cluster # 9457

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9457 cluster # 9457 Sequences # 9 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9457#0 length = 1857 sequences # 9
consensusID : consensus_9457#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1857
fasta sequence
                              [TATTATACAAACAATGTCTTGTCGACCTCAACTAATTGGCAGATCTCCTTTGGGACAGTTGAAGTCCGATGGATTATTAACATCGGGATGTAAATATCATTCATGTCAAGGAAAATTAACCATTCCAAATGTTTGTCAAGATTTGGAATTCTCAACTGAGGATCTTGTGGATGAAGGAGAAATTGGTCGAGGGGCATATGGATTTGTTAATCGTATGATGCATAGACCTACGAAAACAGTTATGGCAGTTAAGCGAATACGTCCAACATTAAATGAACGTGAACAAAGAAATACATTAAAAGATTTAGATGTTGTTATGAATTCAGCAAATTGTCCAAATATTGTTTTATTTTATGGTGCAATATTTACAGAAGGTGATTGTTGGATATGCATGGAAATGATGTCTACTTCATTAGATAAATTTTATAAATTTGTTTATAATTATTTACAATCAAGAATACCTGAAAGTGTTATTGGGAAAATTACTACAGCTACTGTTTCAGCTCTCGATTACTTGAAAACTGCTCTTAAAGTCATACACCGAGATGTAAAACCATCAAATATTCTAATCGATTGTGACGGTAATGTGAAATTATGTGACTTTGGTATATCTGGTCAGTTGGTCGATAGTATTGCTCGATCACGTGATGCTGGTTGTAAACCGTATATGGCGCCAGAACGTATTCATCCAGAGTTAAGCGCTAATGGCTATGATATACGCTCAGATGTATGGAGTTTAGGTATTACCTTGATTGAATTATCTACTGGACAATTTCCTTATCCAGCATGGAATTCCGTATTTGAACAACTCACTTGTGTATTACATAATGATCCACCTAGTTTACCGGAATACTTACCANAATCTATTCAAACTTCATCATCAACTACAACCCTTGTCAATATTGAATATTCCAATCATTCTATAAGTAATAATTCANATGAATCTTGTTCATCAACAACAGATTTTTCATCTGAATTTCGTGATTTTGTCTCACAGTGCTTAGAGAAAGATGTGAGATGTCGACCGAAA-TATCAAGCACTTATGCATCATCCATTTTATTTACGCTCACTAACTGAAGTTATTGATGTTGGAAAATATTNTCAATCGATATTAGATAAAGTTCCTCCTCATATAAATATGAATGAATTAAGTCAGACTAACAGTTGATATTTATTTATATGATCTATGATTGTCTATTTGTATCATTCCAGTCATATCGTATTTACTCAAATTATATTTATCTATCTATCTATGTATATTGTTTGAAAGAGATTTTACCGCGTAAAGTAAGACCCCTTTTTCGGTTTTAAATTTCGCGCTGTGCAAATTACTTTAGATAAACACTGAAATTAACTTTGTTTCATATTACATTTTCATTGTTGCAAGTGATCTGTGTGTGTATACGTGGATTCATCTGAGTGCTTATACATAGAGTTTATATGTGGAGCGAATCACTCTCTTTATTTCTGGTTGCTTTCTTCATTTTTCCTGGGGGGAACCGGTTTCATTTATTTTTCATTATTACCTTTTTCTTATTGTATAAATTTAGATATATGTTCAGATATTACTTATGAATATATGTGCAATTCTATGATAAGTAGTATAATAGTAGTATTATCATAACCTATTATTTTTTAGGACTGTTTGATTTTCTGTATACGTACGTGCTTGCGTATCTGAACAATTTCTTGGTTTATTTGGCTGTGATAATCGGGTTTCTGTTAATCTGTCGCTCTTAGAGATACAGGCGCCATCATTATGTAATCCCATTACTGTTATACCAATATTATTATTATTATTATAGATGTCATAATCATGACCTTTAATTATCGTGTTTTACAAGTTATATAAATCTT]

