cluster # 9458

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Schistosoma mansoni
cluster # 9458 cluster # 9458 Sequences # 9 consensus # 2

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consensus_9458#0 length = 668 sequences # 8

consensus_9458#1 length = 660 sequences # 1

consensusID : consensus_9458#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 668
fasta sequence

                              [GCAACTTAAAATTAAAGACTAACAGATGAACTAAATTGA-AAAAGATTAAAGAAGAAACACAGAAATAATAAAACAGTATTCACAAACAAAATG-AAATAA-AGTAAAACTCATATTATTGAAAACATTAAAATGACTACTGATTAAAATAAAAAACAAGTGAGTAGTATATGATTGACGAAGGTTTCCGATTTGTTCAAATCCAATTGTCACATAATACTGATTAAATAACATACACGATGAAAAAAAAGAAATCG-AAAAAAAACAAGAAAACAAGAAGACACAACATAAATGCAAACAACATTTGATAAAACTAGAAAAAATAATCGTAAAATATACAAAAATGATACAATGGAAGAAATGTACTTAACATTTAAAATTGAACAAGTGAATAAACATAAATAAATGCAATAAAACAAATAGCATTTATTTGAAATGATTAAAACAAACTTTGAGTGTGAAATGGAGCACCATTTTAAAAAGAATGGAAGATATTGAAACTTGAATGAGGTTTACTTTATTCACCACTGTTTATCAGATGTGATTGTAAGAAGGAAAGTGAGTAGAGTAGAGTAGATAGAAAGCTCCAATAAAAGGTATTTTTGTTGTT--AAGTGATTTCATATTTCCAACTCGTGATTATTAATGTAACTAATGATTAGGTAGCTAGTTA]

