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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9477#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 673 fasta sequence
[TAGACAGAGCCAGCGATATGTGGTGTGTGATCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCTGTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATATGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCTGGTCCTCAATACTCTCTATATATGTTAATTATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCATACTTCCCAAGATATCGTTCTTCCAATC]
[+] EMBL CD195120 [TAGACAGAGCCAGCGATATGTGGTGTGTGATCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCTGTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATAGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGNCACCGTTTCCACATTGCTGTGTNTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAGACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAAT ACGACTGAGGGATATGTTTGTACGCTTGCACGCA TTCTAATAATGGTC ]
[+] EMBL CD112153 [ AGACAGAGCCAGCGATATGTGGTGTGTGATCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCTGTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGC ]
[+] EMBL CD200906 [ TCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCTGTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTT ]
[+] EMBL CD192787 [ TGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACGTGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATATGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCTGGTCCTCAATACTCTCTATATATGTTAATCATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCA ]
[+] EMBL CD111933 [ CTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAG ]
[+] EMBL CD063876 [ CAATAAATCAACATGGACACA TGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGA TGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATAT ]
[+] EMBL CD063919 [ ATGGACACA TGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGG TTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATAT ]
[+] EMBL CD064726 [ AACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATCTGCGATTTTAAGGCAGATTGTGTCATTGTTTATCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATATGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCTGGTCCTCAATACTCTCTATATATGTTAATTATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCATACTTCCCAAGATATCGTTCTTCCAATC]
[+] EMBL CD126828 [ CAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTATAAGGCACATTGTGTCATTGCTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATATGAGGCGACTCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATATGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCCGGTCCTCAATACTCTCTATATATGTTAATTATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCATACTTCCCAAGATATCGTTCTTCCAct ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||