[-] EMBL CD119278             [TATTATACAAACAATGTCTTGTCGACCTCAACTAATTGGCAGATCTCCTTTGGGACAGTTGAAGTCCGATGGATTATTAACATCGGGATGTAAATATCATTCATGTCAAGGAAAATTAACCATTCCAAATGTTTGTCAAGATTTGGAATTCTCAACTGAGGATCTTGTGGATGAAGGAGAAATTGGTCGAGGGGCATATGGATTTGTTAATCGTATGATGCATAGACCTACGAAAACAGTTATGGCAGTTAAGCGAATACGTCCAACATTAAATGAACGTGAACAAAGAAATACATTAAAAGATTTAGATGTTGTTATGAATTCAGCAAATTGTCCAAATATTGTTTTATTTTATGGTGCAATATTTACAGAAGGTGATTGTTGGATATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD078303             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGAATTCAGCAAATTGTCCAAATATTGTTTTATTTTATGGTGCAATATTTACAGAAGGTGATTGTTGGATATGCATGGAAATGATGTCTACTTCATTAGATAAATTTTATAAATTTGTTTATAATTATTTACAATCAAGAATACCTGAAAGTGTTATTGGGAAAATTACTACAGCTACTGTTTCAGCTCTCGATTACTTGAAAACTGCTCTTAAAGTCATACACCGAGATGTAAAACCATCAAATATTCTAATCGATTGTGACGGTAATGTGAAATTATGTGACTTTGGTATATCTGGTCAGTTGGTCGATAGTATTGCTCGATCACGTGATGCTGGTTGTAAACCGTATATGGCGCCAGAACGTATTCATCCAGAGTTAAGCGCTAATGGCTATGATATACGCTCAGATGTATGGAGTTTAGGTATTACCTTGATTGAATTATCTACTGGACAATTTCCTTATCCAGCATGGAATTCCGTATTTGAACAACTCACTTGTGTATTACATAATGATCCACCTAGTTTACCGGAATACTTACCANAATCTATTCAAACTTCATCATCAACTACAACCCTTGTCAATATTGAATATTCCAATCATTCTATAAGTAATAATTCAN                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD078391             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TGAATTCAGCAAATTGTCCAAATATTGTTTTATTTTATGGTGCAATATTTACAGAAGGTGATTGTTGGATATGCATGGAAATGATGTCTACTTCATTAGATAAATTTTATAAATTTGTTTATAATTATTTACAATCAAGAATACCTGAAAGTGTTATTGGGAAAATTACTACAGCTACTGTTTCAGCTCTCGATTACTTGAAAACTGCTCTTAAAGTCATACACCGAGATGTAAAACCATCAAATATTCTAATCGATTGTGACGGTAATGTGAAATTATGTGACTTTGGTATATCTGGTCAGTTGGTCGATAGTATTGCTCGATCACGTGATGCTGGTTGTAAACCGTATATGGCGCCAGAACGTATTCATCCAGAGTTAAGCGCTAATGGCTATGATATACGCTCAGATGTATGGAGTTTAGGTATTACCTTGATTGAATTATCTACTGGACAATTTCCTTATCCAGCATGGAATTCCGTATTTGAACAACTCACTTGTGTATTACATAATGATCCACCTAGTTTACCGGAATACTTACCANNATCTATTCANACTTCATCATCAACTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL BG931341             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTCTACTTCATTAGATAAATTTTATAAATTTGTTTATAATTATTTACAATCAAGAATACCTGAAAGTGTTATTGGGAAAATTACTACAGCTACTGTTTCAGCTCTCGATTACTTGAAAACTGCTCTTAAAGTCATACACCGAGATGTAAAACCATCAAATATTCTAATCGATTGTGACGGTAATGTGAAATTATGTGACTTTGGTATATCTGGTCAGTTGGTCGATAGTATTGCTCGATCACGTGATGCTGGTTGTAAACCGTATATGGCGCCAGAACGTATTCATCCAGAGTTAAGCGCTAATGGCTATGATATACGCTCAGATGTATGGAGTTTAGGTATTACCTTGATTGAATTATCTACTGGACAATTTCCTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD128151             