[+] EMBL CD140428             [GCAACTTAAAATTAAAGACTAACAGATGAACTAAATTGA AAAAGATTAAAGAAGAAACACAGAAATAATAAAACAGTATTCACAAACAAAATG AAATAA AGTAAAACTCATATTATTGAAAACATTAAAATGACTACTGATTAAAATAAAAAACAAGTGAGTAGTATATGATTGACGAAGGTTTCCGATTTGTTCAAATCCAATTGTCACATAATACTGATTAAATAACATACACGATGAAAAAAAAGAAATCGAAAAAAAAACAAGAAAACAAGAAGACACAACATAAATGCAAACAACATTTGATAAAACTAGAAAAAATAATCGTAAAATATACAAAAATGATACAATGGAAGAAATGTACTTAACATTTAAAATTGAACAAGTGAATAACCA                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD140458             [GCAACTTATAATTAAAGACTAACAGAT AACTAAATTGA AAAAGATTAAAGAAGAAACACAGAAATAATAAAACAGTATTCACAAACAAAATG AAATAA AGTAAAACTCATATTATTGAAAACATTAAAATGACTACTGATTAAAATAAAAAACAAGTGAGTAGTATATGATTGACGAAGGTTTCCGATTTGTTCAAATCCAATTGTCACATAATACTGATTAAATAACATACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD140365             [GCAACTTAAAATTAAAGACTAACAGATGAACTAAATTGA AAAAGATTAAAGAAGAAACACAGAAATAATAAAACAGTATTCACAAACAAAATG AAATAA AGTAAAACTCATATTATTGAAAACATTAAAATGACTACTGATTAAAATAAAAAACAAGTGAGTAGTATATGATTGACGAAGGTTTCCGATTTGTTCAAATCCAATTGTCACATAATACTGATTAAATAACATACACGATGAAAAAAAAGAAATCGAAAAAAAAACAAGAAAACAAGAAGACACAACATAAATGCAAACAACATTTGATAAAACTAGAAAAAATAATCGTAAAATATACAAAAATGATACAATGGAAGAAATGTACTTAACATTTAAAATTGAACAAGTGAATAAACATTAATTAATGCGATAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD196485             [GCAACTTAAAATTAAAGACTAACAGAT AACTAAATTGA AAAAGATTAAAGAAGAAACACAGAAATAATAAAACAGTATTCACAAACAAAATG AAATAA AGTAAAACTCATATTATTGAAAACATTAAAATGACTACTGATTAAAATAAAAAACAAGTGAGTAGTATATGATTGACGAAGGTTTTCGATTTGTTCAAATCCAATTGTCACATAATACTGATTAAATAACATACACGATGAAAAAAAAGAAATCG AAAAAAAACAAGAAAACAAGAAGACACAACATAAATGCAAACAACATTTGATAAAACTAGAATAAATAATCGTAAAATATACAAAAATGATACAATGGAAGAAATGTACTTAACATTTAAAATTGAACAAGTGAATAAACATAAATAAATGCAATAAAACAAATAGCATTTAT                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD196734             [      TAAAATTAAAGACTAACAGATGAACTAAATTGA AAAAGATTAAAGAAGAAACACAGAAATAATAAAACAGTATTCACAAACAAGATG AAATAA AGTAAAACTCATATTATTGAAAACATTAAAATGACTACTGATTAAAATAAAAAACAAGTGAGTAGTATATGATTGACGAAGGTTTCCGATTTGTTCAAATCCAATTGTCACATAATACTGATTAAATAACATACACGATGAAAAAAAAGAAATCG AAAAAAAACAAGAAAACAAGAAGACACAACATTAATGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD140483             [  cttcttattTTTAAGATTAACTCAT AACTGGCTTGAGATAAGATTATAGAAGAAACATAGAAATAATAAAACAGTATTCACAATCAAGATGTACATAATAGTATAACTCATATTATTGATAACATTATAATGACTACTGATTAAAATAAAAAACTAGTGAGTAGTATATGATTGACGAAGGTTTCCGATTTGTTCAAATCCAATTGTCACATAATACTGATTAAATAACATACACGATG AAAAAAAGAAGTCG AAAAAAAACAAGAAAACAAGAAGACACAACATAAATGCAAACAACATTTGATAAAACTAGAAAAAATAATCGTAAAATATACAAAAATGATACAATGGAAGAAATGTACTTAACATTTAAAATTGAACAAGTGAATAAACATAAATAAATGCCATAAAACAAATAGCATTTATTTGAAATGATTAAAACAAACTTTGAGTGTG                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD196476             [                                                                                                                                                                              TTGACGAAGGTTTCCGATTTGTTCAAATCCAATTGTCACATAATACTGATTAAATAACATACACGATGAAAAAAAAGAAATCG AAAAAAAACAAGAAAACAAGAAGACACAACATAAATGCAAACAACATTTGATAAAACTAGAAAAAATAATCGTAAAATATACAAAAATGATACAATGGAAGAAATGTACTTAACATTTAAAATTGAACAAGTGAATAAACATAAATAAATGCAATAAAACAAATAGCATTTATTTGAAATGATTAAAACAAACTTTGAGTGTGAAATGGAGCACCATTTTAAAAAGAATGGAAGATATTGAAACTTGAATGAGGTTTACTTTATTCACCACTGTTTATCAGATGTGATTGTAAGAAGGAAAGTGAGTAGAGTAGAGTAGATAGAAAGCTCCAATAAAAGGTATTTTTGTTGTT  AAGTGATTTCATATTTCCAACTCGTGATTATTAATGTAACTAATGATTAGGTAGCTAGTTA]
[-] EMBL CD140477             [                                                                                                                                                                                                                                                   AAAAAAAGAAATCG AAAAAAAACAAGAAAACAAGAAGACACAACATAAATGCAAACAACATTTGATAAAACTAGAAAAAATAATCGTAAAATATACAAAAATGATACAATGGAAGAAATGTACTTAACATTTAAAATTGAACAAGTGAATAAACATAAATAAATGCAATAAAACAAATAGCATTTATTTGAAATGATTAAAACAAACTTTGAGTGTGAAATGGAGCACCATTTTAAAAAGAATGGAAGATATTGAAACTTGAATGAGGTTTACTTTATTCACCACTGTTTATCAGATGTGATTGTAAGAAGGAAAGTGAGTAGAGTAGAGTAGATAGAAAGCTCCAATAAAAGGTATTTTTGTTGTTAAAAGTGATTTCATATTTCCAACTCATGATTATTAATGTAACTAATGATTAGATAGCTAGTTA]




>consensus_9458#0
GCAACTTAAAATTAAAGACTAACAGATGAACTAAATTGAAAAAGATTAAAGAAGAAACAC
AGAAATAATAAAACAGTATTCACAAACAAAATGAAATAAAGTAAAACTCATATTATTGAA
AACATTAAAATGACTACTGATTAAAATAAAAAACAAGTGAGTAGTATATGATTGACGAAG
GTTTCCGATTTGTTCAAATCCAATTGTCACATAATACTGATTAAATAACATACACGATGA
AAAAAAAGAAATCGAAAAAAAACAAGAAAACAAGAAGACACAACATAAATGCAAACAACA
TTTGATAAAACTAGAAAAAATAATCGTAAAATATACAAAAATGATACAATGGAAGAAATG
TACTTAACATTTAAAATTGAACAAGTGAATAAACATAAATAAATGCAATAAAACAAATAG
CATTTATTTGAAATGATTAAAACAAACTTTGAGTGTGAAATGGAGCACCATTTTAAAAAG
AATGGAAGATATTGAAACTTGAATGAGGTTTACTTTATTCACCACTGTTTATCAGATGTG
ATTGTAAGAAGGAAAGTGAGTAGAGTAGAGTAGATAGAAAGCTCCAATAAAAGGTATTTT
TGTTGTTAAGTGATTTCATATTTCCAACTCGTGATTATTAATGTAACTAATGATTAGGTA
GCTAGTTA

consensusID : consensus_9458#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 660
fasta sequence

