cluster # 9445

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Schistosoma mansoni
cluster # 9445 cluster # 9445 Sequences # 9 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9445#0 length = 4119 sequences # 9
consensusID : consensus_9445#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
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fasta sequence
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[+] EMBL CD120185             [                                                                                                                                                                      TCATTAATAATAACAGTACTACTACTACTAATAATAATAGTAATATGAATGTAACTAATAATGTAGTAGTAACACCAGCCCATTTACTGACATTATTACCTGGAGCTATTCCACCGGAATCAACAAATTATTTCTATGGAAAAATTACACGTGAACAAGCTGAAGAATTGTTATTTACAAATGGAGCTAATGAAGGTTTATTTTTATTACGTGAATCAGTAAATAGAAATTATGCTGTATCTATATGTCATTTGGGTCGTGTACATCATTATAATGTTGAAAGACAAACAGATTGTTCATATAGAATTtc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD115259             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CATTATCGGATGGAAGAGTATTTATGCAGATGGACTATAGAAGGGGGACAGTATTTTGAAACTATGATGGAACTAATTGATCATTATCATTTTCGTCAAGATGGATTATTATGTAAATAACAGAAACCAATACCAGTATCGAATTTCACATGTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD190235             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        tatACCATCACCAGACTCGAATTTCACATGTTCACTTTCAGGTTCCGGTGGTATATCAAAAATTACAACAATAGATGATTTCAAGATTCCTATTATTTCCGATAAAAATCAACAGTATAAACCACAGACAATGACATCAAATAATTGGAATGGTAGTCATTCATTACCATCTCTTAATTCTATTCCAGTCACTGGAGTTAATCCATTTAACATTAATACTAATACTAATATACAATCTATAGTGAGTAATGGTGTAAATGATACAATAACCTCGAAAACAATAACAACGATGACCACTACTATTTCTAGTACCACTGCCACTACTACTATTACTACTACTACTACCTCTACTATTAACAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD166573             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AACAGACTTATTTCATCAAATCGTTTCATTCAAACATCCACAACAAAAGTTACAACAACAACAACAACACCACCGGTAGAATCATCCATGACTACACCATCAAATTCTAGTAATTTCACAAATGCTATGTTAATAGGATCTACACTTATACCACAAATGGCCTTATTTGATAGAGAAATAAATGAAGTTACTAAATTAATGAATGGACAAACTACATCCGTTAGTACTAATATACATAATACCACTATGAGTAATAATAATAACGTAAAAGATTCACGTGTTGGTTGTTTGAAACCGATCAGATTAAATGAACCATTAACAACAATGAGTAAAGCATTTGCTGAAGTAGACAATGCTATTGCACAAGTTGTATCAAATGCTTTCTCTTCTCCATCTACTAATAGACAATCAATATCACCGATAACTAGTACAATTACAACTGTGATAACAACTACCACTACGGTAATGACAACTATGATgcg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD155945             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TCGACATATTGTAAGATTAATTGGTGTATGTAAAGAGGATCAATTTATGCTTGTCCTTGAATTGGCGCCTTTAGGTCCAATTAATAAATATTTGAAAAAGCGCCCTGATGTCAGTGTGCATACGTTAACTGAATTGATGCATCAAGTTGCATTAGGTATGGCTTATTTGGAATCGTGTAAATTTGTACATCGAGATTTAGCTGCTCGTAATGTTCTATTGGTTACACGTCATTTCGCCAAGATTAGTGATTTTGGAATGAGTAAAGCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD155896             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACATCGAGATTTAGCTGCTCGTAATGTTCTATTGGTTACACGTCATTTCGCCAAGATTAGTGATTTTGGAATGAGTAAAGCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD117899             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTAGCTGCTCGTAATGTTCTATTGGTTACACGTCATTTCGCCAAGATTAGTGATTTTGGAATGAGTAAAGCATTGAATTTTGGTAGTGATTATTATCGGGCTGCAACGGCTGGGAAATGGCCTCTAAAATGGTATGCACCTGAATGTATATATTACTTTCGATTTGACTCAAAGTCTGATGTATGGAGTTATGGCATAACTNTATGGGAAGTTTACTCCTATGGTGAACGACCATATAGAGATATGAAAGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL SMRAP003             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACATCATTCTAAATTTAATATTCCAATCAAATAATGATTAGTGCACAATCAATGTAACAATACTTTACAACAGTCATCAGAGAAGRAAAGGAAACTTTCTTTTTACATAATTATTGGGTCAAAATGGATAACAGTTATCTTTTGCATATTTACAAACATTGCACATCTTACGTTTGTACATTTTGGG]




>consensus_9445#0
ATCGTCATGAGTCATTATCGTTGCGATGTTCGGATAATTTGTCTGCATAATTGTCAATAG
AATCTTGTTCACATTTATGCAGACTCATTTTCAAGTAAATGTTCCACCAGTTTGTACATT
AGTAAATAAACAACCAAGACAGTTGATCTCATGCATAACAATATTCTCATTAATAATAAC
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clustalw multiple alignements is not computed in this case