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Schistosoma mansoni
cluster # 9509 cluster # 9509       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9509#0 length = 1302 sequences # 10  

consensusID : consensus_9509#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1302
fasta sequence
                              [TACCGCTGAACAGCTTGTTTGGCTGCAATTTATCAGCAATGCACGATCCTTTTGACCTGACGCATATAGGACTCAAAAGAAAATGCAGAGTATGTGGCTAAAACACTATGTTATCCATTTTCTTTTGAAATGATATCACTACTATTTACGGATTACCCATCTGTCATCTACACCCGTAAATTTTCTACGATAACCACTTCCAATTCATAAGAAAATATTATTAAAGAACGAGTATTTGACTAAATGTTGCCTACAACGAGAATACCGAGTCAGATAATCTTATCATTGGGTTGTTTCTTTCTGGTTCACCATATTTTTGTACATTCATTATCTGACGTC-GTTCAAAATGTCGATGTAAATGGTTCTCATCCATCTGTATCATTATTATCAGCTTCCAACTTATNCTCACCTAAAAATGAGCCGAGTGCAAATCAAACCACACAGGCTAAATGGCAGTATTTATGTCCATATATGAAGTACAAATGTAGTGAGTTACCAGGTTATTGTCTTATATGCAACTTCAATACTTCATGTGTTTATGGTACAGTAGTCAATGTTACTTGCTTTCCACGTCCAGGAGTTTATTGCAAAGTTCCAAGTAGTATAACTCAAGAAAACCAAACTTCTCAAACGAATTCATCAGAGTTTTCTTATCCTATGAGTGATCAAACAAATTACATAATTCAAAAACCGATTGTTTGTCGATTTTGCCACCAGTTGGATGATACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAATGTACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATCTTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTTTTTATTTAGGCATGTGGATAGAAGGATTAGGCAAATTGTTCAGCTTCGGTGGCCTTGGTTTATGGAGTATTGTTGACTTTATCTTAATTGTATCCGGATATGTAAAGCCTCCTGGAGATGCTGTATACTGGTGATATAATATGAAACAATAATGAAATAACTCACCCATATAATTCAAGCTAATTTATACCTTTTACCATCTCCAATAAGTTCAACAACTATNTCGTGCTNTAATTCTTCCTGTCTTCAATATATAATTATGTCCTCCAAGAGTTAGTTTCTAGTACTTGAACATATATTAATAACTTGTATATTTTTTATGTATTTATTGTTGGTTATTCTGTAACATGTAATTGCTTAAAGTC]

[+] EMBL BF936976             [TACCGCTGAACAGCTTGTTTGGCTGCAATTTATCAGCAATGCACGATCCTTTTGACCTGACGCATATAGGACTCAAAAGAAAATGCAGAGTATGTGGCTAAAACACTATGTTATCCATTTTCTTTTGAAATGATATCACTACTATTTACGGATTACCCATCTGTCATCTACACCCGTAAATTTTCTACGATAACCACTTCCAATTCATAAGAAAATATTATTAAAGAACGAGTATTTGACTAAATGTTGCCTACAACGAGAATACCGAGTCAGATAATCTTATCATTGGGTTGTTTCTTTCTGGTTCACCATATTTTTGTACATTCATTATCTGACGTC GTTCAAAATGTCGATGTAAATGGTTCTCATCCATCTGTATCATTATTATCAGCTTCCAACTTATCCTCACCTAAAAATGAGCCGAGTGCAAATCAAACCACACAGGCTAAATGGCAGTATTTATGTCCATATATGAAGTACAAATGTAGTGAGTTACCAGGTTATTGTCTTATATGCAACTTCAATACTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL SMAA69093            [                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCATTGGGTTGTTTCTTTCTGGTTCACCATATTTTTGTACATTCATTATCTGACGTCAGTTCAAAATGTCGATGTAAATGGTTCTCATCCATCTGTATCATTATTATCAGCTTCCAACTTATNCTCACCTAAAAATGAGCCGAGTGCAAATCAAACCACACAGGCTAAATGGCAGTATTTATGTTCATATATGAAGTACAAATGTAGTGAGTTACCAGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL SMAA69034            [                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCATTGGGTTGTTTCTTTCTGGTTCACCATATTTTTGTACATTCATTATCTGACGTCAGTTCAAAATGTCGATGTAAATGGTTCTCATCCATCTGTATCATTATTATCAGCTTCCAACTTATNCTCACCTAAAAATGAGCCGAGTGCAAATCAAACCACACAGGCTAAATGGCAGTATTTATGTTCATATATGAAGTACAAATGTAGTGAGTTACCAGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD191445             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATGGCAGTATTTATGTCCATATATAAAGTACAAATGTAGTGAGTTACCAGGTTATTGTCTTATATGCAACTTCAATACTTCATGTGTTTATGGTACAGTAGTCAATGTTACTTGCTTTCCACGTCCAGGAGTTTATTGCAAAGTTCCAAGTAGTATAACTCAAGAAAACCAAACTTCTCAAACGAATTCATCAGAGTTTTCTTATCCTATGAGTGATCAAACAAATTACGTAATTCAAAAACCGATTGTTTGTCGATTTTGCCACCAGTTGGATGATACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAATGTACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD126501             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTACTTGCTTTCCACGTCCAGGAGTTTATTGCAAAGTTCCAAGTAGTATAACTCAAGAAAACCAAACTTCTCAAACGAATTCATCAGAGTTTTCTTATCCTATGAGTGATCAAACAAATTACATAATTCAAAAACCGATTGTTTGTCGATTTTGCCACCTGTTGGATGATACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD122202             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTATAACTCAAGAAAACCAAACTTCTCAAACGAATTCATCAGAGTTTTCTTATCCTATGAGTGATCAAACAAATTACATAATTCAAAAACCGATTGTTTGTCGATTTTGCCACCAGTTGGATGATACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAATGTACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATCTTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTTTTTATTTAGGCATGTGGATAGAAGGATTAGGCAAATTGTTCAGCTTCGGTGGCCTTGGTTTATGGAGTATTGTTGACTTTATCTTAATTGTATCCGGATATGTAAAGCCTCCTGGAGATGCTGTATACTGGTGATATAATATGAAACAATAATGAAATAACTCACCCATATAATTCAAGCTAATTTATACCTTTTACCATCTCCAATAAGTTCAACAACTATNTCGTGCTNTAATTC                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD091352             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTATAACTCAAGAAAACCAAACTTCTCAAACGAATTCATCAGAGTTTTCTTATCCTATGAGTGATCAAACAAATTACATAATTCAAAAACCGATTGTTTGTCGATTTTGCCACCAGTTGGATGATACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAATGTACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATCTTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTTTTTATTTAGGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD180871             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAACGTACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATCTTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTTTTTATTTAGGCATGTGGATAGAAGGATTAGGCAAATTGTTCAGCTTCGGTGGCCTTGGTTTATGGAGTATTGTTGACTTTATCTTAATTGTATCCGGATATGTAAAGCCTCCTG                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD181014             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAATGTACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATCTTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD160659             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TACCTCGGAGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTATTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATCCTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTTTTTATTTAGGCATGTGGATAGAAGGATTAGGCAAATTGTTCAGCTTCGGTGGCCTTGGTTTATGGAGTATTGTTGACTTTATCTTAATTGTATCCGGATATGTAAAGCCTCCTGGAGATGCTGTATACTGGTGATATAATATGAAACAATAATGAAATAACTCACCCATATAATTCAAGCTAATTTATACTTTTTACCATCTCCAATAAGTTCAACAACTATTTCGTGCTTTAATCCTTCCTGTCTTCAATATATAATTATGTCCTCCAAGAGTTAGTTTCTAGTACTTGAACATATATTAATAACTTGTATATTTTTTATGTATTTATTGTTGGTTATTCTGTAACATGTAATTGCTTAAAGTC]


