cluster # 9543

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Schistosoma mansoni
cluster # 9543 cluster # 9543 Sequences # 10 consensus # 2

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consensus_9543#0 length = 1699 sequences # 7

consensus_9543#1 length = 707 sequences # 3

consensusID : consensus_9543#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 1699
fasta sequence

                              [CTACGGGCCAANAATTCGGCACGAGGTTATTGCTTGGTTGATATTATTTGAAATGTTCTGATAACTGGTTTCTTGATTTTAATATTTCTGTCACTAAGTTAAGTCACTAATCGCATCTTGTTCGATAGTGGGTAAAGTTGTAATATTTATTTGATTCTATTTACTTTTATACAGCAACCAATTAAACTTATGAATACAACTCTTACAAATCAAGATAACCTACAGGCTACGTTAGATACTATTTCTGGATCTGTAAAGAAAAGATCCACTGCAGCTCGTCCATTGATTACATCACGTAAACAATCTATAGTCGCTGGTGTTACAGCTGAAGCAGAAAATGAAAATTATCAAACTGATTCACGAAGTCTTTGGAGTCGTCGACGTAAAATTGATGGTGCATTGAATCGTGCCCCACCTGGATTCTATAAACGAGTTTATATCACATTAACTCATATGCAAGGTTTAAGCATTGGCAATCTAACACTTAGTCATAATTTGACAAAAGAAATGACAATGGGTGAACATAAATTTGCTTTAACTGTTGAACATGTATGCACAATGGTTAGTACACCAGAATATCGTCAACTAATTATTGAAGCAATTCATGTACTTGGTTCATTGATGATGCATGATGTTGACAACCGAATATTTATTGATTGTATCGTTAAAGTTGAAGATATTGTAGAAAAAGCAA-ATAATTTATTTTTAATTGATCAAGTAAAGTATGGTGGGAACGCCACACTGTGTTGTGCAAAATCAATAAAACAATCTGGAATAACTGATTTAACGCCCAGTAATGATTGTCAAACACCACGTAGACGAAGCACTTTAACCTGCCACGGATTACATAATATTTGTCAGCGTTTCTATGACACACCACCTGCTGGAAAATTCGGCACAATGTCCTATATGGTACGTGCCGTATCTGAATTACTTACGTGTAATAAATGTTTCAACCCAGATAAACCTTTACCAATCAATTGCAATGTTCAATAATATTCATATTCGTTTTGCAATTGTATGACCTGCGTCCTTGTTTTATTCCTCATATTGCGTAACTACACATAAATCCTGTCTTTACTTTCTTATCTTTCATTTCACTCCGTCGCATGCGCACTTCTGTACACTATACACTGGCCTATTCACCTATTAACATTGGTGGTAGTAAGAGGCTTTGCCTAGTCAATATTTTCTACCCTTTATACACTCAAGTATAGACTCTTTTCATTTAACATTTCTTAATCATGTTTCATCTAGTGGATTGGAGAATTCAGTGATACTATACTGCCTGTCTAATTTTTAATAATATCCTATTATTTTGTAACATCTCACCTGTTACTACTTATTTTATACAATCAATTTCCTCTTGATCGTATTGACTGTTGAATTTATTTTGACAGAACTACGTGTAATAATCTAATTCTCATTTTGCAAAAGATACTCAATTTTTATTTTCTGATTTCTCTGCCATCTTGACTTCACCATCTTTTTTTTTAAATCTTAATTTTAATTTAGTTCAATAGTTTATAGTGTGTCATGGTATTTCTCCCACCTTTTCTGATTTGTTTTATCTAGTCAAACTGTACCTCAAATTATTTTAAAGAAGTTGATATGCAGAAAAATACATTACAGTACGATTCTTTACGTGTATGTACCTTCTTAGAATGATTGCATGTATTAACTTAAAAAAGTAAATGAA]

