cluster # 9486

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Schistosoma mansoni
cluster # 9486 cluster # 9486 Sequences # 10 consensus # 2

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consensus_9486#0 length = 824 sequences # 4

consensus_9486#1 length = 797 sequences # 6

consensusID : consensus_9486#0
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Sequences nbr = 4
consensus length = 824
fasta sequence

                              [AAGGATTTTAGTAATAACAACTGGCAGAATGATACATGGACAAACAATCATGTCAATTCAATTGCTGGTGGTGATGGTGATTNAGCTATGCTTCGATCAGCTAATGAAGGTGAAGTACCTGAAGAAGTTCTTCATTTTCATGAAGTTATTGATCAGATTGAACGCATGGAAGAAGAAATTTGTGATGATCACAAAGCTGTTTGTCATTCCATGAGCGATTGGACTAAGGAGCATTATTCTTTATACAAGATATCAAATCAAGTGGAATTCGATGTTGAAGAATACAGTGCTCGTTTAGAATATCTACTTGGCAAACAAATTAAAGTTTTATCCTCTTTAAAAGATAAAGTGACATTATGGCGCCGTGATCTACGACAAGAAGAAGAATTAAGCACTAATTTACAACGAAATCATAAATTATAGTTTCTAACTCATTTTATTGACACAAATCAATAACATAAATAATATGAAATGTTTAACAATTTTCACTGAATCAATCATGTTTCAAATGTATCCGACTGTCCGTTCACCGATTCCACAAGGTGATGAAGGTAATCTAGTCAACAACATTTTTGTTGGTTAGATTTTTTGTCAAAGATTTACTGTGATACCATAAAATAGGATTGTGAAATGCTTCCTTTTTACAGTTTGTATGTGGTTATAAGCATATCAAACGTTGAGAAGACTTTTCGTGTTTTCAAAACACTCCTATTGTGTTACACTGTTGTTGCACCATGTCAAACACACATGGTTGCTGGTAATTTGTATGCATGTAAAACATTGAAAGCGTTTGCGGATTATTGTCTTATATGTATCATCAATCC]

[-] EMBL CD186932             [AAGGATTTTAGTAATAACAACTGGCAGAATGATACATGGACAAACAATCATGTCAATTCAATTGCTGGTGGTGATGGTGATTNAGCTATGCTTCGATCAGCTAATGAAGGTGAAGTACCTGAAGAAGTTCTTCATTTTCATGAAGTTATTGATCAGATTGAACGCATGGAAGAAGAAATTTGTGATGATCACAAAGCTGTTTGTCATTCCATGAGCGATTGGACTAAGGAGCATTATTCTTTATACAAGATATCAAATCAAGTGGAATTCGATGTTGAAGAATACAGTGCTCGTTTAGAATATCTACTTGGCAAACAAATTAATGTTTTATCCTCTTTAAAAGATAAAGTGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD061743             [                                     tGACAAACAATCATGTCAATTCAATTGCTGGTGGTGATGGTGATTTAGCTATGCTTCGATCAGCTAATGAAGGTGAAGTACCTGAAGAAGTTCTTCATTTTCATGAAGTTATTGATCAGATTGAACGCATGGAAGAAGAAATTTGTGATGATCACAAAGCTGTTTGTCATTCCATGAGCGATTGGACTAAGGAGCATTATTCTGTATACAAGATATCAAATCAAGTGGAATTCGATGTTGAAGAATACAGTGCTCGTTTAGAATATCTACTTGGCAAACAAATTAAAGTTTTATCCTCTTTAAAAGATAAAGTGACATTATGGCGCCGTGATCTACGACAAGAAGAAGAATTAAGCACTAATTTACAACGAAATCATAAATTATAGTTTCTAACTCATTTTATTGACACAAATCAATAACATAAATAATATGAAATG TTAACGATTTTCACTGAATCAATCATGTTTC AATGTATCCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD169116             [                                                                                                                                                                                         TGATCACAAAGCTGTTTGTCATTCCATGAGCGATTGGACTAAGGAGCATTATTCTTTATACAAGATATCAAATCAAGTGGAATTCGATGTTGAAGAATACAGTGCTCGTTTAGAATATCTACTTGGCAAACAAATTAAAGTTTTATCCTCTTTAAAAGATAAAGTGACATTATGGCGCCGTGATCTACGACAAGAAGAAGAATTAAGCACTAATTTACAACGAAATCATAAATTATAGTTTCTAACTCATTTTATTGACACAAATCAATAACATAAATAATATGAAATGTTTAACAATTTTCACTGAATCAATCATGTTTCAAATGTATCCGACTGTCCGTTCACCGATTCCACAAGGTGATGAAGGTAATCTAGTCAACAACATTTTTGTTGGTTAGATTTTTTGTCAAAGATTTACTGTGATACCATAAAATAGGATTGTGAAATGCTTCCTTTTTACAGTTTGTATGTGGTTATAAGCATATCAAACGTTGAGAAGACTTTTCGTGTTTTCAAAACACTCCTATTGTGTTACACTGTTGTTGCACCATGTCAAACACACATGGTTGCTGGTAATTTGTATGCATGTAAAACATTGAAAGCGTTTGCGGATTATTGTCTTATATGTATCATCAATCC]
[+] EMBL CD169070             [                                                                                                                                                                                         TGATCACAAAGCTGTTTGTCATTCCATGAGCGATTGGACTAAGGAGCATTATTCTTTATACAAGATATCAAATCAAGTGGAATTCGATGTTGAAGAATACAGTGCTCGTTTAGAATATCTACTTGGCAAACAAATTAAAGTTTTATCCTCTTTATAAGATAAAGTGACATTATGGCGCCGTGATCTACGACAAGAAGAAGAATTAAGCACTAATTTACAACGAAATCATAAATTATAGTTTCTAACTCATTTTATTGACACAAATCAATAACATAAATAATATGAAATGTTTAACAATTTTCACTGAATCAATCATGTTTCAAATGTATCCGACTGTCCGTTCACCGATTCCACAAGGTGATGAAGGTAATCTAGTCAACAACATTTTTGTTGGTTAGATTTTTTGTCAAAGATTTACTGTGATACCATAAAATAGGATTGTGAAATGCTTCCTTTTTACAGTTTGTATGTGGTTATAAGCATATCAAACATTGAGAAGACTTTTCGTGTTTTCAAAACACTCCTATTGTGTTACACTGTTGTTGCACCATGTCAAACACACATGGTTGCTGGTAATTTGTATGCCTGT AAACATT                                          ]




