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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9475#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 1388 fasta sequence
[GGCACGAGGGAAGAATATACTAGAGCTATGGAACAAGAACATCATACTGGTCATTTTGCATGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCACATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAAATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTTAAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGTTTTTTATGTGTTGAATGTAAACAACCAATTGGTGCAAAAAGTTTTATTCCACGTGAAAATCAAGTTGTATGTGTACCATGTTATGAAGCGAAATATGCTCAACGTTGTACGAAATGTTCAGAAGTTATACGTCGTGGTGGAGTTACATACAAAGGAAATCCATGGCATAAAGAATGTTTCACTTGTACTAGTTGTTCTAAACAATTAGCCGGTTTAAAA-TTCACATCTAAAGATGAACAACCTGATTGTGCTGATTGTTATGGTGAATTATTTGCTAAAAAATGCACAAAATGTACCAAACCAATTACGGGATTTGGTGGTTGT-AATTCATTTCATTCGAAGATCGTCATTGGCATTCAGAATGTTTTCTATGTGGAAAATGTAATTCTAATCTGGTTGGTAGAGGTTTTCTTACTAGTGATGATATGATTATGTGTTCTGAATGTGGTCGTTAACTTTGACAAGCACAATCAGTATACAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAAGCAGCAGATATATCTAGTCAAAAGTGCGTGATTCAATGATTCGTTCATTCATTCGTTCTTTCTTTCTTTGTTTAATCAGCTTTATGATATCCATTTATTTGTTTTCGTTTTGTTATGTTTGGTTACTAGTTAAATCTCCTTATAACTATGTTCATTCTAATGTTCATAATGCATTTATATAGACCAACAACAACAAAAAAAGTTTTGAACCATGACTTGAAAAGGCCAGACCTTAAATGTTCATTGTTGCTCATTCACTATGGAAATTCTATTCTAGTCCTTATTCTTCTTCTTCTTCTTACCCTTCGAATATATTGATTTATTATGTTTTTTTGTACTGTTTTTTTCTCTGTCTCTTCGATTGTCTGTTTTAATGATGATGATGTCCAAAACTGTCTTCCTTTTTCATAGACATTCAAATGAATGAATGAACATATATATATATATATATATATATACTATTA]
[+] EMBL CD079328 [GGCACGAGGGAAGAATATACTAGAGCTATGGAACAAGAACATCATACTGGTCATTTTGCATGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCACATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAAATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTa ]
[+] EMBL AI067185 [ AACATCATACTGGTCATTTTGCATGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCACATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAAATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTTAAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGTTTTTTATGTGTTGAATGTAAACAACCAATTGGTGCAAAAAGTTTTATTCCACGTGAAAATCAAGTTGTATGTGTACCATGTTATGAAGCGAAATATGCTCAACGTTGTACGAAATGTTCAGAAGTTATACGTCGTGGTGGAGTTACATACAAAGGAAATCCATGGCATAAAGAATGTTTCACTTGTACTAGTTGTTCTAAACAATTAGCCGGTTTAAAA TTCACATCTA ]
[+] EMBL AI067120 [ AACATCATACTGGTCATTTTGCATGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCACATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAAATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTTAAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGG ]
[+] EMBL AI068302 [ AACATCATACTGGTCATTTTGCATGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCACATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAAATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTTAAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGTNTTTTATGTGTTGAA ]
