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Schistosoma mansoni
cluster # 9603 cluster # 9603       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9603#0 length = 1051 sequences # 10  

consensusID : consensus_9603#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1051
fasta sequence
                              [TTTGAGTAAATGGTTAACAATCTGCAAGGGACCAATAAGATGTTGTTCTCGTTGGGTTCCTGACAAAAAGTTCATGGATGAACTTAAGGAGTCATTGTACAACCCGGCTGTCGTCAAGGCGAACACAACAGTCCAACCAATCGACTTTTTCAATGTAAGTCATCAGGAGGTTCAATCTGTTCATCTAAATTTCGGCCCACAGCATCCTGCTGCTCATGGAGTTTTGAGACTAATAATGGAACTCGATGGAGAGAAAATTATTCGTCTTGATCCACATATCGGTCTGCTACATCGTGGTACAGAAAAGTTGATTGAATACAAAACGTATACTCAAGCTTTGCCTTATTTCGACCGACTCGATTATGCTTCCATGATGTGTAACGAACAGTGTTATTCATTGGCTGTGGAGAAGCTACTCAATATCGAAGTGCCTCCCCGTGCAAAGTATATACGAACTCTTTATTCTGAAATAACTAGAATAATGAATCACTGTTTAGCTGTTGGTTCCACTGTTCTGGATATTGGAGGTATAACTCCAATCTTCTGGTTGTTTGAAGAACGTGAAAAAATGTTTGAATTCTATGAACGTGTGTCTGGTGCTCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGAGGTGTTTATTTAGATATGCCACTGGGACTGATGGATGATATTTATCAGTTCATACAAAAATTCCCACAGCGATTAGATGAAATTAGCGATCTATTGTTTGATAATCCAATTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGCTGAAGATGCTCTAGATTTGGGATTCTCGGGGGTTATGCTTCGTGGGAGTGGGATTAAATGGGATTTACGTAAAACACAACCTTACGACGCCTATGAAGATATGGATTTTGATGTACCAGTTGGTGTTCATGGTGATTGCTATGATCGATTTATAGTACGTATGGAAGAAATGCGTCAATCATTGCGTATTATGGAACAATGTCTTAAT-AAATGCCCAAAGGTGAGATCANAGTGGATGATGCCAAAATTTGTCCACCTAAACGTGCTGAAA]

