cluster # 9447

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Schistosoma mansoni
cluster # 9447 cluster # 9447 Sequences # 9 consensus # 2

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consensus_9447#0 length = 1262 sequences # 8

consensus_9447#1 length = 459 sequences # 1

consensusID : consensus_9447#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 1262
fasta sequence

                              [CTTCTCATGTGGCATGTGGTCGAGCACATACTATTATATCCTATGAAAATTTGAAGGAGTCGAATAGTGATACACCTCCTCTTGTTTTCAGCCTGGGCAACAATGTTTTTGGGCAGTGTGGGAGAGAAATAGTTCCTGGCGAAAAGTACGATCATGATATGGAAGTTATAACAAAAATAGTTTTGCCACCAGAAATAAAATCTATTAAACAATTAGTTTGTGGCCAAGATCATACCTTGTTGCTCAGTTCAGATGGTGTTGTTTATTCCTGTGGACTTGGATCAGATGGTCAGACTGGTTTGGGCCATTATAACGTGGTTGATCGATTTACTGCTGTAAAGGGTTCATTGATGAATGAACGTGTTTGTCTGCTATCATCTCGCGGTGATACTGTTCTTGCGCTTACTGAATCAAATAAATTATTTGCTTGGGGTAATAATGAATACGGTCAAATATGGCCATTAGATCAGGATATACAAGTTCCAGAACCTGTTCACTTAAATTTAGATCACTGTATTGTACCGATAGAATCTCATTTATCTTCAGATAATGTTCATGTAGGTGAAATACAATCAATTGCTTGTGCCGGTTCTATGTGTTGTATTGTGAATAAAATTGGACAGGTATTCGTTTGGGGCTTTGGATGCATTGGATTAGGTCCAAAAGTTACTTGTTCACCTCGTCCAACATTGATTCCACCTGGTTTATTTATGCCAGCTATTGTAAATAGTGAATCTTGTATTAATTATGTTGCTGCTGGTCTACATCATTTTATTGTTCAAAGTAATGATGGTTTATTATGGGCCTGGGGTGCTCCACGTGGTGGTCTATATTGTCTAGGCTTAGGTAAACAAATTACAAGTAATTCTGTTAATCAAACCTACCCAGTCTCATTACTTCTTCCAATTAAATCTAAAGATGTAGTATGCGGTGTTGATCATACTGTTGTGATTGGCAAATCGTTTGGTTAATATTTACTGATTACTCGTTGTTCATATATTATTTATTGTAAATATACAGACATTTCCTCACGAAACTAGTACTTTAACAAAAAAATTTCAGATATATATTTATATGTATACAATTGTACAGCGTGATAGTAAATTCGTTGAAAGAGTTCCCTTCGCTAAACTTCGTGTTTTTAATATATATGTACTGTAATTCTACCCTTCTGTATTACATAACTATTATTCAATAATTGTGCATTCGATAGTTCAGTCTGTATTGTATTATCCGCATTACAATTTTGTATAATAAAAATA]