                              [GGGCGCCCGGATGTAAACCTTTCCACCCCATGGTTAAGAAACCATTTTTGAACCTTAATGCTCCTGTTAATAAAAACAATGAGTGTTATGATGACGAGGTTCCGATTGTCAATCAATTGCACATATACTGCTTAATACTCCCGATGAAAAAAGAATCGAAAAAACAGAAACAGGAGGCCCACCTAATGCAACACATTGATAAACTCGAAAAATATCGTAAATTTACAAAATGATACATGGAGAAAGTACTTACATTTAAATTGACCACTGGATTAACCTTAATTAATGCATTAAAACCAATAGCATTTATTTCGAAATGATTAAAACAAACTTGAGTGTGAAATGGAGCACCATTTTAAAAAGAATGGAAGATATTGAAACTTGAATGAGGTTTACTTTATTCACCACTGTTTATCAGATGTGATTGTAACGAAGGAAAGTGAGTAGAGTAGAGTAGATAGAAAGCTCCCAATAAAACGTAATTTTTTGTTGTTAAAAAGTCGAATTTCCATATTTCCCAACTCATGAATTATTAAATGTAACTAAATGATTTACGATAGCCTAGTTTAGCCTAATTGAAACTCAATGTGAAGTTGAACACCCATGGAACAGATCGCGTGCCATGTTTATCAGCTGAACCAGGCCAAATGCCGACGTATG]

[-] EMBL AI639541             [GGGCGCCCGGATGTAAACCTTTCCACCCCATGGTTAAGAAACCATTTTTGAACCTTAATGCTCCTGTTAATAAAAACAATGAGTGTTATGATGACGAGGTTCCGATTGTCAATCAATTGCACATATACTGCTTAATACTCCCGATGAAAAAAGAATCGAAAAAACAGAAACAGGAGGCCCACCTAATGCAACACATTGATAAACTCGAAAAATATCGTAAATTTACAAAATGATACATGGAGAAAGTACTTACATTTAAATTGACCACTGGATTAACCTTAATTAATGCATTAAAACCAATAGCATTTATTTCGAAATGATTAAAACAAACTTGAGTGTGAAATGGAGCACCATTTTAAAAAGAATGGAAGATATTGAAACTTGAATGAGGTTTACTTTATTCACCACTGTTTATCAGATGTGATTGTAACGAAGGAAAGTGAGTAGAGTAGAGTAGATAGAAAGCTCCCAATAAAACGTAATTTTTTGTTGTTAAAAAGTCGAATTTCCATATTTCCCAACTCATGAATTATTAAATGTAACTAAATGATTTACGATAGCCTAGTTTAGCCTAATTGAAACTCAATGTGAAGTTGAACACCCATGGAACAGATCGCGTGCCATGTTTATCAGCTGAACCAGGCCAAATGCCGACGTATG]




>consensus_9458#1
GGGCGCCCGGATGTAAACCTTTCCACCCCATGGTTAAGAAACCATTTTTGAACCTTAATG
CTCCTGTTAATAAAAACAATGAGTGTTATGATGACGAGGTTCCGATTGTCAATCAATTGC
ACATATACTGCTTAATACTCCCGATGAAAAAAGAATCGAAAAAACAGAAACAGGAGGCCC
ACCTAATGCAACACATTGATAAACTCGAAAAATATCGTAAATTTACAAAATGATACATGG
AGAAAGTACTTACATTTAAATTGACCACTGGATTAACCTTAATTAATGCATTAAAACCAA
TAGCATTTATTTCGAAATGATTAAAACAAACTTGAGTGTGAAATGGAGCACCATTTTAAA
AAGAATGGAAGATATTGAAACTTGAATGAGGTTTACTTTATTCACCACTGTTTATCAGAT
GTGATTGTAACGAAGGAAAGTGAGTAGAGTAGAGTAGATAGAAAGCTCCCAATAAAACGT
AATTTTTTGTTGTTAAAAAGTCGAATTTCCATATTTCCCAACTCATGAATTATTAAATGT
AACTAAATGATTTACGATAGCCTAGTTTAGCCTAATTGAAACTCAATGTGAAGTTGAACA
CCCATGGAACAGATCGCGTGCCATGTTTATCAGCTGAACCAGGCCAAATGCCGACGTATG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9458#0      GCAACTTAAAATTAAAGACTAACAGATGAACTAAATTGAAAAAGATTAAAGAAGAAACAC 60
consensus_9458#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9458#0      AGAAATAATAAAACAGTATTCACAAACAAAATGAAATAAAGTAAAACTCATATTATTGAA 120
consensus_9458#1      --------------------GGGCGCCCGGATGTAAACCTTTCCACCCCATGGTTAAGAA 40
                                                *   *** **     *  * * ***  *   ***

