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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9612#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1571 fasta sequence
[AAACTAAAGAGGAAGCGTATATCGCAAAGTTGGATGCTCGAACAGGTGCTTCATTAAAGCTTACTATACTTAATCCAAATGGTCGTATATGGACAATGAGTGCAGGTGGTGGAGCTTCAGTGATTTATGCTGATACAGTTTGTGAATTAGCTGAAAAAGTCAAAGCAGCCGGTGGTATAAGTCAAGGTGTAAAAGATTTAGCTAATTATGGTGAATATTCTGGAGCACCATCAGAAGAATTAACTTATGAATATTCAAAAACAATTTTAACCTTGATGACTACTGGTGAACCACATCCAGATGGTAAAGTTTTACTGATCGGTGGAGGAATTGCAAATTTCACCAATATTGCTGCTACATTCAAGGGTATTGTACGTGCTTTGACAGAATTCAAAGAACAATTGAAGAGACATAATATACGTATATTTGTCCGTCGTGCTGGTCCCAACTACCAGGAGGGTCTTCGTATAATGCGTGAATTGGGCCGTACTATCGATATTCCAATTTATGTATTTGGACCTGAAACTCATATGACTGCTATCGTGTCAATGGCATTTGGTTTACGTCAAATACCTCCACCTCAAGTAAATCAAATTCAGTCATCTGCAGATAGTTTATCATTGTACAGTTACAATGGTTCTGGCTGTGAACATAAAAATTCAGACAAATCAACACCAATGGTGACCAATCAAACTCTCAAGGTTTCTGAATTCTCTTCTACTATCACTACTACGGCTACTACTGCTACTTCTGATAATAATCATGAAACTATTTATGAAGAACCACTTTTCACAGTGAAAACAAAGTGTTTAATATGGGGTTTACAAGTTAAAGCTGTTCAGTCTATGTTAGATTTCGATTATGCTTCCGGCCGTGATAGTCCAAGTGTAGCAGCTCTGATTTATCCTTTCAGTGATGATCATCAGTTGACATTTTATTGGGGTGCAAAAGAATTATTTCTACCAGTTTATAAGTATATGTTGAATGCAATGCACAAGCATCCAGATGCACGTATATTAGTGAATTTCGCTTCATTGCGAGTTGCTTATGATATATGTATGGAAGCTATGGAAGTGGACTGTATATTGTCATCTAATTATAAAGAGAATGGAATATTGAATGAACACAGTGATACATCTATCAATCATAATGATGGTTTACGGGTAAACGAGGCACAGATCAAATG-TATCGCTATTATAGCTGAAGGTATACCAGAAAATATGACACGTCGTTTAATACAACGATCCAGAGAAAGAAATATTCTATTGATTGGTCCAGCAACCGTAGGTGGCTTGAAATCTGGCTGCTTCAAAATCGGTAATACAGGCGGAATGACAGATAACATACTGGCATCAAAACTTTATCGACCTGGAAGTGTTGCTTATGTATCACGTTCTGGTGGAATGTCCAATGAATTGAATAATATTATTTCAATGAATTCTGATGGTGTGTATGAAGGTGTCGCGATTGGTGGTGATCGTTTTCCTGGTTCAACATTTATTGATCATATTCTACGTTATGAAAATAATCCAGAAATCGGTATGATTGTTGTCTTGGGCGAAGTTGGTGGT]
[+] EMBL CD133009 [AAACTAAAGAGGAAGCGTATATCGCAAAGTTGGATGCTCGAACAGGTGCTTCATTAAAGCTTACTATACTTAATCCAAATGGTCGTATATGGACAATGAGTGCAGGTGGTGGAGCTTCAGTGATTTATGCTGATACAGTTTGTGAATTAGCTGAAAAAGTCAAAGCAGCCGGTGGTATAAGTCAAGGTGTAAAAGATTTAGCTAATTATGGTGAATATTCTGGAGCACCATCAGAAGAATTAACTTATGAATATTCAAAAACAATTTTAACCTTGATGACTACTGGTGAACCACATCCAGATGGTAAAGTTTTACTGATCGGTGGAGGAATTGCAAATTTCACCAATATTGCTGCTACATTCAAGGGTATTGTACGTGCTTTGACAGAATTCAAAGAACAATTGAAGAGACATAATATACGTATATTTGTCCGTCGTGCTG ]
