These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9485#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1091 fasta sequence [ATTACGTGAATGGGGTAAATGTTTATTAAATCCATCCGCTACTCTAGTTGATCGTTCACGTGCTCTTTGGGGATTACGTCATGCTGCTGAACCATTAGCACTTGAATTATTAGCTGATTTTGTTTGTAATTATGTTAAACCATCACCTATCGCTAATGATCTATTACAACATGAAGCTGCTTATTGTTTAGGACAACGTGGTGATCCAAAAGCTGTACCATATCTTTTAAATGCTCTACATAATGATAAACATGTTACACTTATTCGTCATGAAGCTGCTGAAGCATTAGCTGCTTTAAGTGGATGTGATGGTGCAGATATTGAAGTAATTGAAAAAGCTCTAAAAGAATATGTTAATTCAAATATAACTGAGTTGGCTGAAACATGTCAAGTTGGTTTAAATCGTATTGAATGGATTAAAAAGAAGAAAACTGGACAACATAAAGATTCTCAAGCATTATGTGATTTAGCTACAAAATTATTTCCAAATACAATTGATCCAGCTCATAGTTTTANCCGGTGATCAACAATATACTGATGAACAATTACATGATTTATTAATGGATCCTAATCAAAATTTATTTACACGTTATCGTGCAATGTTT-ACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGCCAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA-ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG-TTGCTTTTGTTTT-AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTGT] [-] EMBL CD119692 [ATTACGTGAATGGGGTAAATGTTTATTAAATCCATCCGCTACTCTAGTTGATCGTTCACGTGCTCTTTGGGGATTACGTCATGCTGCTGAACCATTAGCACTTGAATTATTAGCTGATTTTGTTTGTAATTATGTTAAACCATCACCTATCGCTAATGATCTATTACAACATGAAGCTGCTTATTGTTTAGGACAACGTGGTGATCCAAAAGCTGTACCATATCTTTTAAATGCTCTACATAATGATAAACATGTTACACTTATTCGTCATGAAGCTGCTGAAGCATTAGCTGCTTTAAGTGGATGTGATGGTGCAGATATTGAAGTAATTGAAgtg ] [+] EMBL CD079989 [ CCATTAGCACTTGAATTATTAGCTGATTTTGTTTGTAATTATGTTAAACCATCACCTATCGCTAATGATCTATTACAACATGAAGCTGCTTATTGTTTAGGACAACGTGGTGATCCAAAAGCTGTACCATATCTTTTAAATGCTCTACATAATGATAAACATGTTACACTTATTCGTCATGAAGCTGCTGAAGCATTAGCTGCTTTAAGTGGATGTGATGGTGCAGATATTGAAGTAATTGAAAAAGCTCTAAAAGAATATGTTAATTCAAATATAACTGAGTTGGCTGAAACATGTCAAGTTGGTTTAAATCGTATTGAATGGATTAAAAAGAAGAAAACTGGACAACATAAAGATTCTCAAGCATTATGTGATTTAGCTACAAAATTATTTCCAAATACAATTGATCCAGCTCATAGTTTTANCCGGTGATCAACAATATACTGATGAACAATTACATGATTTATTAATGGATCCTAATCAAAATTTATTTACACGTTATCGTGCAATGTTTAACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGCCAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAGTTTGCTTTTGTTTTAANGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCC ] [-] EMBL CD121411 [ GCAGATATTGAAGTAATTGAAAAAGCTCTAAAAGAATATGTTAATTCAAATATAACTGAGTTGGCTGAAACATGTCAAGTTGGTTTAAATCGTATTGAATGGATTAAAAAGAAGAAAACTGGACAACATAAAGATTCTCAAGCATTATGTGATTTAGCTACAAAATTATTTCCAAATACAATTGATCCAGCTCATAGTTTTA CCGGTGATCAACAATATACTGATGAACAATTACATGATTTATTAATGGATCCTAATCAAAATTTATTTACACGTTATCGTGCAATGTTT ACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGCCAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGG ] [-] EMBL CD131953 [ TGCAATGTTT ACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGCCAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGGATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAAg ] [+] EMBL CD097363 [ TTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTCTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTACGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTG ] [+] EMBL CD147357 [ TTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAATGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAGATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCACCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATA ] [+] EMBL CD147604 [ TTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAATATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTG ] [-] EMBL CD097341 [ TAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTGT] [-] EMBL CD097277 [ TAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTGT] [-] EMBL CD130209 [ AGGTGAATTAGAAGGGATATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATAGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTCCCGCAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATCTATTATATTGT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||