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Schistosoma mansoni
cluster # 9586 cluster # 9586       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9586#0 length = 927 sequences # 10  

consensusID : consensus_9586#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 927
fasta sequence
                              [ACTGTAACTTCTGATAGTCGCTTAGTTGATTCAGCAGTTGAAAATGTACATTTTGTAGAGGCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA-TTA-A-AT-C-AGAAAGACAAACAGTGTATGATGATCGCATAATCTTGCAATTGGCAGCTGACAAGAATGCAGTTGTTATATCCAATGATCAATATCGTGATCTTATGTTCGAAAATGCTAAATTTAAAAAACTTATTGAAACACGACTACTTCCATACGTAATGTCAGGGAACATATTTCTTCTTCCTGAAGATCCTTACGGGCCTAAAGGTCCATCCTTATCTGAATGTTTAACAATATCAAATTCAACCAAGGATTAATCGGGTTCATCTTCTTATCTTTTTTGCGTTTTTCCATTACTACTCTATTTAACTCAAATTGTGTAAGAAGCAAAAGCGAATGATTATCTTCATCTGAAATTATTGGTTTATTTGTTTTTGTATAAAAACACTCCAGAAATAATTATTTATTAATGAATTCAGAGGAAACTATCATTTATTGAAATTACGTAGTTTGTTTATTGTTACTATCTTGCTTTTTATTCTCTCAATAAATATGGCTTTTAAGTTGTGAAATAAATGTAGTTTTCTG]

