These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9603#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1051 fasta sequence [TTTGAGTAAATGGTTAACAATCTGCAAGGGACCAATAAGATGTTGTTCTCGTTGGGTTCCTGACAAAAAGTTCATGGATGAACTTAAGGAGTCATTGTACAACCCGGCTGTCGTCAAGGCGAACACAACAGTCCAACCAATCGACTTTTTCAATGTAAGTCATCAGGAGGTTCAATCTGTTCATCTAAATTTCGGCCCACAGCATCCTGCTGCTCATGGAGTTTTGAGACTAATAATGGAACTCGATGGAGAGAAAATTATTCGTCTTGATCCACATATCGGTCTGCTACATCGTGGTACAGAAAAGTTGATTGAATACAAAACGTATACTCAAGCTTTGCCTTATTTCGACCGACTCGATTATGCTTCCATGATGTGTAACGAACAGTGTTATTCATTGGCTGTGGAGAAGCTACTCAATATCGAAGTGCCTCCCCGTGCAAAGTATATACGAACTCTTTATTCTGAAATAACTAGAATAATGAATCACTGTTTAGCTGTTGGTTCCACTGTTCTGGATATTGGAGGTATAACTCCAATCTTCTGGTTGTTTGAAGAACGTGAAAAAATGTTTGAATTCTATGAACGTGTGTCTGGTGCTCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGAGGTGTTTATTTAGATATGCCACTGGGACTGATGGATGATATTTATCAGTTCATACAAAAATTCCCACAGCGATTAGATGAAATTAGCGATCTATTGTTTGATAATCCAATTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGCTGAAGATGCTCTAGATTTGGGATTCTCGGGGGTTATGCTTCGTGGGAGTGGGATTAAATGGGATTTACGTAAAACACAACCTTACGACGCCTATGAAGATATGGATTTTGATGTACCAGTTGGTGTTCATGGTGATTGCTATGATCGATTTATAGTACGTATGGAAGAAATGCGTCAATCATTGCGTATTATGGAACAATGTCTTAAT-AAATGCCCAAAGGTGAGATCANAGTGGATGATGCCAAAATTTGTCCACCTAAACGTGCTGAAA] [+] EMBL AW017071 [TTTGAGTAAATGGTTAACAATCTGCAAGGGACCAATAAGATGTTGTTCTCGTTGGGTTCCTGACAAAAAGTTCATGGATGAACTTAAGGAGTCATTGTACAACCCGGCTGTCGTCAAGGCGAACACAACAGTCCAACCAATCGACTTTTTCAATGTAAGTCATCAGGAGGTTCAATCTGTTCATCTAAATTTCGGCCCACAGCATCCTGCTGCTCATGGAGTTTTGAGACTAATAATGGAACTCGATGGAGAGAAAATTATTCGTCTTGATCCACATATCGGTCTGCTACATCGTGGTACAGAAAAGTTGATTGAATACAAAACGT ] [+] EMBL CD115678 [ GCGAACACAACAGTCCAACCAATCGACTTTTTCAATGTAAGTCATCAGGAGGTTCAATCTGTTCATCTAAATTTCGGCCCACAACATCCTGCCGCTCATGGAGTTTTGAGACTAATAATGGAACTCGATGGAGAGAAAATTATTCGTCTTGATCCACATATCGGTCTGCTACATCGTGGTACAGAAAAGTTGATTGAATACAAAACGTATACTCAAGCTTTGCCTTATTTCGACCGACTCGATTATGCTTCCATGATGTGTAACGAACAGTGTTATTCATTGGCTGTGGAGAAGCTACTCAATATCGAAGTGCCTCCCCGTGCAAAGTATATACGAACTCTTTATTCTGAAATAACTAGAATAATGAATCACTGTTTAGCTGTTGGTTCCACTGTTCTGGATATTGGAGGTATAACTCCAATCTTCTGG ] [+] EMBL CD139937 [ ATCAGGAGGTTCAATCTGTTCATCTAAATTTCGGCCCACAGCATCCTGCTGCTCATGGAGTTTTGAGGCTAATAATGGAACTCGATGGAGAGAAAATTATTCGTCTTGATCCACATATCGGTCTGCTACA ] [-] EMBL CD201123 [ TCTGCTACATCGTGGTACAGAAAAGTTGATTGAATACAAAACGTATACTCAAGCTTTGCCTTATTTCGACCGACTCGATTATGCTTCCATGATGTGTAACGAACAGTGTTATTCATTGGCTGTGGAGAAGCTACTCAATATCGAAGTGCCTCCCCGTGCAAAGTATATACGAACTCTTTATTCTGAAATAACTAGAATAATGAATCACTGTTTAGCTGTTGGTTCCACTGTTCTGGATATTGGAGGTATAACTCCAATCTTCTGGTTGTTTGAAGAACGTGAAAAAATGTTTGAATTCTATGAACGTGTGTCTGGTGCTCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGGGGTGTTT ] [+] EMBL CD139938 [ CGTATACTCAAGCTTTGCCTTATTTCGACCGACTCGATTATGCTTCCATGATGTGTAACGAACAGTGTTATTCATTGGCTATGGAGAAGCTACTCAATATCGGAGTGCCTCCCCGTGCAAAGTATATACGAACTCTTTTTTCTGAAAT ACTAGAAATATG ATCACTGTTTAGCTG ] [+] EMBL AI976385 [ AAAGTATATACGAACTCTTTATTCTGAAATAACTAGAATAATGAATCACTGTTTAGCTGTTGGTTCCACTGTTCTGGATATTGGAGGTATAACTCCAATCTTCTGGTTGTTTGAAGAACGTGAAAAAATGTTCGAATTCTATGAACGTGTGTCTGGTGCTCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGAGGTGTTTATTTAGATATGCCACTGNGACTGATGGATGATATTTATCAGTTCATACAAAAATTCCCACAGCGATTAGATGAAATTAGCGATCTATTGTTTGATAATCCAATTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGCTGAAGATGCTCTAGATTTGGGATTCTCGGTGGCTATGCTTCGTGGGAGTGGGATTAAATGGGATATACTTAAAACACAACCTTACGACGCCTATGAA ] [+] EMBL CD137349 [ ATGAATCACTGTTTAGCTGTTGGTTCCACTGTTCTGGATATTGGAGGTATAACTCCAATCTTCTGGTTGTTTGAAGAACGAGAAAAAATGTTTGAATTCTATGAACGTGTGTCTGGTGCTCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGAGGTGTTTATTTAGATATGCCACTGGGACTGATGGATGATATTTATCAGTTCATACAAAAATTCCCACAGCGATTAGATGAAATTAGCGATCTATTGTTTGATAATCCAATTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGCTGAAGATGCTCTAGATTTGGGATTCTCGGGGGTTATGCTTCGTGGGAGTGGGATTAAATGGGATTTACGTAAAACACAACCTTACGACGCCTATGAAGATATGGATTTTGATGTACCAGTTGGTGTTCATGGTGATTGCTATGATCGATTTATAGTACGTATGGAAGAAATGCGTCAATCATTGCGTATTATGGAACAATGTCTTAAT AAATGCCCAAAGGTGAGATCANAGTGGATGATGCCAAAATTTGTCCACCTAAACGTGCTGAAA] [+] EMBL CD114738 [ GAATAAATGTTTGAATTCTATGAACGTGTGTCTGGTGCTCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGAGGTGTTTATTTAGATATGCCACTGGGACTGATGGATGATATTTATCAGTTCATACAAAAATTCCCACAGCGATTAGATGAAATTAGCGATCTATTGTTTGATAATCCAATTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGCTGAAGATGCTCTAGATTTGGGATT ] [-] EMBL CD114715 [ AATAAATGTTTGAATTCTATGAACGCGTGTCTGGTGCTCGTATGCACGCTGCTTACATTCGTCCAGGAGGTGTTTATTTAGATATGCCACTGGGACTGATGGATGATATTTATCAGTTCATACAAAAATTCCCACAGCGATTAGATGAAATTAGCGATCTATTGTTTGATAATCCAATTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGCTGAAGATGCTCTAGATTTGGGATTC ] [-] EMBL CD140049 [ GATGAAATTAGCGATCTATTGTTTGATAATCCACTTTGGATTACTCGCACTAAAGATGTTGGTATTGTTAGCGCTGAAGATGCTCTAGATTTGGGATTCTCGGGGGTTATGCTTCGTGGGAGTGGGATTAAATGGGATTTACGTAAAACACAACCTTACGACGCCTATGAAGATATGGATTTTGATGTACCAGTTGGTGTTCATGGTGATTGCTATGATCGATTTATAGTACGTATGGAAGAAATGCGTCAATCATTGCGTATTATGGAACAATGTCTTAATAAAATGCCCAAAGGTGAGATCAAAGTGGATGATGCCAAAATTTGTCCACCTAAAC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||