>consensus_9486#0
AAGGATTTTAGTAATAACAACTGGCAGAATGATACATGGACAAACAATCATGTCAATTCA
ATTGCTGGTGGTGATGGTGATTNAGCTATGCTTCGATCAGCTAATGAAGGTGAAGTACCT
GAAGAAGTTCTTCATTTTCATGAAGTTATTGATCAGATTGAACGCATGGAAGAAGAAATT
TGTGATGATCACAAAGCTGTTTGTCATTCCATGAGCGATTGGACTAAGGAGCATTATTCT
TTATACAAGATATCAAATCAAGTGGAATTCGATGTTGAAGAATACAGTGCTCGTTTAGAA
TATCTACTTGGCAAACAAATTAAAGTTTTATCCTCTTTAAAAGATAAAGTGACATTATGG
CGCCGTGATCTACGACAAGAAGAAGAATTAAGCACTAATTTACAACGAAATCATAAATTA
TAGTTTCTAACTCATTTTATTGACACAAATCAATAACATAAATAATATGAAATGTTTAAC
AATTTTCACTGAATCAATCATGTTTCAAATGTATCCGACTGTCCGTTCACCGATTCCACA
AGGTGATGAAGGTAATCTAGTCAACAACATTTTTGTTGGTTAGATTTTTTGTCAAAGATT
TACTGTGATACCATAAAATAGGATTGTGAAATGCTTCCTTTTTACAGTTTGTATGTGGTT
ATAAGCATATCAAACGTTGAGAAGACTTTTCGTGTTTTCAAAACACTCCTATTGTGTTAC
ACTGTTGTTGCACCATGTCAAACACACATGGTTGCTGGTAATTTGTATGCATGTAAAACA
TTGAAAGCGTTTGCGGATTATTGTCTTATATGTATCATCAATCC

consensusID : consensus_9486#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 797
fasta sequence

