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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9509#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1302 fasta sequence
[TACCGCTGAACAGCTTGTTTGGCTGCAATTTATCAGCAATGCACGATCCTTTTGACCTGACGCATATAGGACTCAAAAGAAAATGCAGAGTATGTGGCTAAAACACTATGTTATCCATTTTCTTTTGAAATGATATCACTACTATTTACGGATTACCCATCTGTCATCTACACCCGTAAATTTTCTACGATAACCACTTCCAATTCATAAGAAAATATTATTAAAGAACGAGTATTTGACTAAATGTTGCCTACAACGAGAATACCGAGTCAGATAATCTTATCATTGGGTTGTTTCTTTCTGGTTCACCATATTTTTGTACATTCATTATCTGACGTC-GTTCAAAATGTCGATGTAAATGGTTCTCATCCATCTGTATCATTATTATCAGCTTCCAACTTATNCTCACCTAAAAATGAGCCGAGTGCAAATCAAACCACACAGGCTAAATGGCAGTATTTATGTCCATATATGAAGTACAAATGTAGTGAGTTACCAGGTTATTGTCTTATATGCAACTTCAATACTTCATGTGTTTATGGTACAGTAGTCAATGTTACTTGCTTTCCACGTCCAGGAGTTTATTGCAAAGTTCCAAGTAGTATAACTCAAGAAAACCAAACTTCTCAAACGAATTCATCAGAGTTTTCTTATCCTATGAGTGATCAAACAAATTACATAATTCAAAAACCGATTGTTTGTCGATTTTGCCACCAGTTGGATGATACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAATGTACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATCTTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTTTTTATTTAGGCATGTGGATAGAAGGATTAGGCAAATTGTTCAGCTTCGGTGGCCTTGGTTTATGGAGTATTGTTGACTTTATCTTAATTGTATCCGGATATGTAAAGCCTCCTGGAGATGCTGTATACTGGTGATATAATATGAAACAATAATGAAATAACTCACCCATATAATTCAAGCTAATTTATACCTTTTACCATCTCCAATAAGTTCAACAACTATNTCGTGCTNTAATTCTTCCTGTCTTCAATATATAATTATGTCCTCCAAGAGTTAGTTTCTAGTACTTGAACATATATTAATAACTTGTATATTTTTTATGTATTTATTGTTGGTTATTCTGTAACATGTAATTGCTTAAAGTC]
[+] EMBL BF936976 [TACCGCTGAACAGCTTGTTTGGCTGCAATTTATCAGCAATGCACGATCCTTTTGACCTGACGCATATAGGACTCAAAAGAAAATGCAGAGTATGTGGCTAAAACACTATGTTATCCATTTTCTTTTGAAATGATATCACTACTATTTACGGATTACCCATCTGTCATCTACACCCGTAAATTTTCTACGATAACCACTTCCAATTCATAAGAAAATATTATTAAAGAACGAGTATTTGACTAAATGTTGCCTACAACGAGAATACCGAGTCAGATAATCTTATCATTGGGTTGTTTCTTTCTGGTTCACCATATTTTTGTACATTCATTATCTGACGTC GTTCAAAATGTCGATGTAAATGGTTCTCATCCATCTGTATCATTATTATCAGCTTCCAACTTATCCTCACCTAAAAATGAGCCGAGTGCAAATCAAACCACACAGGCTAAATGGCAGTATTTATGTCCATATATGAAGTACAAATGTAGTGAGTTACCAGGTTATTGTCTTATATGCAACTTCAATACTTC ]
[+] EMBL SMAA69093 [ TCATTGGGTTGTTTCTTTCTGGTTCACCATATTTTTGTACATTCATTATCTGACGTCAGTTCAAAATGTCGATGTAAATGGTTCTCATCCATCTGTATCATTATTATCAGCTTCCAACTTATNCTCACCTAAAAATGAGCCGAGTGCAAATCAAACCACACAGGCTAAATGGCAGTATTTATGTTCATATATGAAGTACAAATGTAGTGAGTTACCAGGTT ]
[+] EMBL SMAA69034 [ TCATTGGGTTGTTTCTTTCTGGTTCACCATATTTTTGTACATTCATTATCTGACGTCAGTTCAAAATGTCGATGTAAATGGTTCTCATCCATCTGTATCATTATTATCAGCTTCCAACTTATNCTCACCTAAAAATGAGCCGAGTGCAAATCAAACCACACAGGCTAAATGGCAGTATTTATGTTCATATATGAAGTACAAATGTAGTGAGTTACCAGGTT ]
