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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9510#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 928 fasta sequence
[TTTTGATAATCCATGAACAAACACTTAGCATCTATTGGGGAATTTTCTATTTTTGATTTCAATATAATACTATGAGCTCGCCTTCCGTGAAATTTATTAGAATTTAAACATCCTGAGGGCAGCCAATTAACAGCTTCCTTTGACCACGGTCCTGTAGTAAGTATAACTAAGCTGGCAGGGATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCAGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCCCCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACTATGTTACGACTGGTCTAATAATGAGATTTTTTGACTTTGTATTTCGTTTAGTAATGGAACACTTTTGACGTTTT]
[+] EMBL CD196365 [TTTTGATAATCCATGAACAAACACTTAGCATCTATTGGGGAATTTTCTATTTTTGATTTCAATATAATACTATGAGCTCGCCTTCCGTGAAATTTATTAGAATTTAAACATCCTGAGGGCAGCCAATTAACAGCTTCCTTTGACCACGGTCCTGTAGTAAGTATAACTAAGCTGGCAGGGATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCAGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTT CCAGGA ]
[+] EMBL CD073183 [ TCTATTTTTGATTTCAATATAATACTATGAGCTCGCCTTCCGTGAAATTTATTAGAATTTAAACATCCTGAGGGCAGCCAATTAACAGCTTCCTTTGACCACGGTCCTGTAGTAAGTATAACTAAGCTGGCAGGGATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCCGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAGCATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCG ]
[+] EMBL CD189017 [ TAACTAAGCTGGCAGGGATAACTTCAGAATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCAGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCCCCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACC ]
[-] EMBL CD200543 [ AATTTGAAGTAGATGATTCTATTACTCGAACACCACTAACTTTGGGAGCAGATGTATTCGATGTTGAAAATTCCAACCCTATAACACGAGCAATTTTTAATTAGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGC ]
[+] EMBL CD132078 [ CACGAGCAATTTTTAATTTGGTTCCCTGATTTGTTAAATATTGAGCACGCCGAAATAATTCATCTGTGAGTTTTTTGGGATGTACCTGTGCAGTAGTTGTAGAGTCTCCTATCAGGGAACAACTTTTCACTTTCGCACTGACCCAAGATGGTGATTCTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCC ]
[+] EMBL CD155002 [ CTGAAGAGCCGGAAGATTTCCCAGGAGATAGTGATATAGAATACGTGTTAACATGTCTATAATCACATACACTACCGAACTCATCTGCTAATTCCATGTGTAAATCAAAACCTTTTTGGGCTAAAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCCCCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATAC ]
[-] EMBL CD078720 [ AAACATCCATCTCATTGTGAGAACACCAGTCCTTAGCGAGGAATCCCGCAGCTCGCCCAGATGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACTATGTTACGACTGGTCTAATAATGAGATTTTTTGACTTTGTATTTCGTTTAGTAATGGAACACTTTTGACGTTTT]
[-] EMBL CD199552 [ TGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACT ]
[-] EMBL CD199509 [ TGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGAATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACT ]
[-] EMBL CD199497 [ TGCAGCAGATCCAAGTTGCTCTTTTTCAATTATTAGTGTGTCGATTTTCCGTTTTGATAGGTAATAAGCTGTAGAAACACCCATAATACCACCTCCGACTATGATGACTGACATTATGGGGAGCTACATATGTACAGCCTGGATCTTAGTGACGGGATATTGACACCAATACACTGGATACATATATATCCTGACTCTAGTAGACTTAGTTTCCCTCAGTTGTTGTTCGAAAAACGAACT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||