These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9496#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1221 fasta sequence [CTTTGTTGCGTTGTAGTGCAGCCCGAAAAACTTTGCGCCGTCAACTTTCGGTTACATTTGATATTTTCTCTTTATCTCACTTGTGTTACTTCTGATCGCTGTCAATTTCTCTCATTATAAGTAGAAGCCATCAGTAATGGGGAAATCTTCACGTGATAAGCGTGATATTTTACTATAGATTAGCTAAAGAAGAGGGTTGGAGAGCACGTAGCGCCTATAAGCTGCTACAGATTGATGATGAGTATGGAATTTTTTCTACTGAAAATACGCCTTTAGAACGAGTGGTTGATTTGTGTGCTG-CACCTGGTAGCTGGTCACAAGTATTATCAAAACGCTTATGGGAATCGAAATCCCCGGAGGACCAAAAATCTGTGAAAATCGTTGCCGTGGATTTACAGGCTATGGCTCCAATACCAGGAGTCATTCAAATTCAAGGCGATATTACTAGTCAGGATACGGCTCAACAGATTATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAGCTCCTGATCATATAGTCAAGCCACCAGTACAAGTTCCTGTGGATCCTGCTTATTCCGAAGTTTGCCGGTTCAGTCGTTTAAATCAATCAAATACTTCGAAATTTCAATCTTTGGAAAAGAACCATGAAATTGATGACAATGATGATATTTCTAGATTTACAAAACTTATGGAAAAGTTGTCTTTCGATTCAAGAGAAGATAATTTATGATGTTTGCTTTTTATAGACAAAACTGTTTTATTCCATAAACAAATAAATATAG] [+] EMBL CD183608 [CTTTGTTGCGTTGTAGTGCAGCCCGAAAAACTTTGCGCCGTCAACTTTCGGTTACATTTGATATTTTCTCTTTATCTCACTTGTGTTACTTCTGATCGCTGTCAATTTCTCTCATTATAAGTAGAAGCCATCAGTAATGGGGAAATCTTCACGTGATAAGCGTGATATTTTACTATAGATTAGCTAAAGAAGAGGGTTGGAGAGCACGTAGCGCCTATAAGCTGCTACAGATTGATGATGAGTATGGAATTTTTTCTACTGAAAATACGCCTTTAGAACGAGTGGTTGATTTGTGTGCTG CACCTGGTAGCTGGTCACAAGTATTATCAAAACGCTTATGGGAATCGAAATCCCCGGAGGACCAAAAATCTGTGAAAATCGTTGCCGTGGATTTACAGGCTATGGCTCCAATACCAGGAGTCATTCAAATTCAAGGCG ] [+] EMBL SMAA18504 [ GTTACATTTGATATTTTCTCTTTATCTCACTTTTTTTACTTCTGATCGCTGTCAATTTCTCTCATTATAAGTAGAAGCCATCATGAAGTTTTAAATCTTCACGTGATAAGCGTGATA TTTACTATAGATTAGCTAAAGAAGAGGGTTGGAGAGCACGGAGCGCCTATAAGCGGCTACATATTGATGATGAGTATGGAATTTTTTCTACTGAAAATACTCCTTTAGAACGAGTGGTTGATTTGTGTGCTGNCACC ] [-] EMBL CD062762 [ TCTGTGAAAATCGTTGCCGTGGATTTACAGGCTATGGCTCCAATACCAGGAGTCATTCAAATTCAAGGCGATATTACTAGTCAGGATACGGCTCAACAGATTATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTG ] [-] EMBL CD168224 [ TTCAAGGCGATATTACTAGTCAGGATACGGCTCAACAGATTATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAGCTCCTGATCATATAGTCAAGCCACC ] [+] EMBL CD067227 [ ACAGATTATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGCTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAAATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAATCGGAACTCTAGTTTATAGTCGTTCGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAG ] [+] EMBL CD193794 [ ATCAAACATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCT ] [+] EMBL CD078323 [ ATTTTGCCGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGCACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCca ] [+] EMBL CD078243 [ ATTTTGACGGTAAATTAGCTCAACTTGTTGTTTGTGATGGTGCTCCAGATGTGACAGGTCTACATGATTTGGACGAGTATGTTCAGTCGCATCTTATCTTAGCTGCTGTAACTATCTGTTCAAGAGTTCTTGAGCTAGGTGGTACATTTGTTGCCAAGGTTTTTCGTGGGCGAGATTCTGGTTTACTGGGTTCCCAACTTCGATGTTTATTTTCAGGTGAAGTTAGTTTTGCAAAACCAAGAGCTAGTCGGAACTCTAGTTTAGAGTCGTTTGTTATATGTCGTGGATTTATGGGTCCTCGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAGCTCCTGATCATATAGTCAAGCCACCAGTACAAGTTCCTGTGGATCCTGCTTATTCCGAAGTTTGCCGGTTCAGTCGTTTAAATCAATCAAATACTTCGAAATTTCAATCTTTGGAAAAGAACCATGAAATTGATGACAATG ] [-] EMBL CD067122 [ TGGATATATGGGTCATAGTTTACGGACAGATTTGAAACCATCCACACCTTGTGAGAATCACTCAAGCAACGATAATTTGTTATTATTATGGTACGACAAGGACAACTTTGAAGACGTTAATTCTTCTCAACAAGCTCTATTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTA ] [-] EMBL CD072881 [ TTACCATTCATAGCGTGTGGAGATCTAAGAGGTTTCGACCCAGATGTCACGTATACTTTAGCTCCTGATCATATAGTCAAGCCACCAGTACAAGTTCCTGTGGATCCTGCTTATTCCGAAGTTTGCCGGTTCAGTCGTTTAAATCAATCAAATACTTCGAAATTTCAATCTTTGGAAAAGAACAATGAAATTGATGGCAATGATGATATTTCTAGATTTACAAAACTTATGGAAAAGTTGTCTTTCGATTCAAGAGAAGATAATTTATGATGTTTGCTTTTTATAGACAAAACTGTTTTATTCCATAAACAAATAAATATAG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||