[+] EMBL CD081139             [CTACGGGCCAANAATTCGGCACGAGGTTATTGCTTGGTTGATATTATTTGAAATGTTCTGATAACTGGTTTCTTGATTTTAATATTTCTGTCACTAAGTTAAGTCACTAATCGCATCTTGTTCGATAGTGGGTAAAGTTGTAATATTTATTTGATTCTATTTACTTTTATACAGCAACCAATTAAACTTATGAATACAACTCTTACAAATCAAGATAACCTACAGGCTACGTTAGATACTATTTCTGGATCTGTAAAGAAAAGATCCACTGCAGCTCGTCCATTGATTACATCACGTAAACAATCTATAGTCGCTGGTGTTACAGCTGAAGCAGAAAATGAAAATTATCAAACTGATTCACGAAGTCTTTGGAGTCGTCGACGTAAAATTGATGGTGCATTGAATCGTGCCCCACCTGGATTCTATAAACGAGTTTATATCACATTAACTCATATGCAAGGTTTAAGCATTGGCAATCTAACACTTAGTCATAATTTGACAAAAGAAATGACAATGGGTGAACATAAATTTGCTTTAACTGTTGAACATGTATGCACAATGGTTAGTACACCAGAATATCGTCAACTAATTATTGAAGCAATTCATGTACTTGGTTCATTGATGATGCATGATGTTGACAACCGAATATTTATTGATTGTATCGTTAAAGTTGAAGATATTGTAGAAAAAGCAANAT ATTTATTTTTAATTGATCAAGTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD117868             [                                                                                                                                                                  ACATCTACAGCGCATCCAATTGAACTTATGAATACAACTCTTACAAATCAAGATAACCTACAGGCTACGTTAGATACTATTTCTGGATCTGTAAAGAAAAGATCCACTGCAGCTCGTCCATTGATTACATCACGTAAACAATCTATAGGCGCTGGTGTTACAGCTGAAGCAGAAAATGAAAATTATCAAACTGATTCACGAAGTCTTTGGAGTCGTCGACGTAAAATTGATGGTGCATTGAATCGTGCCCCACCTGGATTCTATAAACGAGTTTATATCACATTAACTCATATGCAAGGTTTAAGCATTGGCAATCTAACACTTAGTCATAATTTGACAAAAGACATGACAATGGGTGAACATAAATTTGCTTTAACTGTTGAACATGTATGCACAATGGTTAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD157748             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gttacgTATGCAAGGTTTATGCATTGGCAATCTAACACTTAGTCATAATTTGACAAAAGAAATGACAATGGGTGAACATAAATTTGCTTTAACTGTTGAACATGTATGCACAATGGTTAGTACACCAGAATATCGTCAACTAATTATTGAAGCAATTCATGTACTTGGTTCATTGATGATGCATGATGTTGACAACCGAATATTTATTGATTGTATCGTTAAAGTTGAAGAAATTGTAGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD157704             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gtgCATAATTTGACAAAAGAAATGACAATGGGTGAACATAAATTTGCTTTAACTGTTGAACATGTATGCACAATGGTTAGTACACCAGAATATCGTCAACTAATTATTGAAGCAATTCATGTACTTGGTTCATTGATGATGCATGATGTTGACAACCGAATATTTATTGATTGTATCGTTAAANGTGAAGATATTGTAGAAAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
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[-] EMBL CD148340             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACACCAGAATATCGTCAATTAA TATTGAAGCAATTCATGTACTTGGTTCATTGATGATGCATGATGTTGACAACCGAATATTTATTGATTGTATCGTTAAAGTTGAAGATATTGTAGAAAAAGCAA ATAATTTATTTTTAATTGATCAAGTAAAGTATGGTGGGAACGCCACACTGTGTTGTGCAAAATCAATAAAACAATCTGGAATAACTGATTTAACGCCCAGTAATGATTGTCAAACACCACGTAGACGAAGCACTTTAACCTGCCACGGATTACATAATATTTGTCAGCGTTTCTATGACACACCACCTGCTGGAAAATTCGGCACAATGTCCTATATGGTACGTGCCGTATCTGAATTACTTACGTGTAATAAATGTTTCAACCCAGATAAACCTTTACCAATCAATTGCAATGTTCAATAATATTCATATTCGTTTTGCAATTGTATGACCTGCGTCCTTGTTTTATTCCTCATATTGCGTAACTACACATAAATCCTGTCTTTACTTTCTTATCTTTCATTTCACTCCGTCGCATGCGCACTTCTGTACACTATACACTGGCCTATTCACCTATTAACATTGGTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
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GGATTACATAATATTTGTCAGCGTTTCTATGACACACCACCTGCTGGAAAATTCGGCACA
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ATGACCTGCGTCCTTGTTTTATTCCTCATATTGCGTAACTACACATAAATCCTGTCTTTA
CTTTCTTATCTTTCATTTCACTCCGTCGCATGCGCACTTCTGTACACTATACACTGGCCT
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consensus length = 707
fasta sequence