[+] EMBL CD155083             [CTTCTCATGTGGCATGTGGTCGAGCACATACTATTATATCCTATGAAAATTTGAAGGAGTCGAATAGTGATACACCTCCTCTTGTTTTCAGCCTGGGCAACAATGTTTTTGGGCAGTGTGGGAGAGAAATAGTTCCTGGCGAAAAGTACGATCATGATATGGAAGTTATAACAAAAATAGTTTTGCCACCAGAAATAAAATCTATTAAACAATTAGTTTGTGGCCAAGATCATACCTTGTTGCTCAGTTCAGATGGTGTTGTTTATTCCTGTGGACTTGGATCAGATGGTCAGACTGGTTTGGGCCATTATAACGTGGTTGATCGATTTACTGCTGTAAAGGGTTCATTGATGAATGAACGTGTTTGTCTGCTATCATCTCGCGGTGATACTGTTCTTGCGCTTACTGAATCAAATAAATTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD155076             [CTTCTCATGTGGCATGTGGTCGAGCACATACTATTATATCCTATGAAAATTTGAAGGAGTCGAATAGTGATACACCTCCTCTTGTTTTCAGCCTGGGCAACAATGTTTTTGGGCAGTGTGGGAGAGAAATAGTTCCTGGCGAAAAGTACGATCATGATATGGAAGTTATAACAAAAATAGTTTTGCCACCAGAAATAAAATCTATTAAACAATTAGTTTGTGGCCAAGATCATACCTTGTTGCTCAGTTCAGATGGTGTTGTTTATTCCTGTGGACTTGGATCAGATGGTCAGACTGGTTTGGGCCATTATAACGTGGTTGATCGATTTACTGCTGTAAAGGGTTCATTGATGAATGAACGTGTTTGTCTGCTATCATCTCGCGGTGATACTGTTCTTGCGCTTACTGAATCAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD154926             [ TTCTCATGTGGCATGTGGTCGAGCACATACTATTATATCCTATGAAAATTTGAAGGAGTCGAATAGTGATACACCTCCTCTTGTTTTCAGCCTGGGCAACAATGTTTTTGGGCAGTGTGGGAGAGAAATAGTTCCTGGCGAAAAGTACGATCATGATATGGAAGTTATAACAAAAATAGTTTTGCCACCAGAAATAAAATCTATTAAACAATTAGTTTGTGGCCAAGATCATACCTTGTTGCTCAGTTCAGATGGTGTTGTTTATTCCTGTGGACTTGGATCAGATGGTCAGACTGGTTTGGGCCATTATAACGTGGTTGATCGATTTACTGCTGTAAAGGGTTCATTGATGAATGAACGTGTTTGTCTGCTATCATCTCGCGGTGATACTGTTCTTGCGCTTACTGAATCAAATAAATTATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD083604             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GGTTGATCGATTTACTGCTGTAAAGGGTTCATTGATGAATGAACGTGTTTGTCTGCTATCATCTCGCGGTGATACTGTTCTTGCGCTTACTGAATCAAATAAATTATTTGCTTGGGGTAATAATGAATACGGTCAAATATGGCCATTAGATCAGGATATACAAGTTCCAGAACCTGTTCACTTAAATTTAGATCACTGTATTGTACCGATAGAATCTCATTTATCTTCAGATAATGTTCATGTAGGTGAAATACAATCAATTGCTTGTGCCGGTTCTATGTGTTGTATTGTGAATAAAATTGGACAGGTATTCGTTTGGGGCTTTGGATGCATTGGATTAGGTCCAAAAGTTACTTGTTCACCTCGTCCAACATTGATTCCACCTGGTTTATTTATGCCAGCTATTGTAAATAGTGAATCTTGTATTAATTATGTTGCTGCTGGTCTACATCATTTTATTGTTCAAAGTAATGATGGTTTATTATGGGCCTGGGGTGCTCCACGTGGTGGTCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD078307             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTGAATAAAATTGGACAGGTATTCGTTTGGGGCTTTGGATGCATTGGATTAGGTCCAAAAGTTACTTGTTCACCTCGTCCAACATTGATTCCACCTGGTTTATTTATGCCAGCTATTGTAAATAGTGAATCTTGTATTAATTATGTTGCTGCTGGTCTACATCATTTTATTGTTCAAAGTAATGATGGTTTATTATGGGCCTGGGGTGCTCCACGTGGTGGTCTATATTGTCTAGGCTTAGGTAAACAAATTACAAGTAATTCTGTTAATCAAACCTACCCAGTCTCATTACTTCTTCCAATTAAATCTAAAGATGTAGTATGCGGTGTTGATCATACTGTTGTGATTGGCAAATCGTTTGGTTAATATTTACTGATTACTCGTTGTTCATATATTATTTATTGTAAATATACAGACATTTCCTCACGAAACTAGTACTTTAACAAAAAAATTTCAGATATATATTTATATGTATACAATTGTACAGCGTGATAGTAAATTCGTTGAAAGAGTTCCCTTCGCTAAACTTCGTGTTTTTAATATATATGTACTGTAATTCTACCCTTCTGTATTACATAACTATTATTCAATAATTGTGCATTCGATAGTTCAGTCTGTATTGTATTATCCGCATTACATTTTTGTATAATANAAATA]
[+] EMBL CD078395             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGCGAATAAAATTGGACAGGTATTCGTTTGGGGCTTTGGATGCATTGGATTAGGTCCAAAAGTTACTTGTTCACCTCGTCCAACATTGATTCCACCTGGTTTATTTATGCCAGCTATTGTAAATAGTGAATCTTGTATTAATTATGTTGCTGCTGGTCTACATCATTTTATTGTTCAAAGTAATGATGGTTTATTATGGGCCTGGGGTGCTCCACGTGGTGGTCTATATTGTCTAGGCTTACGTAAACAAATTACAAGTAATTCTGTTAATCAAACCTACCCAGTCTCATTACTTCTTCCAATTAAATCTAAAGATGTAGTATGCGGCGCTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD077115             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATTGGATTAGGTCCAAAAGTTACTTGTTCACCTCGTCCAACATTGATTCCACCTGGTTTATTTATGCCAGCTATTGTAAATAGTGAATCTTGTATTAATTATGTTGCTGCTGGTCTACATCATTTTATTGTTCAAAGTAATGATGGTTTATTATGGGCCTGGGGTGCTCCACGTGGTGGTCTATATTGTCTAGGCTTAGGTAAACAAATTACAAGTAATTCTGTTAATCAAACCTACCCAGTCTCATTACTTCTTCCAATTAAATCTAAAGATGTAGTATGCGGTGTTGATCATACTGTTGTGATTGGCAAATCGTTTGGTTAATATTTACTGATTACTCGTTGTTCATATATTATTTATTGTAAATATACAGACATTTCCTCACGAAACTAGTACTTTAACAAAAAAATTTCAGATATATATTTATATGTATACAATTGTACAGCGTGATAGTAAATTCGTTGAAAGAGTTCCCTTCGCTAAACTTCGTGTTTTTAATATATATGTACTGTAATTCTACCCTTCTGTATTACATAACTATTATTCAATAATTGTGCATTCGATAGTTCAGTCTGTATTGTATTATCCGCATTACAATTTTGTATAATAAAAAT ]
[-] EMBL CD072957             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACCTACCCAGTGTCATTACTTCTTCCAATTAAATCTAAAGATGTAGTATGCGGTGTTGATCATACTGTTGTGATTGGCAAATCGTTTGGTTAATATTTACTGATTACTCGTTGTTCATATATTATTTATTGTAAATATACAGACATTTCCTCACGAAACTAGTACTTTAACAAAAAAATTTCAGATATATATTTATATGTATACAATTGTACAGCGTGATAGTAAATTCGTTGAAAGAGTTCCCTTCGCTAAACTTCGTGTTTTTAATATATATGTACTGTAATTCTACCCTTCTGTATTACATAACTATTATTCAATAATTGTGCATTCGATAGTTCAGTCTGTATTGTATTATCCGCATTACAATTTTGTATAATAAAAATA]




