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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9521#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1200 fasta sequence
[CCATGTGGTTTTTTAGTTCGTTCCAGTTTTCGTTATAGTTTACGTTCATCACGGCACATTGCTAACGATCCACGCTTGTTTTTGTCCCAGAAACTACCTTG-CAAGACACGAA-ACATTTTTTATGCTTCTTGTTCGTAGCTGATTCCCATT-TAGTACAGTTTCATGCAGACATTTTTTCTGCCATACCCAGGCAACTAATAAA-GGGGAAATAAAAGTGGAAAAAGGGGAGATAAAGCGGACAAAGGCGTACGCGTATTGCACAATTGTGTACAGAAGACACTGAATTCATTCTAAAATTCAA-ATACTGAACGTGATACTATGCCTCAAAATTATGAGTTTTATGATTATCTGTACAATCTTGCTCTACCTTGCATCTATTGTCCGACATTTTCTAAGTTATCTAAGAGCAATTCAACTCTGACTAATGCTTTAAGAGCAGCATTTGTACAGGTGGAGAATCAATATCCAGGATTTGGCGAACAGTTTATCATTCGCTTGTTACAGCGTCTTGGAGTCAACGATGATATAAATCTTCCAGAGACATACCTGAGAATTGCTGGTTTACACACTCAACTTTGTGAAAGCATGGAGAATAAAGGGATTAATCGGATCGAAATTTTTGCCAACGTTTTGAGGTTGTGTTTATGTAAAATACCGGACGAGATATCTAGTAATAACGGCTTTACCAACCTAATAAGAGAGATTACAGAGATAACAGATAAATTTTTGGAATCGTTACACTGTCATGATAAACAGATCTTGCAACGAAGAGCGCTGTGCAATCTTAAGTTTGAGTTTATTCGGTCATGTAAGCGATTCAGCGAAACCTTAAAAGCATATAACCGTGATGAAAACCAAACCTCAG--TTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACAAACACTATTCTTGATGCTCTTCGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTCGAAGTTAGTTGAACACCTCAGAAATGTTAGGAATCCCAGATGGTTTTCANAGCTATCTGATGTATTACTTGAAACCTCAAAAGAACATAAAAGCGGGTTGGTCACGAAACCAATATTTAAAATGACGCANAACATATTCTCTGGATTTTTATCTCTTTCTAAACGGATTATT-CATTTTTTTATTATTGNTATCCCTTTATTATTCTTGNGNTNTGNNATTGTCCCGAACGTGACCATTTCA]
[-] EMBL CD178631 [CCATGTGGTTTTTTAGTTCGTTCCAGTTTTCGTTATAGTTTACGTTCATCACGGCACATTGCTAACGATCCACGCTTGTTTTTGTCCCAGAAACTACCTTG CAAGACACGAA ACATTTTTTATGCTTCTTGTTCGTAGCTGATTCCCATT TAGTACAGTTTCATGCAGACATTTTTTCTGCCATACCCAGGCAACTAATAAA GGGGAAATAAAAGTGGAAAAAGGGGAGATAAAGCGGACAAAGGCGTACGCGTATTGCACAATTGTGTACAGAAGACACTGAATTCATTCTAAAATTCAA ATACTGAACGTGATACTATGCCTCAAAATTATGAGTTTTATGATTATCTGTACAAT ]
[+] EMBL CD153791 [ CCACGCTTGTTTTTGTCCCAGAAACTACCTTG CAAGACACGAA ACATTTTTTATGCTTCTTGTTCGTAGCTGATTCCCATT TAGTACAGTTTCATGCAGACATTTTTTCTGCCATACCCAGGCAACTAATAAA GGGGAAATAAAAGTGGAAAAAGGGGAGATAAAGCGGACAAAGGCGTACGCGTATTGCACAATTGTGTACAGAAGACACTGAATTCATTCTAAAATTCAA ATACTGAACGTGATACTATGCCTCAAAATTATGAGTTTTATGATTATCTGTACAATCTTGCTCTACCTTGCATCTATTGTCCGACATTTTCTAAGTTATCTAAGAGCAATTCAACTCTGACTAATGCTTTAAGAGCAGCATTTGTACAGGTGGAGAATCAATATCCAGGATTTGGCGAACAGTTTATCATTCGCTTGTTACAGCGTCTTGGAGTCAACGATGATATAAATCTTCCAGAGACATACCTGAGAATTGCTGGTTTACACACTCAACTNTGTGANAGCATGGAGAATAAAGGGATTAATCGGATCGAAATTTT ]
