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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9532#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1397 fasta sequence
[TCTACGCCAACTTGGTGAACCTGTCTGTTTATTTGGTGAAGATGGAGCAGACCGAAGAGAAAGACTACGGATGATTCTTGCAGTGAGCGGTGGTCCAGCTCAAAGACCACCTTTAACAGATACAGTAAAATCATCGACTGGGACTGGTACATCTATTAATCGACTTGGTGAAAATATTTCTACTGATACTGTCGGAGATGATACTACAGTGTGGTACCATCAAGGTCCGAATACTCTTGCAGAGGCTCGCCTATGGATTAGTGAATTTTCCTTAACTCGAGCTAAAGTACGGCTGGATAGAGCTAGGAATTATTTCAATAATGTTCCAGCACCTCAACGCAAAGCTAAACTCCAAGAATATCATAAGGTTTTGCGAAACACAAATTTGCTATGCAGTCAAGTTGGAGATATTCGACCATTAAGTATGTGTCGCTTTTCACCTGATGGTAAACAATTAGCTACA-TCATCTTGGAGTGG-TCTGTGTCGTTTATGGTCTATACCTGATTGTAATTTAGTTATGAATTTAC-GTGGGCATACTGCACCAACTT-GTGCTATTGTTTGGCATCCTCAAGCTGGTCTCCAGTCGGAACAACAATTGGCACTTGCCAGTTCAGCTCAAGACGGAAGTGTTAAACTATGGAGTTTAGATAATGAAGAACCTTTGGCCGATATTGAAGGTCACGCACCTCACAGAGTATCTCGCTTAGCCTTCCATCCTTCTGGACGTTTCCTGGCAACTACGTGCTTCGATCACTCATGGCGCTTATGGGATTTAGAGGCTTGTGAAG-AAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCAAGCCAGTTTATGATGTTGTTTTTCACCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTGGGACTTACGAACAGGTCGTTGTATTATGTTTCTAGAAGGCCACCTTGAAGAGTTGCTGGGCGCAGATGTAGCTGATAATGGTTATCACGCAGCCACTTCTAGTGCAGATAACACCGTTCGTATTTGGGATTTACGACAACA-ACAAGCAATTTATGTAATACCAGCTCACACTAGTGTTGTAAGCAGCGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCAGTTCGTTTGATAAAACAACCAAAA-TTGGGGCCATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAAGTTGTTTATGCAGACATTT-CACCAGACAATAAATACATTGCAACCTGTTCCCACGACCTGACTTATAAACTGTGGAGTAAAGAAGCAAACTAATCCTCTCCGTTACAACAAATGTTAATAACAATATTCCTATAATACGTTGTAAAATAATCTTATATATACATTCGTGTTTCTAATTTTCCNAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CD081977 [TCTACGCCAACTTGGTGAACCTGTCTGTTTATTTGGTGAAGATGGAGCAGACCGAAGAGAAAGACTACGGATGATTCTTGCAGTGAGCGGTGGTCCAGCTCAAAGACCACCTTTAACAGATACAGTAAAATCATCGACTGGGACTGGTACATCTATTAATCGACTTGGTGAAAATATTTCTACTGATACTGTCGGAGATGATACTACAGTGTGGTACCATCAAGGTCCGAATACTCTTGCAGAGGCTCGCCTATGGATTAGTGAATTTTCCTTAACTCGAGCTAAAGTACGGCTGGATAGAGCTAGGAATTATTTCAATAATGTTCCAGCACCTCAACGCAAAGCTAAACTCCAAGAATATCATAAGGTTTTGCGAAACACAAATTTGCTATGCAGTCAAGTTGGAGATATTCGACCATTAAGTATGTGTCGCTTTTCACCTGATGGTAAACAATTAGCTACA TCATCTTGGAGTGG TCTGTGTCGTTTATGGTCTATACCTGATTGTAATTTAGTTATGAATTTAC GTGGGCATACTGCACCAACTT GTGCTATTGTTTGGCATCCTCAAGCTGGTCTCCAGTCGGAACAACAATTGGCACTTGCCAGTTCAGCTCAAGACGGAAGTGTTAAACTATGGAGTTTAGATAATGAAGAACCTTTGGCCGATATTGA ]
[+] EMBL CD177716 [ TTAATCGACTTGGTGAAAATATTTCTACTGATACTGTCGGAGATGATACTACAGTGTGGTACCATCAAGGTCCGAATACTCTTGCAGAGGCTCGCCTATGGATTAGTGAATTTTCCTTAACTCGAGCTAAAGTACGGCTGGATAGAGC ]
[+] EMBL BE431235 [ CTTGCAGAGGCTCGCCTATGGATTAGTGAATTTTCCTTAACTCGAGCTAAAGTACGGCTGGATAGAGCTAGGAATTATTTCAATAATGTTCCAGCACCTCAACGCAAAGCTAAACTCCAAGAATATCATAAGGTTTTGCGAAACACAAATTTGCTATGCAGTCAAGTTGGAGATATTCGACCATTAAGTATGTGTCGCTTTTCACCTGATGGTAAACAATTAGCTACACTCATCTTGGAGTGGTTCTGTGTCGTTTATGGTCTATACCGGATTGAAATTTAGTTATGAATTTACTGTGGGCATACTGCACCAACTTGGTGCTATTGTTTGGCACCCCCAAGCTGGTCCCCAGTCGGAACAACAATTGGCACTTG CAGTTCAGCTCAAGACGGAAGTGTAAAACTATGGAGTTTAGATAATG AGAA CTTTGGCCGTAATTG AGGTC CGCACCCCACAGA ]
