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Schistosoma mansoni
cluster # 9606 cluster # 9606       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9606#0 length = 940 sequences # 10  

consensusID : consensus_9606#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 940
fasta sequence
                              [AAAGTTATCCCTACAATGGGAAAGGATGGCCCAAAACAGGGGAATTACGTTGTGGCTGTGATGGATGCAGTCAAGTGTCCTATTAACATAACATTGTTCCTAATATGCGTTTTACTTGTTTATTTAAGTCTAAGGCCACTGTTAAGAAAAAAGAAGTCTCAGAAATGTGAAGTCCCGAAGATGGGGAGACGTGATTTTACACTAGAAGAACTCCAGAGTTTCGATGGCAGTGGCGAACATAA-GAGAATATTAATAGCAGTTAATGGTAAGATATTCGATGTCACAAATAAAGGACAGGGATTTTATGGCAAGGGTGCACCGTACGCTGCTTTTGCCGGTAGAGATGCATCAAGAGCACTTGCGTGCTTCAACCTCGAAACAAAAGATGACTATGACGATCTTACTGATCTAACTGCTGATCAAATGCAAACCCTAAGGGAATGGGAAC-TACAATTTTCCGAGCGTTATGATCATATTGGACGACTTTTGAAGCCAGGAGAGCCTCATAGGGTTTATGAAGTCAATGATGGAGAAGATGACGTTGGAACCAACCATGTTCAAAGTGCACTTAGAAAAAAAGTAACTTGAAAGTGTCTACTTCTGTTCTAAGTATCTTATGTATCTAAACTTTGAATATGATTTTCTTGCCTGGACTGATCATCCGTGATGCTCACATTTCAACATCCAGTTATAATTTTAACCTGGTTTTCGATTCGTGCAATAATAAAATCGTTAAATGAAACACTCGTCCACGCAAATCTGTGCACGATGGAGTGGATCTCTTTTAAAATTCAAAATTAAATCTACACTTCTGGGTATTTTTGTTTATCATATTTTGTTCTTATAATTACAAATCATTTTGAATACACTATATGTTCGACCTGGTTGCTACTGCTTAATCATAATGTAAATATTTGTAACTTTCCACAAATATACATGT]

[+] EMBL CD142020             [AAAGTTATCCCTACAATGGGAAAGGATGGCCCAAAACAGGGGAATTACGTTGTGGCTGTGATGGATGCAGTCAAGTGTCCTATTAACATAACATTGTTCCTAATATGCGTTTTACTTGTTTATTTAAGTCTAAGGCCACTGTTAAGAAAAAAGAAGTCTCAGAAATGTGAAGTCCCGAAGATGGGGAGACGTGATTTTACACTAGAAGAACTCCAGAGTTTCGATGGCAGTGGCGAACATAA GAGAATATTAATAGCAGTTAATGGTAAGATATTCGATGTCACAAATAAAGGACAGGGATTTTATGGCAAGGGTGCACCGTACGCTGCTTTTGCCGGTAGAGATGCATCAAGAGCACTTGCGTGCTTCAACCTCGAAACAAAAGATGACTATGACGATCTTACTGATCTAACTGCTGATCAAATGCAAACCCTAAGGGAATGGGAACNTAC ATTNTCCGAGCGTTATGATCATATTGGACGACTTTTGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD189818             [ AAGTTATCCCTACAATGGGAAAGGATGGCCCAAAACAGGGGAATTACGTTGTGGCTGTGATGGATGCAGTCAAGTGTCCTATTAACATAACATTGTTCCTAATATGCGTTTTACTTGTTTATTTAAGTCTAAGGCCACTGTTAAGAAAAAAGAAGTCTCAGAAATGTGAAGTCCCGAAGATGGGGAGACGTGATTTTACACTAGAAGAACTCCAGAGTTTCGATGGCAGTGGCGAACATAA GAGAATATTAATAGCAGTTAATGGTAAGATATTCGATGTCACAAATAAAGGACAGGGATTTTATGGCAAGGGTGCACCGTACGCTGCTTTTGCCGGTAGAGATGCATCAAGAGCACTTGCGTGCTTCAACCTCGAAACAAAAGATGACTATGACGATCTTACTGATCTAACTGCTGATCAAATGCAAACCCTAAGGGAATGGGAAC TACAATTTTCCGAGCGTTATGATCATATTGGACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD133222             [  