTGACAGACTAATTGGATATCGCACATATTTTCTTTGCTTAAGTTGAATTGTACAGTTGTTATTAAGAGGGGTTTATAAAATGTTCGCATTTAATCGAAGTAAGATTTGACAGCAGCTGGTGATAATACCGATAGATTCATATTAGACATGTATGTTCGGAGCATATTTTTTCAGAAAAGACAAAAATAACCTCATAATTTGAAT]

[+] EMBL CD085505             [GGGGAAGAGAAAGGCAAGGGAGGCCCGACTATGACATGGCACCAACCTTTGAAG TCATTGACTGACCTGAGTAGTAGGCTCAGGCTACTTGGTTGGGGTTAGAGTCGTCTTAGCCAACGGTTGCAGA TGTTAAGTCACATGGTTCAGAACCGTTCACAGTGACATAGGTGCATTCATTCTTTGTCTTCCCCTAGATACCCAGTTTCTAAATAATATCATAAAATATTTTCCACTAATTCATATTTGCCTTTCAAGCCATAACTTCTATGCTTAATCTTCTCTATTACCAACAACGCTGTTACTGCCTGTAGTACTTTGAGATTTCCCTTGATAATTTCATGTCGCTATATGTGACTACTTAAACCGATGCAGACATGTTCCAGTTTCTACGTTGTGTATAACTGACAGACTAATTGGATATCGCACATATTTTCTTTGCTTAAGTTGAATTGTACAGTTGTTATTAAGAGGGGTTTATAAAATGTTCGCATTTAATCGAAGTAAGATTTGACAGCAGCTGGTGATAATACCGATAGATTCATATTAGACATGTATGTTCGGAGCATATTCNTTCAGAANAGAC ACAATACCCTTATAtctta   ]
[+] EMBL CD085584             [                  GGAGGCCCGACTATGACATGGCATCAACCTTTGAAGCTCATTGACTGACCTGAGTAGTAGGCTCAGGCTACTTGGTTGGGGTTAGAGTCGTCTTAGCCAACGGTTGCAGA TGTTAAGTCACATGGTTCAGAACCGTTCACAGTGACATAGGTGCATTCATTCTTTGTCTTCCCCTAGATACCCAGTTTCTAAATAATATCATAAAATATTTTCCACTAATTCATATTTGCCTTTCAAGCCATAACTTCTATGCTTAATCTTCTCTATTACCAACAACGCTGTTACTGCCTGTAGTACTTTGAGATTTCCCTTGATAATTTCATGTCGCTATATGTGACTACTTAAACCGATGCAGACATGTTCCAGTTTCTACGTTGTGTATAACTGACAGACTAATTGGATATCGCACATATTTTCTTTGCTTAAGTTGAATTGTACAGTTGTTATTAAGAGGGGTTTATAAAATGTTCGCATTTAATCTAAGTAAGATTTGACAGCAGCTGGTGATAATACCGATAGATTCATATTAGACATGTATGTTCGGAGCATATTTTTTCAGAANAGACAAAAATAACCTCATAATTTGAA ]
[+] EMBL CD085458             [                  GGAGGCCCGACTATGACATGGCATCAACCTTTGAAG TCATTGACTGACCTGAGTAGTAGGCTCAGGCTACTTGGTTGGGGTTAGAGTCGTCTTAGCCAACGGTTGCAGA TGTTAAGTCACATGGTTCAGAACCGTTCACAGTGACATAGGTGCATTCATTCTTTGTCTTCCCCTAGATACCCAGTTTCTAAATAATATCATAAAATATTTTCCACTAATTCATATTTGCCTTTCAAGCCATAACTTCTATGCTTAATCTTCTCTATTACCAACAACGCTGTTACTGCCTGTAGTACTTTGAGATTTCCCTTGATAATTTCATGTCGCTATATGTGACTACTTAAACCGATGCAGACATGTTCCAGTTTCTACGTTGTGTATAACTGACAGACTAATCGGATATCGCACATATTTTCTTTGCTTAAGTTGAATTGTACAGTTGTTATTAAGAGGGGCTTATAAAATGTTCGCATTTAATCGAAGTAAGATTTGACAGCAGCTGGTGATAATACCGATAGATTCATATTACACATGTATGCTCGGAGCATATTTTTTCAGGAAAGACAAAAATAACCTCATAATTTGAA ]