>consensus_9447#0
CTTCTCATGTGGCATGTGGTCGAGCACATACTATTATATCCTATGAAAATTTGAAGGAGT
CGAATAGTGATACACCTCCTCTTGTTTTCAGCCTGGGCAACAATGTTTTTGGGCAGTGTG
GGAGAGAAATAGTTCCTGGCGAAAAGTACGATCATGATATGGAAGTTATAACAAAAATAG
TTTTGCCACCAGAAATAAAATCTATTAAACAATTAGTTTGTGGCCAAGATCATACCTTGT
TGCTCAGTTCAGATGGTGTTGTTTATTCCTGTGGACTTGGATCAGATGGTCAGACTGGTT
TGGGCCATTATAACGTGGTTGATCGATTTACTGCTGTAAAGGGTTCATTGATGAATGAAC
GTGTTTGTCTGCTATCATCTCGCGGTGATACTGTTCTTGCGCTTACTGAATCAAATAAAT
TATTTGCTTGGGGTAATAATGAATACGGTCAAATATGGCCATTAGATCAGGATATACAAG
TTCCAGAACCTGTTCACTTAAATTTAGATCACTGTATTGTACCGATAGAATCTCATTTAT
CTTCAGATAATGTTCATGTAGGTGAAATACAATCAATTGCTTGTGCCGGTTCTATGTGTT
GTATTGTGAATAAAATTGGACAGGTATTCGTTTGGGGCTTTGGATGCATTGGATTAGGTC
CAAAAGTTACTTGTTCACCTCGTCCAACATTGATTCCACCTGGTTTATTTATGCCAGCTA
TTGTAAATAGTGAATCTTGTATTAATTATGTTGCTGCTGGTCTACATCATTTTATTGTTC
AAAGTAATGATGGTTTATTATGGGCCTGGGGTGCTCCACGTGGTGGTCTATATTGTCTAG
GCTTAGGTAAACAAATTACAAGTAATTCTGTTAATCAAACCTACCCAGTCTCATTACTTC
TTCCAATTAAATCTAAAGATGTAGTATGCGGTGTTGATCATACTGTTGTGATTGGCAAAT
CGTTTGGTTAATATTTACTGATTACTCGTTGTTCATATATTATTTATTGTAAATATACAG
ACATTTCCTCACGAAACTAGTACTTTAACAAAAAAATTTCAGATATATATTTATATGTAT
ACAATTGTACAGCGTGATAGTAAATTCGTTGAAAGAGTTCCCTTCGCTAAACTTCGTGTT
TTTAATATATATGTACTGTAATTCTACCCTTCTGTATTACATAACTATTATTCAATAATT
GTGCATTCGATAGTTCAGTCTGTATTGTATTATCCGCATTACAATTTTGTATAATAAAAA
TA