>consensus_9509#0 TACCGCTGAACAGCTTGTTTGGCTGCAATTTATCAGCAATGCACGATCCTTTTGACCTGA CGCATATAGGACTCAAAAGAAAATGCAGAGTATGTGGCTAAAACACTATGTTATCCATTT TCTTTTGAAATGATATCACTACTATTTACGGATTACCCATCTGTCATCTACACCCGTAAA TTTTCTACGATAACCACTTCCAATTCATAAGAAAATATTATTAAAGAACGAGTATTTGAC TAAATGTTGCCTACAACGAGAATACCGAGTCAGATAATCTTATCATTGGGTTGTTTCTTT CTGGTTCACCATATTTTTGTACATTCATTATCTGACGTCGTTCAAAATGTCGATGTAAAT GGTTCTCATCCATCTGTATCATTATTATCAGCTTCCAACTTATNCTCACCTAAAAATGAG CCGAGTGCAAATCAAACCACACAGGCTAAATGGCAGTATTTATGTCCATATATGAAGTAC AAATGTAGTGAGTTACCAGGTTATTGTCTTATATGCAACTTCAATACTTCATGTGTTTAT GGTACAGTAGTCAATGTTACTTGCTTTCCACGTCCAGGAGTTTATTGCAAAGTTCCAAGT AGTATAACTCAAGAAAACCAAACTTCTCAAACGAATTCATCAGAGTTTTCTTATCCTATG AGTGATCAAACAAATTACATAATTCAAAAACCGATTGTTTGTCGATTTTGCCACCAGTTG GATGATACTGAGATTGTTTGTATCGGTCGAACTAACTGTCGTCAACCTAATGTACCTCGG AGTTTTTATGAAACGAAATGTGAACCATTTCCTCATATATTATGCCTAGGACGCAGAGTA TTCAGGCGTATGGTACCTTGTGATTGGTCTTCTGGTAAAAGTTATGTACTAACTGTTATC TTAAGTTTATTTTTCGGAGGTTTAGGAGTTGATCGTTTTTATTTAGGCATGTGGATAGAA GGATTAGGCAAATTGTTCAGCTTCGGTGGCCTTGGTTTATGGAGTATTGTTGACTTTATC TTAATTGTATCCGGATATGTAAAGCCTCCTGGAGATGCTGTATACTGGTGATATAATATG AAACAATAATGAAATAACTCACCCATATAATTCAAGCTAATTTATACCTTTTACCATCTC CAATAAGTTCAACAACTATNTCGTGCTNTAATTCTTCCTGTCTTCAATATATAATTATGT CCTCCAAGAGTTAGTTTCTAGTACTTGAACATATATTAATAACTTGTATATTTTTTATGT ATTTATTGTTGGTTATTCTGTAACATGTAATTGCTTAAAGTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)