[+] EMBL CD085589             [                  GGAGGCCCGACTATGACATGGCATCAACCTTTGAAG TCATTGACTGACCTGAGTAGTAGGCTCAGGCTACTTGGTTGGGGTTAGAGTCGTCTTAGCCAACGGTTGCAGA TGTTAAGTCACATGGTTCAGAACCGTTCACAGTGACATAGGTGCATTCATTCTTTGTCTTCCCCTAGATACCCAGTTTCTAAATAATATCATAAAATATTTTCCACTAATTCATATTTGCCTTTCAAGCCATAACTTCTATGCTTAATCTTCTCTATTACCAACAACGCTGTTACTGCCTGTAGTACTTTGAGATTTCCCTTGATAATTTCATGTCGCTATATGTGACTACTTAAACCGATGCAGACATGTTCCAGTTTCTACGTTGTGTATAACTGACAGACTAATTGGATATCGCACATATTTTCTTTGCTTAAGTTGAATTGTACAGTTGTTATTAAGAGGGGTTTATAAAATGTTCGCATTTAATCGAAGTAAGATTTGACAGCAGCTGGTGATAATACCGATAGATTCATATTAGACATGTATGTTCGGAGCATATTTTTTCAGAANAGACAAAAATAAC              ]
[+] EMBL CD085495             [                  GGAGGCCCGACTATGACATGGCATCAACCTTTGAAG TCATTGACTGACCTGAGTAGTAGGCTCAGGCTACTTGGTTGGGGTTAGAGTCGTCTTAGCCAACGGTTGCAGA TGTTAAGTCACATGGTTCAGAACCGTTCACAGTGACATAGGTGCATTCATTCTTTGTCTTCCCCTAGATACCCAGTTTCTAAATAATATCATAAAATATTTTCCACTAATTCATATTTGCCTTTCAAGCCATAACTTCTATGCTTAATCTTCTCTATTACCAACAACGCTGTTACTGCCTGTAGTACTTTGAGATTTCCCTTGATAATTTCATGTCGCTATATGTGACTACTTAAACCGATGCAGACATGTTCCAGTTTCTACGTTGTGTATAACTGACAGACTAATTGGATATCGCACATATTTNNTTTGGTTAcaactgc                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD085585             [                   GAGGCCCGACTATGACATGGCATCANCCTNTGAAG TCATTGACTGACCTGAGTAGTAGGCTCAGGCTACTTGG TGGGGTTAGAGTCGTCTTAGCCAACGGTTGCAGA TGTTAAGTCACATGGTTCAGAACCGTTCACAGTGACATAGGTGCATTCATTCTTTGTCTTCCCCTAGATACCCAGTTTCTAAATAATATCATAAAATATTTTCCACTAATTCATATTTGCCTTTCAAGCCATAACTTCTATGCTTAATCTTCTCTATTACCAACGACGCTGTTACTGCCTGTAGTACTTTGAGATTTCCCTTGATAATTTCATGTCGCTATATGTGACTACTTAAACCGATGCAGACATGTTCCAGTTTCTACGTTGTGTATAACTGACAGACTAATTGGATATCGCACATATTTTCTTTGCTTAAGTTGAATTGTACAGTTGTTATTAAGAGGGGTTTATAAAATGTTCGCATTTAATCGAAGTAAGATTTGACAGCAGCTGGTGATAATACCGATAGATTCANTNTAGACATGag                                                    ]
[-] EMBL CD085549             [                   GAGGCCGGACTATGACATGGCATCAACCTTNGAAG TCATTGACTGACCTGAGTAGTAGGCTCAGGCTACTTGGTTGGGGTTAGAGTCGTCTTAGCCAACGGTTGCAGA TGTTAAGTCACATGGTTCAGAACCGTTCACAGTGACATAGGTGCATTCATTCTTTGTCTTCCCCTAGATACCCAGTTTCTAAATAATATCATAAAATATTTTCCACTAATTCATATTTGCCTTTCAAGCCATAACTTCTATGCTTAATCTTCTCTATTACCAACAACGCTGTTACTGCCTGTAGTACTTTGAGATTTCCCTTGATAATTTCATGTCGCTATATGTGACTACTTAAACCGATGCAGACATGTTCCAGTTTCTACGTTGTGTATAACTGACAGACTAATTGGATATCGCACATATTTTCTTTGCTTAAGTTGAATTGTACAGTTGTTATTAAGAGGGGTTTATAAAATGTTCGCATTTAATCGAAGTAAGATTTGACAGCAGCTGGTGATAATACCGATAGATTCATATTAGACATGTATGTTCGGAGCATATTTTTTCAGAAAAGACAAAAATAACCTCATAATTTGAAT]