                              [AGGCCAANAATTTGGCACGAGGGTGAATCAATCATGTTTCAAATGTATCCGACTGTCCGTTCACCGATTCCACAAGGTGATGAAGGTAATCTAGTCAACAACATTTTTGTTGGTTAGATTTTTTGTCAAAGATTTACTGTGATACCATAAAATAGGATTGTGAAATGCTTCCTTTTTACAGTTTGTATGTGGTTATAAGCATATCAAACATTGAGAAGACTTTTCGTGTTTTCAAAACACTCCTATTGTGTTACACTGTTGTTGCACCATGTCAAACACACACGGTTGCTGGTAATTTGTATGCCTGTAAAACATTGAAAGCGTTTGCGGATTATTGTCTTATATGTATCATCAATCCTTGTTCTCTGTATTTTTACAGTTCTCATTGTTCTATTCTTATTTTTTTTACTTACACCAATACCAAATAAATAAATAATTCTTCATGCCTTCTCTCTTTACATGTTATCATTTTTAAAAGTATAAACGTTACAATATCCGAATTGCATATTCCATTACCGTTTGTGATTCTGTTACTAAGTCTAACATTACATTTCAAGTGACTGAATGCTCTTTTTCTCCAAGATACTATTTACTTTCCCCCCTCCATCTTTAATGTAACAATAATCTATTTGCGCACTGAATTACTGTTGATTCATTTCTCACACAAAATGAAATGTATGTACCTATTAAATTGCAATGTATTAATTTCTGTTTTTAGTTGCTTCTTTATTCATTGACTATTTTGCATGTTAAAAGACAATGGCATAACTTCACAATGTTGACGGTACCACCACATG]

[+] EMBL CD081144             [AGGCCAANAATTTGGCACGAGGGTGAATCAATCATGTTTCAAATGTATCCGACTGTCCGTTCACCGATTCCACAAGGTGATGAAGGTAATCTAGTCAACAACATTTTTGTTGGTTAGATTTTTTGTCAAAGATTTACTGTGATACCATAAAATAGGATTGTGAAATGCTTCCTTTTTACAGTTTGTATGTGGTTATAAGCATATCAAACATTGAGAAGACTTTTCGTGTTTTCAAAACACTCCTATTGTGTTACACTGTTGTTGCACCATGTCAAACACACACGGTTGCTGGTAATTTGTATGCCTGTAAAACATTGAAAGCGTTTGCGGATTATTGTCTTATATGTATCATCAATCCTTGTTCTCTGTATTTTTACAGTTCTCATTGTTCTATTCTTATTTTTTTTACTTACACCAATACCAAATAAATAAATAATTCTTCATGCCTTCTCTCTTTACATGTTATCATTTTTAAAAGTATAAACGTTACAATATCCGAATTGCATATTCCATTACCGTTTGTGATTCTGTTACTAAGTCTAACATTACATTTCAAGTGACTGAATGCTCTTTTTCTCCAAGATACTATTTACTTTCCCCCCTCCATCTTTAATGTAACAATAATCTATTTGCGCACTGAATTACTGTTGATTCATTTCTCACACAAAATGAAATGTATGTACCTATTAAATT                                                                                                        ]
[-] EMBL CD074965             [                             AATCATGTTTCAAATGTATCGNACTGTCCGTTCACCGATTCCACAAGGTGATGAAGGTAATCTAGTCAACAACATTTTTGTTGGTTAGATTTTTTGTCAAAGATTTACTGTGATACCATAAAATAGGATTGTGAAATGCTTCCTTTTTACAGTTTGTATGTGGTTATAAGCATATCAAACATTGAGAAGACTTTTCGTGTTTTCAAAACACTCCTATTGTGTTACACTGTTGTTGCACCATGTCAAACACACACGGTTGCTGGTAATTTGTATGCCTGTAAAACATTGAAAGCGTTTGCGGATTATTGTCTTATATGTATCATCAATCCTTGTTCTCTGTATTTTTACAGTTCTCATTGTTCTATTCTTATTTTTTTTACTTACACCAATACCAAATAAATAAATAATTCTTCATGCCTTCTCTCTTTACATGTTATCATTTTTAAAAGTATAAACGTTACAATATCCGAATTGCATATTCCATTACCGTTTGTGATTCTGTTACTAAGTCTAACATTACATTTCAAGTGACTGAATGCTCTTTTTCTCCAAGATACTATTTACTTTCCCCCCTCCATCTTTAATGTAACAATAATCTATTTGCGCACTGAATTACTGTTGATTCATTTCTCACACAAAATGAAATGTATGTACCTATTAAATTG                                                                                                       ]
[+] EMBL CD139868             [                                                  GACTGTCCGTTCACCGATTCCACAAGGTGATGAAGGTAATCTAGTCAACAACATTTTTGTTGGTTAGATTTTTTGTCAAAGATTTACTGTGATACCATAAAATAGGATTGTGAAATGCTTCCTTTTTACAGTTTGTATGTGGTTATAAGCATATCAAACATTGAGAAGACTTTTCGTGTTTTCAAAACACTCCTATTGTGTTACACTGTTGTTGCACCATGTCAAACACACACGGTTGCTGGTAATTTGTATGCCTGTAAAACATTNGAAGCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD166834             [                                                                         AAGGTGATGAAGGTAATCTAGTCAACAACATTTTTGTTGGTTAGATTTTTTGTCAAAGATTTACTGTGATACCATAAAATAGGATTGTGAAATGCTTCCTTTTTACAGTTTGTATGTGGTTATAAGCATATCAAACACTGAGAAGACTTTTCGTGTTTTC AAACACTCCTATTGTGTTACACTGTTG TGC CCATGTCAAACACACACGGTTGCTGGTATTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD139960             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TACAATATCCGAATTGCATATTCCATTACCGTTTGTGATTCTGTTACTAAGTCTAACATTACATTTCAAGTGACTGAATGCTCTTTTTCTCCAAGATACTATTTACTTTCCCCCCTCCATCTTTAATGTAACAATAATCTATTTGCGCACTGAATTACTGTTGATTCATTTCTCACACAAAATGAAATGTATGTACCTATTAAATTGCAATGTATTAATTTCTGTTTTTAGTTGCTTCTTTATTCATTGACTATTTTGCATGTTAAAAGACAATGGCATAACTTCACAATGTTGACGGTACCACCACATG]
[-] EMBL CD140027             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTACCGTTTGTGATTCTGTTACTAAGTCTAACATTACATTTCAAGTGACTGAATGCTC TTTTCTCCAAGATACTATTTACTTTCCCCCCTCCATCTTTAATGTAACAATAATCTATTTGCGCACTGAATTACTGTTGATTCATTTCTCACACAAAATGAAATGTATGTACCTATTAAATTGCAATGTATTAATTTCTGTTTTTAGTTGCTTCTTTATTCATTGACTATTTTGCATGTTAAAAGACAATGGCATAACTTCACAATGTTGACGGTACCACCACATG]




