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Schistosoma mansoni
cluster # 9466 cluster # 9466       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9466#0 length = 880 sequences # 9  

consensusID : consensus_9466#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 880
fasta sequence
                              [CCAAGAGACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT-GTC-TTACACACCACAA-TTTAGTTC-ATATGT-TCCTGATCCAGTTGGCCATAA-TATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAAAATCCAGTCCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTATACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCACCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTT-CGTTGTTTTGCCAAATCTGA-CGCTTATGTTGCAAGCATAACATTTGTGATAGCGTGATTGAATATGCTATGTTAACTCATTATTATGTCAATCTCTTAATATATGTCAACTGGGAGTGAATGATGCGGCCACATTTTGATCAAAGGCCAAATAAGTAAAAAGCTGATATGCCCTTAAAATATTCATGTTTCCAATCCACTTTGATTTCCTCGAAAATTTGGNATAATATTAGATGTTAATCATAATAGTGNAGTNTCTTACTCTACCATATTAAATTTGTTATTCCTTTTAATTGAATAAATCCCATCCAAAAGCTAGTCGTTTTGAATGATCTGGAAATAAAATGCCAATAAAATCGTG]

[-] EMBL SM1247322            [CCAAGAGACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACATMGTCTTTACACACCACAATTTTAGTTCAATATGTBTCCTGAACCAGTTG  CATAATTATCCAACCCCATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD112663             [       ACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT GTC TTACACACCACAA TTTAGTTC ATATGT TCCTGATCCAGTTGGCCATAA TATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAAAATCCAGTTCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTATACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGACGCACCTAACAACTATACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD112720             [       ACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT GTC TTACACACCACAA TTTAGTTC ATATGT TCCTGATCCAGTTGGCCATAA TATCCAACCCCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD169522             [                                                 TTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT GTC TTACACACCACAA TTTAGTTC ATATGT TCCTGATCCAGTTGGCCATAA TATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAAAATCCAGTCCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTATACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCACCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD169503             [                                                 TTGTCCCCACTCAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACAT GTC TTACACACCACAA TTTAGTTC ATATGT TCCTGATCCAGTTGGCCATAA TATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAAAATCCAGTCCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTATACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCACCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD135468             [                                                                                                                                                                                                                                                                 TGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACATGTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCACCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTT CGTTGTTTTGCCAAATCTGA CGCTTATGTTGCAAGCATAACATTTGTGATAGCGTGATTGAATATGCTATGTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AA566208             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATCCAAGTGATGCACCTAACAACTAT CTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACGAAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTTCCGTCG TTTGCCAAA CTGACCGCTTATGTTGCAAGCATAACA TTGTGATAGCGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD090239             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAATATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTT CGTTGTTTTGCCAAATCTGA CGCTTATGTTGCAAGCATAACATTTGTGATAGCGTGATTGAATATGCTATGTTAACTCATTATTATGTCAATCTCTTAATATATGTCAACTGGGAGTGAATGATGCGGCCACATTTTGATCAAAGGCCAAATAAGTAAAAAGCTGATATGCCCTTAAAATATTCATGTTTCCAATCCACTTTGATTTCCTCGAAAATTTGG                                                                                                                                           ]
[-] EMBL SMT14412             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGATTGAATATGCTATGTTAACTCANTATTATGTCAATCTCNTNATATATGTCAACTGGGAGTGAATGATGCGGCCACATTTTGATCAAAGGCCAAATAAGNAAAAAGCTGATATGCCCNTAAAATANTCATGTTTCCAATCCACTTTGATTTCCTCGNAAATTTGGNATAATATTAGATGTTAATCATAATAGTGNAGTNTCTTACTCTACCATATTAAATTTGTTATTCCTTTTAATTGAATAAATCCCATCCAAAAGCTAGTCGTTTTGAATGATCTGGAAATAAAATGCCAATAAAATCGTG]


>consensus_9466#0 CCAAGAGACAATAGGGTTTATGCCACACAATTTCCAGATCCGAATTCAATTGTCCCCACT CAAAGTGGTGCTAGTATACCTAGTTATAACATGTCTTACACACCACAATTTAGTTCATAT GTTCCTGATCCAGTTGGCCATAATATCCAACCCCATCGTTCGTTCTCTCAAGGAAACCAA AATCCAGTCCCGCCTGGCTCATTTTCGATGCAAAGTATACAAGCATCTTTGCCAACTTAT ACAAGACAGGATGATTCAAAAGGATACCCTGGGAATCAAACTTATCCATCTAGCCAACAT GTAATGGACGAAAAGAATGTACCTAGGTACACACAGGTTGTGACCCATCCAAGTGATGCA CCTAACAACTATACTGAGCCGGGTGCTGTGGAGGCTCAGTTGATATCTTTCGATTAAACG AAGTTGATTTTCTTTATTCTATGAAGCGAATTATTCGTGATATTTCCCCTGTAATTAAAT ATTGTTGACGTTAGCTAGCCGTTATTAGTTTGGTCTCTTTCGTTGTTTTGCCAAATCTGA CGCTTATGTTGCAAGCATAACATTTGTGATAGCGTGATTGAATATGCTATGTTAACTCAT TATTATGTCAATCTCTTAATATATGTCAACTGGGAGTGAATGATGCGGCCACATTTTGAT CAAAGGCCAAATAAGTAAAAAGCTGATATGCCCTTAAAATATTCATGTTTCCAATCCACT TTGATTTCCTCGAAAATTTGGNATAATATTAGATGTTAATCATAATAGTGNAGTNTCTTA CTCTACCATATTAAATTTGTTATTCCTTTTAATTGAATAAATCCCATCCAAAAGCTAGTC GTTTTGAATGATCTGGAAATAAAATGCCAATAAAATCGTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)