cluster # 9529

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Schistosoma mansoni
cluster # 9529 cluster # 9529 Sequences # 10 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_9529#0 length = 541 sequences # 10
consensusID : consensus_9529#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 541
fasta sequence
                              [TGAGATTCGGCAAGAGGAA-AGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG-AAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT-GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCGATCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGGCCTTTGTGCCTCTCTGTTGCATATTCCCCAATGAAAGAGCCTTCTTCATTGAATTTACCAGGATCAAGATTATAATCGTCAAGTTCACCATCTC]

[+] EMBL CD145142             [TGAGATTCGGCAAGAGGAA AGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG AAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCGATCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGG                                                                                              ]
[+] EMBL CD152707             [  AGATTCGGCAAGAGGAA AGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG AAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCCATCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGGC                                                                                             ]
[+] EMBL CD152692             [  AGATTCGGCAAGAGGAA AGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD149276             [         cgatGAGGAAGAGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAAT AAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG AAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD149283             [              AGGAA AGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAGAAAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGTGGGTAAAAAT AAAAATTTTAACT                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD149324             [               GGAA AGAAGAAGAGCAAGAAGGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAAT AAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG AAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCGATCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGGC                                                                                             ]
[-] EMBL CD149339             [               GGAA AGAAGAAGAGCAAGAAGGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAAT AAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG AAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCGATCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGGC                                                                                             ]
[-] EMBL CD197122             [                           GAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTTTCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACATTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATGAGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTGAG AAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTA                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD131944             [                                                                                                                                                                                                                                                         AAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATATAAACTGTTGGATTGTATTTTCGATCAATAGTTGGTAAACGATTTGATGGGCCT                                                                                           ]
[+] EMBL CD131998             [                                                                                                                                                                                                                                                          AAATTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTATTTCCTCAATTTGATGT GGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATTGGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCGATCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGGCCTTTGTGCCTCTCTGTTGCATATTCCCCAATGAAAGAGCCTTCTTCATTGAATTTACCAGGATCAAGATTATAATCGTCAAGTTCACCATCTC]




>consensus_9529#0
TGAGATTCGGCAAGAGGAAAGAAGAAGAGCAAGAAAGCAAACAAAAGAGGGAATTATTTT
TCGTAAAAAGAAAAGGTAAGATTAAAGAACATTCCCCATTTTCAAACCAGATGGGAAACA
TTAAACAATAAAAAAAAGAGTGTAAGTACACAAAATGAAACAAATTAAGTTAACTCAATG
AGTTAGATCTCTTAAATTGTGAATTTCAAAGGGAATGAGGAATATTTTGATTTACTGGTG
AGAAAAAAAAGTTAAGGGATAATCTGCTTGTTTACCACTTGGTTAATTTCAAGAATTTAT
TTCCTCAATTTGATGTGGTAAAAATCAAAAATTTTAACTTTTAGTTAACAAATAAAAATT
GGACGGGAAAATTGGCAAGAATTGTGTTACTTTATCTAAACTGTTGGATTGTAGTTTCGA
TCAAGAGTTGGTAAACGATTTGATGGGCCTTTGTGCCTCTCTGTTGCATATTCCCCAATG
AAAGAGCCTTCTTCATTGAATTTACCAGGATCAAGATTATAATCGTCAAGTTCACCATCT
C
clustalw multiple alignements is not computed in this case