>consensus_9486#1
AGGCCAANAATTTGGCACGAGGGTGAATCAATCATGTTTCAAATGTATCCGACTGTCCGT
TCACCGATTCCACAAGGTGATGAAGGTAATCTAGTCAACAACATTTTTGTTGGTTAGATT
TTTTGTCAAAGATTTACTGTGATACCATAAAATAGGATTGTGAAATGCTTCCTTTTTACA
GTTTGTATGTGGTTATAAGCATATCAAACATTGAGAAGACTTTTCGTGTTTTCAAAACAC
TCCTATTGTGTTACACTGTTGTTGCACCATGTCAAACACACACGGTTGCTGGTAATTTGT
ATGCCTGTAAAACATTGAAAGCGTTTGCGGATTATTGTCTTATATGTATCATCAATCCTT
GTTCTCTGTATTTTTACAGTTCTCATTGTTCTATTCTTATTTTTTTTACTTACACCAATA
CCAAATAAATAAATAATTCTTCATGCCTTCTCTCTTTACATGTTATCATTTTTAAAAGTA
TAAACGTTACAATATCCGAATTGCATATTCCATTACCGTTTGTGATTCTGTTACTAAGTC
TAACATTACATTTCAAGTGACTGAATGCTCTTTTTCTCCAAGATACTATTTACTTTCCCC
CCTCCATCTTTAATGTAACAATAATCTATTTGCGCACTGAATTACTGTTGATTCATTTCT
CACACAAAATGAAATGTATGTACCTATTAAATTGCAATGTATTAATTTCTGTTTTTAGTT
GCTTCTTTATTCATTGACTATTTTGCATGTTAAAAGACAATGGCATAACTTCACAATGTT
GACGGTACCACCACATG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9486#0      AAGGATTTTAGTAATAACAACTGGCAGAATGATACATGGACAAA-CAATCATGTCAATTC 59
consensus_9486#1      -----------------AGGCCAANAATTTGGCACGAGGGTGAATCAATCATGT---TTC 40
                                          *    *   **  **  **   ** *********   ***

consensus_9486#0      AATTGCTGGTGGTGATGGTGATTNAGCTATGCTTCGATCAGCTAATGAAGGTGAAGTACC 119
consensus_9486#1      AAATGTATCCGAC--TGTCCGTTCACC---GATTCCACAAGGTGATGAAGGTAATCTAGT 95
                      ** **     *    **    ** * *   * *** *  ** * ******** *  **  

consensus_9486#0      TGAAGAAGTTCTTCATTTTCATGAAGTTATTGATCAGATTGAACGCATGGAAGAAGAAAT 179
consensus_9486#1      CAACAACATTTT---TGTTGGTTAGATTTTTTGTCAAAGATTTACTGTGATACCATAAAA 152
                        *  *  ** *   * **  * *  ** **  *** *         **  *  * *** 