                              [CAGCCAGATTTGCCGAGTGACAAAAAATGACAATGGGTGAACATAAATTTGCTTTAACTGTTGAACATGTATGCACAATGGTTAGTACACCAGAATATCGTCAACTAATTATTGAAGCAATTCATGTACTTGGTTCATTGATGATGCATGATGTTGACAACCGAATATTTATTGATTGTATCGTTAAAGTTGAAGATATTGTAGAAAAAGCAAATAATTTATTTTTAATTGATCAAGTAAAGTATGGTGGGAACGCCACACTGTGTTGTGCAAAATCAATAAAACAATCTGGAATAACTGATTTAACGCCCAGTAATGATTGTCAAACACCACGTAGACAAAGCACTTTAACCTGCCACGGATTACATAATATTTGTCAGCGTTTCTATGACACACCACCTGCTGGAAAATTCGGCACAATGTCCTATATGGTACGTGCCGTATCTGAATTACTTACGTGTAATAAATGTTTCAACCCAGATAAACCTTTACCAATCAATTGCAATGTTCAATAATATTCATATTCGTTTTGCAATTGTATGACCTGCGTCCTTGTTTTATTCCTCATATTGCGTAACTACACATAAATCCTGTCTTTACTTTCTTATCTTTCATTTCACTCCGTCGCATGCGCACTTCTGTACACTATACACTGGCCTATTCACCTATTAACATTGGTGGTAGTAAGAGGCTTTGCCTAGTCATAT]

[+] EMBL CD080862             [CAGCCAGATTTGCCGAGTGACAAAAAATGACAATGGGTGAACATAAATTTGCTTTAACTGTTGAACATGTATGCACAATGGTTAGTACACCAGAATATCGTCAACTAATTATTGAAGCAATTCATGTACTTGGTTCATTGATGATGCATGATGTTGACAACCGAATATTTATTGATTGTATCGTTAAAGTTGAAGATATTGTAGAAAAAGCAAATAATTTATTTTTAATTGATCAAGTAAAGTATGGTGGGAACGCCACACTGTGTTGTGCAAAATCAATAAAACAATCTGGAATAACTGATTTAACGCCCAGTAATGATTGTCAAACACCACGTAGACAAAGCACTTTAACCTGCCACGGATTACATAATATTTGTCAGCGTTTCTATGACACACCACCTGCTGGAAAATTCGGCACAATGTCCTATATGGTACGTGCCGTATCTGAATTACTTACGTGTAATAAATGTTTCAACCCAGATAAACCTTTACCAATCAATTGCAATGTTCAATAATATTCATATTCGTTTTGCAATTGTATGACCTGCGTCCTTGTTTTATTCCTCATATTGCGTAACTACACATAAATCCTGTCTTTACTTTCTTATCTTTCATTTCACTCCGTCGCATGCGCACTTCTGTACACTATACACTGGCCTATTCACCTATTAACATTGGTGGTAGTAAGAGGCTTTGCCTAGTCATAT]
[-] EMBL CD166161             [                                                                                                                                                                                                       TGTAGAAAAAGCAAATAATTTATTTTACATTGATCAAGTAAAGTATGGTGGGAACGCCACACTGTGTTGTGCAAAATCAATAAAACAATCTGGAATAACTGATCTAACGCCCAGTAATGATTGTCAAACACCACGTAGACAAAGCACTTTAACCTGCCACGGATTACATAATATTTGTCAGCGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD157692             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CCACGTAGACAAAGCACTTTAACCTGCCACGGATTACATAATATTTGTCAGCGTTTCTATGACACACCACCTGCTGGAAAATTCGGCACAATGTCCTATATGGTACGTGCCGTATCTGAATTACTTACGTGTAATAAATGTTTCAACCCAGATAAACCTTTACCAATCAATTGCAATGTTCAATAATATTCATATTCGTTTTGCAACTCAATAACCAGCGT                                                                                                                                                             ]




