These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9477#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 9 consensus length = 673 fasta sequence [TAGACAGAGCCAGCGATATGTGGTGTGTGATCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCTGTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATATGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCTGGTCCTCAATACTCTCTATATATGTTAATTATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCATACTTCCCAAGATATCGTTCTTCCAATC] [+] EMBL CD195120 [TAGACAGAGCCAGCGATATGTGGTGTGTGATCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCTGTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATAGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGNCACCGTTTCCACATTGCTGTGTNTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAGACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAAT ACGACTGAGGGATATGTTTGTACGCTTGCACGCA TTCTAATAATGGTC ] [+] EMBL CD112153 [ AGACAGAGCCAGCGATATGTGGTGTGTGATCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCTGTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGC ] [+] EMBL CD200906 [ TCGTGGGAACGAACGGTCTCGTATGCAGCTGTTTAGCCGAAGTGGTCATTTTGTACGCCGTATCCCGATTCGGTACATCGATATTGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTT ] [+] EMBL CD192787 [ TGTTGCAGGGCTTGCAATAAATCAACGTGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATATGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCTGGTCCTCAATACTCTCTATATATGTTAATCATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCA ] [+] EMBL CD111933 [ CTTGCAATAAATCAACATGGACACATTGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAG ] [+] EMBL CD063876 [ CAATAAATCAACATGGACACA TGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGGTTTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGA TGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATAT ] [+] EMBL CD063919 [ ATGGACACA TGTTGCTATTGATAGTGTTTCGCCATCGG TTTTGTTGTGTCAGAGGAAGGTGACCTAATTCGTTGGTTCGATTGTAGTAACCACATGAGAGAACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTTTAAGGCACATTGTGTCATTGTTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATAT ] [+] EMBL CD064726 [ AACCATCAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATCTGCGATTTTAAGGCAGATTGTGTCATTGTTTATCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATAGGAGGCGAATCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATATGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCTGGTCCTCAATACTCTCTATATATGTTAATTATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCATACTTCCCAAGATATCGTTCTTCCAATC] [+] EMBL CD126828 [ CAGATGTCGCGATACATGGTCGAGAGTACTATATTTGCGATTATAAGGCACATTGTGTCATTGCTTTTCAGGAGGATGGGTCATTTATTCGTCGTATATGAGGCGACTCAATTACTGACTTTCCTAACGGTATAGATGTTAGCGACCATGGAGATGTACTAGTTGGAGACTCACATGGCAACCGTTTCCACATTGCTGTGTTTAGTCGATCGGGGGAACTGCTGAGCGAATTCGTTTGCAACCAAACAAAAGTCAGTCGCTCATGCTGCTTGAAAATAACGACTGAGGGATATGTTGTTACGCTTGCACGCAGTTCTAATAATGTTCCGGTCCTCAATACTCTCTATATATGTTAATTATGATTCCCAGCCGGTTACTACTCACAACACAGCCAGCATACTTCCCAAGATATCGTTCTTCCAct ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||