cluster # 9500

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9500 cluster # 9500 Sequences # 10 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9500#0 length = 1341 sequences # 10
consensusID : consensus_9500#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1341
fasta sequence
                              [TGTAAATATTTCCAGTCTACATGTTTCATCATCTTCATACTCCCTTTGTAAAGCCCCACATAACCGTAACATTTCGTTTTGTTCGCCGTGTACTAATACGACATAGCTTGGTTTTAGTTCTCGGATAAATGCACTCGTCTGTTGATAGTCAGTATGAGCAGAGAAACTAATATAATCCACCGAACATTTCAACGGTAACATCTGACCTGACATTGTCGGTACTTCAGTTGGTAGAGATAAAATTTGTTTTGCCAGAGTACCCTCAACACAATAGCCTGCAATAATTACTCCATTACGTTTGTCTGTGCACCAATTCCCAAACAGCTCTCGACTAAGACCAGACTGCATCATTCCGGGACTGGCCATAACCACACATGGACCAGAATCATCAAAATGTTCAATACTCTTTAAATTCGATATGTGTCGGAAACAGAATGGATTGTTGTTCGCTAGTTGGTTGCGAATTCGTTCGTTCATGGCATAAATATATGTTTGGTAAACTGCCATACATTTTCGTGCGAGCTGACTGGCATAATAGATAGGTATGTCGTGCAGTTCTGGATGATTGTCCCAATATTCATCAAGAATCAACATTAATTCTTGGGCTCTGCCAAGTGCAAATGCTGGAATCAAACAGCGTCCTCCACGGGTGACAATATCGTGAACTAAGCTAGTAAACCTAGCTTCCCTTTCTTCTCGTTTGTCATGGATATGGATACCATAAGTAGCTTCGGTTATCAGGACATCTGGGCGTATAGGAGGAATTTCAGCACACATTAAATGTCTATCTTCCTGTCGGCTGAAATCTCCAGTATATAAAATTTTCACACCAGCAATTTCTATTAGAAACATAGCTGCACCTAACACATGTCCAGCATGATAGGCAGAAAACTTTATCCCGTTAACTTCAAGTTCTTGGTGAAAATCTATGGTATCAATATGGTCTAAGCTAGCTACTATGTCTCGATCACTGTACAATAATTGATCCGGTAGG-CCGCCAGAATTACTGACGCGAACAAAGTCAGCAAGCAAATAACGATAAATAGCCTTCGTTGCATGTGTCATGTAACACTTTGACTTAGCTCCAGTCTTCAAAAGCAAATGTGGGAGCCCTCCACAGTGATCAAGATGAAAGTGACTAATCAAAATGAGGTCTGTCGTTTGGATATCTGGGATCGCATCAATGAATGGTAAGCTCTCTCGGTTGCGTAAGCCAGGATGTATACCACAATCAAGAATTATCTTCTTCCCTTTAAATGTTAACAGTATACATGACCTTCCAACTTCTTGACCAGCTCCAAGAGGCATAATCGTTAACTTATCACTTTCTTCATAAGTGTC]

[+] EMBL CD096605             [TGTAAATATTTCCAGTCTACATGTTTCATCATCTTCATACTCCCTTTGTAAAGCCCCACATAACCGTAACATTTCGTTTTGTTCGCCGTGTACTAATACGACATAGCTTGGTTTTAGTTCTCGGATAAATGCACTCGTCTGTTGATAGTCAGTATGAGCAGAGAAACTAATATAATCCACCGAACATTTCAACGGTAACATCTGACCTGACATTGTCGGTACTTCAGTTGGTAGAGATAAAATTTGTTTTGCCAGAGTACCCTCAACACAATAGCCTGCAATAATTACTCCATTACGTTTGTCTGTGCACCAATTCCCAAACAGCTCTCGACTAAGACCAGACTGCATCATTCCGGGACTGGCCATAACCACACATGGACCAGAATCATCAGAATGTTCAATACTCTTT AATTCGATATGTGTCCGGAACAGAATGGATTGTTGTTCGCTAGTTGGTTGCGAATTCCTTCGTTCATGGCATAAATATATGGTTGGNTAACTGCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD152714             [                                                                                                                                                                                                                                                                           ACAATAGCTTGCAATAATTATTCCATTACGTTTGTCTGTGCACCAATTCTCAAACAGCTCTCGATTAAGACCAGACTGCATCATTCCGGGACTGGCCATACCCACACATGGACCAGAATCATCAAAATGTTCAATACTCTTTAAATTCGATATGTGTCGGAAACAGAATGGATTGTTGTTCGCTAGTTGGTTGCGAATTCGTTCGTTCATGGCATAAATATATGTTTGGTAAACTGCCATACATTTTCGTGCGAGCTGACTGGCATAATAGATAGGTATGTCGTGCAGTTCTGGATGATTGTCCCAATATTCATCAAGAATCAACATTAATTCTTGGGCTCTGCCAAGTGCAAATGCTGGAATCAAACAGCGTCCTCCACGGGTGACAATATCGTGAAATAAGATAGTAAACCTCGCTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD189991             