|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9586#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 927 fasta sequence
[ACTGTAACTTCTGATAGTCGCTTAGTTGATTCAGCAGTTGAAAATGTACATTTTGTAGAGGCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA-TTA-A-AT-C-AGAAAGACAAACAGTGTATGATGATCGCATAATCTTGCAATTGGCAGCTGACAAGAATGCAGTTGTTATATCCAATGATCAATATCGTGATCTTATGTTCGAAAATGCTAAATTTAAAAAACTTATTGAAACACGACTACTTCCATACGTAATGTCAGGGAACATATTTCTTCTTCCTGAAGATCCTTACGGGCCTAAAGGTCCATCCTTATCTGAATGTTTAACAATATCAAATTCAACCAAGGATTAATCGGGTTCATCTTCTTATCTTTTTTGCGTTTTTCCATTACTACTCTATTTAACTCAAATTGTGTAAGAAGCAAAAGCGAATGATTATCTTCATCTGAAATTATTGGTTTATTTGTTTTTGTATAAAAACACTCCAGAAATAATTATTTATTAATGAATTCAGAGGAAACTATCATTTATTGAAATTACGTAGTTTGTTTATTGTTACTATCTTGCTTTTTATTCTCTCAATAAATATGGCTTTTAAGTTGTGAAATAAATGTAGTTTTCTG]
[+] EMBL CD120493 [ACTGTAACTTCTGATAGTCGCTTAGTTGATTCAGCAGTTGAAAATGTACATTTTGTAGAGGCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAGTCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGGCAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA TTA ANNT C AGAAAGACna ]
[+] EMBL CD120377 [ACTGTAACTTCTGATAGTCGCTTAGTTGATTCAGCAGTTGAAAATGTACATTTTGTAGAGGCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA TTA A ATNC AGAAAG ]
[+] EMBL CD120213 [ACTGTAACTTCTGATAGTCGCTTAGTTGATTCAGCAGTTGAAAGTGTACATTTTGTAGAGGCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAATCAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACATTTA A AT C AGAAAG ]
[+] EMBL CD120358 [ACTGTGACTTCTGATAGTCGCTTAGTTGATTCAGCAGTTGAAAATGTACATTTTGTAGAGGCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA TTANN AT C AGAAAG ]
[+] EMBL CD078662 [ ATTTTGTAGAGGCTTATCGTAAGTGTGAAGCAAGTAACTCGGAATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA TTA A AT CAAGAAAGACAAACAGTGTATGATGATCGCATAATCTTGCAATTGGCAGCTGACAAGAATGCAGTTGTTATATCCAATGATCAATATCGTGATCTTATGTTCGAAAATGCTAAATTTAAAAAACTTATTGAAACACGACTACTTCCATACGTAATGTCAGGGAACATATTTCTTCTTCCTGAAGATCCTTACGGGCCTAAAGGTCCATCCTTATCTG ]
[+] EMBL CD084084 [ CAAGTAACTCGG ATCGGTTAATCGAGATAACGAATCGAACCCATTGTTTTTATTAACAAATCCTTCCAAGGTAAAGTCAGATAAATCGTTGCAATCTCGCTTAAGACCCATTATAATTGACGGTAGTAATGTGAGTTTCGCTCATGGAAAACAAAAAGAATTCAGTGTTCAAGGAATTCGTCTAGCCTTAGATTACTTCAAAAAACGTGGTCATAAAGATATAGTTATTGTAATACCTAGACATTATCAAGGCAAAGGTGGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA TTA A AT CAAGAAAGACAAACAGTGTATGATGATCGCATAATCTTGCAATTGGCAGCTGACAAGAATGCAGTTGTTATATCCAATGATCAATATCGTGA ]
[-] EMBL CD073125 [ GGTCGTTATTTTGATGAACTTGAGCATTCCGGCATGTTGACTTATACACCGTCACGAACA TTA A AT CAAGAAAGACAAACAGTGTATGATGATCGCATAATCTTGCAATTGGCAGCTGACAAGAATGCAGTTGTTATATCCAATGATCAATATCGTGATCTTATGTTCGAAAATGCTAAATTTAAAAAACTTATTGAAACACGACTACTTCCATACGTAATGTCAGGGAACATATTTCTTCTTCCTGAAGATCCTTACGGGCCTAAAGGTCCATCCTTATCTGAATGTTTAACAATATCAAATTCAACCAAGGATTAATCGGGTTCATCTTCTTATCTTTTTTGCGTTTTTCCATTACTACTCTATTTAACTCAAATTGTGTAAGAAGCAAAAGCGAATGATTATCTTCATCTGAAATTATTGGTTTATTTGTTTTTGTATAAAAACACTCCAGAAATAATTATTTATTAATGAATTCAGAGGAAACTATCATTTATTGAAATTACGTAGTTTGTTTATTGTTACTATCTTGCTTTTTATTCTCTCAATAAATATGGCTTT ]
[-] EMBL CD073467 [ TTATATCCAATGATCAATATCGTGATCTTATGTTCGAAAATGCTAAATTTAAAAAACTTATTGAAACACGACTACTTCCATACGTAATGTCAGGGAACATATTTTTTTTTCCTGAAGATCCTTACGGGCCTAAAGGTCCATCCTTATTTGAATGTTTAACAATATCAAATTCAACCAAGGATTAATCGGGTTCATCTTCTTATCTTTTTTGCGTTTTTCCATTACTACTCTATTTAACTCAAATTGTGTAAGAAGCAAAAGCGAATGATTATTTTCATCTGAAATTATTGGTTTATTTGTTTTTGTATAAAAACACTCCAGAAATAATTATTTATTAATGAATTCAGAGGAAACTATCATTTATTGAAATTACGTAGTTTGTTTATTGTTACTATCTTGCTTTTTATTCTCTCAATAAATATGGCTTT ]
[+] EMBL CD137226 [ CAATATCGTGATCTTATGTTCGAAAATGCTAAATTTAAAAAACTTATTGAAACACGACTACTTCCATACGTAATGTCAGGGAACATATTTCTTCTTCCTGAAGGTCCTTACGGGCCTAAAGGTCCATCCTTATCTGAATGTTTAACAATATCAAATTCAACCAAGGATTAATCGGGTTCATCTTCTTATCTTTTTTGCGTTTTTCCATTACTACTCTATTTAACTCAAATTGTGTAAGAAGCAAAAGCGAATGATTATCTTCATCTGAAATTATTGGTTTATTTGTTTTTGTATAAAAACACTCCAGAAATAATTATTTATTAATGAATTCAGAGGAAACTATCATTTATTGAAATTACGTAGTTTGTTTATTGTTACTATCTTGCTTTTTATTC ]
[-] EMBL CD077135 [ TATTTCTTCTTCCTGAAGATCCTTACGGGCCTAAAGGTCCATCCTTATCTGAATGTTTAACAATATCAAATTCAACCAAGGATTAATCGGGTTCATCTTCTTATCTTTTTTGCGTTTTTCCATTAGTACTCTATTTAAATCAAATTGTGTAATAAGCAAAAGCGAATGATTATCTTCATCTGAAATTATTGGTTTATTTGTTTTTGCATAAAAACCCTCCAGAAATAATTATTTATTAATGAATTCAGAGGGAACCATCATTTATTGAAATTACGTAGTTTGTTTATTGTTACTATCTTGCTTTTTATTCTCTCAATAAATATGGCTTTTAAGTTGTGAAATAAATGTAGTTTTCTG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||