consensusID : consensus_9447#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 459
fasta sequence

                              [GGCCATTATAACGTGGTTGATCGATTTACTGCTGTAAAGGGTTCATTGATGAATGAACGTGTTTGTCTGCTATCATCTCGCGGTGATACTGTTCTTGCGCTTACTGAATCAAATAAATTATTTGCTTCGGGGTAATAATGAATACGGTCAAATATGGCCATTAGATCAGGATATACAAGTTCCAGAACCTGTTCACTTAAATTTAGATCACTATAATGTTCATGTAGGTGAAATACAATCAATTGCTTAGTGCCGGTTCTATGTGTTGTATTGTGAATAAAATTGGACAGGTATTCGTTTGGGGCTTTGGATGCATTGGATCAGGTCCAAAAGTTACTTGTTCACCTCGTCCAACATTGATTCCACCTGGTTTATTTATGCCAGCTATTGTAAATAGTGAATCTTGTATTAATTATGTTGCTGCTGGTCAACATCATTTTATTGCTTCAAAGTAATGAT]

[-] EMBL CD159615             [GGCCATTATAACGTGGTTGATCGATTTACTGCTGTAAAGGGTTCATTGATGAATGAACGTGTTTGTCTGCTATCATCTCGCGGTGATACTGTTCTTGCGCTTACTGAATCAAATAAATTATTTGCTTCGGGGTAATAATGAATACGGTCAAATATGGCCATTAGATCAGGATATACAAGTTCCAGAACCTGTTCACTTAAATTTAGATCACTATAATGTTCATGTAGGTGAAATACAATCAATTGCTTAGTGCCGGTTCTATGTGTTGTATTGTGAATAAAATTGGACAGGTATTCGTTTGGGGCTTTGGATGCATTGGATCAGGTCCAAAAGTTACTTGTTCACCTCGTCCAACATTGATTCCACCTGGTTTATTTATGCCAGCTATTGTAAATAGTGAATCTTGTATTAATTATGTTGCTGCTGGTCAACATCATTTTATTGCTTCAAAGTAATGAT]




>consensus_9447#1
GGCCATTATAACGTGGTTGATCGATTTACTGCTGTAAAGGGTTCATTGATGAATGAACGT
GTTTGTCTGCTATCATCTCGCGGTGATACTGTTCTTGCGCTTACTGAATCAAATAAATTA
TTTGCTTCGGGGTAATAATGAATACGGTCAAATATGGCCATTAGATCAGGATATACAAGT
TCCAGAACCTGTTCACTTAAATTTAGATCACTATAATGTTCATGTAGGTGAAATACAATC
AATTGCTTAGTGCCGGTTCTATGTGTTGTATTGTGAATAAAATTGGACAGGTATTCGTTT
GGGGCTTTGGATGCATTGGATCAGGTCCAAAAGTTACTTGTTCACCTCGTCCAACATTGA
TTCCACCTGGTTTATTTATGCCAGCTATTGTAAATAGTGAATCTTGTATTAATTATGTTG
CTGCTGGTCAACATCATTTTATTGCTTCAAAGTAATGAT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9447#0      CTTCTCATGTGGCATGTGGTCGAGCACATACTATTATATCCTATGAAAATTTGAAGGAGT 60
consensus_9447#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9447#0      CGAATAGTGATACACCTCCTCTTGTTTTCAGCCTGGGCAACAATGTTTTTGGGCAGTGTG 120
consensus_9447#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9447#0      GGAGAGAAATAGTTCCTGGCGAAAAGTACGATCATGATATGGAAGTTATAACAAAAATAG 180
consensus_9447#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9447#0      TTTTGCCACCAGAAATAAAATCTATTAAACAATTAGTTTGTGGCCAAGATCATACCTTGT 240
consensus_9447#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9447#0      TGCTCAGTTCAGATGGTGTTGTTTATTCCTGTGGACTTGGATCAGATGGTCAGACTGGTT 300
consensus_9447#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9447#0      TGGGCCATTATAACGTGGTTGATCGATTTACTGCTGTAAAGGGTTCATTGATGAATGAAC 360
consensus_9447#1      --GGCCATTATAACGTGGTTGATCGATTTACTGCTGTAAAGGGTTCATTGATGAATGAAC 58
                        **********************************************************