[-] EMBL CD169868 [ TTTGCGAAACACAAATNTGCTATGCAGTTAAGTTGGAGATATTCGACCATTAAGTATGTGTCGCCTTTCACCTGATGGTAAACAATTAGCTACA TCATCTTGGAGTGG TCTGTGTCGTTTATGGTCTATACCTGATTGTAATTTAGTTATGAATTTAC GTGGGCATACTGCACCAACTT GAGCTATTGTTTGGCATCCTCAAGCTGGTCTCCTGTCGGAACAACAATTGGCACTTGCCAGTTCAGCTCAAGACGGAAGTGTTAAACTATGGAGTTTAGATAATGAAGAACCTTTGGCCGATATTGAAGGTCACGCACCTCACAGAGTATCTCGCTTAGCCTTCCATCCTTCTGGACGTTTCCTGGCAACTACGTGCTTCGATCACT ]
[+] EMBL CD141169 [ AACTATGGAGTTTAGATAATGAAGAACCTTTGGCCGATATTGAAGGTCACGCACCTCACAGAGTATCTCGCTTAGCCTTCCATCCTTCTGGACGTTTCCTGGCAACTACGTGCTTCGATCACTCATGGCGCTTATGGGATTTAGAGGCTTGTGAAG AAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCAAGACAGTTTATGATGTTGTTTTTCACCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTGGGACTTACGAACAGGTCGTTGTATTATGTTTCTANGAGGCCACCTTGAAGAGTTGCTGGGCGCAGATGTAGCTGATAATGGTTATCACGCAGC ]
[+] EMBL CD171503 [ ACTCATGGCGCTTATGGGATTTAGAGGCTTGTGAAGAAAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCATGCCAGTTTATGATGTTGTTTTTCACCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTG ]
[+] EMBL CD183532 [ GGCTTGTGAAG AAATTTTACACCAAGAAGGTCATTCCAAGCCAGTTTATGATGTTGTTTTTCACCCTGATGGTTCCTTAGCTCTAACCACCGGTTTGGATGGATATGCTCGTGTTTGGGACTTACGAACAGGTCGTTGTATTATGTTTCTAGAAGGCCACCTTGAAGAGTTGCTGGGCGCAGATGTAGCTGATAATGGTTATCACGCAGCCACTTCTAGTGCAGATAACACCGTTCGTATTTGGGATTTACGACAACA ACAAGCAATTTATGTAATACCAGCTCACACTAGTGTTGTAAGCAGCGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCAGTTCGTTTGATAAAACAACCAAAA TTGGGGCTATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAAGTTGTTTATGC ]
[+] EMBL CD130627 [ TGCTCGTGTTTGGGACTTACGAACAGGTCGTTGTATTATGTTTCTAGAAGGCCACCTTGAAGAGTTGCTGGGCGCAGATGTAGCTGATAATGGTTATCACGCAGCCACTTCTAGTGCAGATAACACCGTTCGTATTTGGGATTTACGACAACA ACAAGCAATTTATGTAATACCAGCTCACACTAGTGTTGTAAGCAGCGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCAGTTCGTTTGATAAAACAACCAAAATTTGGGGCCATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAAGTTGTTTATGCAGACATTTNCACCAGACAATAAATACATTGCAACCTGTTCCCACGACCTGACTTATAAA ]
[-] EMBL CD141552 [ ACGAC ACANNCAAGCAATTTATGTAATACCAGCTCACACTAGTGTTGTAAGCAGCGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCAGTTCGTCTGATAAAACAACCAAAATTTGGGGCCATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAAGTTGTTTATGCAGACATTT CACCAGACAATAAATACATTGCAACCTGTTCCCACGACCTGACTTATAAACTGTGGAGTAAAGAAG ]
[-] EMBL AI395487 [ TAGTGTTGTAAGCAGCGTACGATTTGAATCACGCAACTGTAGCTATATTGTTACCCGTTCGTTTGATAAAACAACCAAAATTTGGGGCCATCCTATCTGGACACCTATCAAAACGCTCGAAGGACATAACAGTAAAGTTGTTTATGCAGACATTT CACCAGACAATAAATACATTGCAACCTGTTCCCACGACCTGACTTATAAACTGTGGAGTAAAGAAGCAAACTAATCCTCTCCGTTACAACAAATGTTAATAACAATATTCCTATAATACGTTGTAAAATAATCTTATATATACATTCGTGTTTCTAATTTTCCNAAAAAAAAAAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||