AGTTATCCCTGCAATGGGAAAGGATGGCCCAAAACAGGGGAATTACGTTGTGGCTGTGATGGATGCAGTCAAGTGTCCTATTAACATAACATTGTTCCTAATATGCGTTTTACTTGTTTATTTAAGTCTAAGGCCACTGTTAAGAAAAAAGAAGTCTCAGAAATGTGAAGTCCCGAAGATGGGGAGACGTGATTTTACACTAGAAGAACTCCAGAGTTTCGATGGCAGTGGCGAACATAA GAGAATATTAATAGCAGTTAATGGTAAGATATTCGATGTCACAAATAAAGGACAGGGATTTTATGGCAAGGGTGCACCGTACGCTGCTTTTGCCGGTAGAGATGCATCAAGAGCACTTGCGTGCTTCAACCTCGAAACAAAAGATGACTATGACGATCTTACTGATCTAACTGCTGATCAAATGCAAACCCTAAGGGAATGGGAAC TACAATTTTCCGAGCGTTATGATCATATTGGACGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD078583             [                  GGAAAGGATGGCCCAAAACAGGGGAATTACGTTGTGGCTGTGATGGATGCAGTCAAGTGTCCTATTAACATAACATTGTTCCTAATATGCGTTTTACTTGTTTATTTAAGTCTAAGGCCACTGTTAAGAAAAAAGAAGTCTCAGAAATGTGAAGTCCCGAAGATGGGGAGACGTGATTTTACACTAGAAGAACTCCAGAGTTTCGATGGCAGTGGCGAACATAA GAGAATATTAATAGCAGTTAATGGTAAGATATTCGATGTCACAAATAAAGGACAGGGATTTTATGGCAAGGGTGCACCGTACGCTGCTTTTGCCGGTAGAGATGCATCAAGAGCACTTGCGTGCTTCAACCTCGAAACAAAAGATGACTATGACGATCTTACTGATCTAACTGCTGATCAAATGCAAACCCTAAGGGAATGGGAAC TACAATTTTCCGAGCGTTATGATCATATTGGACGACTTTTGAAGCCAGGAGAGCCTCATAGGGTTTATGAAGTCAATGATGGAGAAGATGACGTTGGAACCAACCATGTTCANAGTGCACTTAGAAAAAAAGTAACTTGAAAGTGTCTACTTCTGNTCTAAGTATCTTATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD188632             [                           GGCCCAAAACAGGGGAATTACGTTGTGGCTGTGATGGATGCAGTCAAGTGTCCTATTAACATAACATTGTTCCTAATATGCGTTTTACTTGTTTATTTAAGTCTAAGGCCACTGTTAAGAAAAAAGAAGTCTCAGAAATGTGAAGTCCCGAAGATGGGGAGACGTGATTTTACACTAGAAGAACTCCAGAGTTTCGATGGCAGTGGCGAACATAATGTAAATA TAATAGCAGTTAATGGTAAGATATTCGATGTCACAAATAAAGGACAGGGATTTTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD111963             [                                                                                 ATTAACATAACATTGTTCCTAATATGCGTTTTACTTGTTTATTTAAGTCTAAGGCCACTGTTAAGAAAAAAGAAGTCTCAGAAATGTGAAGTCCCGAAGATGGGGAGACGTGATTTTACACTAGAAGAACTCCAGAGTTTCGATGGCAGTGGCGAACATAA GAGAATATTAATAGCGGTTAATGGTAAGATATTCGATGTCACAAATAAAGGACAGGGATTTTATGGCAAGGGTGCACCGTACGCTGCTTTTGCCGGTAGAGATGCATCAAGAGCACTTGCGTGCTTCAACCTCGAAACAAAAGATGACTATGACGATCTTACTGATCTAACTGCTGATCAAATGCAAACCCTAAGGGAATGGGAAC T                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD079336             [                                                                                                                                                                                                                                                                             AGATATTCGATGTCACAAATAAAGGACAGGGATTTTATGGCAAGGGTGCACCGTACGCTGCTTTTGCCGGTAGAGATGCATCAAGAGCACTTGCGTGCTTCAACCTCGAAACAAAAGATGACTATAACGATCTTACTGATCTAACTGCTGATCAAATGgccc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD073048             