[+] EMBL CD120493             [ACTGTAACTTCTGATAGTCGCTTAGTTGATTCAGCAGTTGAAAATGTACATTTTGTAGAGGCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAGTCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGGCAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA TTA ANNT C AGAAAGACna                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD120377             [ACTGTAACTTCTGATAGTCGCTTAGTTGATTCAGCAGTTGAAAATGTACATTTTGTAGAGGCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA TTA A ATNC AGAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD120213             [ACTGTAACTTCTGATAGTCGCTTAGTTGATTCAGCAGTTGAAAGTGTACATTTTGTAGAGGCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAATCAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACATTTA A AT C AGAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD120358             [ACTGTGACTTCTGATAGTCGCTTAGTTGATTCAGCAGTTGAAAATGTACATTTTGTAGAGGCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA TTANN AT C AGAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD078662             [                                                 ATTTTGTAGAGGCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA TTA A AT CAAGAAAGACAAACAGTGTATGATGATCGCATAATCTTGCAATTGGCAGCTGACAAGAATGCAGTTGTTATATCCAATGATCAATATCGTGATCTTATGTTCGAAAATGCTAAATTTAAAAAACTTATTGAAACACGACTACTTCCATACGTAATGTCAGGGAACATATTTCTTCTTCCTGAAGATCCTTACGGGCCTAAAGGTCCATCCTTATCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD084084             [                                                                               CAAGTAACTCGG ATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA TTA A AT CAAGAAAGACAAACAGTGTATGATGATCGCATAATCTTGCAATTGGCAGCTGACAAGAATGCAGTTGTTATATCCAATGATCAATATCGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD073125             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA TTA A AT CAAGAAAGACAAACAGTGTATGATGATCGCATAATCTTGCAATTGGCAGCTGACAAGAATGCAGTTGTTATATCCAATGATCAATATCGTGATCTTATGTTCGAAAATGCTAAATTTAAAAAACTTATTGAAACACGACTACTTCCATACGTAATGTCAGGGAACATATTTCTTCTTCCTGAAGATCCTTACGGGCCTAAAGGTCCATCCTTATCTGAATGTTTAACAATATCAAATTCAACCAAGGATTAATCGGGTTCATCTTCTTATCTTTTTTGCGTTTTTCCATTACTACTCTATTTAACTCAAATTGTGTAAGAAGCAAAAGCGAATGATTATCTTCATCTGAAATTATTGGTTTATTTGTTTTTGTATAAAAACACTCCAGAAATAATTATTTATTAATGAATTCAGAGGAAACTATCATTTATTGAAATTACGTAGTTTGTTTATTGTTACTATCTTGCTTTTTATTCTCTCAATAAATATGGCTTT                            ]
[-] EMBL CD073467             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTATATCCAATGATCAATATCGTGATCTTATGTTCGAAAATGCTAAATTTAAAAAACTTATTGAAACACGACTACTTCCATACGTAATGTCAGGGAACATATTTTTTTTTCCTGAAGATCCTTACGGGCCTAAAGGTCCATCCTTATTTGAATGTTTAACAATATCAAATTCAACCAAGGATTAATCGGGTTCATCTTCTTATCTTTTTTGCGTTTTTCCATTACTACTCTATTTAACTCAAATTGTGTAAGAAGCAAAAGCGAATGATTATTTTCATCTGAAATTATTGGTTTATTTGTTTTTGTATAAAAACACTCCAGAAATAATTATTTATTAATGAATTCAGAGGAAACTATCATTTATTGAAATTACGTAGTTTGTTTATTGTTACTATCTTGCTTTTTATTCTCTCAATAAATATGGCTTT                            ]
[+] EMBL CD137226             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CAATATCGTGATCTTATGTTCGAAAATGCTAAATTTAAAAAACTTATTGAAACACGACTACTTCCATACGTAATGTCAGGGAACATATTTCTTCTTCCTGAAGGTCCTTACGGGCCTAAAGGTCCATCCTTATCTGAATGTTTAACAATATCAAATTCAACCAAGGATTAATCGGGTTCATCTTCTTATCTTTTTTGCGTTTTTCCATTACTACTCTATTTAACTCAAATTGTGTAAGAAGCAAAAGCGAATGATTATCTTCATCTGAAATTATTGGTTTATTTGTTTTTGTATAAAAACACTCCAGAAATAATTATTTATTAATGAATTCAGAGGAAACTATCATTTATTGAAATTACGTAGTTTGTTTATTGTTACTATCTTGCTTTTTATTC                                               ]
[-] EMBL CD077135             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATTTCTTCTTCCTGAAGATCCTTACGGGCCTAAAGGTCCATCCTTATCTGAATGTTTAACAATATCAAATTCAACCAAGGATTAATCGGGTTCATCTTCTTATCTTTTTTGCGTTTTTCCATTAGTACTCTATTTAAATCAAATTGTGTAATAAGCAAAAGCGAATGATTATCTTCATCTGAAATTATTGGTTTATTTGTTTTTGCATAAAAACCCTCCAGAAATAATTATTTATTAATGAATTCAGAGGGAACCATCATTTATTGAAATTACGTAGTTTGTTTATTGTTACTATCTTGCTTTTTATTCTCTCAATAAATATGGCTTTTAAGTTGTGAAATAAATGTAGTTTTCTG]


>consensus_9586#0 ACTGTAACTTCTGATAGTCGCTTAGTTGATTCAGCAGTTGAAAATGTACATTTTGTAGAG GCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAAC CCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGC TTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAA TTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGAT ATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTT GAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACATTAAATCAGAAAGACAAACAG TGTATGATGATCGCATAATCTTGCAATTGGCAGCTGACAAGAATGCAGTTGTTATATCCA ATGATCAATATCGTGATCTTATGTTCGAAAATGCTAAATTTAAAAAACTTATTGAAACAC GACTACTTCCATACGTAATGTCAGGGAACATATTTCTTCTTCCTGAAGATCCTTACGGGC CTAAAGGTCCATCCTTATCTGAATGTTTAACAATATCAAATTCAACCAAGGATTAATCGG GTTCATCTTCTTATCTTTTTTGCGTTTTTCCATTACTACTCTATTTAACTCAAATTGTGT AAGAAGCAAAAGCGAATGATTATCTTCATCTGAAATTATTGGTTTATTTGTTTTTGTATA AAAACACTCCAGAAATAATTATTTATTAATGAATTCAGAGGAAACTATCATTTATTGAAA TTACGTAGTTTGTTTATTGTTACTATCTTGCTTTTTATTCTCTCAATAAATATGGCTTTT AAGTTGTGAAATAAATGTAGTTTTCTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)