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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9513#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1118 fasta sequence
[CTATTCGCCGCAGGAATGGCTCCGGAACTTTACTTGTGCTAGTTGTCGTGTTGGTTTAGTTCGTCAAGATTTTTATGAACGTGATAATCAAGCTTATTGTACTCAATGTCATCTAAAAATGTTCTCACCTAGATGTGGTTATTGTGGTGAAGCAGTTGTTGAGAAATGTGTTTTGGCTTTGGCCCGTGCATGGCATCCTGAGCACTTTTTTTGTTACGAATGTCATTCCACTTTTAATGGATCGTTAACAGTACATGAACAAAATGGCAAATTTTACTGCTCTAACTGTTATTTCACAC-GATTTGGAACTCCATGCTCTGGTTGTCAACAACCTATTACAGATGCATATATAACTGCATTGGATATGCCTTGGCACAAAGACTGTTTTACTTGTCATGATTGTAATAGAATACTCACTGGATCAAGTTTCCATGAAATTGAAGGATATCCTTACTGTGATTCTCACTATTATTCAAGACGTGGATTATTATGCTTTTCATGCTCCCTACCAATTACTGGAAGGTGTGTAAACGCACTCGGTAAACGTTATCATCCAGAGCATTTTTTATGCGCCTATTGTTTACATCCATTACAAACTGGTACATTTAAAGAACATTCAAGTAAACCATACTGTCATCAGTGTTTTACCCAATTGTTTGGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCAAAAT-AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTTTAAATACTATGCTTCAAAGTATTGGAAATACTGTTTGTATCCTGCTTTTTTATTGGTTAGTCTTACATCTCATAACCTGTTTCTTGCTTAGGCTCAACAACTTACACGAAGATTTATCAAGCACATTGTGTTAGTCAACATCCCACTTTTTAATTTACATCGCCTCTGAATGAGTGTTGGGTGTATGTTTTTTATTGCCCAAACACTATTTGATGTAAAAAAAAGTGATATATTCATTTTGTAATTTCAGTATTCTGTTATTACTCCTGATCATCTTCGCCTAATTGAATATTTTAAAATGTTT]
[+] EMBL CD081204 [CTATTCGCCGCAGGAATGGCTCCGGAACTTTACTTGTGCTAGTTGTCGTGTTGGTTTAGTTCGTCAAGATTTTTATGAACGTGATAATCAAGCTTATTGTACTCAATGTCATCTAAAAATGTTCTCACCTAGATGTGGTTATTGTGGTGAAGCAGTTGTTGAGAAATGTGTTTTGGCTTTGGCCCGTGCATGGCATCCTGAGCACTTTTTTTGTTACGAATGTCATTCCACTTTTAATGGATCGTTAACAGTACATGAACAAAATGGCAAATTTTACTGCTCTAACTGTTATTTCACAC GATTTGGAACTCCATGCTCTGGTTGTCAACAACCTATTACAGATGCATATATAACTGCATTGGATATGCCTTGGCACAAAGACTGTTTTACTTGTCATGATTGTAATAGAATACTCACTGGATCAAGTTTCCATGAAATTGAAGGATATCCTTACTGTGATTCTCACTATTATTCAAGACGTGGATTATTATGCTTTTCATGCTCCCTACCAATTACTGGAAGGTGTGTAAACGCACTCGGTAAACGTTATCATCCAGAGCATTTTTTATGCGCCTATTGTTTACATCCATTACAAACTGGTACATTTAAAGAACATTCAAGTAAACCATACTGTCATCAGTGTTTTACCCAATTGTTTGGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCANAAT AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTTTAAATACTATGCTTCANAGT ]
[-] EMBL CD075034 [ TGAAGCAGTTGTTGAGAAATGTGTTTTGGCTTTGGCCCGTGCATGGCATCCTGAGCACTTTTTTTGTTACGAATGTCATTCCACTTTTAATGGATCGTTAACAGTACATGAACAAAATGGCAAATTTTACTGCTCTAACTGTTATTTCACAC GATTTGGAACTCCATGCTCTGGTTGTCAACAACCTATTACAGATGCATATATAACTGCATTGGATATGCCTTGGCACAAAGACTGTTTTACTTGTCATGATTGTAATAGAATACTCACTGGATCAAGTTTCCATGAAATTGAAGGATATCCTTACTGTGATTCTCACTATTATTCAAGACGTGGATTATTATGCTTTTCATGCTCCCTACCAATTACTGGAAGGTGTGTAAACGCACTCGGTAAACGTTATCATCCAGAGCATTTTTTATGCGCCTATTGTTTACATCCATTACAAACTGGTACATTTAAAGAACATTCAAGTAAACCATACTGTCATCAGTGTTTTACCCAATTGTTTGGTTAGTATGGTGCCCAAATATTTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCAAAAT AGTATGATAAAGAGTAAATGTTAAATTATTTTTAAATACTATGCTTC ]
[+] EMBL CD152261 [ cccaaGTGCATGGCATCCTGAGCACTTTTTTTGTTACGAATGTCATTCCACTTTTAATGGATCGTTAACAGTACATGAACAAAATGGCAAATTTTACTGCTCTAACTGTTATTTCACAC GATTTGGAACTCCATGCTCTGGTTGTCAACAACCTATTACAGATGCATTTGTGGATGCATT ]
[+] EMBL CD114726 [ AGCACTTTTTTTGTTACGAATGTCATTCCACTTTTAATGGATCGTTAACAGTACATGAACAAAATGGCAAATTTTACTGCTCTAACTGTTATTTCACACAGATTTGGAACTCCATGCTCTGGTTGTCAACAACCTATTACAGATGCATttgt ]
[+] EMBL CD096840 [ TTATTCAAGACGTGGATTATTATGCTTTTCATGCTCCCTACCAATTACTGGAAGGTGTGTAAACGCACTCGGTAAACGTTATCATCCAGAGCATTTTTTATGCGCCTATTGTTTACATCCATTACAAACTGGTACATTTAAAGAACATTCAAGTAAACCATACTGTCATCAGTGTTTTACCCAATTGTTTGGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCAAAAT AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTTTAAATACTATGCTTCAAAGTATTGGAAATACTGTTTGTATCCTGCTTTTTTATTGGTTAGTCTTACATCTCATAACCTG ]
[+] EMBL SM0231 [ GGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCAAAAT AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTT ]
[+] EMBL SM0221 [ GGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAAC CAAAAT AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTT ]
[+] EMBL AA931035 [ GGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAAC CAAAAT AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTT ]
[+] EMBL AA931036 [ GGTTAGTATGGTGCACAAATATCTATATCGATATATACATACATACTACTGTTTTTTGTCTTCATGTTTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCAAAAT AGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTT ]
[-] EMBL BF936536 [ TTAAGTTTCAGATATTGGAAGTTGAACAGTTATGTTTATTACCTTTAAACTCAAAATAAGTATGATAAACAGTAAATGTTAAATTATTTTTAAATACTATGCTTCAAAGTACTGTAAATACTGTTTGTATCCTGCTTTTTTATTGGTTAGTCTTACATCTCATAACCTGTTTCTTGCTTAGGCTCAACAACTTACACGAAGATTTATCAAGCACATTGTGTTAGTCAACATCCCACTTTTTAATTTACATCGCCTCTGAATGAGTGTTGGGTGTATGTTTTTTATTGCCCAAACACTATTTGATGTAAAAAAAAGTGATATATTCATTTTGTAATTTCAGTATTCTGTTATTACTCCTGATCATCTTCGCCTAATTGAATATTTTAAAATGTTT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||