[+] EMBL AI068171 [ TCATACTGGTCATTTTGCATGTCATAGTTGTGATGTATCATTAACAGGACAACGTTATATATTACGTGATGATGAACCACATTGTTTAGCTTGTTATGAAGCAAAGTTTGCTAATACATGTGAACAATGTAAAGAAAAAATTGGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTTAAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGTTTTTTATGTGTTGAA ]
[+] EMBL CD131302 [ GGTTGTGATTCAAAAGATCTTTCATTTAAAGAAAGACATTGGCATGAGAAATGTTTTAAATGTTCTGCTTGTACTACTTCATTAGCTGATCGACCATTTGCTACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGTTTTTTATGTGTTGAATGTAAACAACCAATTGGTGCAAAAAGTTTTATTCCACGTGAAAATCAAGTTGTATGTGTACCATGTTATGAAGCGAAATATGCTCAACGTTGTACGAAATGTTCAGAAGTTATACGTCGTGGTGGAGTTACATACAAAGGAAATCCATGGCATAAAGAATGTTTCACTTGTACTAGTTGTTCTAAACAATTAGCCGGTTTAAAA TTCACATCTAAAGATGAACAACCTGATTGTGCTGATTGTTATGGTGAATTATTTGCTAAAAAATGCACAAAATGTACCAAACCAATTACGGGATTTGGTGGTTGT AATTCATTTCATTCGAAGATCGTCAT ]
[-] EMBL CD073605 [ ACAAAAGAAGAACAATTATATTGTTCTGATTGTTATGATGAACGTTTTGCTGCAAGATGTGATGGTTGTCAAGGTGTATTCAAAGCTGGAATGCGTAAATATGAATATCGTGGACAACAATGGCATGAAGAATGTTTTTTATGTGTTGAATGTAAACAACCAATTGGTGCAAAAAGTTTTATTCCACGTGAAAATCAAGTTGTATGTGTACCATGTTATGAAGCGAAATATGCTCAACGTTGTACGAAATGTTCAGAAGTTATACGTCGTGGTGGAGTTACATACAAAGGAAATCCATGGCATAAAGAATGTTTCACTTGTACTAGTTGTTCTAAACAATTAGCCGGTTTAAAATTTCACATCTAAAGATGAACACCCTTATTGTGCTGATTGTTATGGTGAATTATTTGCTAAAAAATGCACAAAATGTACCAAACCAATTACGGGATTTGGTGGTTGTAAATTCATTTCATTCGAAGATCGTCATTGGCATTCAGAATGTTTTCTATGTGGAAAATGTAATTCTAATCTGGTTGGTAGAGGTTTTCTTACTAGTGATGATATGATTATGTGTTCTGAATGTGGTCGTTAACTTTGACAAGCACAA ]
[-] EMBL CD064462 [ CATTGGCATTCAGAATGTTTTCTATGTGGAAAATGTAATTCTAATCTGGTTGGTAGAGGTTTTCTTACTAGTGATGATATGATTATGTGTTCTGAATGTGGTCGTTAACTTTGACAAGCACAATCAGTATACAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAAGCAGCAGATATATCTAGTCAAAAGTGCGTGATTCAATGATTCGTTCATTCATTCGTTCTTTCTTTCTTTGTTTAATCAGCTTTATGATATCCATTTATTTGTTTTCGTTTTGTTATGTTTGGTTACTAGTTAAATCTCCTTATAACTATGTTCATTCTAATGTTCATAATGCATTTATATAGACCAACAACAACAAAAAAAGTTTTGAACCATGACTTGAAAAGGCCAGACCTTAAATGTTCATTGTTGCTCATTCACTATGGAAATTCTATTCTAGTCCTTATTCTTCTTCTTCTTCTTACCCTTCGAATATATTGATTTATTATGTTTTTTTGTACTGTTTTTTTCTCTGTCTCTTCGATTGT ]
[+] EMBL AI976196 [ TAACTTTGACAAGCACAATCAGTATACAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAAGCAGCAGATATATCTAGTCAAAAGTGCGTGATTCAATGATTCGTTCATTCATTCGTTCTTTCTTTCTTTGTTTAATCAGCTTTATGATATCCATTTATTTGTTTTCGTTTTGTTATGTTTGGTTACTAGTTAAATCTCCTTATAACTATGTTCATTCTAATGTTCATAATGCATTTATATAGACCAACAACAACAAAAAAAGTTTTGAACCATGACTTGAAAAGGCCAGACCTTAAATGTTCATTGTTGCTCATTCACTATGGAAATTCTATTCTAGTCCTTATTCTTCTTCTTCTTCTTACCCTTCGAATATATTGATTTATTATGTTTTTTTGTACTGGTTTTTTCTCTGGCTCTTCGATTGTCTGTTTTAATGATGATGATGTCCAAAACTGTCTTCCTTTTTCATAGACATTCAAATGAATGAATGAACATATATATATATATATATATATATACTATTA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||