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGGACTGGCCATAACCACACATGGACCAGAATCATCAAAATGTTCAATACTCTTTAAATTCGATATGTGTCGGAAACAGAATGGATTGTTGTTCGCTAGTTGGTTGCGAATTCGTTCGTTCATGGCATAAATATATGTTTGGTAAACTGCCATACATTTTCGTGCGAGCTGACTGGCATAATAGATAGGTATGTCGTGCAGTTCTGGATGATCGTCCCAATATTCATCAAGAATCAACATTAATTCTTGGGCTCTGCCAAGTGCAAATGCTGGAATCAAACAGCGTCCTCCACGGGTGACAATATCGTGAACTAAGCTAGTAAACCTAGCTTCCCTTTCTTCTCGTTTGTCATGGATATGGATACCATAAGTAGCTTCGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD092460             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CACACATGGACCAGAATCATCANAATGTTCAATACTCTTTAAATTCGATATGTGTCGGAAACAGAATGGATTGTTGTTCGCTAGTTGGTTGCGAATTCGTTCGTTCATGGCATAAATATATGTTTGGTAAACTGCCATACATTTTCGTGCGAGCTGACTGGCATAATAGATAGGTATGTCGTGCAGTTCTGGATGATTGTCCCAATATTCATCAAGAATCAACATTAATCCTTGGGCTCTGCCAAGTGCAAATGCTGGAATCAAACAGCGTCCTCCACGGGTGACAATATCGTGAACTAAGCTAGTAAACCTAGCTTCCCTTTCTTCTCGTTTGTCATGGATATGGATACCATAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD154405             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATGTCGTGCAGTTCTGGATGATTGTCCCAATATTCATCAAGAATCAACATTAATTCTTGGGCTCTGCCAAGTGCAAATAGTGGAATCAAACAGCGTCCTCCACGGGTGACAATATCGTGAACTAAGCTAGTAAACCTAGCTTCCCTTTCTAGTCGTTTGTCATGGATATGGATACCATAAGTAGCTTCGGTTATCAGGACATCTGGGCGTATAGGAGGAATTTCAGCACACATTAAATGTCTATCTTCCTGTCGGCTGAAATCTCCAGTATATAAAATTTTCACACCAGCAATTTCTATTAGAAACATAGCTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD183446             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GGAATCAAACAGCGTCCTCCACGGGTGACAATATCGTGAACTAAGCTAGTAAACCTAGCTTCCCTTTCTTCTCGTTTGTCATGGTTATGGATACCATAAGTAGCTTCGGTTATCAGGACATCTGGGCGTATAGGAGGAATTTCAGCACACATTAAATGTCTATCTTCCTGTCGGCTGAAATCTCCAGTATATAAAATTTTCACACCAGCAATTTCTATTAGAAACATAGCTGCACCTAACACATGTCCAGCATGATAGGCAGAAAACTTTATCCCGTTAACTTCAAGTTCTTGGTGAAAATCTATGGTATCAATATGGTCTAAGCTAGCTACTATGTCTCGATCACTGTACAATAATTGATCCGGTAGG CCGCCAGAATTACTGACGCGAACAAAGTCAGCAAGCAAATAACGATAAATAGCCTTCGTTGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD146632             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TATCGTGAACTAAGCTAGTAAACCTAGCTTCCCTTTCTTCTCGTTTGTCATGGATATGGATACCATAAGTAGCTTCGGTTATCAGGACATCTGGGCGTATAGGAGGAATTTCAGCACACATTAAATGTCTATCTTCCTGTCGGCTGAAATCTCCAGTATATAAAATTTTCACACCAGCAATTTCTATTAGAAACATAGCTGCACCTAACACATGTCCAGCATGATAGGCAGAAAACTTTATCCCGTTAACTTCAAGTTCTTGGTGAAAATCTATGGTATCAATATGGTCTAAGCTAGCTACTATGTCTCGATCACTGTACAATAATTGATCCGGTAGG CCGCCAGAATTACTGACGCGAACAAAGTCAGCAAGCAAATAACGATAAATAGCCTTCGTTGCATGTGTCATGTAACACTTTGACTTAGCTCCAGTCTTCANAAGCANATGTGGGAGCCCTCCACAGTGATCAAGATGAAAGTGACTAA                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD113937             