>consensus_9543#1
CAGCCAGATTTGCCGAGTGACAAAAAATGACAATGGGTGAACATAAATTTGCTTTAACTG
TTGAACATGTATGCACAATGGTTAGTACACCAGAATATCGTCAACTAATTATTGAAGCAA
TTCATGTACTTGGTTCATTGATGATGCATGATGTTGACAACCGAATATTTATTGATTGTA
TCGTTAAAGTTGAAGATATTGTAGAAAAAGCAAATAATTTATTTTTAATTGATCAAGTAA
AGTATGGTGGGAACGCCACACTGTGTTGTGCAAAATCAATAAAACAATCTGGAATAACTG
ATTTAACGCCCAGTAATGATTGTCAAACACCACGTAGACAAAGCACTTTAACCTGCCACG
GATTACATAATATTTGTCAGCGTTTCTATGACACACCACCTGCTGGAAAATTCGGCACAA
TGTCCTATATGGTACGTGCCGTATCTGAATTACTTACGTGTAATAAATGTTTCAACCCAG
ATAAACCTTTACCAATCAATTGCAATGTTCAATAATATTCATATTCGTTTTGCAATTGTA
TGACCTGCGTCCTTGTTTTATTCCTCATATTGCGTAACTACACATAAATCCTGTCTTTAC
TTTCTTATCTTTCATTTCACTCCGTCGCATGCGCACTTCTGTACACTATACACTGGCCTA
TTCACCTATTAACATTGGTGGTAGTAAGAGGCTTTGCCTAGTCATAT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9543#0      CTACGGGCCAANAATTCGGCACGAGGTTATTGCTTGGTTGATATTATTTGAAATGTTCTG 60
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      ATAACTGGTTTCTTGATTTTAATATTTCTGTCACTAAGTTAAGTCACTAATCGCATCTTG 120
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      TTCGATAGTGGGTAAAGTTGTAATATTTATTTGATTCTATTTACTTTTATACAGCAACCA 180
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      ATTAAACTTATGAATACAACTCTTACAAATCAAGATAACCTACAGGCTACGTTAGATACT 240
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      ATTTCTGGATCTGTAAAGAAAAGATCCACTGCAGCTCGTCCATTGATTACATCACGTAAA 300
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      CAATCTATAGTCGCTGGTGTTACAGCTGAAGCAGAAAATGAAAATTATCAAACTGATTCA 360
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      CGAAGTCTTTGGAGTCGTCGACGTAAAATTGATGGTGCATTGAATCGTGCCCCACCTGGA 420
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      TTCTATAAACGAGTTTATATCACATTAACTCATATGCAAGGTTTAAGCATTGGCAATCTA 480
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      ACACTTAGTCATAATTTGACAAAAGAAATGACAATGGGTGAACATAAATTTGCTTTAACT 540
consensus_9543#1      -CAGCCAGATTTGCCGAGTGACAAAAAATGACAATGGGTGAACATAAATTTGCTTTAACT 59
                       **   **   *     *  * ** ***********************************

consensus_9543#0      GTTGAACATGTATGCACAATGGTTAGTACACCAGAATATCGTCAACTAATTATTGAAGCA 600
consensus_9543#1      GTTGAACATGTATGCACAATGGTTAGTACACCAGAATATCGTCAACTAATTATTGAAGCA 119
                      ************************************************************

consensus_9543#0      ATTCATGTACTTGGTTCATTGATGATGCATGATGTTGACAACCGAATATTTATTGATTGT 660
consensus_9543#1      ATTCATGTACTTGGTTCATTGATGATGCATGATGTTGACAACCGAATATTTATTGATTGT 179
                      ************************************************************