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGACTTTGGTATATCTGGTCAGTTGGTCGACAGTATTGCTCGATCACGTGATGCTGGTTGTAAACCGTATATGGCGCCAGAACGTATTCATCCAGAGTTAAGCGCTAATGGCTATGATATACGCTCAGATGTATGGAGTTTAGGTATTACCTTGATTGAATTATCTACTGGACAATTTCCTTATCCAGCATGGAATTCCGTATTTGAACAACTCACTTGTGTATTACATAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD195662             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTCAAACTTCATCATCAACTACAACCCTTGTCAATATTGAATATTCCAATCATTCTATAAGTAATAATTCAAATGAATCTTGTTCATCAACAACAGATTTTTCATCTGAATTTCGTGATTTTGTCTCACAGTGCTTAGAGAAAGATGTGAGATGTCGACCGAAA TATCAAGCACTTATGCATCATCCATTTTATTTACGCTCACTAACTGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD072953             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAAANTATCAAGCACTTATGCATCATCCATTTTATTTACGCTCACTAACTGAAGTTATTGATGTTGGAAAATATTNTCAATCGATATTAGATAAAGTTCCTCCTCATATAAATATGAATGAATTAAGTCAGACTAACAGTTGATATTTATTTATATGATCTATGATTGTCTATTTGTATCATTCCAGTCATATCGTATTTACTCAAATTATATTTATCTATCTATCTATGTATATTGTTTGAAAGAGATTTTACCGCGTAAAGTAAGACCCCTTTTTCGGTTTTAAATTTCGCGCTGTGCAAATTACTTTAGATAAACACTGAAATTAACTTTGTTTCATATTACATTTTCATTGTTGCAAGTGATCTGTGTGTGTATACGTGGATTCATCTGAGTGCTTATACATAGAGTTTATATGTGGAGCGAATCACTCTCTTTATTTCTGGTTGCTTTCTTCATTTTTCCTGGGGGGAACCGGTTTCATTTATTTTTCATTATTACCTTTTTCTTATTGTATAAATTTAGATATATGTTCAGATATTACTTATGAATATATGTGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL AI740233             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTCCGGCGTAAAGTAAGACCCCTTTTTCGG TTAAAATTTCGCGCTGTGCAAATTACTTTAGATAACCACTGAAATTAACTTTGTTTCATATTACATTTTCATTGTTGCAAGTGATCTGTGTGTGTATACGTGGATTCATCTGAGTGCTTATACATAGAGTTTATATGTGGAGCGAATCACTCTCTTTATTTCTGGTGGCTTTCTTCATTTTTCCTGGGGGGAACCGGTTTCATTTATTTTTCATTATTACCTTTTTCTTATTGTATAAATTTAGATATATGTTCAGATATTACTTATGAATATATGTGCAATTCTATGATAAGTAGTATAATAGTAG                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL AI975905             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTCGCGCTGTGCAAATTACNTTAGATAAACACTAAAATTAACTTTGTTTCATATTACATTTTCATTGTTGCAAGTGATCTGTGTGTGTATACGTGGATTCATCTGAGTGCTTATACATAGAGTTTATATGTGGAGCGAATCACTCTCTTTATTTCTGGTTGCTTTCTTCATTTTTCCTGGGGGGAACCGGTTTCATTTATTTTTCATTATTACCTTTTTCTTATTGTATAAATTTAGATATATGTTCAGATATTACTTATGAATATATGTGCAATTCTATGATAAGTAGTATAATAGTAGTATTATCATAACCTATTATTTTTTAGGACTGTTTGATTTTCTGTATACGTACGTGCTTGCGTATCTGAACAATTTCTTGGTTTATTTGGCTGTGATAATCGGGTTTCTGTTAATCTGTCGCTCTTAGAGATACAGGCGCCATCATTATGTAATCCCATTACTGTTATACCAATATTATTATTATTATTATAGATGTCATAATCATGACCTTTAATTATCGTGTTTTACAAGTTATATAAATCTT]