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGCACTTGCGTGCTTCAACCTCGAAACAAAAGATGACTATGACGATCTTACTGATCTAACTGCTGATCAAATGCAAACCCTAAGGGAATGGGAAC TACAATTTTCCGAGCGTTATGATCATATTGGACGACTTTTGAAGCCAGGAGAGCCTCATAGGGTTTATGAAGTCAATGATGGAGAAGATGACGTTGGAACCAACCATGTTCAAAGTGCACTTAGAAAAAAAGTAACTTGAAAGTGTCTACTTCTGTTCTAAGTATCTTATGTATCTAAACTTTGAATATGATTTTCTTGCCTGGACTGATCATCCGTGATGCTCACATTTCAACATCCAGTTATAATTTTAACCTGGTTTTCGATTCGTGCAATAATAAAATCGTTAAATGAAACACTCGTCCACGCAAATCTGTGCACGATGGAGTGGATCTCTTTTAAAATTCAAAATTAAATCTACACTTCTGGGTATTTTTGTTTATCATATTTTGTTCTTATAATTACAAATCATTTTGAATACACTATATGTTCGACCTGGTTGCTACTGCTTAATCATAATGTAAATATTTGTAACTTTCCACAAATATACATGT]
[-] EMBL CD073613             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTCAAAGTGCACTTAGAAAAAAAGTAACTTGAAAGTGTCTACTTCTGTTCTAAGTATCTTATGTATCTAAACTTTGAATATGATTTTCTTGCCTGGACTGATCATCCGTGATGCTCCCATTTCAACATCCAGTTATAATTTTAACCTGGTTTTCGATTCGTGCAATAATAAAATCGTTAAATGAAACCCTTGTCCCCGCAAATTTGTGCCCGATGGAGTGGATTTTTTTTAAAATTCAAAATTAAATTTACCCTTCTGGGTATTTTTGTTTATCATATTTTGTTCTTATAATTACAAATCATTTTGAATACCCTATATGTTCGACCTGGTTGCTACTGCTTAATCATAATGTAAATATTTGTAACTTTCCCCAAATATACATGT]
[-] EMBL AA999398             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTGATGCTCACATTTCAACATCCAGTTATAATTTTAACCTGGTTTTCGATTCGTGCAATAATAAAATCGTTAAATGAAACACTCGTCCACGCAAATCTGTGCACGATGGAGTGGATCTCTTTTAAAATTCAAAATTAAATCTACACTTCTGGGTATTTTTGTTTATCATATTTTGTTCTTATAATTACAAATCATTTTGAATACACTATATGTTCGACCTGGTTGCTACTGCTTAATCATAATGTAAATATTTGTAACTTTCCACAAATATACATGT]


>consensus_9606#0 AAAGTTATCCCTACAATGGGAAAGGATGGCCCAAAACAGGGGAATTACGTTGTGGCTGTG ATGGATGCAGTCAAGTGTCCTATTAACATAACATTGTTCCTAATATGCGTTTTACTTGTT TATTTAAGTCTAAGGCCACTGTTAAGAAAAAAGAAGTCTCAGAAATGTGAAGTCCCGAAG ATGGGGAGACGTGATTTTACACTAGAAGAACTCCAGAGTTTCGATGGCAGTGGCGAACAT AAGAGAATATTAATAGCAGTTAATGGTAAGATATTCGATGTCACAAATAAAGGACAGGGA TTTTATGGCAAGGGTGCACCGTACGCTGCTTTTGCCGGTAGAGATGCATCAAGAGCACTT GCGTGCTTCAACCTCGAAACAAAAGATGACTATGACGATCTTACTGATCTAACTGCTGAT CAAATGCAAACCCTAAGGGAATGGGAACTACAATTTTCCGAGCGTTATGATCATATTGGA CGACTTTTGAAGCCAGGAGAGCCTCATAGGGTTTATGAAGTCAATGATGGAGAAGATGAC GTTGGAACCAACCATGTTCAAAGTGCACTTAGAAAAAAAGTAACTTGAAAGTGTCTACTT CTGTTCTAAGTATCTTATGTATCTAAACTTTGAATATGATTTTCTTGCCTGGACTGATCA TCCGTGATGCTCACATTTCAACATCCAGTTATAATTTTAACCTGGTTTTCGATTCGTGCA ATAATAAAATCGTTAAATGAAACACTCGTCCACGCAAATCTGTGCACGATGGAGTGGATC TCTTTTAAAATTCAAAATTAAATCTACACTTCTGGGTATTTTTGTTTATCATATTTTGTT CTTATAATTACAAATCATTTTGAATACACTATATGTTCGACCTGGTTGCTACTGCTTAAT CATAATGTAAATATTTGTAACTTTCCACAAATATACATGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)