consensus_9447#0      GTGTTTGTCTGCTATCATCTCGCGGTGATACTGTTCTTGCGCTTACTGAATCAAATAAAT 420
consensus_9447#1      GTGTTTGTCTGCTATCATCTCGCGGTGATACTGTTCTTGCGCTTACTGAATCAAATAAAT 118
                      ************************************************************

consensus_9447#0      TATTTGCTT-GGGGTAATAATGAATACGGTCAAATATGGCCATTAGATCAGGATATACAA 479
consensus_9447#1      TATTTGCTTCGGGGTAATAATGAATACGGTCAAATATGGCCATTAGATCAGGATATACAA 178
                      ********* **************************************************

consensus_9447#0      GTTCCAGAACCTGTTCACTTAAATTTAGATCACTGTATTGTACCGATAGAATCTCATTTA 539
consensus_9447#1      GTTCCAGAACCTGTTCACTTAAATTTAGATCACT-------------------------- 212
                      **********************************                          

consensus_9447#0      TCTTCAGATAATGTTCATGTAGGTGAAATACAATCAATTGCTT-GTGCCGGTTCTATGTG 598
consensus_9447#1      -------ATAATGTTCATGTAGGTGAAATACAATCAATTGCTTAGTGCCGGTTCTATGTG 265
                             ************************************ ****************

consensus_9447#0      TTGTATTGTGAATAAAATTGGACAGGTATTCGTTTGGGGCTTTGGATGCATTGGATTAGG 658
consensus_9447#1      TTGTATTGTGAATAAAATTGGACAGGTATTCGTTTGGGGCTTTGGATGCATTGGATCAGG 325
                      ******************************************************** ***

consensus_9447#0      TCCAAAAGTTACTTGTTCACCTCGTCCAACATTGATTCCACCTGGTTTATTTATGCCAGC 718
consensus_9447#1      TCCAAAAGTTACTTGTTCACCTCGTCCAACATTGATTCCACCTGGTTTATTTATGCCAGC 385
                      ************************************************************

consensus_9447#0      TATTGTAAATAGTGAATCTTGTATTAATTATGTTGCTGCTGGTCTACATCATTTTATTG- 777
consensus_9447#1      TATTGTAAATAGTGAATCTTGTATTAATTATGTTGCTGCTGGTCAACATCATTTTATTGC 445
                      ******************************************** ************** 

consensus_9447#0      TTCAAAGTAATGATGGTTTATTATGGGCCTGGGGTGCTCCACGTGGTGGTCTATATTGTC 837
consensus_9447#1      TTCAAAGTAATGAT---------------------------------------------- 459
                      **************                                              

consensus_9447#0      TAGGCTTAGGTAAACAAATTACAAGTAATTCTGTTAATCAAACCTACCCAGTCTCATTAC 897
consensus_9447#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9447#0      TTCTTCCAATTAAATCTAAAGATGTAGTATGCGGTGTTGATCATACTGTTGTGATTGGCA 957
consensus_9447#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9447#0      AATCGTTTGGTTAATATTTACTGATTACTCGTTGTTCATATATTATTTATTGTAAATATA 1017
consensus_9447#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9447#0      CAGACATTTCCTCACGAAACTAGTACTTTAACAAAAAAATTTCAGATATATATTTATATG 1077
consensus_9447#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9447#0      TATACAATTGTACAGCGTGATAGTAAATTCGTTGAAAGAGTTCCCTTCGCTAAACTTCGT 1137
consensus_9447#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9447#0      GTTTTTAATATATATGTACTGTAATTCTACCCTTCTGTATTACATAACTATTATTCAATA 1197
consensus_9447#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9447#0      ATTGTGCATTCGATAGTTCAGTCTGTATTGTATTATCCGCATTACAATTTTGTATAATAA 1257
consensus_9447#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9447#0      AAATA 1262
consensus_9447#1      -----