consensus_9458#0      AACATT----AAAATGACTACTGATTAAAATAAAAAACAAGTGAGTAGTATATGATTGAC 176
consensus_9458#1      ACCATTTTTGAACCTTAATGCTCCTGTTAATAAAAAC--AATGAGTGTTATGA---TGAC 95
                      * ****    **  * * * **  *   ********   * *****  ***     ****

consensus_9458#0      GAAGGTTTCCGATTTGTTCAAATCCAATTGTCACATAATACTGATTAAATAACATACACG 236
consensus_9458#1      GAGG--TTCCGATT--GTCAA--TCAATTG-CACATA-TACTGCTTAA----TACTCCCG 143
                      ** *  ********   ****   ****** ****** ***** ****     *  * **

consensus_9458#0      ATGAAAAAAAAGAAATCGAAAAAAAACAAGAAAACAAGAAGACACAACATAAATGCAAAC 296
consensus_9458#1      ATGAAAAAAGA---ATCGAAAAAACA----GAAACAGGAGGCC--CACCTAA-TGCAAC- 192
                      ********* *   ********** *     ***** ** * *   ** *** *****  

consensus_9458#0      AACATTTGATAAAACTAGAAAAAATAATCGTAAAATATACAAAAATGATACAATGGAAGA 356
consensus_9458#1      -ACATT-GATAAA-CTCGAAAAAT--ATCGTAAA-TTTACAAAA-TGATACA-TGGAGAA 244
                       ***** ****** ** ******   ******** * ******* ******* ****  *

consensus_9458#0      AATGTACTTAACATTTAAAATTGAACAAGTGAATAAACATAAATAAATGCAATAAAACAA 416
consensus_9458#1      A--GTACTTA-CATTTAAATT--GACCACTGGATTAACCTTAATTAATGCATTAAAACCA 299
                      *  ******* ******** *   ** * ** ** *** * *** ****** ****** *

consensus_9458#0      ATAGCATTTATTT-GAAATGATTAAAACAAACTTTGAGTGTGAAATGGAGCACCATTTTA 475
consensus_9458#1      ATAGCATTTATTTCGAAATGATTAAAACAAACTT-GAGTGTGAAATGGAGCACCATTTTA 358
                      ************* ******************** *************************

consensus_9458#0      AAAAGAATGGAAGATATTGAAACTTGAATGAGGTTTACTTTATTCACCACTGTTTATCAG 535
consensus_9458#1      AAAAGAATGGAAGATATTGAAACTTGAATGAGGTTTACTTTATTCACCACTGTTTATCAG 418
                      ************************************************************

consensus_9458#0      ATGTGATTGTAA-GAAGGAAAGTGAGTAGAGTAGAGTAGATAGAAAGCTCC-AATAAAAG 593
consensus_9458#1      ATGTGATTGTAACGAAGGAAAGTGAGTAGAGTAGAGTAGATAGAAAGCTCCCAATAAAAC 478
                      ************ ************************************** ******* 

consensus_9458#0      GTA--TTTTTGTTGTTAAGTGAT------TTCATATTTCC-AACTCGTGA-TTATTAA-T 642
consensus_9458#1      GTAATTTTTTGTTGTTAAAAAGTCGAATTTCCATATTTCCCAACTCATGAATTATTAAAT 538
                      ***  *************    *      * ********* ***** *** ******* *

consensus_9458#0      GTAACTAA-TGATTA--GGTAGC-TAGTTA------------------------------ 668
consensus_9458#1      GTAACTAAATGATTTACGATAGCCTAGTTTAGCCTAATTGAAACTCAATGTGAAGTTGAA 598
                      ******** *****   * **** *****                               

consensus_9458#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9458#1      CACCCATGGAACAGATCGCGTGCCATGTTTATCAGCTGAACCAGGCCAAATGCCGACGTA 658
                                                                                  

consensus_9458#0      --
consensus_9458#1      TG 660