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[+] EMBL CD154064 [ CTTCCAGAGACATACCTGAGAATTGCTGGTTTACACACTCAACTTTGTGAAAGCATGGAGAATAAAGGGATTAATCGGATCGAAATTTTTGCCAACGTTTTGAGGTTGTGTTTATGTAAAATACCGGACGAGATATCTAGTAATAACGGCTTTACCAACCTAATAAGAGAGATTACAGAGATAACAGATAAATTTTTGGAATCGTTACACTGTCATGATAAACAGATCTTGCAACGAAGAGCGCTGTGCAATCTTAAGTTTGAGTTTATTCGGTCATGTAAGCGATTCAGCGAAACCTTAAAAGCATATAACCGTGATGAAAACCAAACCTCAG TTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACAAACACTATTCTTGATGCTCTTCGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTCGAAGTTAGTTGAACACCTCAGAAATGTTAGGAATCCCAGATGGTTTTCANAGCTATCTGATGTATTACTTGAAACCTCAAAAGAACATAAAAGCGGGTTGGTCACGAAACCAATATTTAAAATGACGCANAACATATTCTCTGGATTTTTAT ]
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[+] EMBL CD179755 [ TTTACACACTCAACTTTGTGAAAGCATGGAGAATAAAGGGATTAATCGGATCGAAATTTTTGCCAACGTTTTGAAGTTGTGTTTAAGTAAAATACCGGACGAGATATCTAGTAATAACGGCTTTACCAACCTAATAAGAGAGATTACAGAGATAACAGATAAATTTTTGGAATCGTTACACTGTCATGATAAACAGATCTTGCAACGAAGAGCGCTGTGCTATCTTAAGTTTGAGTTTATTCGGTCATGTAAGCGATTCAGCGAAACCTTAAAAGCATATAACCGTGATGAAAACCAAACCTCAG TTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACAAACACTATTGTTGATGCTCTCTGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTAGAAGTc ]
[-] EMBL CD197234 [ TCGTAACACTGTCATGATAAACAGATCTTGCAACGAAGAGCGCTGTGCAATCTTAAGTTTGAGTTTATTCGGTCATGTAAGCGATTCAGCGAAACCTTAAAAGCATATAACCGTGATGAAAACCAAACCTCAG TTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACAAACACTATTCTTGATGCTCTTCGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTCGAAGTTAGTTGAACACCTCAGAAATGTTAGGAATCCCAGATGGTTTTCAAAGCTATCTGATGTATTACTTGAAACCTCAAAAGAACATAAAAGCGGGTTGGTCACGAAACCAATATTTAAAATGACGCAAAACATATTCTCTGTATTTTTATCTCTTTCTAAACGGATTATT CATTTTTTTATTATTGTTATC ]
[-] EMBL CD141563 [ anCCGTGATGAAAACC AACCTCAGTTTTATCTTTCGAGCGAATCAACTAGTTGTATGTACAAACACTATTCTTGATGCTCTTCGTTGTGATAAATGACGGTGTGACGACCAACCCGGTTCGAAGTTAGTTGAACACCTCAGAAATGTTAGGAATCCCAGATGGTTTTCAAAGCTATCTGATGTATTACTTGAAACCTCAAAAGAACATAAAAGCGGGTTGGTCACGAAACCAATATTTAAAATGACGCAAAACATATTCTCTGTATTTTTATCTCTTTCTAAACGGATTATT CATTTTTTTATTATTGTTATCCCTTTATTATTCTTGTGTTTTGTAATTGTCCCGAACGTGACCATTTCA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||