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consensusID : consensus_9451#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1691 fasta sequence [ACATTCTGGTTTAGTAACATGTCAATCAAATTGTCCACAGTATACTTGGCGAATAGATTTAATTAAAACAACCATTTTGGAAAGAATGGTTTTCTGGTTTGTCTAAACTATTTCTATCAATACCTGAACCAAAATTACTTCTATTAGCTGATGCTGATCGATTGGATAAAGATTTAACCATTGGGCAAATGCAAGGTAAATTTCAGGTTCAACTGTTCCCTCGCGCTGGTCATGCTGTTCAAGAGGATACTCCAGATAGAGTTGCGGAATGCCTGGCTAGATTTCTAGTACGCAATCGATTCACTGAAGCTCGGTCAGATTCTTGAACAATCAATATAGTATCTCACATCAAGATTATTGCTGAATTCAATTATTCAGTTTTCATATAACGTCGACTACACTTTCTTCACGACTGGACAATCGCTAGTTAGACATAGTTTGTGTATGTGTATACATAAAAGCTTTAATCATAGTATTTGTATAATTTCTTTTATAGAACCCTATATTCCATTGTTTCCCTCTTTCTCTCTCCTTATAGTATGACTATTCGAATTCAGTTTATTTCTGAAAATTAATTACTCAAAACGGCACTACAAAATTTCATGCCAAAATTAATTAATTGAACAAGAGAATAGATAGTTAATGCTCATTGTTTTTTTTGTTTAATTCTCCTCGTTATTAGTATCTATGTGTGTATATTTCCTTATGCATGGCATATATTTCAACTTTAATAATATTTTATTGTATGTGTAAAAGATTTCGTTTTATTCTGCTGTCAATTTTTTTTAAAATCCAAAAATGTAACTGACTATTTTTATTTGCTTGTTGATAACTTTTGTTTTCTCGTTTCTCCTTTTTCATTTGATATGATGATTCTTGTAGATTTTCGAGAGGTGTCATTATCACCAACTCTTCATTCATTCATGTATAGGTATGTAGCTTCTTCTTTC--TTTTTTTTCTTCGAAAAAAAGAGGACATTCAACTTTATCTTATTTTTCTCTTCTTTTGATTTTGTTTTCTCTAATAATTGACCGCGTCAATGTCATCGTGGAATCATATTGAATATTTTGGATTTTTCCTTTATTGAGCTAAAAAAACATCTTGAATGTGTACTCTAAGCTGAGGATAATGTTGAATTGCAAATATTCAGTTATTGTCGTTATCGTATTCCCTGTACAAAATTGTCTCTTTTTGGGATTTTTCCTCGGTTTTGGTAAATTAGAGATCTTCACAAGATAAAAGTGTGTTCATCAGTTTGCCACTAACTG-TTTTTTAATTCATAGTTATTGTTGTCATGTAGTTCTTTTTTAACATAGTTGTTTCCCTTTTTTAATGCTGGTGCCAACAACTTATATTATCGAGTCTATTGTTATTTGTTTCTGTGTGGTAATCAGTCACTTTAACTTTTTCTTTCTTGTTTACTTTGTGTTCTTACGTGTATGTGGTTGTTAATAAGATTCAGTGCGCCTATCTACTTTTTTATCCGATTTTTTTTCACACTGTTATTCTTCTTGTCTCTCTCTCTTGCTCTTATCTTTTCGATTCATGTATTTTTACAAAGAATATTTCTCACTGACAATCAAGATGAAGTGTTAATAAAACTAAAAATGCTAATTATTATCATCTTGTACTATTAAAATCCGTGTTTTTTTCTTTCTCATGTTGGTGGTTAACAAATAAAATTATGCCAT] 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blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 470 fasta sequence [GGAGTTCACTTAGTAGTAGGTAATTTAATTAATTCACTGATTTTAGTTTTTTTTTCTCTGTCGAATTAAAAACCAGGAAGCATTGGACAGCCGTTTCGTCCTGGTATGAAATTTCTTAGCACTGTTCATCCATGACTTTACTAAGAATCAATCCCTCATCGTTATACTTATAAAATTCATGTTAGTGTAATGATAAATCATTTCTTTTCAATAAATAATTTGTTATAAATTTCAAAATTTCTTTTGTTTCTAATCTGAATAATACCTACTAAATTTTTTCTTTAAATTTTTTAGTATCTCACATCAAGATTATTGCTGAATTCAATTATTCAGTTTTCATATAACGTCGACTACACTTTCTTCACGACTGGACAATCGCTAGTTAGACATAGTTTGTGTATGTGTATACATAAAAGCTTTAATCATAGTATTTGTATAATTTCTTTTATAGAACCCTATATTCCATTGTT] [-] EMBL AI975633 [GGAGTTCACTTAGTAGTAGGTAATTTAATTAATTCACTGATTTTAGTTTTTTTTTCTCTGTCGAATTAAAAACCAGGAAGCATTGGACAGCCGTTTCGTCCTGGTATGAAATTTCTTAGCACTGTTCATCCATGACTTTACTAAGAATCAATCCCTCATCGTTATACTTATAAAATTCATGTTAGTGTAATGATAAATCATTTCTTTTCAATAAATAATTTGTTATAAATTTCAAAATTTCTTTTGTTTCTAATCTGAATAATACCTACTAAATTTTTTCTTTAAATTTTTTAGTATCTCACATCAAGATTATTGCTGAATTCAATTATTCAGTTTTCATATAACGTCGACTACACTTTCTTCACGACTGGACAATCGCTAGTTAGACATAGTTTGTGTATGTGTATACATAAAAGCTTTAATCATAGTATTTGTATAATTTCTTTTATAGAACCCTATATTCCATTGTT] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||