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Schistosoma mansoni
cluster # 9485 cluster # 9485       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9485#0 length = 1091 sequences # 10  

consensusID : consensus_9485#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1091
fasta sequence
                              [ATTACGTGAATGGGGTAAATGTTTATTAAATCCATCCGCTACTCTAGTTGATCGTTCACGTGCTCTTTGGGGATTACGTCATGCTGCTGAACCATTAGCACTTGAATTATTAGCTGATTTTGTTTGTAATTATGTTAAACCATCACCTATCGCTAATGATCTATTACAACATGAAGCTGCTTATTGTTTAGGACAACGTGGTGATCCAAAAGCTGTACCATATCTTTTAAATGCTCTACATAATGATAAACATGTTACACTTATTCGTCATGAAGCTGCTGAAGCATTAGCTGCTTTAAGTGGATGTGATGGTGCAGATATTGAAGTAATTGAAAAAGCTCTAAAAGAATATGTTAATTCAAATATAACTGAGTTGGCTGAAACATGTCAAGTTGGTTTAAATCGTATTGAATGGATTAAAAAGAAGAAAACTGGACAACATAAAGATTCTCAAGCATTATGTGATTTAGCTACAAAATTATTTCCAAATACAATTGATCCAGCTCATAGTTTTANCCGGTGATCAACAATATACTGATGAACAATTACATGATTTATTAATGGATCCTAATCAAAATTTATTTACACGTTATCGTGCAATGTTT-ACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGCCAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA-ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG-TTGCTTTTGTTTT-AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTGT]

[-] EMBL CD119692             [ATTACGTGAATGGGGTAAATGTTTATTAAATCCATCCGCTACTCTAGTTGATCGTTCACGTGCTCTTTGGGGATTACGTCATGCTGCTGAACCATTAGCACTTGAATTATTAGCTGATTTTGTTTGTAATTATGTTAAACCATCACCTATCGCTAATGATCTATTACAACATGAAGCTGCTTATTGTTTAGGACAACGTGGTGATCCAAAAGCTGTACCATATCTTTTAAATGCTCTACATAATGATAAACATGTTACACTTATTCGTCATGAAGCTGCTGAAGCATTAGCTGCTTTAAGTGGATGTGATGGTGCAGATATTGAAGTAATTGAAgtg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD079989             [                                                                                           CCATTAGCACTTGAATTATTAGCTGATTTTGTTTGTAATTATGTTAAACCATCACCTATCGCTAATGATCTATTACAACATGAAGCTGCTTATTGTTTAGGACAACGTGGTGATCCAAAAGCTGTACCATATCTTTTAAATGCTCTACATAATGATAAACATGTTACACTTATTCGTCATGAAGCTGCTGAAGCATTAGCTGCTTTAAGTGGATGTGATGGTGCAGATATTGAAGTAATTGAAAAAGCTCTAAAAGAATATGTTAATTCAAATATAACTGAGTTGGCTGAAACATGTCAAGTTGGTTTAAATCGTATTGAATGGATTAAAAAGAAGAAAACTGGACAACATAAAGATTCTCAAGCATTATGTGATTTAGCTACAAAATTATTTCCAAATACAATTGATCCAGCTCATAGTTTTANCCGGTGATCAACAATATACTGATGAACAATTACATGATTTATTAATGGATCCTAATCAAAATTTATTTACACGTTATCGTGCAATGTTTAACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGCCAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAGTTTGCTTTTGTTTTAANGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD121411             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GCAGATATTGAAGTAATTGAAAAAGCTCTAAAAGAATATGTTAATTCAAATATAACTGAGTTGGCTGAAACATGTCAAGTTGGTTTAAATCGTATTGAATGGATTAAAAAGAAGAAAACTGGACAACATAAAGATTCTCAAGCATTATGTGATTTAGCTACAAAATTATTTCCAAATACAATTGATCCAGCTCATAGTTTTA CCGGTGATCAACAATATACTGATGAACAATTACATGATTTATTAATGGATCCTAATCAAAATTTATTTACACGTTATCGTGCAATGTTT ACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGCCAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD131953             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGCAATGTTT ACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGCCAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGGATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAAg                                             ]
[+] EMBL CD097363             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTCTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTACGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTG ]
[+] EMBL CD147357             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAATGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAGATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCACCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATA    ]
[+] EMBL CD147604             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAATATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTG ]
[-] EMBL CD097341             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTGT]
[-] EMBL CD097277             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTGT]
[-] EMBL CD130209             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AGGTGAATTAGAAGGGATATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATAGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTCCCGCAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATCTATTATATTGT]


>consensus_9485#0 ATTACGTGAATGGGGTAAATGTTTATTAAATCCATCCGCTACTCTAGTTGATCGTTCACG TGCTCTTTGGGGATTACGTCATGCTGCTGAACCATTAGCACTTGAATTATTAGCTGATTT TGTTTGTAATTATGTTAAACCATCACCTATCGCTAATGATCTATTACAACATGAAGCTGC TTATTGTTTAGGACAACGTGGTGATCCAAAAGCTGTACCATATCTTTTAAATGCTCTACA TAATGATAAACATGTTACACTTATTCGTCATGAAGCTGCTGAAGCATTAGCTGCTTTAAG TGGATGTGATGGTGCAGATATTGAAGTAATTGAAAAAGCTCTAAAAGAATATGTTAATTC AAATATAACTGAGTTGGCTGAAACATGTCAAGTTGGTTTAAATCGTATTGAATGGATTAA AAAGAAGAAAACTGGACAACATAAAGATTCTCAAGCATTATGTGATTTAGCTACAAAATT ATTTCCAAATACAATTGATCCAGCTCATAGTTTTANCCGGTGATCAACAATATACTGATG AACAATTACATGATTTATTAATGGATCCTAATCAAAATTTATTTACACGTTATCGTGCAA TGTTTACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGC CAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAAATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTTAGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTG TTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTA TTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAG AATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGG TTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAAT TTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATT TATTATATTGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)