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consensusID : consensus_9505#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 1022 fasta sequence
[AGGGCCAAAATTCGGCACGAGGCGGCACGAGGTTATATGGAAATAAAAATGAAATTAATAATCTGGATTTTTTTTATATTTGTAACAACAGTTTTCTCAGGGCGTGAAGAAAGCTTTTCTAAGCATAGAAATGATGAAAATTCTAGAAAA-CATCACAGCCGAAAAAGTCAAACAGAAAATAATGATATGGCTGAGTTCGGAACCAATTGGAATGTAAAGAATAATATGGATAATGATTTTGAGTCAGCTTTTGGGTCAGGACGTTCCATATCTAAATATAAACACATAAAAGCTAGAGCTTACGATGCAAAAGGGAAATTTCAATCACGT-GGAACTAGAGGTTATGGTATGGTCTCCTCAGAATCCTCACAATTTTTAATTGAAGAGACTTTGGATAAATATGGTCGACCAAAACCTATTAAATCGAAATTCAAAACTCGTGGGAAAAAAAAGAAATATTCTAAAAAAATTGTTGATAATCAATTCGACATTAAAGGTGGTTTATTTGAAGGACATAAATATAAACAAACTGGTGATTATCAAGCAAATGGTACTCATGTTTACATCAATGTGCGAAATGAA-AATGAGATGGATAATAAATTGAAATCAAATTTGAATAGTAATAGACGGCATGATAAAAACTTAAGTGTAAGTATAGATACCCAAGACAATCATGAACGTAATCAGCATATGGCTATATTCAATTCATAAAATATCTCTTGAGTTATTTAAAACTTTTGTTCAAACAATGGAATTATATCAGATTGAATAATTTTATCTATAACAACTTCCTAATTACT-GTTTTCTTATCTTCTCTATTTCTACTTCAATTTCTTAATAATGATAAT-CCATTTAAAATAATATTTGGAAATTTGTTTTTC--TTNNTTT-AANAAAAAC-AAC-ATCT-CATGT-AATC-TG-NATA-TGAC-ATAA--TNTTG-TC-ATAT-GAATC--ACT-ATAAATTTTGAATAGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]
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[+] EMBL CD080503 [ CTTTTCTAAGCATAGAAATGATGAAAATTCTAGAAAANCATCACAGCCGAAAAAGTCAAACAGAAAATAATGATATGGCTGAGTTCGGAACCAATTGGAATGTAAAGAATAATATGGATAATGATTTTGAGTCAGCTTTTGGGTCAGGACGTTCCATATCTAAATATAAACACATAAAAGCTAGAGCTTACGATGCAAAAGGGAAATTTCAATCACGT GGAACTAGAGGTTATGGTATGGTCTCCTCAGAATCCTCACAATTTTTAATTGAAGAGACTTTGGATAAATATGGTCGACCAAAACCTATTAAATCGAAATTCAAAACTCGTGGGAAAAAAAAGAAATATTCTAAAAAAATTGTTGATAATCAATTCGACATTAAAGGTGGTTTATTTGAAGGACATAAATATAAACAAACTGGTGATTATCAAGCAAATGGTACTCATGTTTACATCAATGTGCGAAATGAA AATGAGATGGATAATAAATTGAAATCAAATTTGAATAGTAATAGACGGCATGATAAAAACTTAAGTGTAAGTATAGATACCCAAGACAATCATGAACGTAATCAGCATATGGCTATATTCAATTCATAAAATATCTCTTGAGTTATTTAAAACTTTTGTT ]
[+] EMBL SM938 [ nCAATTGGAATGTAAAGAATAATATGGATAATGATTTNGAGTCAGCTTTTGGGTCAGGACGTTCCATATCTAAATATAAACACATAAAAGCTAGAGCTNACGATGCAAAAGGGAAATTTCAATCACGTGGGAACTAGAGGTTATGGTATGGTCTCCTCAGAATCCTCACAATTTTTAATTGAAGAGACTTTGGNTAAATATGGTCGACCAAAACCTATTAAATCGAAATTCAAAACTCGTGGGAAAAAAAAGAANTATTCTAAAAAAATTGTTGATNATCANTTCGACATTAAAGGTGGTTTATTTGANGGACATAANTATAAACAAACTGGTGATTATCAAGCAANTGGTACTCATGTTTACATCAATGTGCGAAATGAACAAT ]
