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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9484#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 457 fasta sequence
[GCGACTCCCTTCACGCATAGATTAATCACCACTGTGGATTAATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAATAAATTTTGTTCACTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL CD139517 [GCGACTCCCTTCACGCATAGATTAATCACCACTGTGGATTAATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTcgcc ]
[+] EMBL CD146164 [ AATCACCACTGTGGATTAATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCc ]
[+] EMBL CD191138 [ TAATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGG ]
[+] EMBL CD158215 [ AATAGTCATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGAT ]
[+] EMBL AY118110 [ CATCGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACTCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAATAAATTTTGTTCACTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[-] EMBL AI977270 [ CGGCATGGGCGTTACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAATAAATTTTG ]
[+] EMBL CD131652 [ TACCGTTGATACCTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTTGATGTGGAGTTAATCGATATATTATGACTCATTCCAGTTTTTCTTACCATTCATTGCTTCCACTTAATAAATTTTt ]
[+] EMBL SM612 [ CTACAAGCCAGGGGATGGTAAACGANTTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGNNCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTNATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGNGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGGGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCTGAAATTGGATGTGGAGTTAATCGATATNTTATGACTCATCCCAGgt ]
[+] EMBL CD135267 [ GGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGNGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCT ]
[+] EMBL CD135285 [ GGATGGTAAACGAATTCCAAAGAAAGGTCAGAGAGTCGTTGTTCATTACACTGGTACCCTCATGGATGGGAAAAAGTTTGATAGTTCACGTGACAGAAATAAACCATTCGAGTTTGTAATTGGGACGGGGAAAGTAATTCGAGGTTGGGATGAAGGTGTTATTCAAATGAGTGTGGGAGAGCGTGCCTACCTTACTTGTACTCCAGACTACGCATATGGTTCCAAGGCGGTCGATAAAGTTATCCCTCCAAATGCTACTCT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||