consensus_9486#0      TTGTGATGATCACAAAGCTGTTTGTCATTCCATGAGCGATTGGACTAAGGAGCATTATTC 239
consensus_9486#1      TAG-GATTGTGAAATGCTTCCTTTTTACAGTTTGTATG--TGGTTATAAGCATATCAAAC 209
                      * * ***  * * *    *  ** * *     **   *  ***    * *   ** *  *

consensus_9486#0      TTTATACAAGATATCAAATCAAGTGGAATTCGATGTTGAAGAATACAGTGCTCGTTTAGA 299
consensus_9486#1      ATTG-AGAAGACTTTTCGTGTTTTCAAAACACTCCTATTGTGTTACACTGTTGTTGCACC 268
                       **  * ****  *    *    *  **       *       **** ** *  *  *  

consensus_9486#0      ATATCTACTTGGCAAACAAATTAAAGTTTTATCCTCTT-TAAAAGATAAAGTGACATTAT 358
consensus_9486#1      ATGTCAAACACACACGGTTGCTGGTAATTTGTATGCCTGTAAAACATTGAAAGCGTTTGC 328
                      ** ** *     **       *     *** *   * * ***** **  *  *   **  

consensus_9486#0      GGCGCCGTGATCTACG-ACAAGAAGAAGAATTAAGCACTAATTTACAACGAAATCATAAA 417
consensus_9486#1      GGATTATTGTCTTATATGTATCATCAATCCTTGTTCTCTGTATTTTTAC--AGTTCTCAT 386
                      **     **   **     *  *  **   **   * **   **   **  * *  * * 

consensus_9486#0      TTATAGTTTCTAACTCATTTTATTGACACAAAT--CAATAACATAAATAATATGAAATGT 475
consensus_9486#1      TGTTCTATTCTTATTTTTTTTACTTACACCAATACCAAATAAATAAATAATTCTTCATGC 446
                      *  *   **** * *  ***** * **** ***  ***  * *********     *** 

consensus_9486#0      TTAACAATTTTCACTGAATCAATCATGTTTCAAATGTATCCGACTGTCCGTTCACCGATT 535
consensus_9486#1      CTT-CTCTCTTTAC--ATGTTATCAT-TTTTAAAAGTATAAACGTTACAATATCCGAATT 502
                       *  *  * ** **  *    ***** *** *** ****     *  *  *   *  ***

consensus_9486#0      CCACAAGGTGATGAAGGTAATCTAGTCAACAACATTTTTGTTGGTTAGATTTTTTGTCAA 595
consensus_9486#1      GCATATTCCATTACCGTTTGTGATTCTGTTACTAAGTCTAACA-TTACATTTCAAGTGAC 561
                       ** *      *   * *  *         *  *  * *     *** ****   ** * 

consensus_9486#0      AGATTTACTGTGATACCATAAAATAGGATTGTGAAATGCTTCCTTTTTACAGTTTGTATG 655
consensus_9486#1      TGAAT-GCTCTTTTTCTCCAAGATACTATT-----TACTTTCCCCCCTCCATCTTTAATG 615
                       ** *  ** *  * *   ** ***  ***         ****    * **  **  ***

consensus_9486#0      TGGTTATAAGCATATCAAACGTTGAGAAGACTTTTCGTG---TTTTCAAAACACTCCTAT 712
consensus_9486#1      TAACAATAATCTATTTGCGCACTGA-ATTACTGTTGATTCATTTCTCACACAAAATGAAA 674
                      *    **** *   *    *  *** *  *** **  *    ** *** *  *     * 

consensus_9486#0      TGTGTTACACTGTTG--TTGCACCATGTCAAACACACATGGTTGCTGGTAATTTGTATGC 770
consensus_9486#1      TGTATGTACCTATTAAATTGCAATGTATTAATTTCTGTTTTTAGTTGCTTCTTTATTCAT 734
                      *** *    ** **   *****   * * **   *   *  * * ** *  *** *    

consensus_9486#0      -----ATGTAAAACATTGAAAG-CGTTTGCGGA---TTATTGTCTTATATGTATCATCAA 821
consensus_9486#1      TGACTATTTTGCATGTTAAAAGACAATGGCATAACTTCACAATGTTGACGGTACCACCAC 794
                           ** *   *  ** **** *  * **  *   * *   * **    *** ** ** 

consensus_9486#0      TCC 824
consensus_9486#1      ATG 797