consensus_9543#0      ATCGTTAAAGTTGAAGATATTGTAGAAAAAGCAAATAATTTATTTTTAATTGATCAAGTA 720
consensus_9543#1      ATCGTTAAAGTTGAAGATATTGTAGAAAAAGCAAATAATTTATTTTTAATTGATCAAGTA 239
                      ************************************************************

consensus_9543#0      AAGTATGGTGGGAACGCCACACTGTGTTGTGCAAAATCAATAAAACAATCTGGAATAACT 780
consensus_9543#1      AAGTATGGTGGGAACGCCACACTGTGTTGTGCAAAATCAATAAAACAATCTGGAATAACT 299
                      ************************************************************

consensus_9543#0      GATTTAACGCCCAGTAATGATTGTCAAACACCACGTAGACGAAGCACTTTAACCTGCCAC 840
consensus_9543#1      GATTTAACGCCCAGTAATGATTGTCAAACACCACGTAGACAAAGCACTTTAACCTGCCAC 359
                      **************************************** *******************

consensus_9543#0      GGATTACATAATATTTGTCAGCGTTTCTATGACACACCACCTGCTGGAAAATTCGGCACA 900
consensus_9543#1      GGATTACATAATATTTGTCAGCGTTTCTATGACACACCACCTGCTGGAAAATTCGGCACA 419
                      ************************************************************

consensus_9543#0      ATGTCCTATATGGTACGTGCCGTATCTGAATTACTTACGTGTAATAAATGTTTCAACCCA 960
consensus_9543#1      ATGTCCTATATGGTACGTGCCGTATCTGAATTACTTACGTGTAATAAATGTTTCAACCCA 479
                      ************************************************************

consensus_9543#0      GATAAACCTTTACCAATCAATTGCAATGTTCAATAATATTCATATTCGTTTTGCAATTGT 1020
consensus_9543#1      GATAAACCTTTACCAATCAATTGCAATGTTCAATAATATTCATATTCGTTTTGCAATTGT 539
                      ************************************************************

consensus_9543#0      ATGACCTGCGTCCTTGTTTTATTCCTCATATTGCGTAACTACACATAAATCCTGTCTTTA 1080
consensus_9543#1      ATGACCTGCGTCCTTGTTTTATTCCTCATATTGCGTAACTACACATAAATCCTGTCTTTA 599
                      ************************************************************

consensus_9543#0      CTTTCTTATCTTTCATTTCACTCCGTCGCATGCGCACTTCTGTACACTATACACTGGCCT 1140
consensus_9543#1      CTTTCTTATCTTTCATTTCACTCCGTCGCATGCGCACTTCTGTACACTATACACTGGCCT 659
                      ************************************************************

consensus_9543#0      ATTCACCTATTAACATTGGTGGTAGTAAGAGGCTTTGCCTAGTCAATATTTTCTACCCTT 1200
consensus_9543#1      ATTCACCTATTAACATTGGTGGTAGTAAGAGGCTTTGCCTAGTCA-TAT----------- 707
                      ********************************************* ***           

consensus_9543#0      TATACACTCAAGTATAGACTCTTTTCATTTAACATTTCTTAATCATGTTTCATCTAGTGG 1260
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      ATTGGAGAATTCAGTGATACTATACTGCCTGTCTAATTTTTAATAATATCCTATTATTTT 1320
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      GTAACATCTCACCTGTTACTACTTATTTTATACAATCAATTTCCTCTTGATCGTATTGAC 1380
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      TGTTGAATTTATTTTGACAGAACTACGTGTAATAATCTAATTCTCATTTTGCAAAAGATA 1440
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      CTCAATTTTTATTTTCTGATTTCTCTGCCATCTTGACTTCACCATCTTTTTTTTTAAATC 1500
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      TTAATTTTAATTTAGTTCAATAGTTTATAGTGTGTCATGGTATTTCTCCCACCTTTTCTG 1560
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      ATTTGTTTTATCTAGTCAAACTGTACCTCAAATTATTTTAAAGAAGTTGATATGCAGAAA 1620
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      AATACATTACAGTACGATTCTTTACGTGTATGTACCTTCTTAGAATGATTGCATGTATTA 1680
consensus_9543#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9543#0      ACTTAAAAAAGTAAATGAA 1699
consensus_9543#1      -------------------