[-] EMBL CD085527             [                                           AACC TTGAAG TCATTGACTGACCTGAGTAGTAGGCCCAGGCTACTTGGTGGGGTTTAGAGTCGTCTTAGCCAACGGTTGCAGA TGTTAAGTCACATGGTTCAGAACCGTTCACAGTGACATAGGTGCATTCATTCTTTGTCTTCCCCTAGATACCCAGTTTCTAAATAATATCATAAAATATTTTCCACTAATTCATATTTGCCTTTCAAGCCATAACTTCTATGCTTAATCTTCTCTATTACCAACAACGCTGTTACTGCCTGTAGTACTTTGAGATTTCCCTTGATAATTTCATGTCGCTATATGTGACTACTTAAACCGATGCAGACATGTTCCAGTTTCTACGTTGTGTATAACTGACAGACTAATTGGATATCGCACATATTTTCTTTGCTTAAGTTGAATTGTACAGTTGTTATTAAGAGGGGTTTATAAAATGTTCGCATTTAATCGAAGTAAGATTTGACAGCAGCTGGTGATAATACCGATAGATTCATATTAGACATGTATGTTCGGAGCATATTTTTTCAGAAAAGACAAAAATAACCTCATAATTTGAAT]
[-] EMBL CD085571             [                                                        CATTGACTGACCTGAGTAGTAGGCTCAGGCTACTTGG TGGGGTTAGAGTCGTCTTAGCCAACGG TGCAGANTGTTAAGTCACATGGTTCAGAACCGTTCACAGTGACATAGGTGCATTCATTCTTTGTCTTCCCCCAGATACCCAGTTTCTAAATAATATCATAAAATATTTTCCACTAATTCATATTTGCCTTTCAAGCCATAACTTCTATGCTTAATCTTCTCTATTACCAACAACGCTGTTACTGCCTGTAGTACTTTGAGATTTCCCTTGATAATTTCATGTCGCTATATGTGACTACTTAAACCGATGCAGACATGTTCCAGTTTCTACGTTGTGTATAACTGACAGACTAATTGGATATCGCACATATTTTCTTTGCTTAAGTTGAATTGTACAGTTGTTATTAAGAGGGGTTTATAAAATGTTCGCATTTAATCGAAGTAAGATTTGACAGCAGCTGGTGATAATACCGATAGATTCATATTAGACATGTATGTTCGGAGCATATTTTTTCAGAAAAGACAAAAATAACCTCATAATTTGAAT]




>consensus_9425#0
GGGGAAGAGAAAGGCAAGGGAGGCCCGACTATGACATGGCATCAACCTTTGAAGTCATTG
ACTGACCTGAGTAGTAGGCTCAGGCTACTTGGTTGGGGTTAGAGTCGTCTTAGCCAACGG
TTGCAGATGTTAAGTCACATGGTTCAGAACCGTTCACAGTGACATAGGTGCATTCATTCT
TTGTCTTCCCCTAGATACCCAGTTTCTAAATAATATCATAAAATATTTTCCACTAATTCA
TATTTGCCTTTCAAGCCATAACTTCTATGCTTAATCTTCTCTATTACCAACAACGCTGTT
ACTGCCTGTAGTACTTTGAGATTTCCCTTGATAATTTCATGTCGCTATATGTGACTACTT
AAACCGATGCAGACATGTTCCAGTTTCTACGTTGTGTATAACTGACAGACTAATTGGATA
TCGCACATATTTTCTTTGCTTAAGTTGAATTGTACAGTTGTTATTAAGAGGGGTTTATAA
AATGTTCGCATTTAATCGAAGTAAGATTTGACAGCAGCTGGTGATAATACCGATAGATTC
ATATTAGACATGTATGTTCGGAGCATATTTTTTCAGAAAAGACAAAAATAACCTCATAAT
TTGAAT
clustalw multiple alignements is not computed in this case