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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9485#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1091 fasta sequence
[ATTACGTGAATGGGGTAAATGTTTATTAAATCCATCCGCTACTCTAGTTGATCGTTCACGTGCTCTTTGGGGATTACGTCATGCTGCTGAACCATTAGCACTTGAATTATTAGCTGATTTTGTTTGTAATTATGTTAAACCATCACCTATCGCTAATGATCTATTACAACATGAAGCTGCTTATTGTTTAGGACAACGTGGTGATCCAAAAGCTGTACCATATCTTTTAAATGCTCTACATAATGATAAACATGTTACACTTATTCGTCATGAAGCTGCTGAAGCATTAGCTGCTTTAAGTGGATGTGATGGTGCAGATATTGAAGTAATTGAAAAAGCTCTAAAAGAATATGTTAATTCAAATATAACTGAGTTGGCTGAAACATGTCAAGTTGGTTTAAATCGTATTGAATGGATTAAAAAGAAGAAAACTGGACAACATAAAGATTCTCAAGCATTATGTGATTTAGCTACAAAATTATTTCCAAATACAATTGATCCAGCTCATAGTTTTANCCGGTGATCAACAATATACTGATGAACAATTACATGATTTATTAATGGATCCTAATCAAAATTTATTTACACGTTATCGTGCAATGTTT-ACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGCCAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA-ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG-TTGCTTTTGTTTT-AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTGT]
[-] EMBL CD119692 [ATTACGTGAATGGGGTAAATGTTTATTAAATCCATCCGCTACTCTAGTTGATCGTTCACGTGCTCTTTGGGGATTACGTCATGCTGCTGAACCATTAGCACTTGAATTATTAGCTGATTTTGTTTGTAATTATGTTAAACCATCACCTATCGCTAATGATCTATTACAACATGAAGCTGCTTATTGTTTAGGACAACGTGGTGATCCAAAAGCTGTACCATATCTTTTAAATGCTCTACATAATGATAAACATGTTACACTTATTCGTCATGAAGCTGCTGAAGCATTAGCTGCTTTAAGTGGATGTGATGGTGCAGATATTGAAGTAATTGAAgtg ]
[+] EMBL CD079989 [ CCATTAGCACTTGAATTATTAGCTGATTTTGTTTGTAATTATGTTAAACCATCACCTATCGCTAATGATCTATTACAACATGAAGCTGCTTATTGTTTAGGACAACGTGGTGATCCAAAAGCTGTACCATATCTTTTAAATGCTCTACATAATGATAAACATGTTACACTTATTCGTCATGAAGCTGCTGAAGCATTAGCTGCTTTAAGTGGATGTGATGGTGCAGATATTGAAGTAATTGAAAAAGCTCTAAAAGAATATGTTAATTCAAATATAACTGAGTTGGCTGAAACATGTCAAGTTGGTTTAAATCGTATTGAATGGATTAAAAAGAAGAAAACTGGACAACATAAAGATTCTCAAGCATTATGTGATTTAGCTACAAAATTATTTCCAAATACAATTGATCCAGCTCATAGTTTTANCCGGTGATCAACAATATACTGATGAACAATTACATGATTTATTAATGGATCCTAATCAAAATTTATTTACACGTTATCGTGCAATGTTTAACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGCCAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAGTTTGCTTTTGTTTTAANGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCC ]
[-] EMBL CD121411 [ GCAGATATTGAAGTAATTGAAAAAGCTCTAAAAGAATATGTTAATTCAAATATAACTGAGTTGGCTGAAACATGTCAAGTTGGTTTAAATCGTATTGAATGGATTAAAAAGAAGAAAACTGGACAACATAAAGATTCTCAAGCATTATGTGATTTAGCTACAAAATTATTTCCAAATACAATTGATCCAGCTCATAGTTTTA CCGGTGATCAACAATATACTGATGAACAATTACATGATTTATTAATGGATCCTAATCAAAATTTATTTACACGTTATCGTGCAATGTTT ACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGCCAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGG ]
[-] EMBL CD131953 [ TGCAATGTTT ACTTTACGTGATCGTGTCTTACAAGCAGTTATTGATAAAACATCACCAGAAAAGCCAGCTGGTCTATTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGGATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAAg ]
[+] EMBL CD097363 [ TTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTCTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTACGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTG ]
[+] EMBL CD147357 [ TTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAATGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAGATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCACCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATA ]
[+] EMBL CD147604 [ TTAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAATATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTG ]
[-] EMBL CD097341 [ TAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTGT]
[-] EMBL CD097277 [ TAGCTGAAGGACTGACAGCTCCAA ATAGTGCATTACTTAGACATGAAG TTGCTTTTGTTTT AGGGCAATTAACAGTAGCTAGTACTGTTCCACAATTGTCTACATGTGTTCGTCAAACAAACGAACATCCAATGGTTAGACATGAAGCTGCTGAAGCACTTGGTTCTATTCTAGGTGAATTAGAAGGGAAATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATTGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTACCACAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATTTATTATATTGT]
[-] EMBL CD130209 [ AGGTGAATTAGAAGGGATATATTTAACAAATAATGTGAAAGGTTCCATACCAAAAGAATTTGAGCATCAAGCACGTGAAGTACTAGAAGAATTTACAAAAGATAAAGAGCCAGTGGTTCGTGAAAGTTGTGTACTGGCTTTGGATATAGCAAATTATATTGCATCACCGGAACAATTTCAATATGCTGCTGTCCCGCAAAATTAACTAACCACTACTTGCTATTGATAGTAGTATCTATTATATTGT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||