>consensus_9457#0
TATTATACAAACAATGTCTTGTCGACCTCAACTAATTGGCAGATCTCCTTTGGGACAGTT
GAAGTCCGATGGATTATTAACATCGGGATGTAAATATCATTCATGTCAAGGAAAATTAAC
CATTCCAAATGTTTGTCAAGATTTGGAATTCTCAACTGAGGATCTTGTGGATGAAGGAGA
AATTGGTCGAGGGGCATATGGATTTGTTAATCGTATGATGCATAGACCTACGAAAACAGT
TATGGCAGTTAAGCGAATACGTCCAACATTAAATGAACGTGAACAAAGAAATACATTAAA
AGATTTAGATGTTGTTATGAATTCAGCAAATTGTCCAAATATTGTTTTATTTTATGGTGC
AATATTTACAGAAGGTGATTGTTGGATATGCATGGAAATGATGTCTACTTCATTAGATAA
ATTTTATAAATTTGTTTATAATTATTTACAATCAAGAATACCTGAAAGTGTTATTGGGAA
AATTACTACAGCTACTGTTTCAGCTCTCGATTACTTGAAAACTGCTCTTAAAGTCATACA
CCGAGATGTAAAACCATCAAATATTCTAATCGATTGTGACGGTAATGTGAAATTATGTGA
CTTTGGTATATCTGGTCAGTTGGTCGATAGTATTGCTCGATCACGTGATGCTGGTTGTAA
ACCGTATATGGCGCCAGAACGTATTCATCCAGAGTTAAGCGCTAATGGCTATGATATACG
CTCAGATGTATGGAGTTTAGGTATTACCTTGATTGAATTATCTACTGGACAATTTCCTTA
TCCAGCATGGAATTCCGTATTTGAACAACTCACTTGTGTATTACATAATGATCCACCTAG
TTTACCGGAATACTTACCANAATCTATTCAAACTTCATCATCAACTACAACCCTTGTCAA
TATTGAATATTCCAATCATTCTATAAGTAATAATTCANATGAATCTTGTTCATCAACAAC
AGATTTTTCATCTGAATTTCGTGATTTTGTCTCACAGTGCTTAGAGAAAGATGTGAGATG
TCGACCGAAATATCAAGCACTTATGCATCATCCATTTTATTTACGCTCACTAACTGAAGT
TATTGATGTTGGAAAATATTNTCAATCGATATTAGATAAAGTTCCTCCTCATATAAATAT
GAATGAATTAAGTCAGACTAACAGTTGATATTTATTTATATGATCTATGATTGTCTATTT
GTATCATTCCAGTCATATCGTATTTACTCAAATTATATTTATCTATCTATCTATGTATAT
TGTTTGAAAGAGATTTTACCGCGTAAAGTAAGACCCCTTTTTCGGTTTTAAATTTCGCGC
TGTGCAAATTACTTTAGATAAACACTGAAATTAACTTTGTTTCATATTACATTTTCATTG
TTGCAAGTGATCTGTGTGTGTATACGTGGATTCATCTGAGTGCTTATACATAGAGTTTAT
ATGTGGAGCGAATCACTCTCTTTATTTCTGGTTGCTTTCTTCATTTTTCCTGGGGGGAAC
CGGTTTCATTTATTTTTCATTATTACCTTTTTCTTATTGTATAAATTTAGATATATGTTC
AGATATTACTTATGAATATATGTGCAATTCTATGATAAGTAGTATAATAGTAGTATTATC
ATAACCTATTATTTTTTAGGACTGTTTGATTTTCTGTATACGTACGTGCTTGCGTATCTG
AACAATTTCTTGGTTTATTTGGCTGTGATAATCGGGTTTCTGTTAATCTGTCGCTCTTAG
AGATACAGGCGCCATCATTATGTAATCCCATTACTGTTATACCAATATTATTATTATTAT
TATAGATGTCATAATCATGACCTTTAATTATCGTGTTTTACAAGTTATATAAATCTT
clustalw multiple alignements is not computed in this case