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tttccCTTCTCGTTTGTCATGGATATGGATACCATAAGTAGCTTCGGTTATCAGGACATCTGGGCGTATAGGAGGAATTTCAGCACACATTAAATGTCTATCTTCCTGTCGGCTGAAATCTCTTTTTTATAAAATTTTCACACCAGCAATTTCTATTAGAAACATAGCTGCACCTAACACATGTCCAGCATGATAGGCAGAAAACTTTATCCCGTCAACTTCAAGTCCTTGGTGAAAATCTATGGTATCAATATGGTCTAAGCTAGCTACTATGTCTCGATCACTGCACAATAATTGATCCGGTAGGCCCGCCACAATTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD188324             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATGGTATCAATATGGTCTAAGCTAGCTACTATGTCTCGATCACTGTACAATAATTGATCCGGTAGG CCGCCAGAATTACTGACGCGAACAAAGTCAGCAAGCAAATAACGATAAATAGCCTTCGTTGCATGTGTCATGTAACACTTTGACTTAGCTCCAGTCTTCAAAAGCAAATGTGGGAGCCCTCCACAGTGATCAAGATGAAAGTGACTAATCAAAATGAGGTCTGTCGTTTGGATATCTGGGATCGCATCAATGAATGGTAAGCTCTCTCGGTTGCGTAAGCCAGGATGTATACCACAATCAAGAATTATCTTCTTCCCTTTAAATGTTAACAGTATACATGACCTTCCAACTTCTTGACCAGCTCCAAGAGGCATAATCGTTAACTTATCACTTTCTTCATAAGTGTC]
[+] EMBL CD188322             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ATGGTATCAATATGGTCTAAGCTAGCTACTATGTCTCGATCACTGTACAATAATTGATCCGGTAGG CCGCCAGAATTACTGACGCGAACAAAGTCAGCAAGCAAATAACGATAAATAGCCTTCGTTGCATGTGTCATGTAACACTTTGACTTAGCTCCAGTCTTCAAAAGCAAATGTGGGAGCCCTCCACAGTGATCAAGATGAAAGTGACTAATCAAAATGAGGTCTGTCGTTTGGATATCTGGGATCGCATCAATGAATGGTAAGCTCTCTCGGTTGCGTAAGCCAGGATGTATACCACAATCAAGAATTATCTTCTTCCCTTTAAATGTTAACAGTATACATGACCTTCCAACTTCTTGACCAGCTCCAAGAGGCATAATCGTTAACT                      ]




>consensus_9500#0
TGTAAATATTTCCAGTCTACATGTTTCATCATCTTCATACTCCCTTTGTAAAGCCCCACA
TAACCGTAACATTTCGTTTTGTTCGCCGTGTACTAATACGACATAGCTTGGTTTTAGTTC
TCGGATAAATGCACTCGTCTGTTGATAGTCAGTATGAGCAGAGAAACTAATATAATCCAC
CGAACATTTCAACGGTAACATCTGACCTGACATTGTCGGTACTTCAGTTGGTAGAGATAA
AATTTGTTTTGCCAGAGTACCCTCAACACAATAGCCTGCAATAATTACTCCATTACGTTT
GTCTGTGCACCAATTCCCAAACAGCTCTCGACTAAGACCAGACTGCATCATTCCGGGACT
GGCCATAACCACACATGGACCAGAATCATCAAAATGTTCAATACTCTTTAAATTCGATAT
GTGTCGGAAACAGAATGGATTGTTGTTCGCTAGTTGGTTGCGAATTCGTTCGTTCATGGC
ATAAATATATGTTTGGTAAACTGCCATACATTTTCGTGCGAGCTGACTGGCATAATAGAT
AGGTATGTCGTGCAGTTCTGGATGATTGTCCCAATATTCATCAAGAATCAACATTAATTC
TTGGGCTCTGCCAAGTGCAAATGCTGGAATCAAACAGCGTCCTCCACGGGTGACAATATC
GTGAACTAAGCTAGTAAACCTAGCTTCCCTTTCTTCTCGTTTGTCATGGATATGGATACC
ATAAGTAGCTTCGGTTATCAGGACATCTGGGCGTATAGGAGGAATTTCAGCACACATTAA
ATGTCTATCTTCCTGTCGGCTGAAATCTCCAGTATATAAAATTTTCACACCAGCAATTTC
TATTAGAAACATAGCTGCACCTAACACATGTCCAGCATGATAGGCAGAAAACTTTATCCC
GTTAACTTCAAGTTCTTGGTGAAAATCTATGGTATCAATATGGTCTAAGCTAGCTACTAT
GTCTCGATCACTGTACAATAATTGATCCGGTAGGCCGCCAGAATTACTGACGCGAACAAA
GTCAGCAAGCAAATAACGATAAATAGCCTTCGTTGCATGTGTCATGTAACACTTTGACTT
AGCTCCAGTCTTCAAAAGCAAATGTGGGAGCCCTCCACAGTGATCAAGATGAAAGTGACT
AATCAAAATGAGGTCTGTCGTTTGGATATCTGGGATCGCATCAATGAATGGTAAGCTCTC
TCGGTTGCGTAAGCCAGGATGTATACCACAATCAAGAATTATCTTCTTCCCTTTAAATGT
TAACAGTATACATGACCTTCCAACTTCTTGACCAGCTCCAAGAGGCATAATCGTTAACTT
ATCACTTTCTTCATAAGTGTC
clustalw multiple alignements is not computed in this case