These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9466#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 880 fasta sequence [CCAAGAGACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT-GTC-TTACACACCACAA-TTTAGTTC-ATATGT-TCCTGATCCAGTTGGCCATAA-TATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAAAATCCAGTCCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTATACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCACCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTT-CGTTGTTTTGCCAAATCTGA-CGCTTATGTTGCAAGCATAACATTTGTGATAGCGTGATTGAATATGCTATGTTAACTCATTATTATGTCAATCTCTTAATATATGTCAACTGGGAGTGAATGATGCGGCCACATTTTGATCAAAGGCCAAATAAGTAAAAAGCTGATATGCCCTTAAAATATTCATGTTTCCAATCCACTTTGATTTCCTCGAAAATTTGGNATAATATTAGATGTTAATCATAATAGTGNAGTNTCTTACTCTACCATATTAAATTTGTTATTCCTTTTAATTGAATAAATCCCATCCAAAAGCTAGTCGTTTTGAATGATCTGGAAATAAAATGCCAATAAAATCGTG] [-] EMBL SM1247322 [CCAAGAGACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACATMGTCTTTACACACCACAATTTTAGTTCAATATGTBTCCTGAACCAGTTG CATAATTATCCAACCCCATC ] [-] EMBL CD112663 [ ACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT GTC TTACACACCACAA TTTAGTTC ATATGT TCCTGATCCAGTTGGCCATAA TATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAAAATCCAGTTCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTATACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGACGCACCTAACAACTATACT ] [-] EMBL CD112720 [ ACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT GTC TTACACACCACAA TTTAGTTC ATATGT TCCTGATCCAGTTGGCCATAA TATCCAACCCCAT ] [+] EMBL CD169522 [ TTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT GTC TTACACACCACAA TTTAGTTC ATATGT TCCTGATCCAGTTGGCCATAA TATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAAAATCCAGTCCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTATACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCACCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATT ] [+] EMBL CD169503 [ TTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT GTC TTACACACCACAA TTTAGTTC ATATGT TCCTGATCCAGTTGGCCATAA TATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAAAATCCAGTCCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTATACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCACCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATT ] [-] EMBL CD135468 [ TGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCACCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTT CGTTGTTTTGCCAAATCTGA CGCTTATGTTGCAAGCATAACATTTGTGATAGCGTGATTGAATATGCTATGTTAA ] [+] EMBL AA566208 [ ATCCAAGTGATGCACCTAACAACTAT CTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTTCCGTCG TTTGCCAAA CTGACCGCTTATGTTGCAAGCATAACA TTGTGATAGCGTG ] [+] EMBL CD090239 [ GATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTT CGTTGTTTTGCCAAATCTGA CGCTTATGTTGCAAGCATAACATTTGTGATAGCGTGATTGAATATGCTATGTTAACTCATTATTATGTCAATCTCTTAATATATGTCAACTGGGAGTGAATGATGCGGCCACATTTTGATCAAAGGCCAAATAAGTAAAAAGCTGATATGCCCTTAAAATATTCATGTTTCCAATCCACTTTGATTTCCTCGAAAATTTGG ] [-] EMBL SMT14412 [ TGATTGAATATGCTATGTTAACTCANTATTATGTCAATCTCNTNATATATGTCAACTGGGAGTGAATGATGCGGCCACATTTTGATCAAAGGCCAAATAAGNAAAAAGCTGATATGCCCNTAAAATANTCATGTTTCCAATCCACTTTGATTTCCTCGNAAATTTGGNATAATATTAGATGTTAATCATAATAGTGNAGTNTCTTACTCTACCATATTAAATTTGTTATTCCTTTTAATTGAATAAATCCCATCCAAAAGCTAGTCGTTTTGAATGATCTGGAAATAAAATGCCAATAAAATCGTG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||