[+] EMBL CD154122 [ GAGGAAGCGTATATCGCAAAGTTGGATGCTCGAACAGGTGCTTCATTAAAGCTTACTATACTTAATCCAAATGGTCGTATATGGACAATGAGTGCAGGTGGTGGAGCTTTAGTGATTTATGCTGATACAGTTTGTGAATTAGCTGAAAAAGTCAAAGCAGCCGGTGGTATAAGTCAAGGTGTAAAAGATTTAGCTAATTATGGTGAATATTCTGGAGCACCATCAGAAGAATTAACTTATGAATATTCAAAAACAATTTTAACCTTGATGACTACTGGTGAACCACATCCAGATGGTAAAGTTTTACTGATCGGTGGAGGAATTGCAAATTTCACCAATATTGCTGCTACATTCAAGGGTATTGTACGTGCTTTGACAGAATTCAAAGAACAATTGAAGAGACATAATATACGTATATTTGTCCGTCGTGCTGGTCCCAACTACCAGGAGGGTCTTCGTATAATGCGTGAATTGGGCCGTACTATCGATATTCCAATTTATGTATTTGGACCTGAAACTCATATGACTGCTATCGTGTCAATGGCATTTGGTTTACGTCAAATACCTCCACCTCAAGTAAATCAAATTCAGTCATCTGCAGATA ]
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[-] EMBL CD146017 [ TAGTTTATCATTGTACAGTTACAATGGTTCTGGCTGTGAACATAAAAATTCAGACAAATCAACACCAATGGTGACCAATCAAACTCTCAAGGTTTCTGAATTCTCTTCTACTATCACTACTACGGCTACTACTGCTACTTCTGATAATAATCATGAAACTATTTATGAAGAACCACTTTTCACAGTGAAAACAAAGTGTTTAATATGGGGTTTACAAGTTAAAGCTGTTCAGTCTATGTTAGATTTCGATTATGCTTCCGGCCGTGATAGTCCAAGTGTAGCAGCTCTGATTTATCCTTTCAGTGATGATCATCAGTTGACATTTTATTGGGGTGCAAAAGAATTATTTCTACCAGTTTATAAGTATATGTT ]
[+] EMBL CD154153 [ CTTTTCACAGTGAAAACAAAGTGTTTAATATGGGGTTTACAAGTTAAAGCTGTTCAGTCTATGTTAGATTTCGATTATGCTTCCGGCCGTGATAGTCCAAGTGTAGCAGCTCTGATTTATCCTTTCAGTGATGATCATCAGTTGACATTTTATTGGGGTGCAAAAGAATTATTTCTACCAGTTTATAAGTATATGTTGAATGCAATGCACAAGCATCCAGATGCACGTATATTAGTGAATTTCGCTTCATTGCGAGTTGCTTATGATATATGTATGGAAGCTATGGAAGTGGACTGTATATTGACATCTAATTATAAAGAGAATGGAATATTGAATGAACACAGTGATACATCTATTAATCATAATGATGGTTTACGGGTAAACGAGGCACAGATCAAATG TATCGCTATTATAGCTGAAGGTATACCAGAAAATATGACACGTCGTTTAATACAACGATCCAGAGAAAGAAATATTCTATTGATTGGTCCAGCAACCGTANGTGGCTTGAAATCTGGCTGCTTCAAAATCGGTAATACAGGCGGAATGACAGATAACATACTGGCATCANAACTTTATCGACCTGNAAGTGTTGCTTATGTATCACGTTCTGGTGGGATGTCCAATGAATTG ATAATATTATTTCAATG ATTCTGAT ]
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[+] EMBL CD114634 [ TACTGGCATCAAAACTTTATCGACCTGGAAGTGTTGCTTATGTATCACGTTCTGGTGGAATGTCCAATGAATTGAATAATATTATTTCAATGAATTCTGATGGTGTGTATGAAGGTGTCGCGATTGGTGGTGATCGTTTTCCTGGTTCAACATTTATTGATCATATTCTACGTTATGAAAATAATCCAGAAATCGGTATGATTGTTGTCTTGGGCGAAGTTGGTGGT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||