[-] EMBL CD074519 [ TTCAATCACGT GGAACTAGAGGTTATGGTATGGTCTCCTCAGAATCCTCACAATTTTTAATTGAAGAGACTTTGGATAAATATGGTCGACCAAAACCTATTAAATCGAAATTCAAAACTCGTGGGAAAAAAAAGAAATATTCTAAAAAAATTGTTGATAATCAATTCGACATTAAAGGTGGTTTATTTGAAGGACATAAATATAAACAAACTGGTGATTATCAAGCAAATGGTACTCATGTTTACATCAATGTGCGAAATGAA AATGAGATGGATAATAAATTGAAATCAAATTTGAATAGTAATAGACGGCATGATAAAAACTTAAGTGTAAGTATAGATACCCAAGACAATCATGAACGTAATCAGCATATGGCTATATTCAATTCATAAAATATCTCTTGAGTTATTTAAAACTTTTGTTCAAACAATGGAATTATATCAGATTGAATAATTTTATCTATAACAACTTCCTAATTACT GTTTTCTTATCTTCTCTATTTCTACTTCAATTTCTTAATAATGATAAT CCATTTAAAATAATATTTGGAAATTTGTTTTTC ]
[-] EMBL CD074340 [ TTATGGTATGGTCTCNTCAGAATCCTCACAATTTTTAATTGAAGAGACTTTGGATAAATATGGTCGACCAAAACCTATTAAATCGAAATTCAAAACTCGTGGGAAAAAAAAGAAATATTCTAAAAAAATTGTTGATAATCAATTCGACATTAAAGGTGGTTTATTTGAAGGACATAAATATAAACAAACTGGTGATTATCAAGCAAATGGTACTCATGTTTACATCAATGTGCGAAATGAA AATGAGATGGATAATAAATTGAAATCAAATTTGAATAGTAATAGACGGCATGATAAAAACTTAAGTGTAAGTATAGATACCCAAGACAATCATGAACGTAATCAGCATATGGCTATATTCAATTCATAAAATATCTCTTGAGTTATTTAAAACTTTTGTTCAAACAATGGAATTATATCAGATTGAATAATTTTATCTATAACAACTTCCTAATTACT GTTTTCTTATCTTCTCTATTTCTACTTCAATTTCTTAATAATGATAAT CCATTTAAAATAATATTTGGAAATTTGTTTTTC ]
[-] EMBL CD074413 [ AATCGAAATTCAAAACTCGTGGGAAAAAAAAGAAATATTCTAAAAAAATTGTTGATAATCAATTCGACATTAAAGGTGGTTTATTTGAAGGACATAAATATAAACAAACTGGTGATTATCAAGCAAATGGTACTCATGTTTACATCAATGTGCGAAATGAA AATGAGATGGATAATAAATTGAAATCAAATTTGAATAGTAATAGACGGCATGATAAAAACTTAAGTGTAAGTATAGATACCCAAGACAATCATGAACGTAATCAGCATATGGCTATATTCAATTCATAAAATATCTCTTGAGTTATTTAAAACTTTTGTTCAAACAATGGAATTATATCAGATTGAATAATTTTATCTATAACAACTTCCTAATTACT GTTTTCTTATCTTCTCTATTTCTACTTCAATTTCTTAATAATGATAAT CCATTTAAAATAATATTTGGAAATTTGTTTTTC ]
[-] EMBL AI976388 [ AACCAATCTGGTGATTATCAAGCAAATGGTACTCATGTTTACATCAATGTGCGAAATGAA AATGAGATGGATAATAAATTGAAATCAAATTTGAATAGTAATAGACGGCATGATAAAAGCTTAAGTGTAAGTATAGATACCCAAGACAATCATGAACGTAATCAGCATATGGCTATATTCAATTCATAAAATATCTCTTGAGTTATTTAAAACTTTTGTTCAAACAATGGAATTATATCAGATTGAATAATTTTATCTATAACAACTTCCTAATTACT GTTTTCTTATCTTCTCAATTTCTACTTCAATTTCTTAATAATGATAAT CCATTTAAAATAATATTTGGAAATTTGTTTTTCATTTTTTTTAAAAAAAAACAAACAATCTACATGTAAATCTTGTAATATTGACAATAAATTTTTGTTCAATATAGAATCAAACTAATAAATTTTGAATAGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGCCATGCAGCTGCATTACCGTACTGCGTA]
