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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9491#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1040 fasta sequence
[TTTTAGTTCGTCACGTTTCTTATACACTGTGGACCAAGAAGTTATATTCTCACTTTCCAAGAACGTATCCAAATGGATCTAT-AAAAAAAACAAATAATGGTAATGAAATTTATCACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAGTCTGAATATACTTGGACTCGTCTAATTTACAGTACACTTAAGGCTCCTACATATCATTTGTACTTTGAATTGCTACTAATTATTGGTATTATATGGTTATTGTTTAAACGCAGTTATCGTATTAATGACGTGATTAATCTAAGTGTGGAAGAAAAAAACCAACTGATTAGTGAATGGAAACCCGATAGTTTGGTTCCGAAAGATTGGGAACCATCAAAATATCTATTAAAACAATTCCACAGATGTGCATATGGTCCTCTTGGCAAATATGTCAATTTCAACTTGGAAGTGGAAGAGTTTGAAGCTACTGAAATGAATGTTAGTAAGAACCATCTCAATTTCGCGACATTAAATTTCTTAAACTTTGTTGGGGATTCGGATTTGTCTAATGTTGCTACTGAGCAGATGAAAAAATATGGTGTTGGATCATGTGGACCAAGAGGATTTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATGGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAAAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGAGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTTCGCATTTTGTTAGATGAGACCATTTCTTTTGGAGTATTAGGTAAAACTGGTAGGGG]
[+] EMBL CD081276 [TTTTAGTTCGTCACGTTTCTTATACACTGTGGACCAAGAAGTTATATTCTCACTTTCCAAGAACGTATCCAAATGGATCTAT AAAAAAAACAAATAATGGTAATGAAATTTATCACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAG TGAATATACTTGGACTCGTCTAATTTACAGTACACTTAAGGCTCCTACATATCATTTGTACTTTGAATTGCTACTAATTATTGGTATTATATGGTTATTGTTTAAACGCAGTTATCGTATTAATGACGTGATTAATCTAAGTGTGGAAGAAAAAAACCAACTGATTAGTGAATGGAAACCCGATAGTTTGGTTCCGAAAGATTGGGAACCATCAAAATATCTATTAAAACAATTCCACAGATGTGCATATGGTCCTCTTGGCAAATATGTCAATTTCAACTTGGAAGTGGAAGAGTTTGAAGCTACTGAAATGAATGTTAGTAAGAACCATCTCAATTTCGCGACATTAAATTTCTTAAACTTTGTTGGGGATTCGGATTTGTCTAATGTTGCTACTGAGCAGATGAAAAAATATGGTGTTGGATCATGTGGACCAAGAGGATTTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGNTATCTATTCTTATGGAGCAGC ]
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[-] EMBL CD163378 [ ACACACTTTCTTGCTCAAATCGGACCGCAGTCTGAATATACTTGGACTCGTCTAATTTACAGTACACTTAAGGCTCCTACATATCATTTGTACTTTGAATCGCTACTAATTATTGGTATTATATGGTTATTGTTTAAACGCAGTTATCGTATTAATGACGTGATTAATCTAAGTGTGGAAGAAAAAAACCAACTGATTAGTGAATGGAAACCCGATAGTTTGGTTCCGAAAGATTGGGAACCATCAAAATATCTATTAAAACAATTCCACAGATGTGCATATGGTCCTCTTGGCAAATATGTCAATTTCAACTTGGAAGTGGAAGAGTTTGAAGCTACTGAAATGAATGTTAGTAAGAACCATCTCAATTTCGCGACATTAAATTTCTTAAACTTTGTTGGGGATTCGGATTTGTCTAAT ]
[+] EMBL CD117318 [ AGATGAAAAAATATGGTGTTGGATCATGTGGACCAAGAGGATTTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATGGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAAAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGAGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTTCGCATTTTGTTAGATAAGACCATT ]
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[-] EMBL CD121222 [ cTTATGGTACTTTTGATGTTCATCTTGAATTGGAAAATAAATTAGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATAGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGTTACTGATAGCACAGGCGAAAAGAGACAAAGAAGATCCTAAACGTGCATTACTAACCCGCCGATTTTTTGTTGTTGAAGGTATTTATTTCAATTCTGGGGAAATATGTCCCTTATCTGAGCTTATTGCTTTAAAGTATAAATACAAAGTTCGCATTTTGTTAGATGAGACCATTTCTTTTGGAGTATTAGGTAAAACTG ]
[+] EMBL CD139773 [ AGCTGAATTCCTTGGTGTTGAAAAAGCAGTAATCTATTCTTATGGAGCAGCTACATTTTCTAGTGCTATTCCATCCTATTCCAAACGAACTGATGTAATATTTGCAGATGAACGTATCAGCCATGCTACGTATCTAGGATTAGTGGCATCTAGAAGTCATGTTCGATTTTTCCGTCATAATGATATGGAGCATTTGGAACAGT ]
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clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||