[+] EMBL AW017071             [TTTGAGTAAATGGTTAACAATCTGCAAGGGACCAATAAGATGTTGTTCTCGTTGGGTTCCTGACAAAAAGTTCATGGATGAACTTAAGGAGTCATTGTACAACCCGGCTGTCGTCAAGGCGAACACAACAGTCCAACCAATCGACTTTTTCAATGTAAGTCATCAGGAGGTTCAATCTGTTCATCTAAATTTCGGCCCACAGCATCCTGCTGCTCATGGAGTTTTGAGACTAATAATGGAACTCGATGGAGAGAAAATTATTCGTCTTGATCCACATATCGGTCTGCTACATCGTGGTACAGAAAAGTTGATTGAATACAAAACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD115678             [                                                                                                                      GCGAACACAACAGTCCAACCAATCGACTTTTTCAATGTAAGTCATCAGGAGGTTCAATCTGTTCATCTAAATTTCGGCCCACAACATCCTGCCGCTCATGGAGTTTTGAGACTAATAATGGAACTCGATGGAGAGAAAATTATTCGTCTTGATCCACATATCGGTCTGCTACATCGTGGTACAGAAAAGTTGATTGAATACAAAACGTATACTCAAGCTTTGCCTTATTTCGACCGACTCGATTATGCTTCCATGATGTGTAACGAACAGTGTTATTCATTGGCTGTGGAGAAGCTACTCAATATCGAAGTGCCTCCCCGTGCAAAGTATATACGAACTCTTTATTCTGAAATAACTAGAATAATGAATCACTGTTTAGCTGTTGGTTCCACTGTTCTGGATATTGGAGGTATAACTCCAATCTTCTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD139937             [                                                                                                                                                                 ATCAGGAGGTTCAATCTGTTCATCTAAATTTCGGCCCACAGCATCCTGCTGCTCATGGAGTTTTGAGGCTAATAATGGAACTCGATGGAGAGAAAATTATTCGTCTTGATCCACATATCGGTCTGCTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD201123             [                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCTGCTACATCGTGGTACAGAAAAGTTGATTGAATACAAAACGTATACTCAAGCTTTGCCTTATTTCGACCGACTCGATTATGCTTCCATGATGTGTAACGAACAGTGTTATTCATTGGCTGTGGAGAAGCTACTCAATATCGAAGTGCCTCCCCGTGCAAAGTATATACGAACTCTTTATTCTGAAATAACTAGAATAATGAATCACTGTTTAGCTGTTGGTTCCACTGTTCTGGATATTGGAGGTATAACTCCAATCTTCTGGTTGTTTGAAGAACGTGAAAAAATGTTTGAATTCTATGAACGTGTGTCTGGTGCTCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGGGGTGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD139938             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGTATACTCAAGCTTTGCCTTATTTCGACCGACTCGATTATGCTTCCATGATGTGTAACGAACAGTGTTATTCATTGGCTATGGAGAAGCTACTCAATATCGGAGTGCCTCCCCGTGCAAAGTATATACGAACTCTTTTTTCTGAAAT ACTAGAAATATG ATCACTGTTTAGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AI976385             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAAGTATATACGAACTCTTTATTCTGAAATAACTAGAATAATGAATCACTGTTTAGCTGTTGGTTCCACTGTTCTGGATATTGGAGGTATAACTCCAATCTTCTGGTTGTTTGAAGAACGTGAAAAAATGTTCGAATTCTATGAACGTGTGTCTGGTGCTCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGAGGTGTTTATTTAGATATGCCACTGNGACTGATGGATGATATTTATCAGTTCATACAAAAATTCCCACAGCGATTAGATGAAATTAGCGATCTATTGTTTGATAATCCAATTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGCTGAAGATGCTCTAGATTTGGGATTCTCGGTGGCTATGCTTCGTGGGAGTGGGATTAAATGGGATATACTTAAAACACAACCTTACGACGCCTATGAA                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD137349             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGAATCACTGTTTAGCTGTTGGTTCCACTGTTCTGGATATTGGAGGTATAACTCCAATCTTCTGGTTGTTTGAAGAACGAGAAAAAATGTTTGAATTCTATGAACGTGTGTCTGGTGCTCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGAGGTGTTTATTTAGATATGCCACTGGGACTGATGGATGATATTTATCAGTTCATACAAAAATTCCCACAGCGATTAGATGAAATTAGCGATCTATTGTTTGATAATCCAATTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGCTGAAGATGCTCTAGATTTGGGATTCTCGGGGGTTATGCTTCGTGGGAGTGGGATTAAATGGGATTTACGTAAAACACAACCTTACGACGCCTATGAAGATATGGATTTTGATGTACCAGTTGGTGTTCATGGTGATTGCTATGATCGATTTATAGTACGTATGGAAGAAATGCGTCAATCATTGCGTATTATGGAACAATGTCTTAAT AAATGCCCAAAGGTGAGATCANAGTGGATGATGCCAAAATTTGTCCACCTAAACGTGCTGAAA]
[+] EMBL CD114738             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAATAAATGTTTGAATTCTATGAACGTGTGTCTGGTGCTCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGAGGTGTTTATTTAGATATGCCACTGGGACTGATGGATGATATTTATCAGTTCATACAAAAATTCCCACAGCGATTAGATGAAATTAGCGATCTATTGTTTGATAATCCAATTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGCTGAAGATGCTCTAGATTTGGGATT                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD114715             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AATAAATGTTTGAATTCTATGAACGCGTGTCTGGTGCTCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGAGGTGTTTATTTAGATATGCCACTGGGACTGATGGATGATATTTATCAGTTCATACAAAAATTCCCACAGCGATTAGATGAAATTAGCGATCTATTGTTTGATAATCCAATTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGCTGAAGATGCTCTAGATTTGGGATTC                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD140049             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GATGAAATTAGCGATCTATTGTTTGATAATCCACTTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGCTGAAGATGCTCTAGATTTGGGATTCTCGGGGGTTATGCTTCGTGGGAGTGGGATTAAATGGGATTTACGTAAAACACAACCTTACGACGCCTATGAAGATATGGATTTTGATGTACCAGTTGGTGTTCATGGTGATTGCTATGATCGATTTATAGTACGTATGGAAGAAATGCGTCAATCATTGCGTATTATGGAACAATGTCTTAATAAAATGCCCAAAGGTGAGATCAAAGTGGATGATGCCAAAATTTGTCCACCTAAAC         ]


>consensus_9603#0 TTTGAGTAAATGGTTAACAATCTGCAAGGGACCAATAAGATGTTGTTCTCGTTGGGTTCC TGACAAAAAGTTCATGGATGAACTTAAGGAGTCATTGTACAACCCGGCTGTCGTCAAGGC GAACACAACAGTCCAACCAATCGACTTTTTCAATGTAAGTCATCAGGAGGTTCAATCTGT TCATCTAAATTTCGGCCCACAGCATCCTGCTGCTCATGGAGTTTTGAGACTAATAATGGA ACTCGATGGAGAGAAAATTATTCGTCTTGATCCACATATCGGTCTGCTACATCGTGGTAC AGAAAAGTTGATTGAATACAAAACGTATACTCAAGCTTTGCCTTATTTCGACCGACTCGA TTATGCTTCCATGATGTGTAACGAACAGTGTTATTCATTGGCTGTGGAGAAGCTACTCAA TATCGAAGTGCCTCCCCGTGCAAAGTATATACGAACTCTTTATTCTGAAATAACTAGAAT AATGAATCACTGTTTAGCTGTTGGTTCCACTGTTCTGGATATTGGAGGTATAACTCCAAT CTTCTGGTTGTTTGAAGAACGTGAAAAAATGTTTGAATTCTATGAACGTGTGTCTGGTGC TCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGAGGTGTTTATTTAGATATGCCACTGGGACT GATGGATGATATTTATCAGTTCATACAAAAATTCCCACAGCGATTAGATGAAATTAGCGA TCTATTGTTTGATAATCCAATTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGC TGAAGATGCTCTAGATTTGGGATTCTCGGGGGTTATGCTTCGTGGGAGTGGGATTAAATG GGATTTACGTAAAACACAACCTTACGACGCCTATGAAGATATGGATTTTGATGTACCAGT TGGTGTTCATGGTGATTGCTATGATCGATTTATAGTACGTATGGAAGAAATGCGTCAATC ATTGCGTATTATGGAACAATGTCTTAATAAATGCCCAAAGGTGAGATCANAGTGGATGAT GCCAAAATTTGTCCACCTAAACGTGCTGAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)