consensusID : consensus_9505#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 706 fasta sequence
[CTCGAGGTCCAGAATTCGGCACGAGGTTATTGACTAAAGTGGCTTCTATTTTATGGAAATAAAAATGAAATTAATAATCTGGATTTTTTTTATATTTGTAACAACAGTTTTCTCAGGGCGTGAAGAAAGCTTTTCTAAGCATAGAAATGATGAAAATTCTAGAAAACATCACAGCCGAAAAAGTCAAACAGAAAATAATGATATGGCTGAGTTCGGAACCAATTGGAATGTAAAGAATAATATGGATAATGATTTTGAGTCAGCTTTTGGGTCAGGACGTTCCATATCTAAATATAAACACATAAAAGCTAGAGCTTACGATGCAAAAGGGAAATTTCAATCACGTGGAACTAGAGGTTATGGTATGGTCTCCTCAGAATCCTCACAATTTTTAATTGAAGAGACTTTGGATAAATATGGTCGACCAAAACCTATTAAATCGAAATTCAAAACTCGTGGGAAAAAAAAGAAATATTCTAAAAAAATTGTTGATAATCAATTCGACATTTAAGGTGGTTTATTTGAAGGACATAAATATAAACAAACTGGTGATTATCAAGCAAATGGTACTCATGTTTACATCAATGTGCGAAATGAAAATGAGATGGATAATAAATTGAAATCAAATTTGAATAGTAATAGACGGCATGATAAAAACTTAAGTGTAAGTATAGATACCCAAGACAATCATGAAACGTATCAGCAT]
[+] EMBL CD077839 [CTCGAGGTCCAGAATTCGGCACGAGGTTATTGACTAAAGTGGCTTCTATTTTATGGAAATAAAAATGAAATTAATAATCTGGATTTTTTTTATATTTGTAACAACAGTTTTCTCAGGGCGTGAAGAAAGCTTTTCTAAGCATAGAAATGATGAAATTTCTAGAAAACATCACAG ]
[+] EMBL CD083380 [ aaaaaaaTTATTGACTAAAGTGGCTTCTATTTTATGGAAATAAAAATGAAATTAATAATCTGGATTTTTTTTATATTTGTAACAACAGTTTTCTCAGGGCGTGAAGAAAGCTTTTCTAAGCATAGAAATGATGAAAATTCTAGAAAACATCACAGCCGAAAAAGTCAAACAGAAAATAATGATATGGCTGAGTTCGGAACCAATTGGAATGTAAAGAATAATATGGATAATGATTTTGAGTCAGCTTTTGGGTCAGGACGTTCCATATCTAAATATAAACACATAAAAGCTAGAGCTTACGATGCAAAAGGGAAATTTCAATCACGTGGAACTAGAGGTTATGGTATGGTCTCCTCAGAATCCTCACAATTTTTAATTGAAGAGACTTTGGATAAATATGGTCGACCAAAACCTATTAAATCGAAATTCAAAACTCGTGGGAAAAAAAAGAAATATTCTAAAAAAATTGTTGATAATCAATTCGACATTTAAGGTGGTTTA ]
[+] EMBL CD080427 [ AAGTGGCTTCTATTTTATGGAAATAAAAATGAAATTAATAATCTGGATTTTTTTTATATTTGTAACAACAGTTTTCTCAGGGCGTGAAGAAAGCTTTTCTAAGCATAGAAATGATGAAAATTCTAGAAAACATCACAGCCGAAAAAGTCAAACAGAAAATAATGATATGGCTGAGTTCGGAACCAATTGGAATGTAAAGAATAATATGGATAATGATTTTGAGTCAGCTTTTGGGTCAGGACGTTCCATATCTAAATATAAACACATAAAAGCTAGAGCTTACGATGCAAAAGGGAAATTTCAATCACGTGGAACTAGAGGTTATGGTATGGTCTCCTCAGAATCCTCACAATTTTTAATTGAAGAGACTTTGGATAAATATGGTCGACCAAAACCTATTAAATCGAAATTCAAAACTCGTGGGAAAAAAAAGAAATATTCTAAAAAAATTGTTGATAATCAATTCGACATTAAAGGTGGTTTATTTGAAGGACATAAATATAAACAAACTGGTGATTATCAAGCAAATGGTACTCATGTTTACATCAATGTGCGAAATGAAAATGAGATGGATAATAAATTGAAATCAAATTTGAATAGTAATAGACGGCATGATAAAAACTTAAGTGTAAGTATAGATACCCAAGACAATCATGAAACGTATCAGCAT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_9505#0 ----AGGGCCAAAATTCGGCACGAGGC----GGCACGAG--------GTTATATGGAAAT 44
consensus_9505#1 CTCGAGGTCCAGAATTCGGCACGAGGTTATTGACTAAAGTGGCTTCTATTTTATGGAAAT 60
*** *** ************** * * ** ** *********
consensus_9505#0 AAAAATGAAATTAATAATCTGGATTTTTTTTATATTTGTAACAACAGTTTTCTCAGGGCG 104
consensus_9505#1 AAAAATGAAATTAATAATCTGGATTTTTTTTATATTTGTAACAACAGTTTTCTCAGGGCG 120
************************************************************
consensus_9505#0 TGAAGAAAGCTTTTCTAAGCATAGAAATGATGAAAATTCTAGAAAACATCACAGCCGAAA 164
consensus_9505#1 TGAAGAAAGCTTTTCTAAGCATAGAAATGATGAAAATTCTAGAAAACATCACAGCCGAAA 180
************************************************************
consensus_9505#0 AAGTCAAACAGAAAATAATGATATGGCTGAGTTCGGAACCAATTGGAATGTAAAGAATAA 224
consensus_9505#1 AAGTCAAACAGAAAATAATGATATGGCTGAGTTCGGAACCAATTGGAATGTAAAGAATAA 240
************************************************************
consensus_9505#0 TATGGATAATGATTTTGAGTCAGCTTTTGGGTCAGGACGTTCCATATCTAAATATAAACA 284
consensus_9505#1 TATGGATAATGATTTTGAGTCAGCTTTTGGGTCAGGACGTTCCATATCTAAATATAAACA 300
************************************************************
consensus_9505#0 CATAAAAGCTAGAGCTTACGATGCAAAAGGGAAATTTCAATCACGTGGAACTAGAGGTTA 344
consensus_9505#1 CATAAAAGCTAGAGCTTACGATGCAAAAGGGAAATTTCAATCACGTGGAACTAGAGGTTA 360
************************************************************
consensus_9505#0 TGGTATGGTCTCCTCAGAATCCTCACAATTTTTAATTGAAGAGACTTTGGATAAATATGG 404
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consensus_9505#1 TCGACCAAAACCTATTAAATCGAAATTCAAAACTCGTGGGAAAAAAAAGAAATATTCTAA 480
************************************************************
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********************************** ********
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consensus_9505#1 ------------------------------------------------------------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||