[+] EMBL CD191445 [ ATGGCAGTATTTATGTCCATATATAAAGTACAAATGTAGTGAGTTACCAGGTTATTGTCTTATATGCAACTTCAATACTTCATGTGTTTATGGTACAGTAGTCAATGTTACTTGCTTTCCACGTCCAGGAGTTTATTGCAAAGTTCCAAGTAGTATAACTCAAGAAAACCAAACTTCTCAAACGAATTCATCAGAGTTTTCTTATCCTATGAGTGATCAAACAAATTACGTAATTCAAAAACCGATTGTTTGTCGATTTTGCCACCAGTTGGATGATACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAATGTACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGT ]
[+] EMBL CD126501 [ GTTACTTGCTTTCCACGTCCAGGAGTTTATTGCAAAGTTCCAAGTAGTATAACTCAAGAAAACCAAACTTCTCAAACGAATTCATCAGAGTTTTCTTATCCTATGAGTGATCAAACAAATTACATAATTCAAAAACCGATTGTTTGTCGATTTTGCCACCTGTTGGATGATACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACC ]
[+] EMBL CD122202 [ GTATAACTCAAGAAAACCAAACTTCTCAAACGAATTCATCAGAGTTTTCTTATCCTATGAGTGATCAAACAAATTACATAATTCAAAAACCGATTGTTTGTCGATTTTGCCACCAGTTGGATGATACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAATGTACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATCTTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTTTTTATTTAGGCATGTGGATAGAAGGATTAGGCAAATTGTTCAGCTTCGGTGGCCTTGGTTTATGGAGTATTGTTGACTTTATCTTAATTGTATCCGGATATGTAAAGCCTCCTGGAGATGCTGTATACTGGTGATATAATATGAAACAATAATGAAATAACTCACCCATATAATTCAAGCTAATTTATACCTTTTACCATCTCCAATAAGTTCAACAACTATNTCGTGCTNTAATTC ]
[+] EMBL CD091352 [ GTATAACTCAAGAAAACCAAACTTCTCAAACGAATTCATCAGAGTTTTCTTATCCTATGAGTGATCAAACAAATTACATAATTCAAAAACCGATTGTTTGTCGATTTTGCCACCAGTTGGATGATACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAATGTACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATCTTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTTTTTATTTAGGCA ]
[+] EMBL CD180871 [ ACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAACGTACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATCTTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTTTTTATTTAGGCATGTGGATAGAAGGATTAGGCAAATTGTTCAGCTTCGGTGGCCTTGGTTTATGGAGTATTGTTGACTTTATCTTAATTGTATCCGGATATGTAAAGCCTCCTG ]
[+] EMBL CD181014 [ ACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAATGTACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATCTTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTT ]
[-] EMBL CD160659 [ TACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATCCTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTTTTTATTTAGGCATGTGGATAGAAGGATTAGGCAAATTGTTCAGCTTCGGTGGCCTTGGTTTATGGAGTATTGTTGACTTTATCTTAATTGTATCCGGATATGTAAAGCCTCCTGGAGATGCTGTATACTGGTGATATAATATGAAACAATAATGAAATAACTCACCCATATAATTCAAGCTAATTTATACTTTTTACCATCTCCAATAAGTTCAACAACTATTTCGTGCTTTAATCCTTCCTGTCTTCAATATATAATTATGTCCTCCAAGAGTTAGTTTCTAGTACTTGAACATATATTAATAACTTGTATATTTTTTATGTATTTATTGTTGGTTATTCTGTAACATGTAATTGCTTAAAGTC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||